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长链非编码 RNA 在头颈部肿瘤中的研究进展
长链非编码 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）是一类长度大于200个核苷酸的、缺少特异完整的开放阅读框、极少有蛋白编码功能的非编码 RNA。研究表明 lncRNA 是参与基因表达的关键调控分子，从表观遗传、转录及转录后等多种水平调控相关靶基因的表达。近年来 lncRNA 在头颈部疾病中的研究开始受到关注。现就 lncRNA 在头颈部肿瘤中的研究进展作一综述。
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UCA1诊断膀胱尿路上皮癌的临床价值研究
目的 初步评价尿路上皮癌相关1(urothelial carcinoma-associated 1,UCA1)基因定量检测对膀胱癌的诊断价值,确定UCA1基因诊断膀胱癌的临界值,比较UCA1基因检测与尿细胞学检查诊断效果的差异.方法 首先采用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应检测2014年9月至2015年1月于本院行膀胱癌根治术的16位膀胱癌患者的膀胱癌组织和配对癌旁正常组织中UCA1基因表达水平,以评价该方法的可靠性;检测2014年9月至2015年3月于本院就诊的68例膀胱癌患者和除外膀胱癌及其他泌尿系统移形上皮癌的64例泌尿系统其他疾病患者尿液UCA1基因表达水平,并比较不同病理分级和临床分期膀胱癌患者UCA1基因表达水平的差异.绘制UCA1基因检测和尿细胞学检查诊断膀胱癌的ROC曲线,比较UCA1基因检测和尿细胞学检查诊断膀胱癌的敏感性和特异性.结果 膀胱癌组患者尿液UCA1基因平均表达水平显著高于对照组(P<0.0001),不同病理分级膀胱癌患者UCA1基因平均表达水平无显著性差异,而肌层浸润性膀胱癌患者UCA1基因平均表达水平显著高于非肌层浸润性膀胱癌患者(P<0.05).尿细胞学检查和UCA1基因检测诊断膀胱癌的ROC曲线下面积分别为0.596和0.754,初步确定UCA1基因检测诊断膀胱癌的临界值为0.762,UCA1基因检测和尿细胞学检查诊断膀胱癌的敏感性分别为76.47%和19.12%,特异性分别为65.63%和100.00%.二者联合的诊断敏感性为83.82%,尤其在高级别膀胱癌中诊断敏感性达88.64%.结论 与尿细胞学检查相比,UCA1基因定量检测诊断膀胱癌的敏感性高而特异性低,二者联合检测具有较高的敏感性,可将UCA1作为膀胱癌患者术后随访的监测标志物,以减少膀胱癌患者在随访过程中使用膀胱镜的次数.
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长链非编码RNA UCA1在胃癌多药耐药中的作用研究
目的:研究胃癌耐药细胞及其亲本细胞中长链非编码RNA UCA1的表达差异,探讨UCA1在胃癌多药耐药中的作用.方法:通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测胃癌耐药细胞SGC7901/ADR、SGC7901/VCR及其亲本细胞SGC7901中UCA1的表达差异;通过siRNA转染降低SGC7901/ADR中UCA1表达,MTT法检测细胞半数抑制浓度(IC50)的变化,流式细胞仪检测细胞凋亡变化.结果:QRT-PCR结果显示,UCA1在SGC7901/ADR和SGC7901/VCR胃癌耐药细胞表达显著高于SGC7901胃癌亲本细胞;MTT实验表明,干扰UCA1的SGC7901/ADR相对于阴性对照(NC)组的IC50显著降低;凋亡检测结果显示,在相同剂量化疗药物作用下,干扰UCA1后SGC7901/ADR凋亡率显著高于NC组;Western blot证实,干扰UCA1表达可显著降低BCL-2蛋白表达.结论:长链非编码RNA UCA1在胃癌耐药细胞表达显著升高,干扰UCA1表达可明显逆转胃癌耐药,UCA1可作为治疗胃癌耐药的重要分子靶标.
