首页 > 文献资料
-
长链非编码 RNA 在头颈部肿瘤中的研究进展
长链非编码 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）是一类长度大于200个核苷酸的、缺少特异完整的开放阅读框、极少有蛋白编码功能的非编码 RNA。研究表明 lncRNA 是参与基因表达的关键调控分子，从表观遗传、转录及转录后等多种水平调控相关靶基因的表达。近年来 lncRNA 在头颈部疾病中的研究开始受到关注。现就 lncRNA 在头颈部肿瘤中的研究进展作一综述。
-
长链非编码RNA HOTAIR在肝肿瘤中的研究进展
长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt的RNA分子,在多种层面上(如表观遗传学,转录调控,转录后调控等多种层面上)调控基因表达,而且与肿瘤细胞的增殖,侵袭,凋亡密切相关,参与肿瘤的转移.HOX转录反义RNA(HOXtranscript antisense RNA,HOTAIR),是第一个被发现的具有反式调控作用且远距离调控2号染色体上的HOXD基因簇的lncRNA.HOTAIR作为组蛋白修饰复合物的支架,5'端结构域结合多梳抑制复合体2(PRC2),3’端结构域结合组蛋白去甲基化酶复合体[赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1 (LSD1)/RE1-沉默转录因子(REST)共阻抑蛋白(CoREST)/REST],并介导这两种复合体至特定基因位点,分别使染色体组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(H3K27me3)和组蛋白H3第4位赖氨酸去二甲基化(H3K4me2),从而使长达40kb的碱基(包括HOXD8,HOXD9,HOXD10,HOXD11以及一些ncRNA)发生表现遗传学沉默.肿瘤细胞中高表达HOTAIR能抑制抑癌基因的表达,促进肿瘤复发和转移,而下调HOTAIR表达则降低肿瘤细胞的转移侵袭能力.体外实验还发现下调HOTAIR表达具有增加肝肿瘤细胞对化疗药物敏感性的功能.
关键词： 长链非编码RNA(lncRNA) HOTAIR 肝肿瘤 -
X射线对食管鳞癌细胞HOTAIR,Snail及E-cadherin表达水平影响
目的:探索X线诱导食管鳞癌细胞内HOX转录反义RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)及上皮间质化相关因子Snail,E-钙黏蛋白(E-cadherin)表达的时间剂量效应.方法:0、2、4、6、8 GyX射线分别照射食管鳞癌Ecal09细胞后,分别于0、2、4、8、16、24 h提取细胞内总RNA及蛋白,实时定量PCR检测(real-time quantitative PCR,qRTPCR)及Western blot检测相应指标mRNA及蛋白的表达水平.结果:Eca109细胞接受X线照射后继续培养24 h后发现,随X线照射剂量渐增大(0→2→4→6→8 Gy),HOTAIR与Snail表达水平逐渐升高:HOTAIR mRNA,Snail mRNA在6 Gy与8 Gy照射组表达水平显著高于0 Gy组,Snail蛋白在4 Gy照射组即有显著升高;而E-cadherin mRNA与其蛋白表达水平逐渐降低,6 Gy与8 Gy照射组显著低于0 Gy组,均P＜0.01.细胞接受8GyX线照射后,伴随照射后培养时间延长(0→2→4→8→16→24 h)细胞内HOTAIR,Snail表达水平逐渐升高:与0 Gy组相比,细胞培养至第8小时HOTAIRmRNA表达水平显著升高,培养至第16小时Snail mRNA与其蛋白表达水平显著升高;而E-cadherin mRNA与其蛋白伴随照射后培养时间延长表达水平逐渐降低,培养至第8小时E-cadherin与其蛋白表达水平即显著低于0 Gy组(均P＜0.01).结论:X射线诱导HOTAIR,Snail及E-cadherin 的异常表达呈时间和剂量依赖性,三者可能共同参与肿瘤细胞放疗抵抗形成.
