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环状RNA与心血管疾病
环状RNA(circRNA)是一类存在所有生物体中的非编码RNA.随着测序技术的发展,已发现人类体内存在上万个circRNA.目前研究多的是circRNA能够成为microRNA(miRNA)的海绵体,特异地吸收miRNA,使体内相关miRNA表达下调.已发现circRNA在动脉粥样硬化、主动脉瘤、心肌梗死和冠心病等心血管疾病中起着重要作用.circRNA可以通过不同的机制调控心肌肥厚、心肌纤维化以及心肌细胞凋亡过程,进而引起相应的心血管疾病的发生发展.
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环形RNA与相关疾病研究进展
环形RNA(circular RNA,circ RNA)是由前体RNA的5′末端和3′末端共价闭合形成一类非编码RNA,可竞争内源性RNA,具有miRNA海绵作用,调控基因的转录过程.circRNA与疾病的发生、发展和治疗关系密切,有望成为潜在的新型分子标志物和分子靶向治疗的靶点.
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成骨不全环状RNA生物信息学分析
目的 对成骨不全血清中差异表达的miR-21、miR-26a、miR-29a、miR-29b、miR-30e、miR-34c、miR-133a、miR-145、miR-210、miR-489与miR-1297等共11种miRNAs进行circRNAs及其靶基因的预测,同时分析其与circRNAs及靶基因间的相互作用.方法 采用starbase软件对11种差异性表达miRNAs相关circRNAs进行预测,将得到的miRNA-circRNA进行频数分布分析并通过cytoscape软件进行网络分析寻找核心分子.采用miRWALK软件对11种差异性表达miRNAs相关靶基因进行预测,将得到的miRWALK-靶基因进行频数分布分析并通过cytoscape,DAVID软件进行网络分析寻找核心分子.结果 Starbase软件对11种不同miRNAs所预测的靶circRNAs的总数量为222个,非重叠circRNAs为141个.其中MIB1_hsa_circ_ 000886,MIB1_ hsa_circ_002013,CPNE1 _hsa_circ_000657,CYP4F3_hsa_circ_001395,KIAA1586_hsa_circ_001439与其中4种miRNA相互作用.另有14个circRNAs与3种miRNA相互作用.miRWALK软件对11种不同miRNAs所预测的靶基因中CNOT6、ELF2、NAV3等基因在不同数量级数据库中与相应不同种miRNAs作用密切.通过对11种miRNA相应circRNA以及靶基因生物学预测分析得到YES1基因与miR-133a、miR-145以及FAT1_hsa_circ_000713与LMNB2_hsa_circ_001499之间存在相互作用.PPP2CA与miR-29a、miR-29b、miR-133a以及KIAA1586_ hsa_circ_001439之间存在相互作用.NTN4和SRGAP1与miR-26a、miR-145以及RFC1_hsa_circ 001649之间存在相互作用.结论 本研究对成骨不全血清中差异表达的11种miRNAs及其相互作用的circRNAs、靶基因与相关信号通路进行了网络分析与预测,为进一步分析之间相互作用奠定了基础.
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非编码RNA在子宫内膜容受性中的研究进展
子宫内膜容受性是指子宫内膜对胚胎的接受能力及允许胚胎黏附其上直至植入完成的特定阶段.了解内膜容受性的情况,有助于提高胚胎着床率,对治疗女性不孕症具有积极作用.尽管许多因素参与子宫内膜容受性的发生和发展,但其具体分子机制尚不十分清楚.非编码RNA是一类无蛋白质编码功能的RNA,在各种各样的生理和疾病过程中发挥着重要的调节作用.本文通过回顾文献,对近年来非编码RNA,特别是microRNA、lncRNA及circRNA在子宫内膜容受性方面的研究进展和探索进行了阐述,为深入了解子宫内膜容受性的分子特征,精准把握胚胎“种植窗”提供新思路.
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circRNA在热习服中的作用研究进展
环状RNA(circRNA)是一类内源性非编码RNA,与传统线性RNA不同,它是由反向剪接形成的无5′端帽子和3′端多聚腺苷酸尾部的环状闭合结构.circRNA在哺乳动物细胞中具有内生、丰富、保守、稳定、组织特异性等特点,且亚细胞定位存在差异.热习服(HA)能有效减少心肌耗氧量,调节中枢神经系统,热应激蛋白表达,抑制炎性反应等过程.该文对HA生理效应与机制、circRNA功能与机制及其在HA和热损伤中的作用研究进展进行了综述.
