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基于组学技术临床检验大数据研究的伦理问题
随着基因组测序成本的大幅度下降,高通量测序技术开始应用于临床医学检验领域,并在复杂疾病的临床诊断和治疗中将发挥越来越重要的作用.基于组学技术的临床检验数据系统记载了患者的诊疗信息,成为当前大健康产业重要的独立医疗研究资源.但是,由于这些数据包含患者的身份信息,在开展医疗健康大数据研究的同时,存在患者知情同意权保护、患者隐私保护、数据安全管理等一系列伦理问题.本文基于这些问题,提出可对临床检验数据进行标准化提取,建立临床检验大数据知识库,供教学培训使用,以提高医疗资源的利用率.另外可在临床检测采集样本过程中实施书面化知情同意,告知病人该数据在提供其诊疗后,可能再应用于相关的科学研究.
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黄芪次生代谢研究进展
目的:黄芪为豆科植物,它的生物活性成分种类很多,且都有不同的药理作用.黄芪内生真菌的报道很少,所以对它的研究才刚刚开始.植物次生代谢网络复杂,利用诱导子提高植物特定代谢途径的次生代谢产物的产量,对生物合成途径进行调控.诱导子分为生物诱导子和非生物诱导子,而关于诱导子的作用机理,只有一个初步的假说,没有作用机理的指导,筛选也较盲目.为了消除试验的背景噪音,无土栽培方式在植物内生真菌及根际微生物研究中,消除了土壤菌群的影响.随着新学科的产生和新技术的发展,组学技术、新一代测序技术应运而生,并在各个领域得到广泛应用.
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充分利用组学技术研究及发展中医药
中医临床治疗学主要是基于整体"证候"诊断的中药复方治疗学.其"证候"病理基础是多样的,复方化学成分是多样的,药物作用途径、环节和靶点也是多样的.实际上这是一个高度的复杂体,故有人称中医为"复杂科学".很显然,采用单因素分析方法和检测技术,如寻找某些单一病理分子与中医"证候"的关联,分离中药单一化学成分研究中药治病的作用机理等,并不适合中医学整体治疗和复方用药的特点.系统生物学理论与组学技术(如蛋白质组、代谢组、基因组等)的发展与应用,为克服上述矛盾提供了条件,因为组学技术能够动态、高效地测定机体在整体条件和多因素作用下多种蛋白质大分子及多种小分子的谱学特征,以及描述多分子间的相互作用规律.因此,组学技术将是研究中医"复杂科学"的强大工具,为揭示中医"证候"的发生机理、体质学说的科学内涵、中药复方治疗复杂性疾病的作用原理等重大科学问题提供了可能.当然,采用组学技术研究中医药,尤其要注意严谨的科学设计,以及研究对象和干预因素的标准化和一致性,同时采用生物信息学和计算机科学等分析海量数据的相互关联.这样,便能建立一个适合中医学研究特点的、优质高效的组学技术平台,大力推动传统中医药理论弄口经验与现代科学的合理结合,以及中医药现代化.
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基于系统生物学组学技术的缺血性脑血管病中医药研究新思维
系统生物学是一种整合型大科学,它从系统水平来分析和研究生物学系统;中医学的核心是整体观念和辨证论治,两者的本质具有较好的一致性.系统生物学组学技术为缺血性脑血管病中医药研究提供一个很好的平台,为缺血性脑血管病中医药防治进行有效的指导和反馈,也将成为今后中医药防治缺血性脑血管病现代化研究的重要方向.
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运用组学技术对中医证实质研究的现状与思考
证候是中医辨证论治和临床诊疗的核心,证实质研究是中医关键的科学问题和中医药现代化进程中的重要环节.组学技术作为当前研究复杂生物系统强有力的工具,为证实质的研究提供了一种新的思路,将组学技术引入证实质研究,可以更好的阐释证候的实质,使证候得到客观、定量的描述.近年来中医证实质的研究发展迅速,但大多局限于单一组学技术的初步分析,缺乏对各组学信息整合的相互印证,证候的科学内涵尚未明确阐释.针对各组学技术对中医证实质研究不断积累的海量数据,中医证实质的研究需要从系统生物学的理念出发,运用生物信息学分析技术、数学、统计学等方法,对证候不同组学信息进行整合分析,从不同层面上探讨和相互印证中医证的科学内涵,计算并建立证候的诊断模型.
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论中医证候基础研究的模式和方法
1 证候特性及其研究模式证候是通过四诊(即望、闻、问、切)手段获取的机体在某一时空条件下对各种内外因素(包括机体生理功能及生物、化学、环境、精神、气候等各种致病因子)反应而呈现的生理、病理状态信息的综合判断结果的表述.
关键词： 系统生物学 组学技术 证候 证候要素及证候要素靶位 研究模式 -
营养实验研究的发展历程和现状
本文总结了国内外临床营养研究的发展历程、现状及对今后的展望,供临床营养研究工作者参考.
