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  • 中国壮族群体人类白细胞抗原HLA-CW基因遗传多态性的测序分型研究

    作者:王大明;高素青;戎红辉;徐筠娉;邓志辉

    本研究探讨壮族人群HLA-Cw基因的遗传多态性.采用自行建立的HLA-Cw基因测序分型方法,对150份壮族非血缘个体血样HLA-Cw基因的第2、3、4外显子进行序列测定;测序反应产物用ABI PrismTM3730测序仪电泳检测,用Assign3.5分析软件分析结果.结果表明:经Assign 3.5软件分析,能直接分析出明确的HLA-Cw基因型的样本占33.33%;排除罕见等位基因后,可判定HLA-Cw基因型的样本占63.33%;其余的5份样本(3.33%)经PCR-SSP高分辨分型试剂盒检测后,可判定基因型;共检出了16种HLA-Cw等位基因,频率大于10%的4种常见等位基因为Cw*0304>Cw*0102>Cw*0801>Cw*0702,基因多样性(gene diversity,GD)为0.9297.Cw*01,03,07,08,12,14(Cw 1组)与Cw*02,04,05,06,15,16,17,18(Cw 2组)的频率分别为0.8967和0.1032,与KIR的识别方式以Cw 1组等位基因为主.在检出的51种基因型中,纯合子比例占9.33%(14/150),基因型频率的分布符合Hardy-Weinberg定律.结论:本研究所得到的壮族群体HLA-Cw位点的等位基因频率及其分布特点,可为人类学、HLA-Cw基因与疾病关联等研究提供基础数据.

  • 中国南方汉族人群中一个常见型新等位基因HLA-C*08∶22的基因频率调查和分析

    作者:鲍自谦;王大明;邓志辉;徐筠娉

    本研究调查南方汉族人群中1个常见型的HLA新等位基因C*08∶22的基因频率.对163份南方汉族无血缘关系个体血样进行常规的HLA-C基因第2、第3和第4外显子测序分型;对所检出的32份带有C*08∶01∶01/08∶22模棱两可结果的样本,进一步增加HLA-C基因的第5和第6外显子测序.在C*08∶22被发现和获得WHOHLA因子命名委员会认可前,对40例被鉴定携带C*08∶01∶01等位基因的无血缘关系供/受者进行HLA-C基因外显子2-6再测序.所有的序列均导入Assign 3.5 SBT软件,分析等位基因型.结果表明,32份无血缘关系个体检出C* 08∶01∶01/08∶22模棱两可结果的样本中,发现3例样本鉴定为C*08∶22,南方汉族无血缘关系个体中C*08∶22的基因频率为0.92%.回顾性分析以往40例携带C*08∶01∶01等位基因的无血缘关系供/受者对发现,其中2对供/受者实际为C*08∶22.结论:C*08∶22在南方汉族中为常见型的HLA等位基因,当测序分型出现C*08∶01∶01/08∶22模棱两可的结果时,不能轻易视为罕见型等位基因而错误地排除.

  • 三氯乙烯药疹样皮炎患者携带HLA-B*13∶01等位基因情况与外周血白细胞计数指标的关联分析

    作者:林大枫;王佃鹏;杨炎桦;李培茂;张志敏;张艳芳;黄先青

    目的 探讨三氯乙烯药疹样皮炎患者携带HLA-B* 13∶01等位基因情况与外周血中白细胞计数指标的关联.方法 连续选取2014年1月-2016年10月入院接受诊疗的20名三氯乙烯药疹样皮炎患者作为研究对象.采用测序分型方法检测研究对象外周血DNA样本中HLA-B*13∶01等位基因.分析携带和不携带HLA-B*13∶01基因患者外周血白细胞计数大值、淋巴细胞计数大值、单核细胞计数大值、中性粒细胞计数大值、嗜酸粒细胞计数大值和嗜碱粒细胞计数大值的差异,以及携带HLA-B* 13∶01等位基因数目与上述白细胞计数指标的相关性.结果 研究对象中不携带HLA-B* 13∶01等位基因、携带HLA-B*13∶01杂合子和纯合子者分别占20.0%、70.0%和10.0%.HLA-B* 13∶01携带者与非携带者的白细胞计数指标相比,差异无统计学意义;携带HLA-B*13∶01等位基因数目与白细胞计数指标无显著相关性.结论 该研究人群中未发现携带HLA-B*13∶01等位基因情况与外周血白细胞计数指标有关联,研究结果还需要在更大样本量人群中作进一步验证.

