首页 > 文献资料
-
1983例已婚妇女宫颈HPV感染状况及基因型别分析
目的 了解武汉市某城区已婚妇女宫颈HPV感染状况和基因亚型分布情况,为该地区预防HPV感染和防治宫颈癌提供科学依据.方法 采用原位杂交技术对已婚妇女的宫颈脱落细胞标本进行23种HPV基因分型检测.结果 共对1983例已婚妇女的宫颈脱落细胞标本进行了检测,HPV总感染率为12.86％(阳性者255例).HPV感染者集中在25 ～49岁年龄组(阳性者246例),占96.47％,各年龄组HPV感染率间差异有统计学意义(x2=16.002,P＜0.05);HPV感染者中82.35％为单一型,其中高危单一型感染占75.71％;混合型感染占17.65％,以双重感染为主(71.11％);基因亚型总检出率从高到低依次为16、58、18、11、56、33和52型,而混合型感染主要型别为18、58和16型.结论 该地区HPV感染以16、18、58型为主,高发于25 ～49岁组妇女,针对25～49岁组妇女开展HPV感染检测和准确分型对宫颈病变的防治具有重要的意义.
关键词： 人乳头状瘤病毒(HPV) 感染 基因分型 已婚妇女 -
昆明地区女性HPV基因分型情况分析
人乳头瘤病毒(HPV)是常见的传播性病原体,主要通过直接或间接接触污染物品或性传播方式感染人类.现在研究表明,HPV是引起宫颈癌及其癌前病变的主要因素,99.7％的宫颈癌患者都可以检测到HPV DNA[1,2].HPV检测作为宫颈癌筛查的一种手段越来越受到医务人员的重视.为了解昆明地区妇女HPV感染及基因型分布情况,为宫颈癌早期防治提供理论依据,现对25522例标本的检测结果进行分析,具体报告如下.
-
昆明地区女性宫颈HPV感染亚型分布情况分析
宫颈癌是妇科第三大致死性肿瘤,2012年,全球大概有527 600新发病例,大约有265 700人因此死亡[1].人乳头瘤病毒(HPV)是宫颈癌的主要致病因素,95％以上的宫颈癌组织中含有高危HPV基因[2].目前为止,已发现200种以上HPV亚型,其中大约有60种感染人类生殖道,根据它们致癌能力不同,分为低危或高危HPV亚型[3].不同型别HPV分布存在地域性差异,不同型别的HPV致癌机制、致病能力也不尽相同[4].明确一个地区HPV流行的主要型别,可以根据感染型别预测病变进展,评估患者预后,指导临床制定合理的治疗方案,帮助医生做到早诊早治,还可以为科研人员研制有针对性的基因疫苗提供可靠依据.
-
安徽省婴幼儿腹泻轮状病毒G/P分型分析
目的 了解安徽省婴幼儿腹泻轮状病毒的基因型别分布特点.方法 对2011年1 ～12月收集的5岁以下住院婴幼儿腹泻粪便标本307份,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测轮状病毒抗原,阳性标本运用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行G型和P型分型.结果 307份粪便标本中轮状病毒阳性率为15.64％(48/307)；G3型为优势株,占47.91％(23/48),G9型占27.08％(13/48),G1型占16.67％(8/48),混合G型感染占14.58％(7/48),G2型占6.25％(3/48),G4型占2.08％(1/48)；P基因型中常见为P[8],占62.67％(32/48),P[4]占8.33％(4/48)；G3P[8]优势组合占47.91％.结论 引起安徽地区婴幼儿腹泻的轮状病毒G3P[8]是主要优势流行株,G9型为次之的优势株且存在混合G型感染.