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恶性肿性肿瘸的个性化治疗
恶性肿瘤具有异质性,这种异质性要求对恶性肿瘤患者必须提供个性化治疗.基于肿瘤标志物的分子分型、分子诊断和分子预后是个性化治疗的前提,高效且毒副作用小的分子靶向药物治疗是个性化治疗的关键,组学技术则为大量开发肿瘤标志物和新的靶向药物提供了有效的方法 和手段.如何将这些分子生物学的理论和技术应用于临床并使肿瘤患者获益则是肿瘤转化研究的主要内容.本文将就肿瘤标志物、组学技术和肿瘤转化研究在肿瘤个性化治疗中的作用进行扼要综述.
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药物性肝损伤生物标志物研究进展
药物性肝损伤(drug-induced liver injury,DILI)是药物不良反应和药物撤市或限制使用的主要原因.生物标志物检测是临床前药物肝毒性评价和临床患者潜在肝损伤诊断的重要技术手段.随着组学技术的快速发展和肝损伤机制研究的不断深入,关于新型DILI生物标志物研究报道也越来越多.本文综述了近年来国内外DILI生物标志物研究的新进展,以期为更好地评价药物潜在的肝毒性风险提供参考,为临床肝损伤诊断提供依据.
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基于整体观的系统生物学技术在中医药研究中的应用
系统生物学在系统科学整体观理念与生物学相结合的基础上产生,很多学者认为这种整体观与中医药理论的整体观高度相似,而提出尝试运用其先进的技术方法解决中医药瓶颈问题的研究思路.但是系统生物学的整体现与中医药理论整体观并不完全相同.深入探讨两种整体观的客观差异和联系,是找准系统生物学技术应用于中医药研究的适当切入点、适宜切入方式,更充分发挥其技术先进性的必要前提.系统科学、系统生物学都是新兴学科,与中医药理论在科研和临床应用上相整合,不仅有利于中医药研究的快速发展,还可以促进系统科学、系统生物学的学科完善,并启发系统生物学对系统论视角下生命功能涌现性的理论阐释.
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组学技术与肝癌转移复发机制的研究
肿瘤转移是一个涉及肿瘤细胞本身、肿瘤细胞与其周围的微环境及宿主免疫状态的相互作用等多种因素的复杂过程,并有许多因素参与调节.
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环境污染物的生态毒理学研究方法进展
随着现代工业的迅速发展和农业现代化、集约化的不断增加,污染物进入到生态系统中的数量和种类日益增加.如农药、兽药、饲料添加剂、抗生素等在环境中蓄积、迁移和降解而对整个生态系统产生广泛而深远的影响.现今新型污染物的种类不断增加,如多环芳烃(PAH)、多溴联苯醚(PBDEs)、全氟辛烷磺酸(PFOS)、全氟辛酸(PFOA)、酚类环境雌激素(PEE)等,都具有残留期长、环境毒性大、不易降解等特点,致使在生态环境中长期积累成为持久性有机污染物(POPs),对周边生物包括人的健康造成严重威胁.
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基于系统生物学的肺气虚证证本质探究
生物体是一个整体化和网络化的复杂系统,证的本质需要采用适用于复杂系统和现象研究的系统科学理论来阐释.系统生物学的出现给证候实质研究带来了新希望.本文基于系统生物学的研究方法和技术,从基因组学、蛋白质组学、代谢组学等组学角度,论述肺气虚证的证本质研究,并对肺气虚证的研究前景予以展望.
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侵袭性真菌感染与宿主免疫应答的评述
近年来,侵袭性真菌感染的发病率和病死率呈急剧上升趋势.侵袭性真菌感染时会引起宿主一系列免疫应答反应来清除病原体,其中固有免疫应答在识别侵袭性真菌抗原、清除病原体和介导适应性免疫反应等方面发挥重要功能,而近期研究证实适应性免疫在应答真菌感染时发挥着不可缺失的功能.一方面侵袭性真菌采取多种策略来逃避宿主的免疫反应,另一方面特异免疫细胞识别病原体并启动一系列免疫反应来维持宿主免疫平衡和避免机体病菌的发生.为更深入的认识侵袭性真菌感染宿主引起的免疫应答和免疫逃避造成的侵袭性真菌病,本文对侵袭性真菌感染和宿主免疫应答的机制研究现状作一评述.
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药物毒理学技术方法研究进展
药物是否安全和有效是药物研发成功与否的决定性因素.就药物研发的整个流程而言,毒性是终止药物研发的重要原因之一.药物毒理学研究贯穿于新药发现阶段、临床前安全性评价和上市后跟踪监督的全过程,因此药物的毒理学研究至关重要.简要综述了药物毒理学研究过程中所涉及的技术方法以及研究新动向,并主要介绍了组学技术的发展.
