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呼吸道感染致病菌16S rRNA基因V3、V6可变区序列分析及在液态芯片中应用的探索性研究

陈愉生;张伟;王毅;伍严安;沈晓娜;胡辛兰;李鸿茹;黄丽萍

摘要: 目的 探讨呼吸道感染致病菌16S rRNA基因V3、V6可变区在液态芯片系统的应用价值.方法 通过GenBank公布的呼吸道感染致病菌16S rRNA基因序列,设计并合成探针及引物,建立液态芯片检测系统,检测福建省立医院收集的52例呼吸道感染痰标本抽提的DNA,与测序结果比对,分析其灵敏度和特异度.结果 呼吸道感染致病菌16S rRNA基因V3、V6区均存在差异,应用液态芯片可在3.5h得到检测结果,铜绿假单胞菌16S rRNA V6探针,可检测浓度大于102/μl标本,检测灵敏度为100.0%,特异度为100.0%;金黄色葡萄球菌16S rRNA V3探针灵敏度为66.7%,特异度为98.0%;金黄色葡萄球菌16S rRNA V6探针灵敏度为0.0%.结论 呼吸道感染致病菌16S rRNA基因V3、V6可变区差异可应用于病原学诊断,但不适合检测所有的呼吸道感染致病菌.

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