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WCX纳米磁珠在宫颈鳞癌血清蛋白质组中的应用及其临床意义
目的 研究宫颈鳞癌患者血清蛋白,筛选差异蛋白并建立诊断模型,探讨其临床意义.方法 用WCX纳米磁珠联合基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱检测77例宫颈鳞癌,13例宫颈上皮内瘤变Ⅲ级患者和52名健康人的血清.用Biomarker Wizard软件分析并找出差异蛋白,再用Biomarker Patterns软件建立诊断模型.同时与SCC-Ag作比较.结果 建立了由3974、3398和13732等差异蛋白峰组成的宫颈癌诊断模型,其敏感性为100%(32/32),特异性为93.8%(30/32).扩大样本验证,其敏感性为77.8%(35/45),特异性为75%(15/20).另外13例CINⅢ级患者有11例被检出,34例SCC-Ag阴性的患者中有30例被检出.结论 由3974、3398和13732三个差异蛋白组成的诊断模型有助于区分宫颈鳞癌,CINⅢ级患者与健康人.同时也能检出SCC-Ag阴性的宫颈鳞癌患者.
关键词： 宫颈癌 基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱 纳米磁珠 -
质谱在乳腺癌血清蛋白组中的应用及其临床意义
目的 研究乳腺癌患者血清蛋白,筛选候选肿瘤标志物并建立诊断模型,初步探讨所建立的诊断模型在乳腺癌早期诊断中的临床意义.方法 对48例乳腺浸润性导管癌患者和26例乳腺良性肿瘤患者与52名健康人血清,采用弱阳离子交换型(WCX)纳米磁珠联合基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱,检测各血清标本获得蛋白指纹图谱;用Biomarker Wizard找出差异蛋白,再用Biomarker Patterns建立诊断模型;扩大样本量,通过盲法分析进一步验证诊断模型.结果 初步筛选出6个差异蛋白峰,差异有统计学意义(P<0.01),建立由3164、3403m/z两个差异蛋白峰组成的乳腺癌诊断模型,其敏感率为90.0%,特异性为93.3%;扩大样本盲法验证结果其敏感性为77.8%,特异性为90.9%;另外26例乳腺良性肿瘤患者中有21例可以检出.结论 由两个差异表达蛋白及其特定组合构成的诊断模型可以区分乳腺浸润性导管癌、乳腺良性肿瘤患者与健康人.
关键词： 乳腺癌 基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱 纳米磁珠 -
基于双向凝胶电泳/基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱技术的腐蹄病奶牛血浆蛋白质组学轮廓分析
目的 利用双向凝胶电泳/基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(two-dimensional electrophoresis matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,2DE/MALDI-TOF-MS)技术,筛选、鉴定腐蹄病奶牛血浆差异表达蛋白,并进行血浆蛋白质组学轮廓分析.方法 选取20头腐蹄病奶牛为实验组,20头健康奶牛为对照组,采血,分离血浆,2DE筛选差异表达蛋白点,MALDI-TOF-MS鉴定差异表达蛋白,并对其进行生物信息学分析(GO分析和KEGG pathway数据库).根据2DE及MALDI-TOF-MS的实验结果,选取纤维蛋白原进行Western blot验证试验.结果 患腐蹄病奶牛血浆中共筛选出63个差异蛋白点,其中表达上调蛋白点14个,表达下调蛋白点49个,选取33个点进行质谱分析,得到26个阳性结果,鉴定为11种蛋白,差异表达蛋白多与炎症反应过程相关.Western blot对差异表达蛋白的验证结果与2DE结果一致.结论 奶牛腐蹄病使血浆蛋白的表达发生了变化,机体蛋白质组参与炎症反应、补体通路、凝血过程等多个机体生理和病理过程,为进一步探索奶牛腐蹄病发病机制提供理论依据.