-
LncRNA在胃癌中的表达及其预后价值
目的 长链非编码RNA (lncRNA)在肿瘤中的作用已经逐渐被证实,但是目前尚没有大样本的基因组学研究评估lncRNA在胃癌中的表达水平及其预后价值.本研究采用TCGA全基因组mRNA测序资料研究lncRNA在胃癌中的表达.方法 TCGA胃癌mRNA测序数据经过滤后提取lncRNA,采用R软件包DESeq2对组间差异表达基因进行分析;同时对存在差异表达的lncRNA进行生存分析.结果 基因差异表达分析共鉴定出61个lncRNA在胃癌组织中表达异常.其中46个lncRNA在胃癌中上调,15个lncRNA在胃癌中下调(矫正后P＜0.001;倍数变化绝对值＞2).不同分子亚型胃癌的lncRNA表达情况不完全相同,其中lncRNA RP11-400N13.2和RP11-297P16.4在EBV型胃癌中表达高.聚类分析显示,按照lncRNA表达对胃癌进行分类与胃癌分子分型的一致性较高.生存分析鉴定出16个具有预后意义的差异表达lncRNA (P＜0.05),其中lncRNA高表达者预后较好的有A C004870.4、CYP4A 22-AXl、CTD-2377D24.6、RP11-10A 14.5、RP11-328K4.1、HOXA-A S4、RPll-497G19.1、RPll-1029J19.4;lncRNA高表达者预后较差的有AP000695.6、AC093850.2、RPll-400N13.3、RP11-148L24.1、RPll-1069G10.1、CTB-113P19.4、RPll-417E7.2、A C002398.12. HOTAIR在胃癌中表达明显升高(对数倍数变化5.16;校正后P=1.72× 10-33);而ANRIL和GA S5在肿瘤和正常组织中无明显差异.结论本研究通过分析大样本胃癌lncRNA表达谱研究数据.发现了一批异常表达lncRNA,有望为胃癌的靶向治疗和预后评估提供新的治疗靶点和分子标志物.
-
HOT转录反义RNA在头颈肿瘤研究进展
长链非编码RNA (long noncodin RNA,lncRNA)的异常调节在肿瘤的发生、发展过程中起着重要作用,其中HOX转录反义RNA (HOT transcript antisense RNA,HOTAIR)是第一个发现的具有反式调控作用的lncRNA.多个研究表明HOTAIR在头颈部肿瘤呈上调表达,并且通过募集染色质修饰复合体(polycomb repressive complex 2,PRC2)或组蛋白去甲基化酶1(lysine specific demethylas 1,LSD1)蛋白复合体,对Wnt、Akt、p53等信号通路进行调控,其异常调节终影响头颈部肿瘤的细胞周期、凋亡、血管生成、侵袭、转移等过程.本文将结合HOTAIR的分子机制及其在头颈部肿瘤新的研究进展,讨论HOTAIR在头颈部恶性肿瘤诊断、预后及治疗中的临床应用前景.
-
长链非编码RNA HOTAIR在胰腺癌中的表达
目的 探讨长链非编码RNA HOTAIR在胰腺癌患者中的表达水平.方法 选取2010年10月—2016年12月山西医科大学第一医院普外科诊断明确的胰腺癌标本共54例.对照组为良性胰腺手术者(如胰腺外伤、胰腺囊肿内引流术).通过qRT-PCR方法检测HOTAIR mRNA的表达水平,统计分析胰腺癌组织与正常对照组间的差异.结果 与对照组相比,胰腺癌患者HOTAIR mRNA表达水平升高(P<0.05),胰腺癌TNM分期I、Ⅱ与Ⅲ、Ⅳ期组间比较无明显差异.结论 长链非编码RNA HOTAIR与胰腺癌的发生发展有关.
