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丽水地区妇女感染人乳头瘤病毒基因型模式
目的:了解丽水地区妇女人乳头瘤病毒(HPV)基因型在宫颈疾病中的感染状况及其分布特点.方法:以该地区2008年9月19日到2011年3月15日期间2 638例妇科患者为研究对象,运用HybriXax医用核酸分子快速杂交系统进行21种HPV(6、11、16、18、31、33、35、39、42、43、44、45、51、52、53、56、58、59、66、68、CP8304)基因型的分型检测,分析常见感染亚型和分布特点.结果:研究人群HPV总阳性率为50.87％,常见的10种高危型为HPV16、52、58、33、31、53、68、CP8304、18、39型;常见的2种低危型为HPV11、6型.多重感染的比例为32.41％,其中以二重感染多见.结论:该地区HPV感染率和多重感染比例均较高,常见感染亚型总体符合亚洲人群的分布规律,又有独特的区域分布特点,值得重视.
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一起疑似食源性诺如病毒胃肠炎事件病原分子生物学特征分析
目的 研究厦门市思明区一起聚集性胃肠炎事件的诺如病毒的分子生物学特征.方法 将收集到的11份肛拭子标本及1份生蚝样品,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测诺如病毒核酸,阳性标本再进行实时荧光定量RT-PCR扩增,扩增产物经过凝胶电泳分析后,进行序列测定,确定基因型,并进行系统发育树分析.结果 11份肛拭子标本中检出5株GⅠ组诺如病毒株,2株测序成功,检出4株GⅡ组毒株,3株测序成功;1份生蚝样品中检出1株GⅠ组毒株,测序成功.对测序成功的6株毒株进行同源性分析,GⅠ.2型毒株所测序列与2014年上海株KP325648等6株参考株高度同源,GⅡ.17型毒株所测序列与2015年韩国株KT384078等8株参考株高度同源,证实这是一起由GⅠ.2和GⅡ.17型诺如病毒混合感染引起的聚集性胃肠炎事件,GⅡ.17型毒株为厦门市首次报道.结论 此次聚集性胃肠炎事件是由诺如病毒引起,且为GⅠ.2与GⅡ.17型毒株混合感染引起.
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2014-2016年济南市哨点医院食源性诺如病毒感染病例流行病学特征分析
目的 了解济南市哨点医院食源性散发腹泻病例中诺如病毒感染类型以及流行病学状况和临床特征.方法 采集2014年1月-2016年12月济南市2家食源性疾病主动监测哨点医院的腹泻病例粪便标本,并收集病例的临床症状资料和流行病学资料.结果 共收集1 292份病例标本,诺如病毒阳性率为18.58％(240/1 292),其中GⅡ基因型占75.42％ (181/240).不同性别的诺如病毒感染病例以及GⅠ和GⅡ基因型病例阳性率差异均无统计学意义(P＞0.05);2种基因型各年龄段阳性率差异有统计学意义(x2=27.912,P＜0.001;x2=42.285,P＜0.001).第一和第四季度诺如病毒阳性率高于其他季度,具有季节性分布特点.240例诺如病毒阳性病例中以单纯腹泻症状为主(54.17％,130/240),其次为腹泻+呕吐症状(18.75％,45/240);腹泻强度以中度腹泻为主(38.75％,93/240),平均腹泻频次为5.82次/d,粪便性状均以水样便为主(93.75％,225/240).诺如病毒阳性病例出现呕吐症状的比例为30.00％ (72/240),呕吐频次以1～2次/d居多.可疑暴露食物种类以内与肉制品所占比例高,其次为水产动物及其制品和乳及乳制品,占比分别为20.00％(48/240)、18.33％(44/240)和15.00％(36/240).结论 济南市食源性散发腹泻病例诺如病毒感染类型以GⅡ基因型为主,全年流行且具有明显的季节性,婴幼儿为易感人群.应针对诺如病毒感染的季节性特点,以及暴露人群易感程度的差异和暴露食品种类不同的特点,加强食源性散发腹泻病例的监测、识别和防控.