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尿路上皮癌胚抗原1(UCA1)在舌鳞癌中的表达及意义
目的:探讨尿路上皮癌胚抗原Ⅰ (UCA1) mRNA在舌鳞状细胞癌中的表达及其与舌鳞癌病理分级和临床分期的关系.方法:采用SYBR Green Ⅱ实时荧光定量反转录聚合酶链反应实验方法,从6种基因中筛选出在40对舌鳞癌组织及配对正常舌组织样本中表达有明显差异的基因UCA1,扩大样本量至93例,检测UCA1 mRNA在两者中的表达.应用SPSS13.0软件包分析UCA1 mRNA表达量与舌鳞癌患者临床病理学特征的关系.结果:UCA1 mRNA在93例患者的肿瘤组织中平均表达量为0.7213,在正常舌组织中为0.2756,表达量有显著差异(P＜0.001);UCA1 mRNA的表达与患者的性别、年龄、肿瘤大小无关(P＞0.05),与舌鳞癌的病理分级和临床分期有显著相关性(P＜0.05).结论:UCA1 mRNA高表达与舌鳞状细胞癌密切相关,对舌鳞癌的诊断、判断病理分级和临床分期具有重要意义.
关键词： 舌鳞状细胞癌 UCA1 肿瘤分子标志物 实时荧光定量反转录聚合酶链反应 -
长链非编码RNA UCA1在消化系统肿瘤中的研究进展
尿路上皮癌抗原1(UCA1)是一重要的长链非编码RNA,初在膀胱癌中被发现.近来发现在食管癌、胃癌等消化系统肿瘤中UCA1也高表达,并在其发生发展过程中起重要作用.文章就UCA1在消化系统肿瘤中的研究进展予以综述.
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非编码RNA UCA1基因的细胞定位和组织表达谱分析
目的 对UCA1基因进行细胞定位和组织表达谱分析,证实它与膀胱肿瘤的相关性,为进一步研究该基因在膀胱肿瘤中的作用提供实验依据.方法 采用电镜原位杂交方法对基因进行细胞定位,RT-PCR分析基因在组织中的表达情况.结果 透射电镜观察细胞膜上可见散在胶体金颗粒,胞浆有大量的胶体金均匀分布,没有特异性聚集现象,核内有散在的金颗粒.组织表达谱分析UCA1基因在绒毛组织、胎盘组织和胎儿的膀胱均有明显表达;在成人心脏和脾脏有表达外,其余组织均无表达:在8种常见癌中均有差异表达,且大多数癌比相应的癌旁组织表达量高;在膀胱正常粘膜、前列腺增生、肾癌及相应的癌旁组织中均不表达,而在膀胱肿瘤中均有不同程度的表达.结论 UCAI基因定位于细胞浆.该基因可能与膀胱肿瘤密切相关.有望成为膀胱肿瘤分子标记物.
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UCA1和miR-141在膀胱癌细胞系和膀胱癌组织中的表达及与临床预后的相关性
目的 探讨UCA1和miR-141在膀胱癌细胞和膀胱癌组织中的表达及与临床预后的相关性.方法 选取人膀胱尿路上皮癌细胞系及宜宾市第二人民医院收治患者的膀胱尿路上皮癌组织标本为研究对象,另外分别选取人膀胱尿道正常细胞系和癌旁正常组织为研究对照,采用实时荧光定量PCR检测UCA1和miR-141表达情况,分析UCA1、miR-141表达与临床参数及预后的关系.结果 与膀胱尿道正常细胞系和癌旁正常组织比较,膀胱尿路上皮癌细胞系及膀胱尿路上皮癌组织中UCA1和miR-141相对表达量均显著升高,差异具有统计学意义(P＜0.05).UCA1的表达与病理分级、临床分期及肿瘤转移显著相关(P＜0.05);miR-141的表达与临床分期及肿瘤转移显著相关(P＜0.05).Cox回归分析显示,临床分期、肿瘤转移、UCA1和miR-141表达是影响患者预后的独立危险因素.膀胱尿路上皮癌组织中UCA1和miR 141表达呈正相关(r=0.613,P＜0.05).结论 UCA1、miR-141在膀胱癌细胞和膀胱尿路上皮癌组织中均呈高表达,且与膀胱癌患者临床分期、肿瘤转移及预后效果密切相关.
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非编码RNA-UCA1对膀胱癌细胞耐药及转化能力的影响
目的:构建长链非编码RNA-UCA1的真核表达载体pcDNA/UCA1,探讨UCA1对膀胱癌细胞BLS-211耐药及转化能力的影响.方法:构建UCA1的真核表达载体pcDNA/UCA1,用脂质体2000将pcDNA/UCA1表达载体及空载体pcDNA3.1转染入膀胱癌细胞BLS-211细胞,用G418筛选,建立稳定表达UCA1 RNA的BLS-211/UCA1细胞及转染空载体的BLS-211/pcDNA3.1细胞,用RT-PCR方法检测两株细胞中UCA1及neo基因的表达,鉴定阳性细胞株,通过四甲基偶氮唑蓝(MTT) 比色法检测两株细胞对顺铂及丝裂霉素耐药的变化,软琼脂克隆形成实验检测两株细胞克隆形成率的变化.结果:成功构建pcDNA/UCA1真核表达载体,并建立起稳定表达UCA1的BLS-211/UCA1细胞,表达UCA1 RNA后,BLS-211/UCA1细胞对顺铂及丝裂霉素C的耐药性增加,软琼脂克隆形成能力增强.结论:UCA1 RNA增强了膀胱癌细胞BLS-211的耐药能力及转化能力,可能在膀胱癌复发及进展中发挥作用.