-
长链非编码RNA-HOTAIR与乳腺癌腋窝淋巴结转移相关性研究
目的：探索长链非编码RNA-HOTAIR在乳腺癌及前哨淋巴结、腋窝淋巴结中的表达情况，分析与乳腺癌其他指标的相关关系，以指导治疗并预测预后。方法：收集2013年6月-2013年12月乳腺癌住院手术患者10例，均行前哨淋巴结活检术，取乳腺肿块组织、癌旁组织及前哨淋巴结（SLN）、腋窝淋巴结（ALN）。术后均经病理证实为浸润性导管癌。四组标本组织采用实时荧光定量RT-PCR检测HOTAIR的表达情况，结合临床病理结果，采用t检验、等级相关等统计方法分析各指标之间的关系。结果：（1）HOTAIR基因在各组中的表达，SLN组（9.33±1.23），ALN组（6.90±2.00），两者比较差异有统计学意义（t=3.401，P=0.004）；癌组织组（8.81±1.27），癌旁组织组（7.00±1.11），两者比较差异有统计学意义（t=3.389，P=0.003）；SLN组与癌旁组织组比较差异有统计学意义（t=4.441，P<0.001）。（2）HOTAIR表达情况与临床病理指标关系密切，与淋巴结转移率、ki-67蛋白表达呈正相关，相关系数分别为0.67和0.82，差异有统计学意义（P<0.05）。结论：HOTAIR基因在乳腺癌前哨淋巴结以及癌组织中有异常高表达，其促进细胞增殖、侵袭转移的功能显著，提供乳腺癌基因靶向治疗的新位点。
-
HOTAIR与肿瘤生物学行为的研究进展
长链非编码RNA（long noncoding RNA，lncRNA）是一类长度>200 bp，无蛋白质编码产物，却广泛参与细胞的生理及病理学过程，特别是在肿瘤生物学行为方面。HOX转录反义RNA（HOX transcript antisense RNA，HOTAIR）全长2158 bp，是功能研究为深入的lncRNA之一。HOTAIR过表达可以沉默特定抑癌基因的表达并促进多种上皮系统来源恶性肿瘤，如乳腺癌、结直肠癌等的发生及转移，抑制肿瘤中HOTAIR表达能有效抑制肿瘤细胞生长与侵袭能力。本文结合国内外文献报道，就HOTAIR在肿瘤中的研究进展进行综述。
-
长链非编码RNA HOTAIR在膀胱癌中的表达及临床意义
目的:探讨长链非编码RNA HOTAIR在膀胱癌组织与癌旁正常组织的表达差异,了解HOTAIR与膀胱癌恶性程度、进展及预后的相关性.方法:采用qRT-PCR方法检测88例膀胱癌组织与癌旁正常组织中HOTAIR RNA的差异表达,分析HOTAIR表达水平与患者临床病理特征的关系,采用Kapaln-Meier生存分析及COX比例风险回归模型分析HOTAIR表达水平与膀胱患者预后的相关性.结果:膀胱癌组织中HOTAIR RNA表达明显高于癌旁正常组织,HOTAIR RNA高表达与肿瘤高分级及临床高分期有关(P＜0.05),HOTAIR高表达组膀胱癌患者5年生存率明显低于HOTAIR低表达组(P＜0.05),COX回归分析提示HOTAIR RNA高表达可能为膀胱癌不良预后的独立危险因子之一.结论:长链非编码RNA HOTAIR与膀胱癌发生发展及其恶性程度相关,HOTAIR可以作为预测膀胱癌患者生存率的分子标志物.