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TNF-α基因多态性与支气管哮喘及蒙汉民族差异性的研究
目的：探讨肿瘤坏死因子（TNF）-α-238位点和-308位点基因多态性，及其与支气管哮喘及蒙汉民族差异性的关系。方法：收集蒙、汉族哮喘患者和蒙、汉族健康人静脉血，提取 DNA，采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）的方法检测上述人群中TNF-α基因-238位点，-308位点基因多态性，统计分析各组基因型及等位基因频率。结果：（1）哮喘患者和健康人群TNF-α基因-238位点和-308位点A等位基因突变率无差异。（2）蒙古族和汉族TNF-α基因-238位点和-308位点A等位基因突变率无差异。（3）蒙古族与其他种族和地区人群比较 TNF-α基因-238位点和-308位点 A 等位基因突变率无差异。（4）本研究的汉族和其他种族地区人群-308位点A等位基因基因多态性相比，均有统计学差异。-238位点基因多态性分布与其他国家和地区人群相比无统计学差异。结论：哮喘患者和健康对照者间TNF-α基因-238位点和-308位点基因多态性分布无差异；蒙古族和汉族间TNF-α基因-238位点和-308位点基因多态性分布无差异；内蒙古地区汉族TNF-α基因-308位点基因多态性分布与欧洲白种人不同。
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乙型肝炎病毒DNA阳性者基因型的检测意义及与HBeAg的相关性探讨
目的:了解乙型肝炎病毒DNA阳性者基因型检测结果,基因型与HBeAg阳性或阴性的相关性.方法:收治HBV-DNA阳性患者285例,对其进行基因分型,并同时检测乙肝两对半.结果:B基因型150例(52.6％),C基因型114例(40％),BC基因型3例(1％),非BCD基因型18例(6.4％).B基因型中HBeAg阳性102例(68％),HBeAg阴性48例(32％).C基因型中HBeAg阳性72例(63％),HBeAg阴性42例(37％).结论:乙肝病毒基因分型以B、C基因型为主,符合地区流行病学分布特点,乙肝基因型与HBeAg阳性或阴性无相关性,对临床有指导意义.
关键词： 乙型肝炎病毒DNA.阳性 基因型 HBeAg 相关性 -
探讨遵义地区苗族、仡佬族与汉族HBV基因型的分布及特点
目的:探讨遵义地区苗族、仡佬族与汉族慢性乙型肝炎患者HBV基因型分布特点.方法:采用PCR-反向斑点杂交方法,对遵义地区的苗族、仡佬族与汉族慢性乙肝HBV DNA阳性患者165例进行HBV基因分型.结果:苗族、仡佬族各40例,80例患者的基因型分别为B型55例(68.7%),C型23例(28.8),BC混合型2例(2.5%);汉族85例,基因型分别为B型57例(67.1%),C型25例(29.4%),BC混合型3例(3.5%).结论:HBV的3种基因型在遵义地区苗族、仡佬族与汉族中总体分布差异无统计学意义;两者B型都占有绝对优势;C型基因在乙肝肝硬化、肝癌中的发病率高于B型基因.