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LncRNA UCA1对卵巢癌细胞侵袭及迁移的影响及机制
目的：探讨长链非编码RNA UCA1对卵巢癌细胞SKOV3侵袭及迁移能力的影响及可能的作用机制。方法：用脂质体2000将pcDNA/UCA1表达载体及pcDNA3.1空载体转染卵巢癌细胞SKOV3细胞。用G418筛选，建立稳定表达UCA1 RNA的SKOV3/pcDNA-UCA1细胞及转染空载体的SKOV3/pcDNA3.1细胞。RT-PCR方法检测两株细胞中UCA1的表达，鉴定阳性细胞株。Millicell小室检测两株细胞侵袭及迁移能力的变化，蛋白印迹法检测两株细胞MMP2及MMP9蛋白表达的变化。结果：成功构建稳定表达UCA1的SKOV3细胞，表达UCA1 RNA后，SKOV3细胞的侵袭及迁移能力均增加，MMP2及MMP9蛋白表达增加。结论：UCA1 RNA可能通过增加SKOV3细胞中MMP2及MMP9的表达来增强其侵袭及迁移能力，在卵巢癌侵袭及进展中发挥作用。
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人UCA1基因新剪接变异体全长cDNA序列的克隆
目的 克隆新的UCA1剪接变异体全长cDNA序列,为研究其可变剪接机制奠定基础.方法 用电子克隆技术和cDNA序列末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增细胞系BLZ-211 cDNA并进行产物测序和序列拼接.结果 新克隆的UCA1剪接变异体全长cDNA序列为2 202 bp.结论 综合采用电子克隆技术与RACE技术是获得全长cDNA序列的有效方法,为该基因的后续可变剪接机制的研究奠定了基础.
关键词： UCA1 电子克隆 cDNA末端快速扩增技术 -
人UCA1基因新剪接变异体UCA1a全长cDNA序列的生物信息学分析
目的 对UCA1基因新剪接变异体UCA1a全长cDNA序列进行生物信息学分析.方法 运用生物信息学的电子基因定位和序列比对进行预测.结果 UCA1a基因与已登录的CUDR基因是同一基因.我们用UCA1a(CUDR)指代这一基因.此外,UCA1a(CUDR)与UCA1之间有一段长1265bp的共同序列.结论 推测UCA1a(CUDR)基因可能具有与UCA1基因相同的生物学功能.
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尿路上皮癌胚抗原1 在消化系统肿瘤中表达研究进展
尿路上皮癌胚抗原1(UCA1) 是发现于人膀胱移行细胞癌细胞系 BLZ-211 中的一个长链非编码RNA(lncRNA)分子,在肝癌、胃癌、胰腺癌、结直肠癌、食管癌等消化系统肿瘤中表达普遍上调,发挥原癌基因作用,在消化系统肿瘤的发生、发展过程中发挥着关键作用.
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长链非编码RNA UCA1与 miRNA-99b在膀胱癌细胞株和膀胱癌组织表达的相关性分析
目的：验证LncRNA UCA1与miRNA‐99b的相关性。方法：采用荧光定量PCR法检测UCA1和miRNA‐99b在过表达和敲低表达 UCA1的膀胱癌细胞、膀胱癌组织中的表达。结果：在敲低 UCA1表达的膀胱癌细胞5637中，UCA1表达下调60％，而miRNA‐99b的表达上调250％；在过表达UCA1的膀胱癌细胞 UM UC2中，UCA1表达上调410％，而miRNA‐99b的表达下调60％；UCA1在膀胱癌中的表达水平明显高于癌旁组织（P＜0．05），而miRNA‐99b在膀胱癌中的表达水平明显低于癌旁组织（P＜0．05）；UCA1与miRNA‐99b在膀胱癌组织中的表达呈负相关（R＝‐0．502，P＜0．05）。结论：UCA1负向调节miRNA‐99b的表达，但是它对miRNA‐99b的调节在膀胱癌发生发展中的作用机制还需深入研究。