-
长链非编码RNA HOTAIR影响人舌鳞癌细胞Tb3.1增殖与凋亡的体内外研究
目的：研究长链非编码 RNA HOTAIR 对人舌鳞癌细胞系 Tb3.1增殖与凋亡的影响。方法使用HOTAIR siRNA（siHOTAIR）敲低HOTAIR的表达；实验分为siHOTAIR组、无义序列组和空白对照组。前2组分别用siHOTAIR和无义序列转染舌鳞癌细胞，空白对照组细胞不做任何处理。实时定量PCR检测HOTAIR的表达水平；四甲基偶氮唑蓝（MTT）法检测Tb3.1细胞增殖；Western blot检测B细胞淋巴瘤2（Bcl-2）、活化型半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3（Cleaved Caspase-3）、BAX的表达；流式细胞仪检测细胞凋亡；平板克隆形成实验检测细胞增殖情况；并行细胞衰老检测。动物实验建立Tb3.1裸鼠皮下荷瘤模型，通过免疫组织化学染色及TUNEL法评价干扰HOTAIR后对Tb3.1细胞增殖、凋亡的作用。结果 siHOTAIR处理后HOTAIR的表达水平降低；Western blot结果示Cleaved Caspase-3和BAX表达水平升高，Bcl-2表达水平降低。MTT结果显示siHOTAIR组细胞增殖受到抑制；流式细胞示siHOTAIR组细胞凋亡升高；细胞衰老实验显示siHOTAIR组细胞衰老数目增加；免疫组化结果显示， siHOTAIR组较对照组Ki-67、Bcl-2表达减少，Caspase-3、BAX表达增加；TUNEL结果显示，siHOTAIR组较空白对照组肿瘤细胞凋亡水平升高。结论干扰HOTAIR可以促进舌鳞癌细胞的凋亡并抑制其增殖，HOTAIR可以作为舌鳞癌治疗的研究方向。
-
Hox基因在马蹄内翻足病因中的研究进展
先天性马蹄内翻足（CCF）是危害儿童健康的常见先天畸形，病因不明，现阶段认为是多基因遗传因素与环境因素共同作用的结果。关于遗传因素在CCF病因中的研究众多，结合目前研究成果，多个基因可能在CCF发病中起重要作用，如同源异型盒基因(Hox）、PITX1、NAT2、P63、DTDS、COL9A等，这为探讨CCF的预防和治疗提供了更多设想，但是还未确定哪个基因在发病因素中起决定性作用。近年来有研究报道显示CCF发病与Hox基因的表达密切相关。Hox是一类专门调控生物形体的基因，一但它发生突变，就会导致身体的一部分变形，在人体中表现为肢体的先天畸形。本文就Hox在CCF致病相关基因的研究进展作一综述，为其临床治疗提供基础。
-
HOTAIR通过靶向抑制miR-519d促进人卵巢癌SKOV3细胞增殖
目的 研究HOTAIR对人卵巢癌SKOV3细胞增殖的影响以及可能机制.方法 使用LipofectamineTM2000试剂将HOTAIR过表达慢病毒载体以及HOTAIR沉默慢病毒载体分别稳定转染SKOV3卵巢癌细胞后,应用Real-time PCR验证其转染效率;应用CCK-8法检测HOTAlR对人卵巢癌SKOV3细胞增殖的影响;应用Real-time PCR检测人SKOV3卵巢癌细胞中miR-519dmRNA表达变化.应用双荧光素酶报告基因验证HOTAIR和miR-519d存在靶向结合并明确其结合位点.结果 和对照组相比,HOTAI过表达显著促进了人卵巢癌SKOV3细胞的增殖,极大降低了miR-519d在SKOV3细胞中的mRNA水平;HOTAIR和miR-519d存在靶向结合,并明确了其结合位点;miR-519d过表达显著抑制了人卵巢癌SKOV3细胞增殖能力;miR-519d过表达有效阻断了HOTAI促进SKOV3细胞增殖的作用.结论 HOTMR能够通过靶向抑制miR-519d,提高人卵巢癌SKOV3细胞的增殖能力.