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两例以抽搐为首发症状的低血糖患儿家系基因型及临床表型分析
目的 认识低血糖所诱发的抽搐发作,并对其基因型及临床表型分析,加深对高胰岛素血症的认识.方法 收集2012年和2014年分别在河南省人民医院儿科神经门诊以抽搐症状就诊的2例患儿,经抗癫痫药物(AEDs)治疗1年余效果不佳,分别进行家系全外显子检测.结果 1例患儿发现ABCC8基因突变,突变位置位于11号染色体,核酸变化:c.4607C＞T(exon38),氨基酸改变:p.A1536V,rs745918247,该遗传方式可为常染色体显性遗传,也可为常染色体隐形遗传,患儿父母亲在该位点均为野生型,该基因突变与家族性高胰岛素低血糖1型/胰岛细胞增生症相关联.另1例患儿检测结果为GLUD1基因突变,突变位置位于10号染色体,核酸变化:c.1498G＞A(exon12),氨基酸改变:p.A500T,该遗传方式为常染色体显性遗传,父母亲在该位点均为野生型,该基因突变与家族性高胰岛素低血糖6型/胰岛细胞增生症相关联.此2个基因突变位点目前国内外尚未见相关报道,为新发突变.结论 上述2个基因位点突变可能是导致低血糖抽搐的根本原因,也是AEDs控制不佳的好解释.
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人乳头瘤病毒基因亚型与宫颈病变的关系
目的:了解不同基因亚型HPV感染在宫颈病变中的作用,探讨其致病性.方法:对310例有性生活史的妇女,取宫颈分泌物,采用凯普医用核酸分子快速杂交基因分型试剂盒作病毒分型.其中102例在阴道镜下多点取活组织病理诊断,以病理诊断为金标准,评价在宫颈病变中的价值.根据病理学诊断结果分3组,正常或炎症组、低度鳞状上皮内瘤变(CIN1)组、高度鳞状上皮内瘤变组(CIN2及CIN3)包括宫颈早浸癌.根据HPV-DNA亚型分布,分析HPV感染基因型与宫颈病变程度的关系.结果:310名妇女中HPV感染102例,阳性率32.9%.正常或炎症组、低度鳞状上皮内瘤变组、高度鳞状上皮内瘤变组,HPV感染分别占48.84%(21/43)、68.75%(11/16)、93.62%(40/43),高级别组HPV感染明显高于其他两组,差异显著,P＜0.001.宫颈病变存在多重HPV感染.结论:本油区宫颈病变HPV感染常见型别是HPV-16、58、52、18、33型,并且是高度鳞状上皮内瘤变的主要致病型,多重HPV感染可能促进宫颈病变的发生.
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佛山市新生儿地中海贫血筛查及基因型分析
目的 了解佛山市新生儿地中海贫血的基因型分布特征,探讨Hb Bart's带含量尤其是临界值对α-地中海贫血分型的价值和意义. 方法 我们于2016年1月-2016年9月募集本市出生的28491名新生儿,采集其足底末梢血用血红蛋白电泳法做地中海贫血初筛,初筛阳性者召回,回来者经家长知情同意采集其静脉血做地中海贫血基因诊断. 结果 确诊地中海贫血患儿523名,其中,静止型α地中海贫血占38.4％,主要基因型为-α3.7/αα,轻型α地中海贫血占37.7％,主要基因型-SEA/αα,轻型β地中海贫血占18.7％,主要基因型为CD41-42/N.Hb Bart's带含量为0.1％的确诊阳性率53.3％,95.8％为静止型α地中海贫血,Hb Bart's带含量1％ ～5％的确诊阳性率94.8％,95.0％为轻型α地中海贫血,5％ ～ 20％的确诊阳性率100.0％,84.2％为中间型α地中海贫血. 结论 本研究阐明了佛山市新生儿地中海贫血基因型分布特征,主要为静止型α地中海贫血和轻型α地中海贫血.此外,Hb Bart's带含量对α-地中海贫血分型有一定的参考价值,但是临界值须慎重,具体分型还须做基因确诊.
