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黔西南汉族人群表皮生长因子前体蛋白编码序列第14和16外显子中单核苷酸多态性研究

周白玉;张兵;陈海明;王兴林;刘祖明;李方明;刘金伟;杨绍华

摘要: 背景与目的单核苷酸多态性(SNPs)在蛋白编码序列中多以富集成簇的方式分布,并提示其可能有民族区域和人种之间的差异性,然而 SNPs 在黔西南汉族人群表皮生长因子前体蛋白(preproEGF)编码序列第14和16外显子中的分布状况迄今尚未见报道,本研究拟对35例黔西南汉族受试者进行研究,旨在分析 SNPs 在 preproEGF 编码序列第14和16外显子中的分布特征。方法设计合成4条引物,分别对35例汉族受试者 preproEGF 编码序列第14和16外显子区段进行 PCR 扩增和产物的 DNA 测序;检索单核苷酸多态性资料库(dbSNP)获取资料并与测序结果进行对比分析。结果35例黔西南汉族受试者中13例(37.1%)在 preproEGF 编码序列的2525 bp 位点出现 SNPs,基因型为 AG 和 GG,频率分别为69.2%和30.8%,其等位基因频率分别为 A 34.6%和 G 65.4%;27例(77.1%)在2576 bp 位点有 SNPs,基因型为 AA 和 AG,频率分别为66.7%和33.3%,等位基因频率分别为 A 83.3%和 G 16.7%。相比之下,北京汉族受试者较黔西南汉族受试者在 preproEGF 编码序列第14外显子内多了1个单核苷酸多态位点,即2619 bp 位点;欧美等其他民族不仅在 preproEGF 编码序列第14外显子内分布有 rs199935855等7个 SNPs,而且在其第16外显子内也分布有 rs149396988等6个 SNPs;黔西南汉族和北京汉族受试者在 preproEGF 编码序列的第16外显子内均未见有 SNPs 分布。结论在黔西南汉族、北京汉族和欧美等民族的 preproEGF 编码序列第14和16外显子中, SNPs 分别具有各民族、各种族的特征性分布,据此可区分不同地域的种族和人群,甚至进行个体识别。也可将这些呈特征性分布的 SNPs 视为遗传标记进而深入研究 SNPs 与疾病发生的关系。

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