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环状非编码RNA在口腔鳞癌中的研究进展
环状RNA是一类新发现的不同于miRNA和lncRNA的共价闭合环状内源性非编码RNA.目前,已有许多报道关于circRNA在疾病发生发展机制的研究,为肿瘤的预防、诊断和精准治疗提供一种全新的理论依据.本文主要对circRNA的生物学特征和作用机制及其在口腔鳞癌中发生发展的作用进行综述.
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CircRNA在氧化钕致人支气管上皮细胞炎症反应中的表达
目的 研究稀土氧化钕致人支气管上皮细胞(16HBE)炎症反应中circRNA表达变化.方法 以CCK-8法测定不同剂量氧化钕(0、40、60、80、100、120 μg/ml)混悬液分别处理16HBE细胞24 h和48 h后,检测细胞生存率.以ELISA测定不同剂量氧化钕(0、40、60、80、100、120 μg/ml)混悬液处理16HBE细胞48 h后,炎症因子IL-1β和IL-8的表达变化.以80 μg/ml稀土氧化钕颗粒混悬液处理16HBE细胞48 h,以微阵列检测其circRNA表达改变,以荧光定量PCR验证10种明显差异表达circRNA.结果 与对照组相比,氧化钕混悬液分别处理16HBE细胞24 h和48 h后,细胞生存率均明显降低(P＜0.01).与对照组相比,氧化钕混悬液处理48h后IL-1β和IL-8分泌明显增加(P＜0.01).ELISA检测结果发现与对照组相比,氧化钕混悬液处理48h后IL-1β和IL-8分泌明显增加(P＜0.01).基因微阵列结果显示有1263种circRNA表达发生改变,其中上调circRNA有247种,下调有1 016种.与对照组比较,hsa_circRNA_0080083相对表达量下调了53.48％(P＜0.01).不同剂量氧化钕(0～ 120.μg/ml)混悬液处理16HBE细胞后,hs a_c ircR_ NA _008008表达量和氧化钕染毒剂量呈负相关性(r=-0.968,P＜0.001).结论 稀土氧化钕致16HBE细胞炎症反应中,circRNA表达谱发生改变,其中hsa_circRNA _0080083下调明显,且有剂量-效应关系.
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circRNA404524在PM2.5致BEAS-2B细胞炎症过程中的功能及机制研究
目的 研究circRNA 404524在PM2.5致永生化人支气管上皮样细胞(BEAS-2B)炎症过程中表达改变,探索circRNA在PM2.5致气道炎症过程中的功能及机制.方法 BEAS-2B细胞分为6组:NT组(DMSO),PM2.5组(75 μg/ml PM25),NC组(转染空载体质粒+DMSO),NC+PM2.5组(转染空载体质粒+75μg/ml PM2.5),OE组(转染circRNA 404524+DMSO),OE+PM2.5组(转染circRNA 404524+75μgml PM2.5).使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测circRNA404524在75 μg/ml PM2.5染毒BEAS-2B细胞中的表达水平,同时通过转染circRNA 404524拘过表达载体联合75 μg/ml PM2.5染毒后检测circRNA404524、IL-6及IL-8的表达水平.检测circRNA 404524在BEAS-2B细胞胞浆/胞核的表达水平,分析其表达位置.通过KEGG生物信息学软件分析circRNA 404524可能参与调控的基因通路,而后检测NF-κB炎症通路关键基因的表达水平.结果 与NT组相比,circRNA 404524在PM2.5组表达下调,相对变化倍数为2.63,差异有统计学意义(P＜0.01).转染circRNA 404524过表达载体后,通过检测发现,相比于NC组,OE组中circRNA 404524上调154.74倍,差异有统计学意义(P＜0.01).检测炎症因子表达水平发现,与NC组相比,OE组中IL-6及IL-8表达均下调,差异均具有统计学意义(P＜0.05),NC+PM25组中IL-6和IL-8表达均上调,差异均具有统计学意义(P＜0.01).胞浆胞核定位结果显示circRNA 404524主要在胞核表达,检测NF-κB炎症通路关键基因的表达水平发现,相比于NC组,OE组中IKK-alpha、IKB-alpha及NFKB1表达均下调,NC+PM2.5组中表达均上调,差异均具有统计学意义(P＜0.05).结论 circRNA 404524在PM2.5染毒的BEAS-2B细胞中低表达,将其过表达后,PM2.5引起的炎症水平降低,提示其在PM2.5染毒致BEAS-2B细胞炎症过程中发挥抑炎基因的作用,并可能通过对NF-κB炎症通路的调控发挥功能.
