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北京市双桥医院妇科门诊患者人乳头瘤病毒感染情况调查
目的 了解北京市朝阳区双桥医院妇科门诊不同年龄女性患者人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)亚型感染情况.方法 采用核酸分子快速导流杂交技术,对2009-2012年835例受检者宫颈分泌物进行HPV-DNA亚型检测.结果 538例女性患者中共检测到175例HPV阳性病例,其中高危亚型170例,低危亚型5例.高危亚型检出率居前5位依次为HPV-16 (31.4％)、52(20.0％)、58(17.1％)、56(14.3％)、66(14.3％).≥40岁以上年龄组HPV阳性率显著高于40岁以下年龄组.结论 高危型HPV-16、52、58、56、66亚型是北京市双桥医院人乳头瘤病毒感染的主要亚型,40岁以上人群是防治的重点.
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北京市吸毒人群HCV感染状况及基因特征分析
目的 分析北京市吸毒人群HCV感染情况及其HCV的病毒基因特征.方法 利用ELISA方法和Real-time PCR方法同时检测684名吸毒人群血清中HCV抗体和HCV RNA,确定该人群的HCV感染情况.对HCV抗体或RNA检测阳性的样本进行C/E1和NS5B基因区扩增并对扩增产物进行序列测定,分析吸毒人群HCV基因亚型构成.结果 吸毒人群HCV感染率为26.2％(179/684).142例样本的C/E1或NS5B基因区扩增成功,基因进化分析发现8种HCV基因亚型:1a、1b、2a、3a、3b、6a、6n和6u.结论 伴随着人口流动性的增加,目前北京市吸毒人群HCV流行情况复杂,具有多种基因亚型.
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人类疱疹病毒8型基因亚型与Kaposi肉瘤相关性的研究进展
Kaposi肉瘤(Kaposi's sarcoma,KS)是一种罕见的特发性多灶性血管内皮肿瘤,本病分为经典型KS、艾滋病(AIDS)相关性KS、地方性KS、医源性或移植后KS四种类型.虽然其发病机制尚未明确,但研究已经证实人类疱疹病毒8型(HHV-8)与KS之间的关系密切,认为HHV-8对KS可能不仅是机会感染,而是KS的可能病因之一.目前国内外有关HHV-8与KS之间密切关系的相关研究提示:HHV-8是KS主要的致病因子.2μg的HHV-8便可以感染人群,并作为KS病原学诊断的因素之一[1],同时HHV-8亚型与不同KS临床类型及损害之间的相关性也越来越引起各国学者的重视.现对HHV-8型基因亚型与KS关系的研究作如下综述.
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2011年浙江省台州地区新发现HIV-1感染者分子流行病学调查
目的 了解2011年浙江省台州地区新发现艾滋病病毒(HIV)感染者的基本情况以及不同HIV-1基因亚型的分布情况.方法 选取台州市2011年新发现未经抗病毒治疗的HIV感染者抗凝全血标本140份,提取血浆中的病毒RNA,通过RT-PCR扩增HIV-1 pol区的蛋白酶基因全序列与反转录酶基因部分序列,使用HIV-Blast软件判定亚型.结果 2011年台州地区新发现的未经抗病毒治疗的HIV感染者男女性别比为3.24:1,感染者中92.86％为性传播感染,3.57％为注射毒品感染;共检测出5种HIV-1基因亚型,分别为CRF01 _AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B和C亚型.性传播感染人群中57.14％为CRF01_AE亚型,注射毒品人群中以CRF07 _BC亚型为主.结论 台州地区艾滋病患者以性传播途径感染为主,HIV-1基因亚型呈多样性特点,CRF01_AE亚型流行于性传播感染人群,而CRF07_BC亚型流行于毒品注射感染人群.
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2010-2012年内蒙古呼和浩特市儿童轮状病毒腹泻病监测分析
目的 研究呼和浩特地区5岁以下儿童腹泻轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行病学特征及病毒基因亚型特点.方法 采集内蒙古妇幼保健医院2010年7月至2012年6月所有≤59月龄的住院腹泻患儿粪便标本789份.采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测RV,抗原阳性标本以反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法做基因亚型检测.后整理数据,应用SPSS 13.0统计软件进行统计分析.结果 共检测789份粪便标本,ELISA法检出阳性288份,阳性率为36.50％.轮状病毒腹泻的主要流行月份为10月至次年2月,12～23月龄组感染率高为50.00％,2岁以下患儿占全部患儿总数的95.83％.轮状病毒G血清亚型检测中,2010-2011年以G3亚型为主,占37.6％,2011-2012年以G9亚型为主,占67.3％；轮状病毒P基因亚型检测中,2010-2012年以P[8]亚型为主.结论 轮状病毒是引起呼和浩特地区婴幼儿腹泻的主要病原之一,流行优势毒株发生了从G3到G9的转变.