-
赤峰地区丙型肝炎病毒基因分型相关因素分析
目的 了解赤峰地区慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因分型情况,与传播途径,肝功及HCV-RNA之间的关系.方法 采集门诊及住院患者血清HCV-Ab(+),HCV-RNA(+)标本479例,利用基因芯片技术进行基因分型检测,分析不同感染途径HCY基因型分布区别及不同基因型与HCV-RNA水平,肝功能的关系.结果 发现1b型239例(49.9％),2a型229例(47.8％),2i型6例(1.25％),3b型2例(0.42％),2r型1例(0.21％),3a型1例(0.21％),1a型1例(0.21％).输血史15例(5.22％),毒品注射史229例(47.81％),纹身3例(0.6％),穿耳孔2例(0.4％),手术史61例(12.73％),拔牙21例(4.38％),夫妻感染6例(1.25％).肝功异常321例,肝功正常158例,肝功异常以2a型居多.HCV-RNA复制水平1b和2a型无明显差异.结论 赤峰地区HCV流行株为1b型,主要感染途径为毒品注射史(包括少数静脉药隐者和大部分短期或偶尔毒品注射者,所应用毒品为安纳加).HCV-RNA水平与基因型无关系,肝功能指标ALT、AST、GGT、TBiL等2a型与1b型无统计学差异.年龄＞50岁的以1b型为主.
-
乙型肝炎病毒的研究进展
乙型肝炎病毒(hepatitis B Virus,HBV)引起的乙型肝炎是一种流行久远、传播广泛、危害严重的传染性疾病.全球约20亿人感染过HBV.我国约有1亿HBV携带者,严重危害国人健康,影响生活质量.文章从乙肝病毒的分类、特征、基因分型、发病机制、检测技术、预防和治疗等方面进行了综述.
-
对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒检测及各基因型分析
根据虾传染性皮下和造血器官坏死病毒（IHHNV）病毒基因型特点和OIE《水生动物疾病诊断手册》推荐的引物，对一例进境南美白对虾（Litopenaeus vannamei）亲虾进行IHHNV病毒分型PCR扩增并对扩增产物测序，测序结果与NCBI 的IHHNV基因序列比对显示同源性为95%以上，确定样品为IHHNV阳性；309F/R引物扩增序列与IHHNV福建分离株、夏威夷分离株、马达加斯加分离株（3A型）、坦桑尼亚分离株（3B型）、泰国分离株进行序列比对，同源性分别为99%、98.7%、79.9%、90.6%和93.9%，显示分离的309bp序列与IHHNV 3A型和3B型的同源性较低，样品为传染性皮下和造血器官坏死病毒感染型毒株I型或Ⅱ型阳性。
关键词： 传染性皮下和造血器官坏死病毒 PCR扩增 基因分型 感染型毒株 -
低拷贝DNA模板检验方法探讨
目的 探讨扩增及检测方法对低拷贝DNA模板分型检测灵敏度的影响.方法 Control DNA 9947A按比例稀释,采用ldentifiler~(TM)和DNATyper15~(TM)试剂扩增,循环参数设置为28和28+6个循环,平行扩增3次,分别单独检测及3次合并检测,使用310及3130分析仪检测.结果 28+6个循环的基因座检出率高于28个循环;等位基因不平衡及丢失与基因座没有特异性的关联,随着DNA模板量的减少,等位基因不平衡及丢失增多;将3次扩增产物混合后检测,等位基因不平衡及丢失情况减少,分型正确率增高.结论 模板DNA分3次扩增后混合检测、循环数为28+6,可提高低拷贝模板基因座的检出率.
-
不同分型方法的STR分型差异
目的调查不同的STR分型系统之间分型的一致性.方法100例不同个体的DNA样本分别用单位点聚丙烯酰胺凝胶银染法和Rower P1ex 16 System试剂盒对13个法医学常用STR位点进行基因分型,并比较两种不同分型系统间的分型结果.结果1例样本在D8S1179位点出现了分型不一致的结果:银染法的基因型为12/14.而用PowerPlex16 System试剂盒的分型则为12/15.结论不同的STR分型系统可导致不同的基因分型.