关键词： HOTAIR miR-519d 增殖 人卵巢癌SKOV3细胞 -
长链非编码RNA HOTAIR对外阴鳞状细胞癌A431细胞生物学行为的影响
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA) HOTAIR对外阴鳞状细胞癌A431细胞生物学行为的影响.方法 采用实时荧光定量PCR检测外阴鳞状细胞癌A431细胞与正常表皮HaCaT细胞中HOTAIR的表达水平,转染HOTAIR siRNA至A431细胞后采用CCK-8法检测各组细胞活性,流式细胞术检测细胞凋亡,Transwell小室迁移实验检测细胞迁移情况,Transwell小室侵袭实验检测细胞侵袭情况.结果 HOTAIR在A431细胞中的表达高于正常表皮HaCaT细胞;下调A431细胞中HOTAIR表达后,细胞增殖、迁移及侵袭能力均降低(P均＜0.05),而凋亡率增加(P＜0.05).结论 lncRNA HOTAIR可能在调控外阴鳞状细胞癌细胞的增殖、凋亡、迁移及侵袭行为中起重要作用.
-
LncRNA-HOTAIR与肿瘤代谢重编
lncRNA HOX 转录反义 RNA (HOX transcript antisense RNA , HOTAIR)是由2158个核苷酸构成的长链非编码 RNA ,虽不编码蛋白质,但通过修饰染色质结构在基因调控中发挥重要作用.已表明 HOTAIR 与人类多种癌症相关,其高表达促进肿瘤的发生、发展,并与癌症预后差、化疗耐药相关.HOTAIR 与 miR-34 a、miR-454-3 p、miR-197、miR-138、miR-203 等miRNAs 交互作用参与癌症形成.代谢重编是肿瘤的十大特征之一,转换肿瘤的代谢模式已成为癌症治疗的新靶点.HOTAIR 在肿瘤代谢重编中的重要作用越来越受到重视,它可以通过调节 GLUT1、mTOR、SirT1、HK2、GLS、UQCRQ 等调节肿瘤细胞的糖代谢、谷氨酰胺代谢、线粒体代谢.深入了解 HOTAIR 在肿瘤代谢重编中的具体作用机制,有助于理解肿瘤发生、发展的机制,为癌症检查、诊断、治疗、预防提供新方向.
-
长链非编码 RNA HOTAIR 对胃癌迁移和侵袭能力的影响
目的：探讨长链非编码RNA HOTAIR（ lncRNA HOTAIR）在胃癌组织中的表达，并分析其对胃癌细胞侵袭和迁移能力的影响。方法采用定量反转录PCR检测HOTAIR在53例胃癌组织中的表达水平，用Transwell法评估异常表达的HOTAIR对胃癌细胞迁移和侵袭能力的影响。结果胃癌组织中HOTAIR相对表达水平为（18．46±10．62）。 Transwell实验显示，通过转染si-HOTAIR来下调HOTAIR表达可抑制位子细胞的迁移和侵袭（P＜0．05）；相反，过表达HOTAIR可以显著促进胃癌细胞迁移和侵袭（ P＜0．05）。结论 HOTAIR在胃癌组织中异常高表达，且其可以促进胃癌细胞的迁移和侵袭能力，提示其可能作为判断胃癌恶性程度的一个分子标志。
-
HOTAIR促进卵巢癌恶性生物学行为
目的:研究沉默HOTAIR后对上皮性卵巢癌恶性生物学行为的影响.方法:实时荧光定量聚合酶链反应检测HOTAIR在卵巢癌细胞株SKOV3、OVCAR3和A2780的表达情况.沉默HOTAIR后,划痕实验检测卵巢癌细胞转移能力,侵袭实验检测卵巢癌细胞侵袭能力,胸腺嘧啶核苷类似物检测卵巢癌细胞增殖能力.结果:HOTAIR在SKOV3和OVCAR3细胞中表达高于A2780细胞;沉默HOTAIR后,卵巢癌SKOV3细胞转移 、侵袭和增殖能力降低;结论:沉默HOTAIR可以抑制卵巢癌SKOV3细胞恶性生物学行为.
