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  • EB病毒转化人类外周血B-淋巴细胞建立永生细胞系

    作者:裴丽君;李竹

    EB病毒(epstein-barr virus)转化外周血B淋巴细胞(B-LC),使其成为一种能连续分裂永久生存的类淋巴母细胞(lymphoblastoid),由此建立的类淋巴母细胞株即为永生细胞株(immortalized cell lines),它可永远传代,并且每一种永生细胞株保存了原来提供血样个体的完整基因组,而且它的生化和分子生物学特性不发生变化[1,2],可作为生物标本库建立的首选方法.

  • 广州生物库队列人群心脑血管病相关基因多态性研究

    作者:刘斌;江朝强;Graham Neil Thomas;劳向前;林洁明;岳晓军;张维森;朱彤;林大庆

    目的 应用Taqman单核苷酸多态性(SNP)分型法检测广州生物库队列人群心脑血管疾病相关基因的多态性.方法 从广州生物库队列研究(GBCS)中选取2000名研究对象,应用ABI7900HT型荧光定PCR仪并采用Taqman SNP分型法检测该人群rs4220、rs5368及rs285等15个心脑血管疾病相关基因多态性.对检测的基因分型数据采用遗传平衡定律检测,并与国际染色体单倍型计划(HapMap)的中国人群数据进行比较.结果 (1)所有15个SNP的分型数据均满足遗传平衡定律;(2)有两个SNP的分型数据与HapMap的中国人群数据差异有统计学意义(rs4220 28.2%对17.8%,X~2=4.891,P=0.028;rs5368 22.1%对32.2%,X~2=5.137,P=0.024).对比美国Perlegen公司人类遗传变异研究(AFD-CHN-PANEL)、美国科学基金会等位基因频率数据库(ALFRED)、日本生物信息学协会(JBIC-allele)等多个基因库数据,造成本研究SNP频率不同于HapMup的中国人群数据的原因是华南人群在遗传背景上与北方人群有一定的差异.结论本研究的数据可能更能反映南方人的特性,因此,建立大样本的广州人群心脑血管疾病相关基因多态性数据库以研究基因与环境对心脑血管疾病的影响是必要的.

  • 2016年全国细胞分子生物学技术学习班

    作者:

    北京大学第三医院坐落于北京大学医学部大院内,北医三院中心实验室与北京大学基础医学院、北京大学药学院仅一栏之隔。北医三院中心实验室成立于1983年,是北医三院重要的实验技术平台和人才培训基地,实验研究涵盖了分子生物学、细胞生物学、病理学、代谢组学、生物信息学、生物标本库和基因检测等7个方面。实验室以特色实验技术服务项目为切入点,与临床科室之间相互联系、渗透结合,共同创建多学科、开放式的服务平台,为医院的临床和教学发展提供了多功能、全方位的服务和强有力的技术支撑。

  • 生物样本库建立现况及进展

    作者:董哲君;肖飞;郭健

    生物库的建立是为了1个或多个研究目的,有组织地收集并储存人体样本及其相关信息的机构.生物库可作为基础研究成果向临床应用转化的基础平台,在疾病诊断、新药研发、疾病相关基因研究及流行病学研究中均有重要作用.转化医学的兴起促进了生物样本库的建立及发展.我们主要阐述生物样本库建立的必要性、现代生物库类型、样本质量控制、生物库构建及操作指南的现况及研究进展,以为生物库的完善提供参考.