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中国HIV-1基因亚型分布文献分析
目的 了解中国国内不同感染人群人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型及分布特点.方法 计算机检索中国知网、万方数据资源和维普科技期刊全文数据库,下载题录,并按纳入和排除标准选择文献,提取资料,分析HIV基因亚型在不同感染人群中和不同年代的分布.结果 纳入62篇文章,共2091例病例；中国主要流行的HIV-1基因亚型为B(12.4％)、B’(23.9％)、CRF01-AE (30.0％)、CRF-BC(27.2％)；HIV的基因亚型与传播途径相关；近年来,中国流行的重组毒株增多.结论 中国HIV基因亚型流行日趋复杂,为其监测、防控和治疗带来了更大的困扰.
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高原地区藏族妇女宫颈人乳头瘤病毒感染各亚型分布状况调查
目的:了解高原地区藏族妇女宫颈人乳头瘤病毒(HPV)感染率及基因亚型分布特点.方法:采用医用核酸分子快速导流杂交基因芯片技术,对7051名藏族妇女宫颈脱落细胞标本进行HPV基因分型检测.高危型15种(HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68),低危型6种(HPV6、11、42、43、44、CP8304).结果21种HPV亚型均被检出,HPV总感染率19.50％ (1375/7051),HPV16出现的频率高(32.29％),其次为HPV58(19.64％)、HPV52(10.25％)、HPV53(7.42％)、HPV18(5.96％).其中高危型、单纯低危型、单一和多重HPV感染率分别为93.60％(1287/1375)、6.40％(88/1375)、88.58％(1218/1375)、11.49％(158/1375).存在着两个感染高峰年龄,第一个高峰组在＜25岁(24.23％),第二个高峰组在≥55岁(30.54％).结论:高原地区藏族妇女宫颈常见亚型是HPV16、HPV58、HPV52、HPV53、HPV18,以高危型和单一HPV感染为主,单纯低危型和多重感染率均较低,感染年龄趋于年轻化和老年化.
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衢州地区人乳头状病毒感染的型别分布
目的:探讨衢州市普通人群不同年龄妇女人乳头瘤病毒(HPV)感染状况和感染型别,为宫颈癌的防治提供理论依据.方法:对1 003例衢州市不同年龄的妇女宫颈分泌物予通用引物PCR和HPV GenoArray-test同步检测,PCR-RFLP用于补充.结果:1003例妇女中共检出HPV阳性142例,占14.16%,其中单一感染118例,占11.76%;双重及以上感染24例,占2.39%;142例阳性患者中有高危型HPV感染的为122例,占HPV总阳性人数的85.91%.阳性患者中高危型以52、58、16为主,检出率分别为3.68%、1.79%、1.49%.不同年龄组(＜25,25～,30～,35～,40～,45～,≥50)的HPV感染率分别为34.56%、23.66%、12.09%、11.66%、10.19%、11.18%、9.09%,随年龄增长有下降趋势,但经统计学检验差异无显著性(X2=0.00,P＞0.05).农村与城市各年龄段感染率经统计学检验差异无显著性(X2=0.00,P＞0.05).HPV感染高峰年龄在＜30岁(4.99%).结论:衢州普通人群各年龄段妇女HPV感染均有一定比例,且高危型HPV感染率在总阳性患者中所占比例较高.因此,有必要定期对健康妇女进行HPV感染筛查,作为宫颈癌的初筛手段;并进行随访和相应治疗,以降低宫颈癌的发病风险.
