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  • 两种菌体前处理方法对MALDI-TOF MS鉴定临床分离菌效果的影响

    作者:曹韪凡;宋召;周凤丽;刘昕超;马庆伟;曹峰林

    目的 评价2种不同前处理方法对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定临床分离菌效果的影响.方法 收集临床菌株43株,划线传代后,分别使用提取法和抹板法对微生物样本进行前处理,然后用MALDI-TOF MS鉴定比较两种处理方法的准确率和蛋白指纹图谱特征.结果 以16S rRNA/ITS RNA测序结果为参考标准,待测菌株经提取法处理后,MALDI-TOF MS鉴定革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌的种水平准确率分别为93.8%、100.0%和30.8%,待测菌株经抹板法处理后,MALDI-TOF MS鉴定革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌的种水平准确率分别为75.0%、100%和7.7%.提取法处理菌株后得到的蛋白指纹图谱中特征峰更多,信噪比更高,蛋白指纹图谱重现性更好.结论 推荐采用提取法为MALDI-TOF MS鉴定的常规前处理方法,其对建立标准的微生物检测流程,提高质谱鉴定的正确率,有重要价值.

  • 不同中医证型原发性肝癌患者介入治疗前后血清蛋白指纹图谱的观察

    作者:杨素芳;邱颂平;刘清华

    目的 应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片检测不同中医证型原发性肝癌患者介入治疗前后血清蛋白指纹图谱的变化.方法 将154例原发性肝癌患者分为肝郁证、脾虚证、湿热证、血瘀证及阴虚证5组,应用SELDI-TOF-MS分析其血清蛋白指纹图谱,观察肝癌介入治疗前后不同中医证型与血清蛋白指纹图谱之间的关系.结果 与健康对照组比较,符合叶氏诊断模型者,肝郁证中质荷比(M/Z)为4 182 Da及6 589 Da、湿热证中M/Z为5 710 Da、阴虚证中M/Z为6 992 Da的差异蛋白表达下调;脾虚证中M/Z为5 816 Da、血瘀证中M/Z为4 297 Da的差异蛋白表达上调;差异均有统计学意义(P<0.01);与介入前比较,符合叶氏诊断模型者,肝郁证中 M/Z为4 182 Da及6 589 Da、湿热证中M/Z为5 710 Da、脾虚证中 M/Z为5 816 Da、血瘀证中M/Z为4 297 Da的差异蛋白表达下调;阴虚证中 M/Z为6 992 Da的差异蛋白表达上调;差异亦有统计学意义(P<0.05,P<0.01).结论 不同中医证型原发性肝癌患者介入治疗前后的血清蛋白指纹图谱变化有统计学意义.

  • 胃癌脾虚证唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型研究

    作者:谢梦洲;贺佐梅;黄飞娟;周小青;吴正治

    目的 研究建立胃癌脾虚证唾液蛋白质指纹图谱新型分子诊断模型.方法 采集未经手术和放化疗治疗的57例胃癌患者(脾虚证组40例,非脾虚证组17例)、45例健康志愿者(正常对照组)的唾液标本,用弱阳离子交换型(WCX)纳米磁珠联合基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术进行检测,获得各组标本的蛋白指纹图谱.比较各组唾液蛋白质质谱数据,找出胃癌脾虚证组与正常对照组、胃癌脾虚证组与胃癌非脾虚证组之间具有统计学意义的差异表达蛋白质峰;采用决策树算法计算出多个变量即质荷比(m/z)变化对两组样本的判别价值,确定优化的诊断模型.结果 胃癌脾虚证组与正常对照组唾液蛋白质质谱比较共有106个差异蛋白质峰有统计学意义,胃癌脾虚证组与胃癌非脾虚证组唾液蛋白质质谱比较共有6个差异蛋白质峰有统计学意义(P <0.05或P<0.01).筛选建立了由m/z为5439.67、2411.67、3619.18共3个主要差异蛋白峰组成的胃癌脾虚证诊断模型;临床回代检验该模型的灵敏度和特异度分别达100%和93%;交叉验证法进一步验证诊断模型的灵敏度和特异度分别为87%和89%.结论 基于WCX纳米磁珠结合MALDI-TOF-MS技术建立的胃癌脾虚证唾液蛋白质组无创性分子诊断模型敏感性高、特异性强,对胃癌脾虚证的诊断具有良好效率.