关键词： 短串联重复(STR) 基因分型 异常分型 聚合酶链反应(PCR) -
高分辨率熔解曲线分析技术及其在法医学中的应用
高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)分析技术是一种利用DNA杂交与退火熔解特性进行核酸分析的技术,主要通过对DNA解离活动中荧光染料变化的监控,实现突变的筛查和检测.HRM分析技术不需要探针标记,并且能够在很大程度上减少测序的负担,具有特异性好、通量高、时间成本低、便于操作等优点.HRM分析技术还是一种同质闭管的检测方法,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)与后续检测均在同一孔内完成,无需转移样品,能有效的减少交叉污染的可能性.近年来有越来越多的专家学者尝试将HRM分析技术应用于法医学研究和相关案例中.本文拟对高分辨率熔解曲线分析技术的原理、技术特点、局限性以及在法医学中的应用进行综述.
关键词： 法医物证学 高分辨率熔解曲线分析 基因分型 -
广西地区京族人群9个STR基因座遗传多态性
286例广西地区京族人群无关个体血样,采用Chelex-100的方法提取DNA,荧光标记复合扩增系统Profiler Plus Kit(ABI公司)扩增D8S1179、D21S11、 D18S51、D3S1358、VWA、 FGA、D5S818、D13S317、D7S820 等 9个 STR 基因座,ASI 377-96全自动测序仪对扩增产物进行检测,Geno Typer软件进行基因分型.
-
6个STR基因座在宁夏山区回族聚居区的多态性
128名无关个体血样,取自宁夏回族聚居之南部山区6县.Chelex法提取DNA,按Promega公司试剂盒操作方法进行D16S539、D7S820、D13S317、CSF1PO、TPOX、TH01等6个基因座的复合扩增,并进行聚丙烯酰胺变性胶电泳分离和银染检测,得到基因分型及各基因座等位基因频率分布(表1).
-
建立检测制式长枪上DNA多态性的新方法
目的 建立快速、准确检测制式长枪上基因分型的新方法.方法 联合使用直扩法、硅膜法对48支制式长枪上5个不同部位共240份检材进行DNA检测.结果 联合使用直扩法及硅膜法,在48支制式长枪中检测出DNA完整分型42支,检出率达87.50%.结论 联合使用直扩法、硅膜法,可有效快速、准确地检测出制式长枪上DNA多态性.
-
中国北方汉族和南方黎族RHCE基因分型
目的 建立应用PCR技术进行RHCE基因分型的方法.方法 应用序列特异性引物PCR技术(PCR-SSP)检测200例中国北方汉族、南方黎族个体的RHCE基因型,同时对5例亲子鉴定样品进行检测.结果 2个民族个体RHCE基因分型结果与血清学分型结果完全一致;其中中国北方汉族RH基因型频率分布为RHCCEE 1例,RHCCEe 3例,RHCCee 88例,RHCcEE 4例,RHCcEe 20例,RHCcee 54例,RHccEE 1例,RHccEe 22例,Rhccee 7例;中国南方黎族RH基因型频率分布为RHCCEE 2例,RHCCEe2例,RHCCee 106例,RHCcEE 7例,RHCcEe 62例,RHCcee 10例,RHccEE 3例,RHccEe 8例.亲子鉴定样品RHCE基因型检测结果与13个STR位点联合鉴定结论一致.结论 PCR-SSP技术能准确判断中国北方汉族和南方黎族个体的RHCE基因型.
关键词： RHCE基因 基因分型 序列特异性引物PCR 中国汉族 中国黎族 -
寡核苷酸芯片技术在HLA-A抗原基因分型中的应用研究
目的建立一种HLA-A位点的基因芯片分型方法,为HLA-A位点的基因分型提供一个较新的思路.方法利用基因芯片技术,根据HLA-A位点不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值分析确定样品HLA-A位点的基因亚型.将这一方法应用于100份标准DNA和200份无关个体的HLA-A位点基因分型并将部分样品进行测序.结果检测结果表明HLA-A基因分型芯片可准确分辨出A位点等位基因20大类,耗时2.5h.结论寡核苷酸芯片技术用于HLA-A基因分型,分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便、结果直观,适合于法医学实践和临床应用.