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江阴市HIV-1感染者基因亚型分析
目的:对156例来自江阴市的新发HIV-1感染者进行基因亚型分析,以监测该地区感染人群HⅣ-1毒株的流行状况.方法:选取江阴市疾病预防控制中心2013-2016年确认和管理的156例常住人口新发HIV-1感染者为研究对象,从外周血单个核细胞中提取DNA并扩增HIV病毒pol区部分基因,通过系统进化树判断患者基因亚型.结果:156例样本中,pol区成功扩增并测序139例,系统进化树结果确定江阴市HIV-1流行毒株分属7种亚型和重组型,以CRF01_AE (43.9％,61/139)、CRF07_BC(19.4％,27/139)、CRF67_01B(13.7％,19/139)亚型为主;HIV-1基因亚型在不同性别、年龄、婚姻状况上的分布差异有统计学意义(P＜0.05);不同传播途径在各亚型中的分布差异没有统计学意义,但在同性性传播与异性性传播人群间的分布差异具显著的有统计学差异(P＜0.05).结论:2013-2016年常住人口中新发HIV-1感染者亚型分布呈现多样性,且具有明显的人群特点.
关键词： 人免疫缺陷病毒(HIV) 基因亚型 系统进化分析 -
宫颈高危型人乳头状瘤病毒在健康体检妇女中的感染情况和基因亚型分析
目的：探究在健康体检妇女中宫颈高危型人乳头状瘤病毒的感染情况和基因亚型分析情况。方法：筛选常规体检的健康妇女800例，对宫颈高危型乳头状瘤病毒的感染情况进行检测，同时分析其基因亚型分布状况，并结合妇女的年龄分组分析其感染率。结果：感染率高的亚型为HPV52。50～59岁的年龄宫颈高危型乳头状瘤病毒检出率明显高于20～29岁年龄段(P＜0.05)。结论：随着年龄的增加，宫颈高危型乳头状瘤病毒发病率有所增加，感染率高的亚型为HPV52，在临床宫颈癌的筛查和诊断中具有一定的参考意义。
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HPV亚型在预防宫颈病变中的检测分析
目的:为HPV检测在预防宫颈癌防治中的重要意义提供理论依据.方法:通过HPV-DNA检测法对576例宫颈癌患者宫颈细胞进行HPV亚型检测.结果:宫颈癌患者中大部分HPV感染,高危各亚型排序为16、58、18、52、59、68、31和CP8304型.宫颈病变Ⅰ～Ⅱ期与Ⅲ～Ⅳ期之间及病变细胞分化程度之间,HPV差异无显著性(P＞0.05).结论:宫颈癌患者中有相当的比例感染HPV,加强HPV检查对有效降低宫颈癌的发生率及死亡率有重要意义.
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不同HPV基因亚型单纯性感染与宫颈病变的关系
目的 探讨感染不同HPV基因亚型单纯性感染与宫颈上皮内瘤变(CIN)、宫颈癌的关系. 方法 分析2013年1月-2013年12月在本院门诊就诊的31 040例女性患者的宫颈HPV检测结果,对于HPV阳性的患者行宫颈薄层液基细胞学检查(TCT),TCT异常和高度怀疑有宫颈病变者进一步行阴道镜下宫颈多点活检.探讨不同HPV基因亚型单纯性感染与活检病理学检查结果的关系. 结果 (1)HPV52型是女性宫颈常见的感染型(5.4％),其他高危型HPV感染率由高到低排序依次为16、58、68、18、39、33、31、56、59、51、45、35型;(2)单一亚型HPV感染中,HPV52型是导致CIN I常见的亚型(21.7％),HPV16型是导致高级别CIN病变及宫颈鳞癌的主要亚型(40.5％、71.2％),HPV18型是导致宫颈腺癌的主要亚型(80.0％);(3)21种HPV亚型均是CIN Ⅰ发病的危险因素,其中HPV42型(OR=6.98,95％ CI为1.17 ～41.8)的危险度大;除了HPV59、6、42型以外的HPV亚型均是高级别CIN的危险因素,其中HPV16型(0R=7.09,95％ CI为5.65 ～8.90)的危险度大,其次是HPV33、58、31型;同时HPV16型(OR=22.69,95％ CI为15.92～32.34)是导致宫颈癌危险度高的基因亚型,其次是HPV18、58、31型. 结论 在现有的13种高危型HPV中,HPV52型是宫颈常见但并非危险的亚型,HPV16、18、58和33型是同高级别宫颈癌前病变及宫颈癌关系密切的基因亚型.
