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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术在医学中的应用
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术是近几年兴起的一个新方法.它是一种基于质谱技术与蛋白质芯片技术结合的研究方法,为研究蛋白质的结构、属性和功能提供了可靠的技术平台.
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在食品微生物检测和鉴定中应用的一种质谱新技术
基质辅助激光解析电离(MALDI)是近年来发展的一种新的软电离技术,常与飞行时间质谱(TOF-MS)联用,称为基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS).它具有快速、灵敏和高通量等特点,被广泛应用于生命科学及其他领域.全细胞或细胞裂解产物经MALDI-TOF-MS分析得到的指纹图谱可完成对细菌、真菌及病毒的检测及鉴定.
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海洋弧菌鉴定方法学评价
近年来,由海洋细菌导致的感染越来越常见,弧菌是海洋细菌中常见的类群之一,可引起人类腹泻、菌血症及外伤感染,严重时可导致死亡。目前,对海洋弧菌尚缺乏快速可靠的鉴定方法。16S rRNA 序列分析目前被公认为细菌鉴定的金标准。然而由于海洋细菌进化缓慢,且基因具有高同源性,16S rRNA 测序并不能对海洋弧菌进行可靠鉴定。编码 RNA 聚合酶β亚基的基因 rpoB 为序列较长的单拷贝基因,可以克服16S rRNA 的高度保守性。至今为止,许多研究已经证明 rpoB 基因可用于各种细菌的分类,包括芽孢杆菌、军团菌、分枝杆菌、葡萄球菌等[1]。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱( matrix-assisted laser desorption / ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF/ TOF MS)技术是近年发展起来的一种全新的用于微生物快速鉴定的技术,具有快速、稳定、准确、重复性好的特点。为促进海洋弧菌的快速可靠鉴定,本研究利用16S rRNA 测序、rpoB 测序和MALDI- TOF/ TOF MS 3种技术对128株海洋弧菌同时进行鉴定,对比分析检测结果并进行方法学评估。
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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱与细菌的快速鉴定
用传统的方法鉴别细菌往往需要较长的时间(≥48h)和复杂的程序,不利于细菌的快速鉴定.基质辅助激光解析电离飞行时间质谱是近采用的用于细菌检测的生物质谱技术,可以对完整的细菌进行检测.这种技术以激光作为能量来源,将待测细菌的表面成分解析为离子,产生重现性很好的质谱图.将未知细菌质谱图与细菌质谱图库进行比较,可以达到对细菌进行鉴别的目的.此种质谱技术的应用,对微生物的快速鉴别有重要意义.
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结直肠癌分类树模型建立的初步探讨
本研究采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术对结直肠癌Dukes B、C、D期患者、结直肠良性疾病患者和正常人血清中的蛋白质进行对比分析,建立用于在普通人群中诊断Dukes B、C、D期结直肠癌的分类树模型,并探讨其临床意义.
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应用蛋白芯片技术探索乙型肝炎相关肝癌诊断新方法
表面加强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术可将蛋白质沉析在芯片表面,离子化后用飞行时间质谱进行检测[1].这一技术操作简单,可直接检测体液,具有快速、高通量、准确等优点.
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食管癌易感性与丝氨酸苏氨酸激酶15T+91A基因多态性的关系
既往研究结果显示遗传因素在食管癌的发病过程中起重要作用[1].丝氨酸苏氨酸激酶15(Aurora-A/STK 15,又称STK15)基因参与调节G2/M期转换,在有丝分裂的正常进行中发挥重要作用,其扩增和过表达使中心体异常扩增,导致染色体的异常分配及不稳定,终癌基因激活,导致肿瘤产生,因此进行STK15T+91A基因多态性与食管癌发生易感性的研究很有必要.我们应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱( MALDI-TOF MS)技术,探讨STK15单核苷酸多态性与食管癌发生危险因素的相关性.
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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在微生物检测中的应用进展
目前,临床微生物实验室鉴定细菌主要依赖于传统的生物化学、分子生物学和形态学等方法[1]。基于单菌落的生化特征鉴定耗时长,不能满足临床对检测结果时效性的要求;基于分子生物学方法进行微生物鉴定大大地提高了灵敏度和时效性,但对工作人员技术要求高,检测成本高,仅针对某些特定细菌,难以满足临床常规要求[2]。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption /ionizationtime -of -flight mass spectrometry,MALDI -TOF MS)以其操作简便、自动化、快速、高通量等优势受到青睐,成为了一种新的微生物鉴定方法。由于仪器昂贵,一次性投入成本高,MALDI -TOF MS 在国外临床微生物实验室的应用尚未普及,而在国内临床微生物检验中的应用刚刚起步。MALDI -TOF MS 以其固有的优势进入临床微生物诊断,将彻底改变微生物实验室的面貌。因此,了解并引进该技术用于快速低成本鉴定临床分离菌株是国内临床微生物工作者的迫切需要。本文就该技术和两种常用质谱系统在临床微生物实验室用于鉴定各种常见或重要细菌和真菌纯菌落,以及应用该技术直接检测临床标本中的细菌和真菌等方面作一综述,以便国内临床微生物工作者初步了解MALDI -TOF MS 在临床微生物诊断的应用和价值,并且基于实验室情况选择合适的质谱系统。
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围手术期肺癌患者血浆特异蛋白质的筛选
肺癌作为威胁全世界人类健康的重大疾病,其死亡率高达13%,且呈逐渐上升趋势[1].虽然在常见肿瘤标志物中肺癌标志物多,其中包括蛋白质、内分泌物质、酶、肽类和各种抗原物质,但总的来说均缺乏特异性,只能作为观察病情变化的参考指标[2].我们应用表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肺癌及对照组血浆标本,以期寻找高表达的差异蛋白质.
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精神分裂症的分子诊断新方法
泸州医学院附属医院检验科利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术发现了一组对精神分裂症的早期预警、鉴别诊断、治疗观察具有重要意义的蛋白标志物.