  • 4例人类白细胞抗原罕见等位基因的结果分析

    作者:王大明;何柳媚;邹红岩;高素青

    背景:虽然国内与国外关于新等位基因的报道较多,但是,因某些等位基因首次发现较晚,而后却再次被检测到,并且等位基因频率很低,此类相关文章报道甚少,这些等位基因往往被忽视。目的:检测与确认4例临床移植配型供受者携带的罕见等位基因。方法:采用快速 DNA提取试剂盒从全血样本中提取基因组DNA,经人类白细胞抗原基因商品化测序分型试剂盒检测和SSP高分辨试剂盒验证,得到人类白细胞抗原高分辨分型结果。结果与结论:被检测到的4个罕见等位基因分别为B*27:15、B*51:39、C*07:66和C*08:22。对于以上4个等位基因虽被美国骨髓库列为罕见等位基因,但在中国可能并不罕见。事实证明,被美国骨髓库列为罕见等位基因的C*08:22为中国汉族人群常见等位基因。

  • 造血干细胞移植志愿捐献者罕见基因人类白细胞抗原C*08:99的测序分析

    作者:王大明;邹红岩;聂冬梅;高素青;王飞

    背景:随着测序技术被广泛应用,器官移植配型的高分辨确认工作逐渐深入开展,人类白细胞抗原新等位基因不断涌现,但由于发现较晚,基因频率还不能准确计算,相关报道甚少,这些基因常被忽视,有时单纯根据基因频率判断分型结果,易造成分型结果的误判。目的:检测与分析1例造血干细胞移植志愿捐献者携带的罕见等位基因人类白细胞抗原C*08:99。方法:采用快速DNA提取试剂盒从全血样本中提取基因组DNA,经人类白细胞抗原C基因商品化测序分型试剂盒扩增,纯化后的扩增产物作为模板由试剂盒配套的第2,3和4外显子常规检测区正反向测序引物及自行研制的非常规检测区第5外显子正反向、第6外显子正向和第7外显子反向测序,经乙醇/醋酸钠/EDTA纯化的测序反应产物于ABI PrismTM 3730测序仪电泳检测,相关的Assign 3.6+分析软件予以人类白细胞抗原高分辨水平基因分型。结果与结论:①将电泳后的数据导入Assign-SBT 3.6+分析软件,得出的分型结果为C*07:04,08:99。②结果证实,临床移植配型人类白细胞抗原C基因分型增加第5,6,7外显子区域外的多态性检测可提高分型结果的准确性,对临床组织配型工作具有重要意义。

  • 辽宁地区汉族人群HLA-DRB1位点的测序分型研究

    作者:韩世新;李久宏;王岩;毕桂姣;尚英彬;耿龙;曹凯;宋芳吉

    [目的] 调查辽宁地区人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1位点等位基因多态性,获得完整准确的遗传学数据.[方法] 应用聚合酶链反应-直接测序方法(PCR-SBT)对108名健康个体进行HLA-DRB1基因型检测.[结果] 检出DRB1等位基因亚型33个,其中等位基因DRB1*07011,*15011,*09012,*11011,*12021的频率较高.[结论] 提供了辽宁汉族人群HLA-DRB1位点等位基因频率,证实了PCR-SBT分型方法快速准确的优点.

  • 人类白细胞抗原新等位基因A*24:257序列及其编码蛋白分子三维结构模拟分析

    作者:聂向民

    目的 鉴定分析人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因A*24:257的序列变异及其氨基酸残基改变在其编码蛋白分子三维空间结构中的位置及影响.方法 应用PCR-SBT测序分型技术发现1例等位基因结果 异常样本,采用单等位基因特异性测序进行鉴定.应用Phyre2蛋白折叠识别在线建模服务器以及RasMol和PDB Protein Workshop分析软件,对其编码蛋白分子三级结构及其氨基酸残基改变特点在MHC分子三维空间结构中所处位置及可能影响进行模拟分析.结果样本A*24:198等位基因第2外显子第155位核苷酸碱基发生了T->A碱基替代.导致相应的第28位密码子由GTG→GAG.其编码氨基酸由缬氨酸(Val,V)变为谷氨酸(Glu,E).与A*24:02:01相比,A*24:257第28位编码氨基酸由中性缬氨酸(V)→酸性谷氨酸(E),第29位由酸性天冬氨酸(D)→中性天冬酰胺(N).其编码蛋白分子三级结构建模分析表明,该氨基酸变异位置位于 α1结构域β折叠片层底面的外侧第3β股链近转角处,接近抗原多肽结合槽中心外缘区域.结论 该等位基因序列被WHO HLA因子命名委员会正式命名A*24:257.分析预测其编码氨基酸改变将可能影响A*02:257分子的抗原多肽结合及呈递功能.