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父母亚甲基四氢叶酸脱氢酶基因型对后代发生先天性心脏病的影响
目的探讨父母亚甲基四氢叶酸(CMTHFD)基因型对后代发生先天性心脏病(CHD)的影响.方法选择辽宁省192例CHD患者的父母作为病例组,同一地区年龄、性别匹配的124名正常人的父母作为对照组,采用PCR-RFLP方法检测其MTHFD G1958A位点基因多态性,比较2组的基因型频率和等位基因频率,并计算2组父母生育纯合突变后代的概率的比值.结果 CHD父母基因型频率和等位基因频率与对照组相比差异无显著性(P＞0.05);房间隔缺损母亲突变等位基因频率为10.87%,明显低于对照组28.15%(P＜0.05),OR=0.31(95%CI:0.09～0.84);房间隔缺损患者父母至少携带一个突变等位基因的比例为43.48%,亦明显低于对照组69.64%(P＜0.05),OR=0.34(95%CI:0.12～0.92);病例组和对照组父母可能生育的纯合突变胎儿占总胎儿数的比例分别为5.17%和7.04%,差异无显著性(P＞0.05).结论亲代(尤其是母亲)MTHFD G1958A位点基因突变可降低后代房间隔缺损的危险性.
关键词： 亚甲基四氢叶酸脱氢酶 基因型 先天性心脏病 -
A101/B301基因家系分析
目的：研究ABO血型表型与基因型不符的家系，分析产生该现象原因。方法采用试管法对微板法筛查出的正反定型不符血样做进一步血型血清学分析进行亚型确认。对亚型样本进行血清学分析和DNA测序，测序结果用软件比对分析后确定其基因型。结果从9278份AB型无偿献血者血样中检出AB亚型血样6例(检出率为6.5/万)，其中AelB1例、AB34例、B(A)表型1例。1例AB3亚型个体，红细胞与标准抗-B血清凝集为1+混合视野，若按血清表现型可归为ABend；但是经基因测序其基因均为A101/B301，且父代和子代也均为典型B3亚型。结论 ABO亚型确认应采用血型血清学、分子生物学和遗传学相结合的检测方法；B亚型基因与正常的A基因结合在一起表现为α-1,3D-半乳糖转移酶活性的降低，使B抗原表达量减弱。
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铜绿假单胞菌脉冲场电泳分型及对消毒剂抗性研究
为了解医院特殊病房内铜绿假单胞菌的基因型及其对常用消毒剂的抗药性,采用脉冲场凝胶电泳分型技术对其进行基因分型,并测定了其对3种常用消毒剂小抑菌浓度和小杀菌浓度.结果,30株铜绿假单胞菌可分为13个基因型(A～M).其中9个基因型铜绿假单胞菌株对一种含氯消毒剂的小抑菌浓度和小杀菌浓度均为有效氯450 mg/L;其余铜绿假单胞菌株均为400 mg/L.30株不同基因型铜绿假单胞菌对含苯扎溴铵消毒剂小抑菌浓度为80 mg/L,小杀菌浓度为160 mg/L;对碘伏消毒剂的小抑(杀)菌浓度相同,均为800 mg/L.结论,不同基因型铜绿假单胞菌对含氯消毒剂抗力不同,对其它消毒剂未显示出差别.
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杭州市肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析
目的 了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型( EV71)流行株VP1基因特征.方法 手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行病毒分离、培养；通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物,并扩增VP1区全长基因和序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建基因进化树.结果 从2008年和2011年手足口样本中分离到EV71阳性毒株各4株,VP1基因全序列测定结果显示其与C4亚型代表株核苷酸和氨基酸的相似性高,分别为93.8％～95.2％、99.0％～99.7％.结论 杭州市手足口病患者感染EV71病毒的流行株属C基因型的C4亚型.
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2010年婴幼儿腹泻轮状病毒监测分析
目的 了解乌鲁木齐地区婴幼儿轮状病毒(RV)腹泻流行情况.方法 2010年1-12月,采集门诊或住院≤5岁婴幼儿腹泻样本503份,用胶体金法和ELISA检测RV抗原,阳性样本用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行G,P基因型分型.结果 503份腹泻样本,RV阳性率为24.25%(122/503).RV感染对象主要为35月以内婴幼儿(95.08%).对102份RV阳性样本进行G/P分型,G3型是主要优势株,占46.08%,其次为G1型(34.31%),G9型(11.76%)和G2型(2.94%),混合G型感染占4.90%; P基因型以P [8]为主导,占67.65%,其次为P型混合感染(19.61%),P [4](6.86%)和P [6](4.90%),1例(0.98%)未能分型.常见的G/P组合为G3P [8](35.29%)和GlP [8] (27.45%).结论 RV是乌鲁木齐地区婴幼儿腹泻的主要病原,2010年G3P[8]和GlP [8]为主要流行基因型.