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非编码RNA在喉鳞状细胞癌中的研究进展
非编码RNA是一类不编码蛋白质的RNA,包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,ln-cRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)等.非编码RNA不仅在生物调节过程中扮演着重要角色,在包括肿瘤在内的多种疾病的发生机制中也起到了不可或缺的作用,其在喉癌的诊断、预后评估及治疗中同样具有重要的临床价值.喉鳞状细胞癌是喉癌中常见的病理学类型,近年来发病率有明显增高的趋势,已严重危害人类健康及生存质量.本文总结了近年国内外研究,对miRNA、lncRNA和circRNA在喉癌发生发展的作用机制进行综述.
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circRNA在消化道肿瘤中的研究进展
circRNA是广泛存在的内源性非编码RNA,通过反式剪接使3'端和5'端共价结合形成闭合的环状结构,具有高度稳定性、生物进化保守性和组织表达特异性.circRNA具有miRNA"海绵作用"、调控亲本基因表达、提高转录水平及翻译蛋白质等潜在功能.在消化道肿瘤中,circRNA主要发挥miRNA"海绵作用",从而影响癌细胞的增殖、分化、凋亡及侵袭.另外,circRNA在肿瘤中特异性表达,且表达水平与癌旁组织有显著差异.因此,高度保守、稳定的circRNA序列可能成为消化道肿瘤早期诊断及预后标志物.本文将从circRNA的概况以及与各消化道肿瘤(食管癌、胃癌、结直肠、肝癌等)的相关性进行综述.
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非编码RNA在卵巢癌中的研究进展
卵巢癌是妇科常见的恶性肿瘤疾病，具有早期诊断困难、预后较差的特点。非编码 RNA 是一类不具有蛋白编码潜能的 RNA 转录本，包括微小 RNA（microRNA，miRNA）、长链非编码 RNA（long non－coding RNA，lncRNA）和环状 RNA（circular RNA，circRNA）。它们能够在生物体内大量存在，参与调控细胞增殖、分化、凋亡等一系列生物过程，并且与肿瘤的发生、发展、转移及预后等方面有着密切联系。该文分别综述 miRNA、lncRNA、circRNA 与卵巢癌的发生、发展、转移和预后的有关研究进展。
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CircRNA在非小细胞肺癌中的研究进展
肺癌是全世界发病率和死亡率高的恶性肿瘤之一,尽管开发了新的靶向和免疫疗法但是肺癌的五年存活率仍旧很低.随着高通量技术的发展,circRNA在非小细胞肺癌中的生物学作用受到了人们的广泛关注.新研究表明,circRNA在肺癌的发生,转移和预后中起相关作用,可以作为潜在的肿瘤诊断和预后的生物标志物.
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环状RNA研究的新进展
背景:环状RNA(circRNA)是一种新型的RNA,与线性RNA不同,它形成共价闭合的连续环,并且在真核转录组中高度表达.它的生物学功能被忽视多年.近的研究已经在哺乳动物细胞中发现了数千种内源性circRNA.目的:综述circRNA的形成、性质、功能,以及在疾病中的潜在意义.方法:第一作者应用计算机检索2000年1月至2016年12月PubMed数据库、中国期刊全文数据库关于circRNA的文章,英文检索词“CircRNA,miRNA,function,mechanision”;中文检索词“CircRNA,microRNA,功能,机制”.对纳入的62篇文献进行分析讨论.结果与结论:①CircRNA主要从外显子或内含子序列产生,并且反向互补序列或RNA结合蛋白是circRNA生物发生所必需的;②大多数circRNAs是跨物种保守,对核糖核酸R稳定的和耐,并经常表现出组织/发育阶段特异性表达;③近的研究表明,circRNAs可以作为微小RNA(miRNA)海绵体,剪接和转录的调节器和亲代基因表达的修饰;④新的证据表明circRNAs可能在动脉粥样硬化血管疾病,神经系统疾病,朊病毒疾病和癌症中发挥重要作用;在结肠直肠癌中异常表达;并用作一些疾病的诊断或预测性生物标志物;⑤类似于miRNA和长非编码RNA,circRNAs成为RNA领域的新研究热点,可以广泛参与生命过程.
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circRNA与疾病研究进展
环状RNA(circular RNA,circRNA)不同于传统的线性RNA,是一类共价闭合环状的非编码RNA,广泛存在于生物体中,具有稳定、广泛的组织特异性表达.其特殊的分子结构使其具有充当miRNA“海绵”、调节转录或剪接、与RNA结合蛋白相互作用等功能,还可作为疾病诊断的生物标志.本文从circRNA的形成、分类、功能及其与疾病、与环境和表观遗传学的关系等方面进行综述,可为circRNA在疾病研究、诊断和治疗中的应用提供参考.