  • 利用Au蛋白芯片技术快速鉴定铜绿假单胞菌的研究

    作者:解春宝;肖代雯;杨永长;姜伟;刘华;黄文芳

    目的 利用Au蛋白芯片建立铜绿假单胞菌蛋白指纹图谱诊断模型,为铜绿假单胞菌感染快速鉴定奠定基础.方法 收集临床分离鉴定的铜绿假单胞菌64株及对照菌199株,随机分成训练组和验证组.运用表面增强激光解析电离飞行时问质谱技术及Au蛋白芯片(proteinchip golden array)检测铜绿假单胞菌及对照菌的蛋白表达,用Ciphergen Proteinchip和BioMarker Wizard软件自动采集数据,筛选铜绿假单胞菌特征性蛋白.结果 经 BioMarker Patterns 软件建立分类树模型.利用该模型对29株铜绿假单胞菌和64株对照菌进行盲法验证.结果 在相对分子质量3000~20 000范围内共检测到80个蛋白峰,其中具有统计学差异的蛋白峰58个(P<0.01).BioMarker Patterns软件判别分析,择优选出质荷比(M/Z)为14 045.2的蛋白质峰建立铜绿假单胞菌分类树模型.验证结果表明其对铜绿假单胞菌诊断的灵敏度和特异度分别为96.55%(28/29)、100%(64/64).结论 利用Au蛋白芯片技术可快速鉴定铜绿假单胞菌.

  • SELDI蛋白指纹技术在肿瘤早期诊断中的应用

    作者:张建中;郑燕华;冯凯;邹德威

    血清蛋白组学模式诊断技术是一种新型的蛋白组学平台,在此平台上通过高维质谱所获得的蛋白指纹图谱可用做疾病的诊断标准.此技术在早期肿瘤的检测中具有巨大应用前景.目前发现通过SELDI蛋白指纹技术所获得的生物标记物,大多数是在特异性肿瘤微环境中所产生的低分子质量蛋白碎片.通过多种肿瘤的检测表明,其敏感性和特异性均优于传统的肿瘤标记物,对某些肿瘤的敏感性已达100%,特异性也超过95%,因而在肿瘤早期诊断和早期预警中具有重要临床应用价值.

  • 用血清蛋白指纹图谱筛选胃癌血清标记物的意义

    作者:刘春;徐亮;韩海彬;杨建碧;罗兵;彭超

    胃癌治疗效果较差,总的5年生存率仅为20%~40%,进展期Ⅲ期和Ⅳ期的5年生存率几乎为0.因此,从血清中寻求特异性生物学标志物用于胃癌的诊断是临床亟需解决的难题.为此,我们设计了该研究,以探讨血清蛋白指纹图谱在胃癌诊断中的意义.

  • 血清蛋白指纹图谱对多发性骨髓瘤诊断及分期诊断价值研究

    作者:曾艳;韩红;熊微;曾雅丽;杨芬;张静;熊亮

    目的 多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)是一种恶性克隆性浆细胞肿瘤,其起病隐匿,误诊、漏诊率高.本研究通过对MM患者及健康对照组的血清样本进行检测分析,探讨应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术构建蛋白指纹图谱在MM诊断及分期诊断中的价值.方法 应用WCX2蛋白芯片结合SELDI-TOF-MS技术检测初诊的46例MM(其中Ⅰ、Ⅱ期15例,Ⅲ期31例,ISS分期)患者组及30名健康对照组血清蛋白含量.用Biomarker Wizard软件对MM与健康对照,及不同分期的MM进行比较,Biomarker Patterns 5.0软件,找出佳标志物组合.结果 MM组与健康对照组比较,由荷质比(m/z)为4 180、5 260和5 342建立的决策树模型敏感性为97.8%,特异性为93.3%.MM Ⅰ、Ⅱ期组与Ⅲ期组比较,当m/z 2 020≤6.58且m/z 3 485≤1.26,诊断为MM Ⅰ、Ⅱ期,其准确率为100.0%;当m/z 2 020≤6.58且m/z 3 485 >1.26,诊断为MMⅢ期,其准确率为87.1%.结论 SELDI-TOF-MS筛选出了MM的血清生物标志物,其构建的诊断模型敏感性、特异性及准确性均高,有较好的临床应用前景.

