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EB病毒转化人类外周血B-淋巴细胞建立永生细胞系
EB病毒(epstein-barr virus)转化外周血B淋巴细胞(B-LC),使其成为一种能连续分裂永久生存的类淋巴母细胞(lymphoblastoid),由此建立的类淋巴母细胞株即为永生细胞株(immortalized cell lines),它可永远传代,并且每一种永生细胞株保存了原来提供血样个体的完整基因组,而且它的生化和分子生物学特性不发生变化[1,2],可作为生物标本库建立的首选方法.
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丙型肝炎的病理生理学及抗病毒治疗
丙型肝炎病毒(HCV)属于黄病毒(Flaviviridae)家族中的嗜肝病毒(Hepcivirus).它是一种直径为55~65 nm的单股正链RNA病毒.HCV完整基因组或部分序列的系统发育分析证实,HCV主要存在6种基因型和50多种亚型.不同基因型的核苷酸序列异源性为33%~34%,氨基酸序列异源性约30%,而基因亚型不同区域的核苷酸序列异源性为20% ~ 23%.人类是HCV惟一的宿主,全球大约1.7亿即3%的人口受HCV感染.HCV从世界的一个区域向另一个区域传染流行.HCV主要经血液传输(医药和手术传输过程、静脉内注射毒品以及输血过程).在发达国家,由于高危途径如输血传播和医院感染已得到了有效的控制,60%~70%的新感染病例与静脉内注射毒品相关[1].
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痢疾杆菌基因组遗传密码被破译
据健康报2000年12月26日报道,我国科学家经过顽强拼搏,在世界上率先完成了福氏2A痢疾杆菌完整基因组的测定和分析,这标志着我国微生物基因组研究水平进入了国际先进行列。这是我国第一个向国际公布的微生物基因组研究项目,也是当前我国完成的第一个大生物体完整基因组序列测定,由465万多个碱基对组成,其长度位居目前国际上已经完成的微生物基因组的前列。据介绍,痢疾是我国的第一大传染病,每年临床分离的痢疾杆菌菌株多数对抗生素耐药,给临床治疗带来很大困难。痢疾等传染病之所以反复流行,主要在于微生物病原体基因的不断变异,因此痢疾杆菌基因组的研究具有十分重要的意义,可以为痢疾的诊断、预防和治疗提供分子基础和手段。
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中国人群出生缺陷核心家庭永生细胞株的建立
EB病毒(Epstein-Barr virus)转化人外周血B淋巴细胞,使其成为能连续分裂永久生存的类淋巴母细胞(lymphoblastoid),利用这一特点建立各种疾病人群永生细胞株(immortalized cell lines),可永远传代,并且保存了每个个体的完整基因组,其生化和分子生物学特性不发生变化,可作为建立生物标本库的首选方法.
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疫苗研究新进展——反向疫苗学
随着千余种细菌基因组在生物信息学的有效利用及实验研究的技术发展,疲苗学的领域发生着翻天履地的变化.
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食管鳞状细胞癌基因组改变的确认
食管癌是具侵袭性的癌症之一,居全球恶性肿瘤病死率的第六位。全球约70%的食管癌患者在中国,食管鳞状细胞癌是常见的病理类型(>90%)。目前,临床上对于食管鳞状细胞癌的早期诊断和治疗非常有限,患者5年生存率仅为10%。然而,直到目前对于导致食管鳞状细胞癌发病的完整基因组事件仍知之甚少。本组对158例食管鳞状细胞癌病例进行一次全面的基因组分析:其中17例食管鳞状细胞癌病例进行全基因组测序,71例进行外显子测序,在71例进行外显子测序的53例加上另外的70例未使用全基因组和全外显子测序,并进行阵列比较基因组杂交分析。本实验确定8个明显突变的基因,其中有6个是众所周知的肿瘤相关基因( TP53、 Rb1、CDKN2A、PIK3CA、 NOTCH1、NFE2L2),另两个基因在食管鳞状细胞癌中未被描述(AD-AM29、FAM135B)。值得注意的是,FAM135B被确定为新的肿瘤相关基因,并鉴定其促进食管鳞状细胞癌细胞恶性程度的能力。此外,MIR548K是编码在扩增11q13.3~13.4区域的microRNA,它是一种新的癌基因,功能实验证明MIR548K增强食管鳞状细胞癌细胞的恶性表型。本组还发现几个重要的组蛋白调控基因MLL2(又称作KMT2D)、ASH1L、MLL3(KMT2C)、SETD1B、CREBBP 和EP300在食管鳞状细胞癌中频繁发生改变。信号通路分析结果揭示一些体细胞变异主要与Wnt、细胞周期以及Notch信号通路相关。基因组分析结果表明,食管鳞状细胞癌和头颈部鳞状细胞癌共享某些共同的致病机制,且食管鳞状细胞癌的形成与饮酒有关。本文着重探讨新的生物学标志物和致瘤性的途径,提高食管鳞状细胞癌的治疗策略。