  • 微生物测序分型系统——基于美国应用生物系统公司基因分析仪的MicroSeq(R)微生物鉴定系统

    作者:王博飞;梁晓媛;杨林森

    当微生物危害人类健康时,需要依靠高效、快速、高精确性的微生物鉴定系统检测.为了获得可靠的结果,越来越多的制药公司、食品企业和公共卫生实验室、相关医院卫生系统依靠DNA 测序法来进行微生物鉴定.

  • HLA-Cw基因测序分型的研究

    作者:蓝欲晓;邓志辉

    目的 建立HLA-Cw位点测序分型技术,以用于无关供/受者HLA-Cw基因配型等基础应用研究.方法 对HLA-Cw位点的第2和第3外显子,设计、合成一对PCR引物和4条测序引物,探索佳的PCR反应体系和扩增条件,采用PCR引物扩增HLA-Cw基因的第2、第3外显子和第2内含子,扩增产物经纯化后作为测序模板,进行4个测序反应,产物经酒精/EDTA/NaAc法纯化,用ABI PrismTM3100测序仪电泳检测,相关的分析软件分析HLA基因型.检测分型结果的可靠性采用基因型已知的U-CLA国际HLA室间质控的DNA样本进行验证.结果 检测6例UCLA国际HLA室间质控的DNA样本,HLA-Cw等位基因型与UCLA公布的结果完全一致.结论 本文的HLA-Cw基因测序分型方法准确、可靠,具有广泛的应用前景.

  • HLA-DPA1和-DPB1基因第2、第3外显子同步测序分型的研究

    作者:鲍自谦;蔡思齐;钟艳平;陈瑞;甄建新;邓志辉

    目的:建立可靠的HLA-DPA1和-DPB1基因第2、第3外显子同步测序分型的方法.方法:采用一对位点特异性引物扩增HLA-DPA1基因的第2外显子、第2内含子、第3外显子及其两翼的部分内含子序列,采用2对位点特异性引物扩增HLA-DPB1目的基因片段:第1对引物扩增HLA-DPB1基因第2外显子及两翼的部分内含子序列,第2对引物扩增HLA-DPB1基因第3外显子及两翼的部分内含子序列.PCR产物经核酸外切酶和碱性磷酸酶纯化,用本文的测序引物分别对HLA-DPA1和-DPB1第2、第3外显子进行双向测序.纯化的测序反应产物,经ABI 3730测序仪电泳,用Assign 4.7.1分析软件判定基因型.结果:HLA-DPA1及-DPB1基因的PCR扩增获得了清晰的目的条带,对其第2、第3外显子进行测序,所获的序列中无背景杂峰.用本文的方法对随机的96人份造血干细胞志愿捐献者标本进行HLA-DPB1测序分型,与采用SeCoreTM DPB1商品化测序分型试剂盒平行对照检测的结果相一致.结论:本文的方法在群体遗传学及疾病关联研究等领域具有广泛的使用价值.

  • 磁珠提取DNA改良法在HLA测序分型中的应用

    作者:夏家安;李王霞;马严

    目的:建立并改良磁珠提取基因DNA的方法,以应用于HLA常规测序分型.方法:使用磁珠法自动提取系统从全血中提取基因组DNA,利用DNA定量仪测定DNA浓度与纯度,利用测序仪对PCR扩增产物进行测序及相关的分析软件进行HLA分型结果分析.比较改良前后DNA浓度与纯度、HLA分型结果成功率、信噪比及测序胶图的反应格局.结果:改良后96份DNA浓度的均一性、纯度均优于改良前;32份HLA分型结果中HLA-A、B位点成功率改良后高于改良前,差异有统计学意义(P<0.01);改良后32人份HLA-B第二外显子信噪比(N/S)合格率均高于改良前,差异有统计学意义(P<0.01);改良后32份分型胶图反应格局均优于改良前.结论:改良磁珠提取DNA法能稳定、可靠地应用于HLA测序分型,具有快速、高通量化的特点和广泛的应用前景.