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非编码RNA与血管内皮功能障碍的研究进展
血管内皮功能障碍(vascular endothelial dysfunction,VED)是动脉粥样硬化、心肌梗死、代谢综合征等多种疾病的前期阶段,研究表明,VED与非编码RNA(noncoding,ncRNA)关系密切,ncRNA主要包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,cir-cRNA)等,本文中作者就miRNA、lncRNA、circRNA与血管内皮的关系作一综述.
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竞争性内源RNA在肝癌中的研究进展
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是常见的消化系统恶性肿瘤之一,肝癌发生、发展机制不清是制约肝癌诊疗的重要原因.近年研究发现,RNA在肝癌的调控机制中发挥重要作用,某些长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)、假基因以及mRNA拥有microRNA应答元件(microRNA response element,MRE),通过竞争性结合microRNA,发挥相互调控作用.这类RNA称为竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA).该文将按照ceRNA分类,对其在肝癌发生、发展机制中的生物学功能及临床意义进行系统综述.
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环状RNA(circRNA)在肝细胞癌中的研究进展(综述)
肝细胞癌(HCC)在全球恶性肿瘤中的发病率排名第六位,病死率则名列第二位,严重威胁人类的生命健康.我国每年死于肝癌的人数约30多万.肝癌高病死率的原因主要是由于肝癌发病隐匿,恶性程度高,预后差,长期存活率较低.除了临床上常用的手术切除、放化疗、介入治疗等,还需要从分子层面(如circP NA)发现更早期诊断标志物,寻找新的治疗药物靶点.
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结核分枝杆菌调节miRNAs及circRNAs抗细胞自噬机制的生物分析
目的 探索结核分枝杆菌抵抗人或小鼠巨噬细胞自噬机制的关键miRNAs及circRNAs,为寻找新型结核诊断标志物及治疗靶点提供思路.方法 筛选出结核分枝杆菌诱导细胞差异表达的自噬相关基因;制作蛋白交互图并文献挖掘筛选关键自噬基因;多数据库综合预测相应的miRNA,制作自噬基因mRNA-miRNAs交联图并筛选关键miRNA;制作miRNAs-circRNAs相互作用图并筛选关键circRNA.结果 筛选出18种结核感染后差异表达的自噬相关基因,并在此基础上预测16种自噬关键基因;筛选出4种通过靶向自噬mRNA参与自噬调控的关键miRNA分子(miR-17-5p,miR-20a-5p,miR-30a-5p,miR-33-5p);针对4种miRNA筛选出6种与其密切相关的circRNA分子,并预测hsa-circRNA2908和hsa-cir-cRNA6439是影响结核抗自噬关键circRNA分子.结论 miR-miR-17-5p,miR-20a-5p,miR-30a-5p,miR-33-5p及其上游共同调控分子hsa-circRNA2908和hsa-circRNA6439可能是潜在的诊断标志物和疾病治疗靶点.
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circRNA在妇科恶性肿瘤中的研究进展
环状RNA(circularRNA,circRNA)是一类环状结构的非编码RNA.既往的研究表明,circRNA可以通过多种调控方式影响基因表达,例如可负性调控miRNA表达,也可与蛋白质结合调控基因表达,或可作为相应疾病的诊断标志物或潜在治疗靶点.近的研究发现,妇科恶性肿瘤的发生、发展可能与circRNA的异常密切相关.妇科恶性肿瘤是严重影响女性健康的常见疾病,其中子宫颈癌、子宫内膜癌和卵巢癌是三种常见且研究较多的妇科恶性肿瘤.本文将对circRNA在这几种妇科恶性肿瘤的发生、发展和诊断等方面的新研究进行综述.
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非编码RNA通过竞争性内源性RNA机制对肿瘤生物学行为的调控
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)表达谱的异常见于包括肿瘤在内的多种人类疾病.由于研究体系的不成熟,ncRNA家族中的长链非编码RNA (lncRNA)、假基因(pseudogene)、环状RNA(circular RNA,circRNA)等的研究仍处于起步阶段.近年来的研究显示,lncRNA、假基因、circRNA等可以作为竞争性内源性RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)调控恶性肿瘤的各类生物学行为,包括增殖、凋亡、侵袭、转移以及自噬.以ceRNA机制为背景,论述ncRNA(主要包括lncRNA、假基因、circRNA)在肿瘤生物学行为中的新研究进展.