  • 不同耐药结核分枝杆菌蛋白LC-MS分析

    作者:郭炽星;蒋敏慧;黎敬忠

    目的:比较结核分支杆菌耐药菌株与临床敏感株在蛋白种类上的差异,构建不同耐药结核分枝杆菌蛋白指纹图谱,为进一步研究结核杆菌耐药的分子调控机制提供依据.方法:利用高效液相质谱非标记的方法(LC-MS)鉴定耐药结核分支杆菌蛋白质类型,通过与临床敏感株比对,构建耐药结核分枝杆菌蛋白指纹图谱分析.结果:与临床敏感组相比阿米卡星耐药组有856种差异性蛋白被发现,其中显著上调的有332种,明显下调的524种;与临床敏感组相比利福平耐药组有726种差异蛋白,其中有441种明显下调, 285种明显上调.阿米卡星耐药组与利福平耐药组相比有141种差异性蛋白被发现,其中下调67种,上调74种.结论:耐多药结核杆菌与临床敏感结核分枝菌株在蛋白种类与表达水平存在明显差异.

  • 采用蛋白指纹图谱技术筛选大肠癌肝转移特异性相关蛋白

    作者:崔丹瑜;姜泊;王继德;李霆;吴保平

    目的:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术从大肠癌及大肠癌肝转移患者中筛选出大肠癌肝转移患者血清特异性相关蛋白.方法:实验于2005-07/2006-09分别在南方医院消化中心实验室与解放军第一五○医院实验室完成.应用美国CipherGan公司IMAC3(lmmobitized Metal Affinity Capture,金属亲和表面)芯片和蛋白芯片仪检测44例大肠癌患者及36例大肠癌肝转移患者血清中的蛋白质相对含量.设定所有血清样本检测的蛋白质相对分子质量区间在1 500~20 000.利用PBSⅡ型蛋白质芯片阅读仪对IMAC 3芯片进行检测,所得到的蛋白质以波谱的形式表示.采用Biomarker Wizard软件对2组血清在相同质荷比的蛋白质含量数据进行方差分析,将分析所得到的含量有显著性差异(P<0.05)的蛋白质建立数据库,导入Biomarker Pattern智能统计分析软件,选择相应条件,对其进行分组统计,从而得到能够正确分组的特异性蛋白标志物并构建大肠癌肝转移的诊断模型.采用酶联免疫法检测相同血清标本中的CEA水平,与构建的诊断模型在大肠癌肝转移诊断中作比较.结果:①44例大肠癌患者与36例大肠癌肝转移患者的血清蛋白质在质荷比为2 685.64~11 813间有16个蛋白质含量有显著差异.②大肠癌组在质荷比为5 909处的蛋白质的相对含量高于大肠癌肝转移组[(30.1±9.6)%,(14.5±10.4)%,P≤0.01].③其中44例大肠癌患者中有38例患者被正确分组,36例大肠癌肝转移患者被正确识别,准确率为92.5%(74/80),灵敏度和特异性分别为100%(36/36),86.4%(38/44).结论:表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术快速、准确、灵敏度、特异性高,通过蛋白芯片仪发现的特异性相关蛋白,有望成为大肠癌肝转移诊断中有应用价值的临床检测指标.

  • 临床常见葡萄球菌蛋白指纹图谱的建立

    作者:闫慧;杨永长;肖代雯;姜伟;钟敏;黄文芳

    目的 建立临床常见三种葡萄球菌的蛋白指纹图谱,为其快速诊断奠定基础.方法 收集临床常见葡萄球菌包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌及溶血性葡萄球菌,利用16S rDNA测序技术对其进行鉴定;表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术检测其蛋白表达,采用Ciphergen Protein chip软件自动采集数据.评价该检测方法的重复性及细菌蛋白表达的稳定性.结果 在分子量3000 ~20000 Da范围内,3种葡萄球菌有各自特异的蛋白指纹图谱;SELDI-TOF MS检测细菌蛋白的孔间重复性和芯片间重复性好,同一株细菌4次重复的蛋白指纹图谱相似;同种细菌不同株之间蛋白指纹图谱表达稳定,共有蛋白峰分子量变异系数≤0.5%.结论 在分子量3000 ~20000 Da范围内,各细菌蛋白指纹图谱差异明显,为细菌的快速鉴定提供了新方法.