关键词： 奶牛 腐蹄病 双向凝胶电泳 基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱 蛋白质组学 -
食管癌患者血清蛋白指纹图谱的检测及食管癌诊断模型的建立
目的:利用蛋白质组学基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱,建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,探讨其临床应用价值.方法:收集河北医科大学第四医院2008年5月至9月间胸外科食管癌患者血清32例和健康志愿者血清28例,采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX磁珠)提纯血清蛋白,MALDI-TOF MS技术进行血清蛋白质质谱检测,所得结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统进行分析.运用遗传算法结合支持向量机运算建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型;将60例标本随机分成训练组和盲法测试组,训练组为21名食管癌患者和19名健康人,盲法测试组为11名食管癌患者和9名健康人,验证诊断模型的特异性和敏感性.结果:采集食管癌患者和健康对照者的血清蛋白指纹图谱,经数据对比分析找到44个有显著性差异的质荷比峰(P<0.05);从中筛选出差异显著的6个蛋白质荷比峰(m/z分别为2 210、2 864、6 634、4 068、2 083和8 131),并以此建立食管癌蛋白指纹图谱诊断预测模型;验证该模型诊断食管癌的特异性为88.9%、敏感度为100%.结论:应用MALDI-TOF MS技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱建立的食管癌蛋白指纹图谱诊断模型在食管癌的诊断中具有较高的敏感度和特异性.
关键词： 食管癌 基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱 蛋白指纹图谱 诊断模型 -
运用MALDI-TOF MS方法建立食管癌患者血清蛋白指纹图谱诊断模型
目的 本研究利用基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱,建立食管癌诊断模型,探讨其临床应用价值.方法 采用弱阳离子蛋白芯片(WCX磁珠)对血清进行分析前处理,运用MALDI-TOF MS技术检测119例标本(75例食管癌和44例健康对照)血清蛋白质谱图,通过蛋白芯片数据分析系统进行数据处理,以遗传算法结合支持向量机运算建立食管癌与健康对照组、早期食管癌与中晚期食管癌组诊断模型,随机抽取79例建模标本( 50例食管癌和29例健康对照)进行训练与交叉验证,并选择新病例( 30例食管癌和23例健康对照)血清标本进行测试.结果 采集食管癌患者和健康对照者的血清蛋白质纹图谱,经数据分析找到75个有显著性差异的质荷比峰(P＜0.05)和71个有非常显著性差异的质荷比峰(P＜0.01)；软件包运算后,建立两个诊断模型:模型1:区分食管癌与健康对照组,由11个蛋白质峰(2 087,2 210,3 258,3 973,4 283,4 645,4 092,4 210,1 985,2 818和2 046 Da)组成,该诊断模型检测食管癌的敏感度为92.4％,特异性为87.4％；模型2:区分早期食管癌与中晚期食管癌组,由8个蛋白质峰(4 195,4 074,4 268,2 106,4 905,5 965,2 863和3 953 Da)组成,该诊断模型检测食管癌的敏感度为87.50％,特异性为89.7％.结论 运用MALDI-TOF MS技术结合磁珠分选的方法可检测食管癌血清质谱图,建立具有较高的敏感度和特异性食管癌诊断模型.
关键词： 食管癌 基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱 血清蛋白质组学 -
颅内动脉瘤患者血清蛋白组变化的研究
[目的] 寻找颅内动脉瘤患者血清中表达差异的蛋白.[方法] 采集12例血清蛋白样本(颅内动脉瘤患者4例、脑挫裂伤患者4例及正常成人本4例)用不同的CyDye染料交叉标记后依次进行双向胶内差异凝胶电泳(2-D DIGE)、图像分析及基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定.[结果] 发现胶号为1119的蛋白质点,在颅内动脉瘤患者血清中比正常成人组表达升高1.82倍(P＜0.05),而在脑挫裂伤患者血清中与正常成人的表达差异没有统计学意义(P＞0.05).该蛋白点经质谱鉴定为结合珠蛋白.[结论] 结合珠蛋白在颅内动脉瘤患者血清中表达升高,可能参与了颅内动脉瘤的形成及扩张.