关键词： HOTAIR 卵巢癌 实时荧光定量聚合酶链反应 -
长链非编码RNA HOTAIR在宫颈癌中的表达及其对宫颈癌HeLa细胞增殖和凋亡的影响
目的:探讨长链非编码RNA HOX转录反义RNA (HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)在宫颈癌中的表达及对宫颈癌HeLa细胞增殖和凋亡的影响.方法:实时荧光定量PCR法检测36例宫颈癌组织及其相应癌旁组织中HOTAIR mRNA的表达,分析其与宫颈癌患者临床病理特征之间的关系;将靶向HOTAIR基因的短发夹RNA (short hairpin RNA,shRNA)慢病毒液感染人宫颈癌HeLa细胞后,应用CCK-8(cell counting kit-8)法和FCM法分别检测细胞增殖、细胞周期和细胞凋亡的情况.结果:宫颈癌组织中HOTAIR mRNA的表达水平明显高于其相应的癌旁组织(P＜0.001);HOTAIR的表达与患者的临床分期、肿瘤大小和淋巴结转移有关(P值均＜0.05),而与患者的年龄、组织学类型、分化水平、鳞状细胞癌相关抗原和宫体转移无关(P值均＞0.05).干扰HOTAIR的表达后,HeLa细胞的增殖受到抑制(P＜0.05),G0/G1期细胞比率和细胞凋亡率增加(P＜0.05,P＜0.01).结论:HOTAIR在宫颈癌组织中表达上调;干扰HOTAIR的表达可抑制HeLa细胞的增殖,并促进其凋亡.
-
类风湿关节炎患者血清长链非编码RNA HOTAIR、XIST和H19表达研究
目的 探讨3种长链非编码RNA(lncRNA)HOTAIR、XIST和H19在类风湿关节炎(RA)、系统性红斑狼疮(SLE)和健康人对照组血清中的差异表达.方法 收取50例RA疾病组、50例SLE疾病对照组和60例健康人对照组血清,共160例血清标本,提取血清总RNA,利用RT-qPCR方法分析HOTAIR、XIST和H193种lncRNA表达情况.用Spearman相关性分析探讨RA患者疾病活动指数(DAS28)与HOTAIR表达量的相关性.结果 RA组与健康人对照组和SLE疾病对照组相比,血清HOTAIR表达量显著增加(P<0.01),XIST在RA和对照组之间表达量差异无统计学意义;RA患者血清中HOTAIR表达值与DAS28评分呈正相关(R2=0.27,P=0.002),且DAS28评分≥5.1的疾病高度活动组的HOTAIR表达值显著高于3.2
-
长链非编码RNA HOTAIR在肿瘤发生中的研究进展
长链非编码RNA以RNA的形式在多个层面(表观遗传学、转录水平、转录后水平)上调控基因的表达,在个体发育及肿瘤的发生、发展过程中起着重要的作用.近来研究表明长链非编码RNA HOTAIR (lnc-HOTAIR)在多种肿瘤中表达上调,与肿瘤的发生、发展、转移和预后等密切相关,成为肿瘤研究的新热点.本文结合国内外新报道,对lnc-HOTAIR在各种肿瘤中的研究进展作一综述.
-
长链非编码RNA HOTAIR在食管鳞癌中的表达及意义
目的:研究食管鳞癌患者长链非编码RNA HOTAIR (long non-coding RNA HOTAIR,lncRNA HOTAIR)的表达、临床意义及其与转化生长因子β1(TGF-β1)间的关系.方法:实时荧光定量PCR技术检测57例食管鳞癌患者癌组织与癌旁组织中HOTAIR及TGF-β1 mRNA的表达水平,分析HOTAIR mRNA表达与患者临床病理特征的关系.结果:食管鳞癌组织中HOTAIR mRNA表达较癌旁组织明显升高(Z=-2.507,P=0.012),TGF-β1 mRNA表达明显降低(Z=-2.038,P=0.042).癌组织中HOTAIR mRNA表达与肿瘤分化程度及临床分期有关,与TGF-β1mRNA表达呈负相关(r=-0.406,P=0.002).结论:lncRNA HOTAIR与食管鳞癌的发生发展及其恶性程度显著相关,可能通过TGF-β1通路起作用.