  • 体外培养乳腺癌细胞线粒体差异蛋白的筛选

    作者:韵雪雪;杨永长;姜伟;肖代雯;闫慧;黄文芳;罗春丽

    目的 比较体外培养的乳腺癌细胞与正常乳腺细胞线粒体蛋白指纹图谱,筛选差异蛋白,为乳腺癌亚细胞蛋白标志物的研究奠定基础.方法 提取乳腺癌细胞株MDA-MB-231、MCF-7及正常乳腺细胞株HBL-100线粒体蛋白,表面增强激光解析蛋白飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测蛋白表达,Biomarker Wizard Software分析软件统计结果,筛选差异蛋白,并探讨溶剂及长期冻存对结果分析的影响.结果 在相对分子质量2 000~100 000范围内检测到近200个蛋白峰,HBL-100与MDA-MB-231和MCF-7细胞相比,差异蛋白峰分别为45个和36个(P<0.05),其中相对分子质量9 200、13 800、14 000和22 500的蛋白在2株癌细胞中表达均下降,相对分子质量10 000和11 600的蛋白在2株癌细胞中表达均升高.4‰的TritonX-114及冻存3~6个月对结果分析无影响.结论 SELDI-TOF-MS能够快速、灵敏地检测分析乳腺癌线粒体差异表达蛋白,为亚细胞水平乳腺癌标志物的研究提供了新的思路.

  • 食管癌患者血清蛋白指纹图谱的检测及食管癌诊断模型的建立

    作者:刘丽华;单保恩;王士杰;孟君;王玲

    目的:利用蛋白质组学基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱,建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,探讨其临床应用价值.方法:收集河北医科大学第四医院2008年5月至9月间胸外科食管癌患者血清32例和健康志愿者血清28例,采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX磁珠)提纯血清蛋白,MALDI-TOF MS技术进行血清蛋白质质谱检测,所得结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统进行分析.运用遗传算法结合支持向量机运算建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型;将60例标本随机分成训练组和盲法测试组,训练组为21名食管癌患者和19名健康人,盲法测试组为11名食管癌患者和9名健康人,验证诊断模型的特异性和敏感性.结果:采集食管癌患者和健康对照者的血清蛋白指纹图谱,经数据对比分析找到44个有显著性差异的质荷比峰(P<0.05);从中筛选出差异显著的6个蛋白质荷比峰(m/z分别为2 210、2 864、6 634、4 068、2 083和8 131),并以此建立食管癌蛋白指纹图谱诊断预测模型;验证该模型诊断食管癌的特异性为88.9%、敏感度为100%.结论:应用MALDI-TOF MS技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱建立的食管癌蛋白指纹图谱诊断模型在食管癌的诊断中具有较高的敏感度和特异性.

  • 3种虫类药材蛋白指纹图谱的建立

    作者:范玮;余伯阳;刘吉华

    考察土鳖虫、僵蚕、蜈蚣电泳样品的制备方法、上样量、分离胶浓度及染色方法,建立3种虫类药SDS-PAGE蛋白指纹图谱.结果显示,3种虫类药的优化样品制备方法为以Tris-HC1缓冲液提取,上样量均为18 μg,优选12.5%浓度的分离胶,银染法显色可获得清晰的鉴别电泳图谱.该研究首次建立了土鳖虫、僵蚕、蜈蚣的SDS-PAGE蛋白指纹图谱,且方法可靠、操作简便、重现性好,可用于上述3种虫类药原药材,特别是粉碎药材的定性鉴别,也可为其他动物类中药材的鉴别提供方法学借鉴.

  • 蛋白指纹图谱与非小细胞肺癌个体化治疗的研究进展

    作者:杨邵瑜;陈雪琴;潘月龙;张苏展

    肺癌是全球发病率和死亡率高的肿瘤,其中约80%为非小细胞肺癌.对于非小细胞肺癌个体化治疗的大目标和任务就是要通过各种有效方法获得肺癌治疗获益人群的准确信息指导临床治疗.新兴的蛋白质谱技术正为这一探索提供了优良的高通量技术平台.