-
微量DNA的短串联重复序列分型可行性
目的了解微量DNA分型的法医学应用的可行性.方法一系列浓度的DNA模板用PowerPlexTM16 Svstem试剂盒扩增,并用ABI 377 DNA测序仪进行短串联重复序列(STR)的分型.结果当模板量小于250pg时,部分位点发生了等位基因漏扩,并出现非特异带、杂合子扩增不平衡等干扰分型的杂峰.结论上述这些不正常的现象可能会导致分型错误.在对微量检材的DNA检验结果进行判型时一定要小心谨慎,全面考虑.
-
HLA基因分型技术的进展与展望
研究人的主要组织相容性复合物HLA(human leucocyte antigen,人类白细胞抗原)的结构和功能有助于认识生命现象的本质以及疾病的致病机理,因此长期以来一直是生命科学研究的重点之一.随着分子生物学技术的迅速发展,HLA分型已经由传统的血清学水平向DNA水平过渡,并取得了很好的效果.本文对目前各种HLA基因分型方法的原理和优缺点结合自己的应用经验做了评价,并简要介绍了在HLA基因分型研究中出现的新的动态.
-
PCR-RFLP用于 ABO分型遇到的问题及解决方法
用 PCR-RFLP技术进行 ABO基因分型，是从基因水平进行 ABO血型判定，具有操作简单、结果准确等优点，特别是能够解决 " 非分泌 " 型斑迹的血型鉴定问题，在法医学中具有重要的应用价值。近年来这种技术已广泛地被国内外众多法医界学者采用，取得了较好的效果 [1-3]。我们实验室应用 PCR-RFLP方法 [4 ]在对刑事案件中 100 多份血斑、混合斑生物物证进行 ABO基因型检测的过程中，对绝大多数生物物证的血型都能做出明确的判定。但曾遇到过两份生物物证，一份是手帕上微量的血迹 ,另一份是阴道擦拭棉签，在结果判定上遇到了问题，不能明确判定血型。原因是，人 ABO基因 233～ 433区域扩增产物经电泳分离后产生的本该为 200bp一条区带，而这两份样品 233～ 433区域扩增产物经电泳分离后除产生 200bp区带外，在 178 bp 位置另显现一条清晰的区带，从而干扰了 KpnI酶切结果的判读，导致不能确定两份样品的基因型。为解决这类样品的 ABO基因分型问题，我们取该手帕血 DNA,对 ABO基因的 233～ 433 与 660～ 788两个区域进行序列分析，报告如下。
-
DYS389Ⅱ基因座在家系样本中分型异常的分析
Y-STR (short tandem repeat)基因座是遗传学[1]、法医学[2]和系谱学[3]研究中重要的遗传标记,商品化的Y-filer试剂盒同步检测DYS389Ⅱ等17个Y-STR基因座,具有高度的多态性,但文献报道Y-STR的突变率较高[4],且单一基因座的突变就可导致整条Y染色体单倍型的改变.
关键词： 法医生物学 Y-STR 基因分型 DYS389Ⅱ基因座 -
自贡地区乙肝病毒基因分型检测的应用
目的:了解自贡地区乙肝病毒(HBV)基因分型和HBV-DNA载量之间的关系.方法:应用实时荧光聚合酶链反应(PCR)技术对124例乙肝患者血清进行基因分型和HBV-DNA载量检测.结果:124例乙肝患者中B基因型110例(88.7％),C基因型14例(11.3％),无B/C混合基因型.B基因型在乙肝患者中所占构成比高,C基因型次之,差异有显著性(P<0.01).B基因型、C基因型之间HBV-DNA载量差异均无显著性(P>0.05).结论:自贡地区乙肝病毒基因型以B型为主,C型次之;B型乙肝病毒DNA含量与C型无统计学差异.