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人乳头瘤病毒-DNA分型检测在年轻妇女宫颈病变诊断中的价值
目的 探讨人乳头瘤病毒(HPV)-DNA分型检测在30岁以下妇女宫颈病变诊断中的价值.方法 674例30岁以下年轻妇女采用核酸分子快速杂交基因分型技术进行HPV-DNA分型检测阳性;同时进行宫颈细胞学检查、阴道镜下活检,病理检查结果 为诊断标准.结果 10种常见HPV感染频率由高至低为HPV-16、52、58、6、11、33、18、53、39、31;HPV-16型与宫颈病变严重程度有明显关联,在正常或炎症组、低度鳞状上皮内瘤变(LSIL)组、高度鳞状上皮内瘤变(HSIL)组HPV的感染率分别为12.1%(33/273)、19.0%(61/321)、51.3%(40/78),HSIL组的感染率明显高于其他2组,差异有统计学意义(P＜0.01);2例宫颈癌均检出HPV-16型感染;在HSIL组中HPV-16、58、33、18型感染率分别为53.8%(42/78)、16.7%(13/78)、12.8%(10/78)、7.7%(6/78),均高于正常或炎症组的感染率;在外阴宫颈湿疣病变中,HPV-6、11型的感染率明显高于其他型别HPV的感染,差异有统计学意义(P＜0.01);在正常或炎症组、LSIL组、HSIL组中多重感染率分别为16.5%(45/273)、39.6%(127/321)、32.1%(25/78),LSIL组与HSIL组明显高于正常或炎症组,差异有统计学意义(P＜0.01).结论 年轻妇女人群的高危型HPV感染及多重HPV感染与宫颈病变的严重程度密切相关,对年轻高危人群妇女应行HPV-DNA分型检测,及早诊断及早治疗.
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柳州市16例吸毒者HIV-1病毒流行株亚型分布及耐药情况分析
目的：了解2011-2013年柳州市吸毒人群人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1, HIV-1)亚型分布和毒株耐药情况。方法从2011-2013年柳州市吸毒人群HIV-1感染者中，随机抽取16例作为研究对象，从血浆中抽提核酸RNA，用RT-PCR进行gag及pol基因扩增，并对扩增产物进行测序和序列分析。结果16例标本中存在2种HIV-1亚型：重组亚型CRF01_AE 14例(87.5%)，重组亚型CRF07_BC 2例(12.5%)。6株发生相关耐药突变，主要发生在NRTIs和NNRTIs相关突变。结论2011~2013年柳州市吸毒人群HIV-1感染主要以CRF01_AE为主，主要在NRTIs和NNRTIs相关耐药突变。
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烟台市部分HIV-1流行毒株的基因特征和亚型分析
目的了解烟台市HIV-1流行毒株的流行情况和基因亚型特征.方法采集了7份HIV-1感染者的全血分离单个核细胞(PBMC),提取前病毒DNA,经nested-PCR扩增HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段进行扩增,并测定和分析了C2-V3区及其邻区270个核苷酸序列.结果7份HIV-1感染者的PBMC样品中扩增到HIV1env基因片段,经序列分析发现7份样品中有A、B′和E亚型.5名有偿献血人员均为B′(泰国B)亚型,2名回国劳务人员分别为A、E亚型.结论烟台市目前存在HIV-1A、B′和E三种亚型毒株,感染情况复杂,因此应加强对献血者及回国劳务人员等高危人群的检测和控制,以防HIV-1各亚型毒株在烟台市的蔓延.
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辽宁省2008-2010年HIV-1基因亚型分布特征及流行病学分析
HIV-1毒株的感染力较强,是目前HIV流行的主要病毒株和重点研究对象[1].HW-1分为M(main)、O(outlier)和N(non-M-non-O)3个组.其中M组又分为A～K亚型.近年又证实了至少16种各种亚型的重组型CRF 01至CRF016.本研究对59例HIV-1感染者血浆样本进行基因扩增和序列分析并收集相关流行病学资料,结果报道如下.1.材料与方法:(1)样本来源:选取2008-2011年经病毒载量检测,载量＞1000 copy/ml的59例样本进行HIV蛋白酶(PR)和反转录酶(RT)基因区的扩增和测序.
关键词： 人类免疫缺陷病毒1型 基因亚型 -
乙型肝炎病毒与丙型肝炎病毒及其基因亚型的重叠感染与原发性肝癌家庭聚集性的关系
广西自治区原发性肝癌(HCC)高发区人群中,在相同的生活环境、生活习惯、生活条件、生活水平中却存在明显的肝癌家庭聚集现象.初步研究结果提示,HCC的家庭聚集现象除了与遗传因素有关外,还与乙型肝炎病毒(HBV)感染有明显关系.但丙型肝炎病毒(HCV)感染、HBV与HCV重叠感染及其相互作用对肝癌家庭聚集性的影响如何目前国内外尚无报道.