  • 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术在结核分枝杆菌与胞内分枝杆菌差异蛋白分析中的应用

    作者:邹盛华;李丹;陈晓红;吴国兰;张丽水;黄明翔;方美兰;毛文捷;李红艳

    目的 对比分析结核分枝杆菌与胞内分枝杆菌菌体蛋白、分泌蛋白指纹图谱,评价表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在结核病快速诊断中的价值.方法 结核分枝杆菌和胞内分枝杆菌标准菌株经BACTEC960仪培养30 d,灭活菌株,离心沉淀物提取菌体蛋白,上清液提取分泌蛋白.利用SELDI-TOF-MS进行蛋白质/多肽谱分析.结果 结核分枝杆菌与胞内分枝杆菌菌体蛋白指纹图谱存在差异,有33个差异蛋白峰;结核分枝杆菌与胞内分枝杆菌分泌蛋白指纹图谱存在差异,有51个差异蛋白峰;结核分枝杆菌有其特征性蛋白峰.结论 结核分枝杆菌与胞内分枝杆菌菌体蛋白、分泌蛋白指纹图谱有明显的差异蛋白峰,应用SELDI-TOF-MS技术可以早期、快速、简便地诊断结核病.

  • 非小细胞肺癌患者血清蛋白指纹图谱的构建及其临床意义

    作者:廖晓东;毛伟敏;郑智国

    目的 探讨血清蛋白指纹图谱在非小细胞肺癌诊断中的价值.方法 取肺癌患者与年龄、性别匹配的对照组的血清标本进行实验,应用SELDI-TOF-MS技术及WCX2磁珠,检测各血清标本构建血清蛋白指纹图谱,应用Bio-marker Wizard和SPSS 13.0软件分析数据并建立诊断模型,并评价各诊断模型对肺癌的诊断价值.结果 由分子量为4797、2768、3268(m/z)的差异蛋白峰组成的非小细胞肺癌诊断模型Ⅰ,经验证诊断模型Ⅰ的判别准确率为91.3%(158/173),敏感性为89.2%(66/74),特异性为92.9%(92/99),统计学分析结果提示其敏感性高于CYF21-1、SCC、CEA的联合检测.由分子量为2768、3403、9498(m/z)的差异蛋白峰组成的Ⅰ期非小细胞肺癌诊断模型Ⅱ,其判别准确率为88%(44/50),敏感性为90.0%(18/20),经扩大样本量验证,其特异性为83.8%(83/99),统计学分析结果提示其敏感性高于SCC、CYF21-1及CEA的联合检测.分别对23例肺腺癌、51例肺鳞癌患者和30名正常对照组对比分析后,筛选出差异大的4个标志蛋白,其分子量为3268、2768、3403,9498(m/z),分别组合成的诊断模型Ⅲ、Ⅳ,对肺腺癌及肺鳞癌的诊断均具有较高的敏感性及特异性,统计学分析结果提示其敏感性高于相关肿瘤标志物的检测.结论 非小细胞肺癌诊断模型Ⅰ、Ⅱ分别时NSCLC、Ⅰ期NSCLC患者的诊断具有较高的敏感性及特异性,其敏感性高于相关肺癌肿瘤标志物的联合检测;差异蛋白3268、2768、3403、9498(m/z)对于肺腺癌或肺鳞癌的诊断具有较高的敏感性及特异性,有望成为新的肿瘤标志物.

  • SELDI血清蛋白指纹图谱在肿瘤研究中的应用

    作者:张秀强;王巾帼;陈瑛

    肿瘤治疗的关键在于早期发现和早期治疗.SELDI-TOF-MS(表面加强激光解析电离飞行时间质谱)是随着蛋白质组学兴起而出现的一种新技术,具有快速、简便、准确及超敏感等特点,在肿瘤临床诊断方面潜力巨大.现将近年来SELDI在血清中蛋白质组学研究的进展综述如下.