  • 乳腺癌生物标本库的建立与管理

    作者:陈庆秋;钟玲;齐晓伟;张孔涌;姜军

    乳腺癌的基础与临床转化研究是当前医学研究的热点领域。已有研究显示,建立并充分发挥生物样本库是推动转化医学发展的基础[1]。既往多根据研究课题的需要进行临时的标本收集,大量有使用价值的肿瘤标本和相关资料流失,给相关疾病的深入研究带来了极大的损失[2]。为解决上述问题,自20世纪末期以来,国内外兴起了标准化肿瘤标本库的创建,并逐渐规范化,形成了标准化的标本数据库平台。第三军医大学附属西南医院结合国内外建立肿瘤标本库的经验,自2004年起着手建立乳腺癌标本库,历经10余年的建设和发展,初步探索出较为完善的建立乳腺癌标本库的方法与管理模式,现介绍如下。

  • 中国南方汉族人肺癌资源库的建设与使用

    作者:邱源;张鑫;何建行;李慧灵;廖东江;王炜;徐鑫;温丹萍;邓秋华;冼海凤;钟南山

    近年来,随着国内外肺癌发病率与患病人数的上升,前瞻性或回顾性研究课题不断增加,肺癌生物学研究对肺癌临床诊断治疗的影响剧增.如何整合肺癌病例资源,保存珍贵的肺肿瘤生物资源,大限度地完善临床资源数据,为临床与基础科研研究提供可靠的资源平台,是亟待解决的问题.

    关键词: 肺肿瘤 生物标本库
  • 自然沉降法分离抗凝全血建立生物样本库的特点

    作者:陈智滨;林琴;马长华;刘凯宁;孟焕新

    目的:评估用自然沉降法分离EDTA抗凝外周静脉全血(抗凝全血)建立血浆、白细胞、基因组DNA生物样本库的特点.方法:采集符合纳入标准的29名志愿者抗凝全血,进行血常规检测作为对照组;然后将抗凝全血分装到4支EP管中,每支1 mL,分为0.5、1、2、3 h 4个试验组,于室温静置自然沉降0.5、1、2、3 h后吸取血浆层,测量其体积,检测血浆层中白细胞总数及中性粒细胞、淋巴细胞的百分比;将含有白细胞的血浆层离心后,分装为无细胞血浆管和白细胞沉淀管,用部分白细胞提取DNA,建立血浆、白细胞、DNA 3种生物样本库.结果:0.5 h组血浆体积(241.72±101.52)μL显著低于1 h组(317.24±97.50)μL、2 h组(371.03±91.66)μL和3 h组(408.97±97.43)μL,P<0.05.1 h组血浆体积显著低于2 h组和3 h组,P<0.05;2 h组显著低于3 h组,P<0.05.0.5 h组白细胞总数[(2.50×106)±(1.48×106)]显著高于2 h组[(1.47×106)±(7.19×105) ]和3 h组[(1.21×106)±(7.41×105)]的白细胞总数,P<0.05,与1 h组[(2.29×106)±(1.17×106)]比较差异无统计学意义,P>0.05;1 h组显著高于2 h和3 h组,P<0.05;2 h组与3 h组差异无统计学意义,P>0.05.4个试验组白细胞总数均显著低于对照组.中性粒细胞百分比:0.5 h组(54.14%±11.65%)显著高于1、2、3 h组(46.66%±12.70%,39.17%±12.33%,43.25%±14.54%),P<0.05,显著低于对照组(60.53%±8.46%),P<0.05;1 h组显著高于2 h组,P>0.05; 1 h组与3 h组比较差异无统计学意义,P>0.05;3 h组与1 h、2 h组比较差异无统计学意义,P>0.05.淋巴细胞百分比:0.5 h组(35.09%±10.84%)显著低于1、2、3 h组(41.48%±12.20%、47.96%±12.27%、45.50%±13.71%),显著高于对照组(30.98%±7.33%),P<0.05;1 h组显著高于对照组、0.5 h组,显著低于2 h、3 h组,P<0.05;2 h组显著高于对照组、0.5 h、1 h组,P<0.05,与3 h组之间差异无统计学意义,P>0.05.结论:抗凝全血自然沉降法是一种无化学试剂干扰、低物理因素影响、低消耗、操作简单的分离白细胞血浆层的方法;0.5~1 h是抗凝全血自然沉降获取含白细胞血浆层的佳时间段;利用一份抗凝全血可以分离出血浆、白细胞和DNA 3种生物样本,建立3种生物样本库.