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乙型肝炎病毒A～D基因型及B1、B2、C1和C2基因亚型巢式聚合酶链反应分型法的建立
目的 建立检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型和亚型特异性巢式聚合酶链反应(nPCR)分型法.方法 用DNAStar软件比较分析GenBank中登录的A～H 8种基因型HBV全基因组序列,用Primer Premier 5.0软件进行引物设计,建立nPCR分型法.该法在第一轮扩增基础上,第二轮分为3步扩增:第一步用Mix A扩增,检测B、D基因型和C1、C2亚型;第二步用Mix B扩增,检测A基因型;第三步用Mix C扩增,检测B1和B2亚型.应用该法检测68份慢性HBV感染者的血清样本,并从中随机选取15份样本的PCR产物直接测序,以验证该法的准确性.结果 该法检测68份慢性HBV感染者血清样本中,23.53%(16/68)为B2亚型,11.76%(8/68)为C1亚型,48.53%(33/68)为C2亚型,1.47%(1/68)为D型,11.76%(8/68)为B2C2混合型,1.47%(1/68)为C2D混合型,1.47%(1/68)为B2C1D混合型.随机选取15份样本测序分型,结果 与PCR法一致.结论 nPCR分型法简单快速,具有较高的灵敏度和特异度,可检测A～D基因型和B1、B2、C1、C2亚型.
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浙江省临海市2004年病毒性脑膜炎暴发疫情的病原学及其分子特征研究
目的 为确证2004年浙江省临海市病毒性脑膜炎暴发疫情的病因,分析病原的遗传变异及进化关系.方法 采集患者脑脊液样本60份,采用RD和Hep-2细胞同时分离病毒,中和试验法鉴定病毒型别；对分离株VP1和VP4/VP2基因测序,进行同源性与进化分析.结果 从60份脑脊液样本中分离到埃柯病毒30型(E30)19株,分离率为31.7％；对4株E30分离株VP1区核苷酸序列测定,其长度均为876个核苷酸(nt),编码292个氨基酸(aa).临海分离株与E30原型株Bastianni在VP1区的nt和aa同源性分别为82.4％～84.1％和93.5％ ～ 94.2％；4株临海E30株之间nt和aa的同源性分别为87.1％～99.9％和97.9％ ～ 100.0％.临海分离株分成两类,同类病毒株间的差异很小,而两类病毒株间的差异很大,nt和aa的大差异率分别为12.9％和2.1％.与临海E30株同源性高的为2002-2003年浙江E30株.在VP1基因进化树上,临海E30株分别位于G和H基因亚型分支上,其中临海G基因株与2003年浙江、江苏和山东E30株位于同一进化分支,临海H基因株与2002年浙江诸暨株位于同一进化分支.VP4/VP2区进化分析结果与VP1区相似.结论 2004年临海市病毒性脑膜炎暴发疫情由E30G和H不同基因亚型的E30流行株引起；临海E30株与2002-2003年浙江、江苏和山东E30株具有密切的亲缘关系；H基因亚型株推测为新的E30变异株,首先分离于2002年浙江省.
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云南省德宏傣族景颇族自治州2016年新报告艾滋病病毒感染者的基因亚型分析
目的 分析2016年云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)新报告HIV感染者HIV基因亚型,了解中国籍和缅甸籍HIV感染者基因亚型分布特征.方法 对2016年德宏州新报告的HIV感染者提取核酸,使用RT-PCR法对HIV基因gag,env和pol进行反转录扩增,直接测序扩增产物,综合分析3个基因的测序结果,确定终基因亚型.结果 2016年德宏州新报告HIV感染者1 112例,成功测定基因亚型的感染者860例.C亚型所占比例大(占33.6％,289/860);其后为独特重组(unique recombinant forms,URFs)(占28.4％,244/860)、CRF01_ AE(占18.6％,160/860)等亚型;URFs中主要包括4种形式的重组,其中以CRF01 AE和C亚型重组为主.缅甸籍感染者的亚型分布与民族和传播方式相关.结论 德宏州2016年新报告HIV感染者基因亚型主要集中在C、URFs和CRF01_AE亚型,URFs分布依然复杂多样.