  • 低剂量螺旋 CT 扫描联合血清蛋白指纹图谱检测在肺癌早期诊断中的临床应用

    作者:王文;杨劲松;李长江;刘宇;张志功;刘一骐

    目的:研究低剂量螺旋 CT (30 mA)扫描联合蛋白指纹图谱检测诊断早期肺癌的临床价值。方法应用表面增强激光解析电离化飞行时间质谱技术,分析50例肺癌患者和50例健康志愿者的血清,获得蛋白表达图谱,建立肺癌诊断模型。对30例肺部肿块患者进行低剂量 CT扫描联合血清蛋白质谱分析检测。结果应用表面增强激光解析电离化飞行时间质谱技术构建血清蛋白指纹图谱,在4763.26 m/z 、9725.37 m/z 、11534.16 m/z 和15335.22 m/z 蛋白峰构建一个肺癌诊断模型。盲筛分析显示诊断模型对肺癌诊断敏感性和特异性分别为75.0%和90.0%。低剂量 CT 筛查与低剂量 CT 联合蛋白指纹图谱分析对肺癌诊断的准确度分别为73.9%和85.7%。结论低剂量螺旋 CT 扫描联合血清蛋白质指纹图谱技术筛查早期肺癌具有较高的敏感度和准确度,对早期诊断肺癌有积极的临床意义。

  • 蛋白指纹图谱技术对肾透明细胞癌分期和预后判定的临床价值

    作者:董德鑫;李汉忠;严维刚;纪志刚;张玉石

    目的:应用蛋白组指纹图谱技术对不同分期和手术前后的肾透明细胞癌进行血清差异蛋白研究,寻找显著性表达的差异蛋白,以判定肾透明细胞癌的分期和预后.方法:采集肾透明细胞癌血清样本33例,其中术前血清样本24例,男性18例,女性6例,TNM分期:Ⅰa期8例,Ⅰb期7例,Ⅱ期3例,Ⅲ期2例,Ⅳ期4例.肾透明细胞癌术后组:男性5例,女性4例,TNM分期:Ⅰa期3例,Ⅰ b期4例,Ⅱ期2例.应用磁珠联合MALDI-TOF MS技术对肾透明细胞癌血清进行差异蛋白研究,筛选出显著性差异的血清蛋白,并应用遗传算法建立诊断模型.结果:肾透明细胞癌早期组与晚期组之间差异蛋白峰133个,具有显著性差异的蛋白峰2个,分子量为9293.53和4 646.76(P<0.05).利用ClinProTools2.2软件通过遗传算法优化选择,筛选出15个差异蛋白峰建立诊断模型,诊断识别能力为91.67%.肾透明细胞癌术前组与术后组之间差异蛋白峰128个,其中具有显著性差异的蛋白峰10个,分子量分别为3 885.32、7 769.69、2 770.68、5 163.14、9 070.9、3 542.1、5 135.01、4 301.21、4 271.81和7 684.4(P<0.05).通过遗传算法筛选出15个差异蛋白峰建立诊断模型,诊断识别能力为100%.结论:肾透明细胞癌不同分期和手术前后存在显著性差异的血清蛋白,应用遗传算法建立血清差异蛋白的诊断模型,模型识别能力高,有助于肾透明细胞癌的分期和预后的判定.

  • 肾癌患者手术及免疫治疗前后的血清蛋白指纹图谱的研究

    作者:高燕华;高春芳;王道元;赵光;李宝辉;邹永强

    目的:分析肾癌患者手术前后及免疫治疗前后的血清蛋白指纹图谱,构建并评估血清差异蛋白诊断模型.方法:首先应用弱阳离子磁珠技术富集肾癌患者手术前后、免疫治疗后及健康对照组的血清蛋白,其次用基质辅助激光解离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术构建肾癌患者不同时期的蛋白指纹图谱,再应用有监督以及无监督的化学计量学模式识别方法对构建的指纹图谱进行效力评价,后应用受试者工作特征曲线(ROC)寻求区别各个时期肾癌患者血清中的差异蛋白.结果:在无监督模式识别方法(主成分分析,PCA)结果不理想的情况下,对比了不同有监督模式识别方法构建的指纹图谱模型,结果表明遗传算法(GA)对各个时期的肾癌患者均有较高的识别率,达到了97.7%;术前和术后差异蛋白只有一个,而术前和免疫治疗后、术后和免疫治疗后存在较多的差异蛋白.结论:肾癌患者经过免疫治疗后,血清蛋白质和术前及术后存在明显差异,肾癌应用遗传算法构建的血清蛋白指纹图谱可有效识别术前、术后、免疫治疗后以及正常对照组的血清差异蛋白.

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