  • 中国人群出生缺陷核心家庭永生细胞株的建立

    作者:裴丽君;李竹;任爱国;赵文睿;曲梅;朱江辉

    EB病毒(Epstein-Barr virus)转化人外周血B淋巴细胞,使其成为能连续分裂永久生存的类淋巴母细胞(lymphoblastoid),利用这一特点建立各种疾病人群永生细胞株(immortalized cell lines),可永远传代,并且保存了每个个体的完整基因组,其生化和分子生物学特性不发生变化,可作为建立生物标本库的首选方法.

  • 北京大学临床肿瘤学院标本库的建设

    作者:季加孚

    研究恶性肿瘤的重要材料就是肿瘤标本,但长期以来国内始终没有建立起切实可行、规范的科研型标本库,未形成规范的标本保存方法.北京大学临床肿瘤学院标本库始建于1996年,其职责是采集、保存和利用人类常见肿瘤的组织和血液标本,并对其进行科学的管理和质量控制.目的是充分利用医院现有的肿瘤标本资源,为人类疾病的基础和临床研究提供材料.标本库于2000年底改建,在外科、手术室、病理科的配合下,现已初步形成标准化、规范化的样本采集、储存和管理体系.目前库存常见肿瘤标本3 000多份,近5年增加了血清标本的保存项目,现已库存常见肿瘤血清标本2 000份.

  • 标本资源库存储与标识规范探讨

    作者:胡颖;张连海;季加孚

    标本资源库的建设是一个长期的过程,它涉及到很多领域的技术和规范.标本资源库的储存容器与相应的标识方法因所储存标本的不同而不同,本文将就存储方式以及标识方面有共性的规范进行详细介绍,希望对正在建设及完善标本资源库的同道们有所帮助.

  • 切尔诺贝利核事故受照射人员生物标本数据库的建立

    作者:李雨;Кравцов ВЮ;Ⅲантыръ ИИ;Астафьев ОМ;ФеДорцева РФ;Aleksani SS;闵锐;蔡建明

    目的 建立一种简易的核事故受照射人员生物标本库,准备用于研究小剂量电离辐射对人体作用.方法 将血液标本固定于滤膜上加以封存,血液标本常规涂片染色保存和保存一部分头发.结果 收集1162例人体生物标本,其中958例切尔诺贝利核事故清理工作人员,46例其他核事故受照射人员,158例对照组人员,这些生物标本附有完整的信息数据.结论 建立的生物标本数据库对于更加详尽获取辐射生物效应信息、回顾性研究辐射对人类机体作用机制,具有重要的理论和实践价值.

  • 人脑胶质瘤标本库的初步建立与管理

    作者:焦保华;梁朝辉;王苑宇;孙实安;席增辉

    目的 建立脑胶质瘤标本库,充分保护和合理应用胶质瘤标本,为胶质瘤的临床及科研提供肿瘤标本.方法 收集脑胶质瘤患者手术前静脉血、获取新鲜肿瘤组织标本和部分正常脑组织标本,分别提取血液及组织标本中DNA、RNA以及蛋白,贮存于-196℃液氮罐中,记录每例患者流行病学特点及病理诊断,术后6个月开始进行随访.结果 全血及组织中提取的基因组DNA、组织标本中提取的总RNA其OD260/280比值都在1.8~2.1之间、所提取蛋白经二辛可酸法蛋白定量检测均能够满足胶质瘤分子生物学研究的需要.结论 脑胶质瘤标本库的初步建立,形成了一套系统的、可行的胶质瘤标本库的建设及管理方法,可为胶质瘤的分子生物学研究提供标本和相关资料来源.

