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酵母转录因子结合位点保守性的生物信息学分析

沈霞;冯居君;谭从娥

摘要: 目的:本研究拟发掘出酵母基因组中转录因子结合位点的保守性位点和规律.方法:本研究采用生物信息学中保守性模体参数Mi分析基因上游不同区域与真核生物转录因子结合位点保守性之间的关系.结果:转录因子Sok2、Swi4结合位点的保守性在基因转录起始位点上游各个区间的差异主要由其本身的序列特性决定.此外,本研究分别发掘出转录因子Sok2、Swi4结合位点的保守性位点.结论:本研究结果有助于提供新的参数用以改进现有预测转录因子结合位点的方法,在此基础上为深入研究真核生物的转录水平调控模式奠定理论基础.

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