  • 单管扩增测序分型技术用于人类白细胞抗原-DRB1基因分型的研究

    作者:陈耿臻;郭钊轩;许铭炎;翁惠兰;吴丽娥

    目的:用单管PCR扩增方法建立高效的人类白细胞抗原(HLA)-DRB1基因测序分型技术并探讨其应用价值.方法:合成7个5'端特异性扩增引物和一个3'端共用引物,将上述引物混合在一起组成单个PCR反应用于120个临床样本的HLA-DRB1的DNA测序分型.结果:本组样本都能成功分型,且结果准确,重复性好.结论:本法改进了测序分型技术,具有高分辨率、高特异性和高效率的特点,值得推广应用.

  • 中国南方汉族人群KIR2DS4基因的多态性

    作者:甄建新;张国彬;喻琼;何柳媚;徐筠娉;邹红岩;邓志辉

    目的 探讨南方汉族人群KIR2DS4分子遗传多态性.方法 应用特异性PCR引物扩增306名无关个体KIR2DS4基因的全部外显子,确定KIR2DS4框架基因的有无.对存在KIR2DS4的样本,对该基因的全部外显子进行双向测序,用Assign 3.5分析软件鉴定基因型.在测序分型中出现与国际IPD-KIR数据库不完全匹配结果的样本,进行cDNA分子克隆和单倍型测序.结果 306名南方汉族无关个体中,携带KIR2DS4基因的个体为297例,经测序分型,均获得了清晰的序列峰图.共检出了7种等位基因,其中3个新等位基因被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名.检出的等位基因及其频率分别为KIR2DS4* 00101(78.8%)、*003 (10.5%)、*004 (16.0%)、*010 (23.2%)、*017(0.3%)、* 00105(0.3%)和*018(0.7%),未检出KIR2DS4* 007等位基因.能正常表达于细胞表面的等位基因(KIR2DS4* 00101、*017、*00105)和不能正常表达于细胞表面的等位基因(KIR2DS4* 003、*004、*010、*018)的检出比例分别为79.4%及50.4%,约为1.6∶1.结论 获得了南方汉族人群KIR2DS4等位基因分子遗传多态性,可为移植、疾病关联研究及人类进化等提供基础数据.

  • HLA测序分型中模棱两可结果的分析及其解决策略

    作者:王大明;何柳媚;邹红岩;高素青;邓志辉

    目的 探讨无关供-受者器官移植人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)高分辨分型确认实验中,HLA测序分型模棱两可结果的种类、比例及高效解决方法.方法 采用美国Atria公司的HLA测序分型试剂盒,对650人份无关供-受者样本的HLA-A、B、C基因第2、3和4外显子,HLA-DRB1第2外显子及HLA-DQB1第2、3外显子进行常规检测,统计常见模棱两可等位基因种类及比例,再应用PCR序列特异性引物(squence specific primer,PCR-SSP)高分辨试剂盒或增加常规检测区外的外显子进行再测序分型(sequencing-based typing,SBT),以获得精确的HLA高分辨分型结果.结果 650人份供-受者的HLA-A、B、C、DRB1及DQB1基因的直接测序分型出现模棱两可比例分别为76.31% (496/650),91.08% (592/650),97.69% (635/650),88.62% (576/650)和43.38% (141/650).共发现常规检测区内模棱两可等位基因型组合36种,常规检测区外模棱两可等位基因组合22种.依据中国常见及确认的(common and well-documented,CWD) HLA等位基因表(1.01版),排除罕见等位基因后,共有9种模棱两可CWD组合,除了HLA-B、C位点包括等3种外,其余的3个位点各出现1种;检测区外模棱两可等位基因组合减少为10种,其中HLA-A、B位点各1种,HLA-C、-DRB1位点各4种.所有模棱两可结果采用高分辨PCR-SSP或PCR-SBT方法进行必要的复核确认.结论 分析了HLA 5个位点测序分型中模棱两可结果的常见种类,采用相应的解决策略,可以达到高效、低耗、精确分型的目的.

  • KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序及一个新等位基因的鉴定

    作者:孙革;王畅;甄建新;张国彬;徐筠娉;邓志辉

    目的:建立KIR2DL1框架基因 cDNA 的分子克隆测序方法,并鉴定南方汉族人群一个新的KIR2DL1等位基因。方法对一KIR2DL1框架基因测序分型结果异常的外周血样,提取 mRNA,反转录为 cDNA,用1对KIR2DL1框架基因特异性 PCR 引物进行扩增,特异性扩增产物(1.2 kb)经切胶回收纯化后,进行分子克隆和单倍型测序。结果KIR2DL1特异性 PCR 扩增产物,经分子克隆和单倍型测序,检出1个正常的KIR2DL1?00302等位基因和1个新变异的KIR2DL1等位基因。该新等位基因的序列与KIR2DL1?00302相近,但存在编码区 nt 188 A>G 点突变、位于第4外显子的第42密码子由 GAG 变成 GGG,导致第42位氨基酸残基发生 Glu42Gly 改变;其序列提交 GenBank(序列号:KP025960)和 IPD-KIR 数据库(IWS40001982),已被世界卫生组织 HLA 因子命名委员会 KIR 分委会正式命名为KIR2DL1?031。结论我们建立了KIR2DL1框架基因 cDNA 分子克隆测序方法,在等位基因水平的 KIR 研究中具有广泛的应用前景。

  • 南方汉族人群HLA-DPA1及-DPB1基因多态性与青光眼睫状体炎综合征的关联研究

    作者:赵军;祝天辉;何柳媚;申晓丽;王彦君;邓志辉

    目的 探讨HLA-DPA1和-DPB1基因多态性与南方汉族人群青光眼睫状体炎综合征(Posner-Schlossman syndrome,PSS)的相关性.方法 实验组为确诊为PSS的南方汉族患者100例,对照组为南方汉族健康志愿捐血者128名.应用测序分型法对全部血样进行HLA-DPA1和-DPB1基因第2外显子双向测序.用Assign 3.5 HLA测序分型软件判定等位基因型,比较实验组和对照组HLA-DPA1和-DPB1等位基因及单倍体的频率.结果 在实验组及对照组中分别检出6个及4个HLA-DPA1等位基因,实验组HLA-DPA1*02:01等位基因频率(4.5%)显著低于对照组(12.109%)(x2=8.124,P=0.004);实验组及对照组均分别检出16个HLA-DPB1等位基因,实验组HLA-DPB1*14:01及-DPB1*17 01等位基因频率均显著低于对照组(DPB1*14:01:1.00% vs.4.688%,x2=5.130,P=0.024;DPB1*17:01:0% vs.2.344%,x2=3.897,P=o.048);实验组及对照组DPA1-DPB1单倍体数量分别为23种及25种,实验组DPA1*02:01-DPB1*14:01及DPA1*02:01-DPB1*17:01单倍体的频率均显著低于对照组.结论 DPA1*02:01-DPB1*14:01及DPA1*02:01-DPB1 *17:01单倍体可能为南方汉族人群PSS发病的保护因素.

  • 测序分型中2例样本HLA-DQB1等位基因第2外显子PCR扩增丢失及其原因分析

    作者:高素青;王大明;徐筠娉;邓志辉

    目的 探讨HLA-DQB1基因测序分型时等位基因漏检和丢失的原因,以进一步提高HLA测序分型的准确性.方法 对2000份HLA高分辨组织配型血样,采用AlleleSEQR HLA-DQB1测序分型试剂盒进行常规检测.对序列峰图“异常”及无完全匹配结果的样本,进一步采用PCR-rSSO流式磁珠法复检,同时采用自行设计的特异性引物进行PCR产物分子克隆和测序,进行单倍型序列分析.结果 在2000份经AlleleSEQR HLA-DQB1测序分型的样本中,共发现2例样本序列峰图“异常”.经PCR-rSSO流式磁珠法和自行设计的引物测序复检,确认其为杂合型样本.PCR产物分子克隆和单倍型序列分析证实,第1份样本为第2外显子PCR扩增丢失HLA-DQB1*02:02等位基因序列.第2份样本为第2外显子PCR扩增丢失HLA-DQB1*02:01:01等位基因序列,未发现新的碱基突变.结论 HLA-DQB1基因测序分型时,因DQB1基因存在优势扩增现象,可导致HLA-DQB1第2外显子等位基因的漏检和丢失.上述发现将为HLA精确分型提供借鉴.

  • HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因全相合的无关供-受者对的HLA-DPA1和-DPB1基因匹配性研究

    作者:甄建新;邹红岩;金士正;高素青;王大明;何柳媚;邓志辉

    目的 研究HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因全相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因的匹配性.方法 对76对HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因10/10相合的无关供-受者样本进行HLA-DPA1和-DPB1基因测序分型,从等位基因水平统计和分析HLA-DPA1和-DPB1基因匹配的比例和特点.结果 单个HLA-DPA1、-DPB1基因高分辨水平完全相合的比例分别为17.1%、9.2%,完全相合的比例均较低.HLA-DPA1等位基因半相合的比例占绝大多数(73.7%),完全不合的比例为9.2%;具有高度多态性的HLA-DPB1基因半相合的比例为57.9%,而完全不合的比例为32.9%.统计HLA-DPA1+-DPB1等位基因的匹配率,2/4相合的比例高(51.4%),4/4相合的比例仅为5.6%,而0/4相合的比例为8.3%.结论 HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因匹配率尚较低,HLA-DPA1和-DPB1基因匹配程度对无关供者造血干细胞移植的影响应引起临床的重视和探讨.

  • 人类白细胞抗原HLA-DPA1和HLA-DPB1基因高通量测序分型的研究

    作者:喻琼;王大明;邓志辉

    目的 建立可靠的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因HLA-DPA1和HLA-DPB1同步测序分型方法,研究南方汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1基因的多态性.方法 根据HLA-DPA1和HLA-DPBI等位基因的全长序列,分别采用位点特异性引物扩增HLA-DPA1和HLA-DPBI目的基因片段,涵盖完整的第2外显子.PCR产物经磁珠纯化,用自行设计的测序引物及优化的测序反应体系对HLA-DPA1和HLA-DPB1第2外显子进行双向测序.纯化的测序反应产物经ABI 3730测序仪测序,用Assign 3.5 SBT软件分析结果.结果 PCR扩增获得了清晰的HLA-DPA1和HLA-DPB1基因目的片段,对HLA-DPA1和HLA-DPB1基因的第2外显子进行的双向测序结果中,序列无背景信号和杂峰.在176名南方汉族健康无关个体中,共检出了4种HLA-DPA1等位基因,其频率分布依次为:DPAI* 02:02(0.589)>DPAl* 01:03(0.284)> DPAI* 02:01(0.096)> DPAl* 04:01(0.031).HLA-DPB1检出了14种等位基因,其中频率大于5%的4种等位基因为:DPBl* 05:01、DPBl* 02:01、DPBl* 04:01和DPBl* 02:02,频率介于1%~5%的7种,其余3种等位基因的频率均为1%以下.HLA-DPB1测序分型的结果与用AtriaAlleleSEQR商品化测序分型试剂盒检测的结果一致.结论 建立了HLA-DPA1及HLA-DPB1测序分型的方法,在群体遗传学及疾病关联研究等领域具有广泛的实用价值.

  • 五例样本HLA-C基因测序分型中等位基因丢失及其原因分析

    作者:曾健强;徐筠娉;王大明;邹红岩;邓志辉;杨宝成

    目的 探讨HLA-C基因测序分型时等位基因漏检和丢失的原因,以提高HLA测序分型的成功率和准确性.方法 620份随机选择的深圳健康捐血者血样,采用AlleleSEQR HLA-C plus测序分型试剂盒进行检测,对无完全匹配、分型结果"异常"的标本,采用分子克隆和测序方法进行全长单倍体序列分析;对未检出新的碱基点突变的样本,进一步采用自行设计的PCR引物和AlleleSEQR试剂盒中的测序引物进行再测序,分析测序分型结果"异常"的原因.结果 620份经AlleleSEQR HLA-C测序分型的样本中,发现5例样本无完全匹配的基因型,与之接近的多种等位基因型均存在单个碱基的不匹配;并且在第4外显子出现碱基杂合,但第2和第3外显子区域内无杂合碱基.经分子克隆和单倍体测序,以及采用自行设计的PCR引物和AlleleSEQR试剂盒中的测序引物再测序,证实了5例标本均存在Cw * 0706等位基因漏检和丢失现象,未发现新的碱基点突变.结论 HLA-C基因测序分型时,因PCR引物与模板DNA不匹配会导致等位基因的漏检和丢失.根据中国人群HLA-C分子全长序列特点,开发适合于中国人群的测序分型试剂十分必要.

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