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志贺菌对喹诺酮类抗菌药物耐药性及耐药机制研究
目的 检测志贺菌对喹诺酮类抗菌药物的耐药情况,探讨染色体介导DNA旋转酶和拓扑异构酶Ⅳ基因突变存在与志贺菌喹诺酮类药物耐药性的相关性.方法 用琼脂稀释法对60株志贺菌进行耐药性检测;PCR法检测喹诺酮耐药决定区(QRDR)相关基因gyrA、gyrB、parC、parE,并对其中20株PCR扩增所得的阳性产物进行测序分析;分析志贺菌gyrA、gyrB、parC基因突变与喹诺酮类药物耐药性的关系.结果 60株志贺菌对萘啶酸、诺氟沙星、环丙沙星、左氧氟沙星的耐药率分别为90.0%、35.0%、28.3%和15.0%;测序结果显示gyrA、gyrB、parC基因突变率分别为85%、30%和100%,parE基因未发现突变.结论 志贺菌对喹诺酮类耐药严重;靶基因突变是喹诺酮类药物耐药的主要机制之一,以DNA旋转酶GyrA基因突变为主,DNA拓扑异构酶IV parC基因突变次之.
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乌鲁木齐市2011年婴幼儿腹泻轮状病毒感染监测
目的 了解乌鲁木齐地区婴幼儿腹泻轮状病毒(RV)感染流行情况.方法 2011年1～12月,采集门诊或住院≤5岁婴幼儿腹泻样本419例,用胶体金和ELISA法检测RV抗原,阳性样用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行G、P基因型分型.结果 419例腹泻患儿,RV阳性率为24.3％ (102/419),主要感染对象为24月以内婴幼儿(占92.2％).对100份RV阳性样本进行G/P基因型分型,结果显示:G1和G9型为主要流行株,分别占26％,其次为G2型(1 9％)和G3型(11％)；混合G型感染占7％,其中首次检到G4以混合感染形式存在3例；未能G分型达11％.P基因型以P[8]为主占55％,其次为P[4](21％)和P[6](16％)；P型混合感染占6％；2例(2％)未能分型.主要的G/P基因型组合依次为GIP[8] (25％),G2P[4] (18％),G9P[8] (13％)、G9P[6] (11％)和G3P[8](11％).结论 2011年乌鲁木齐地区婴幼儿腹泻轮状病毒流行基因型多样,G9型和G2型明显上升,值得高度关注.持续监测优显重要.
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戊肝病毒(HEV)在猪和牛群中的流行病学研究
目的探讨戊型肝炎病毒(HEV)在猪和牛群中的感染情况.方法用抗-HEV抗体试剂盒检测猪和牛血清中的抗体;对部分血清用逆转录聚合酶链的方法(RT-PCR)检测HEV RNA,并对PCR阳性产物进行克隆测序,然后将序列进行分析.结果281份猪血清中有235份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为83.6%;其中56份血清中有3份为HEV RNA阳性,序列分析显示从猪中克隆的3株序列(SB 2、SH1和SJ 14)之间在ORF 2(6007-6354bp)区域的核苷酸序列的同源性为83%～86%,该3株序列在ORF2区与1,2,3,4型的同源性分别为74%～79%、73%～77%,73%～76%和83%～93%;190份牛血清中有12份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为6.3%.结论HEV在猪和牛群中均有流行,但在猪群中的流行率明显高于牛群.猪感染的HEV的基因序列与人群中散发性戊型肝炎病毒的4型同源性高.