  • 非酒精性脂肪性肝病生物样本库的建立与管理

    作者:陈立震;张海英;姜曼;牛同红;王健;耿宁;刘昊刚;辛永宁;宣世英

    目的:探讨非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)血液标本的采集和保存及生物样本库的建立和信息化管理方法。方法收集2009年10月-2013年10月经B超及临床血液学检测诊断为NAFLD的1226例患者的全血标本,进行生化指标测定、血浆及全血基因组DNA提取,并检测DNA的浓度和纯度,分别放至-80℃超低温冰箱储存备用,同时建立一套信息管理系统用于NAFLD生物样本库的管理。结果1226例NAFLD患者的全血标本,其中包括双生子标本83例及家系标本100例。血浆及DNA的提取成功率均为100%,并随机抽取100份 DNA 进行检测,结果表明所收集标本能够满足后续试验要求。结论该研究成功建立了NAFLD生物样本库,拥有标准化的信息管理系统,对标本进行质量控制和信息化管理,为进一步研究NAFLD奠定了良好的基础。

  • 苏州市血清库建设与发展的思考

    作者:倪川明;张钧;胡一河;陆艳;高艳

    [目的]实施苏州市血清库建设项目,为医学科学研究与生物医药产业的协调发展和形成适合生物医药产业快速发展的基地创造条件。[方法]建设工作主要涉及四个方面,一是场所建设,二是设备购置,三是组织机构与体系架构,四是样品与信息的采集、处理与保存。[结果]场所、设备和组织体系建设均达到了项目设计要求,共收集样品60980人份,制作保存标本367837份,在规定的时间内完成了计划任务。[结论]血清库完成了向政府承诺的一期项目要求,并在实施过程中积累了一些有益经验,同时也发现和总结了不足,为今后的发展奠定了基础。

  • 中华(上海)骨髓库的HLA分布报告

    作者:张工梁;杨颖;冯喆;张雁征;冯明亮;嵇月华;陆琼;马俊;季芸;毛昕;张钦辉;杨钧仪;张瑾;袁惠章

    目的报告中华(上海)骨髓库中HLA血型资料,了解中国人群HLA分布特点。方法用微量淋巴细胞毒试验检测11 995名志愿者的HLA-A、B抗原,并用序列特异引物聚合酶链反应(PCR-SSP)进行DNA水平的质控和对有疑问结果作复查。结果共检出A座位特异性25种,B座位抗原特异性52种,有显著意义的连锁不平衡单型有62种,其中以A2-B46、A30-B13、A33-B58、A11.1-B60、A24-B62、A24-B60等为常见;检索HLA-A、B、DR抗原(基因)匹配志愿者的“命中率”约为1‰。结论中国人群HLA分布有自身特点,而现有骨髓库HLA-A、B基因的遗传特征介于南、北方汉族之间,但偏向于北方人群。

  • 两步和三步法分离样本资源库抗凝血单个核细胞和血浆效果比较

    作者:丛佳;徐杰;代艳超;王子康;孙坚萍

    目的 比较两步和三步法分离外周血单个核细胞(PBMC)和血浆的效果.方法 对送至样本资源库的16例抗凝血标本分别采用两步法和三步法分离PBM C及血浆,并对2种不同处理方法的分离效果进行比较.两步法为将抗凝血加入淋巴细胞分离液,离心后分别分离PBM C和血浆;三步法则先离心分离血浆后再加入淋巴细胞分离液,离心后分离PBM C.结果 2种处理方法处理后检测的活细胞数、总细胞数及活细胞比例结果相近,差异均无统计学意义(P>0.05).两步法血浆中细胞因子水平均低于三步法,其中25种细胞因子比较,差异均有统计学意义(P<0.05).结论 两步法省时,操作少,在分离PBMC方面效果与三步法类似;但两步法在分离血浆方面会影响血浆细胞因子水平.

  • 科学防癌乐观情绪很重要

    作者:科技日报

    "近我经常问自己,我们究竟能治愈多少病?就像我们消化类疾病,消化道肿瘤一发现就是中晚期."在近日由广东省中医药协会、中国医药生物技术学会组织生物标本库分会举办的第二届中国中西医交融高峰论坛上,同济大学教授、消化病学专家、上海分子医学中心主任郜恒骏有感而发,回想过去30年,西医整天干的事情就是围绕疾病,现在才发现,我们过去忽视了很多预防性的东西,包括产前检查、出生之前、正常亚健康的时候,也包括发现疾病前期的时候.

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