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云南瑞丽口岸入境驾驶员中HIV-1基因型分布与新重组型发现
目的 了解云南省瑞丽口岸入境驾驶员主要流行HIV-1基因型的分布情况.方法 对云南瑞丽25例HIV-1抗体阳性的入境驾驶员血清样本,用RT-Nested PCR方法扩增HIV-1 gag(1 155bp)、gag-prot(885bp)、RT(1 010bp)基因片段,经核酸序列测定与拼接后,进行同源关系分析,确定其基因型,并进行重组型分析并确定重组位点.结果 在本研究的25例样本中,5例PCR扩增为阴性,未能有效分型.20例确定基因型的样本中,CRF01_AE比例高(40.00％),其次为C亚型(25.00％)、B亚型(5.00％)、CRF07_ BC (5.00％)和CRF08_BC (5.00％),还有4份为未知重组型(20.00％).重组位点分析发现,这4例未知重组是以CRF01_AE为骨架,嵌入部分B或C亚型的基因片段,是在01_AE重组的基础上发生的二代重组.结论 瑞丽口岸入境驾驶员中流行的HIV-1以CRF01_AE为主,C、B亚型及CRF07_BC/CRF08_BC同时存在,并出现以CRF01_AE为母株嵌入其他毒株基因片段的两种新型重组,该人群中HIV-1基因型分布的复杂性正影响我国云南地区艾滋病分子流行病学特性.
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上海市静安区2010-2014年结核杆菌耐药状况及传播特征研究
目的 了解上海市静安区结核病传播特征及结核分枝杆菌耐药情况,为制定有针对性的结核病控制策略提供依据.方法 选择上海市疾病预防控制中心菌株库保存的2010-2014年静安区结核病患者菌株,通过药物敏感性试验和可变数目串联重复序列分型,后纳入70株菌株进行耐药、VNTR基因型分型结果分析.结果 总耐药率为30.00％ (21/70),总耐多药率为15.71％ (11/70),单耐药率为12.86％ (9/70),多耐药率为1.43％ (1/70).无单耐利福平和单耐乙胺丁醇.初治与复治患者、男性与女性患者、＜65岁与≥65岁患者耐药率和耐多药率差异无统计学意义(P＞0.05).70株菌株共得到57种VNTR基因型,其中50例患者的分离株为单一基因型,其他20例患者的菌株可归人7个基因簇,总成簇率为28.57％ (20/70),同簇病例中有2簇存在家庭内接触,有5簇居住地间的直线距离在1.7 km以内.耐多药菌株成簇率高于全敏感结核菌株(X2 =9.406,P=0.004),差异有统计学意义.结论 上海市静安区结核分枝杆菌的耐多药率较高,结核病患者中存在一定比例的近期传播,耐多药肺结核近期传播程度较高,高于全敏感结核.
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湖北地区丙型肝炎病毒基因型分布及流行病学特征
目的 分析湖北地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布及其流行病学特征.方法 收集2013年5月至2016年3月在华中科技大学同济医学院附属同济医院接受HCV基因分型检查的丙肝患者血清及相关流行病学资料.采用实时荧光定量PCR对HCV RNA进行测定;采用巢式RT-PCR对HCV RNA阳性样本的核心区(core-e1)进行扩增并测序;对所测序列进行基因分型和进化树分析,并对各基因型相关的危险因素进行综合分析.结果 共有HCV RNA阳性310例,测序223例,测序结果显示湖北地区存在5种基因型,1b型178例(79.82％),2a型32例(14.35％),6a型8例(3.59％),3b型4例(1.79％),3a型1例(0.45％).1b、2a型主要见于1997年以前的有偿供血者和输血者;2a还多见于通过性接触传播的人群;6a、3b和3a型仅见于静脉注射毒品者.结论 湖北地区HCV基因型分布呈现多样性且与传播途径密切相关,有关各方应予以关注及干预.
