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登革热的流行病学特征和预防措施
登革热是由登革热病毒引起的急性传染病，主要流行于热带和亚热带地区。登革热病毒分为4种血清型（ DV-1、DV-2、DV-3、DV-4），在我国登革热疫情中4种血清型均有流行，但以DV-1流行为主。自1978年以来，我国几乎每年都有登革热疫情报道，尤其是广东省成为登革热的重灾区。2014年广东省有登革热感染者达4万多人，这一疫情引发社会广泛关注。但是，目前公众对登革热认识不足，影响了公共卫生防治措施的效果，现针对这一现象，从该流行病分布规律、病毒病原学特征、相关疾病临床特点以及预防控制措施等几个方面进行介绍和分析。
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重庆单中心手足口病分子流行病学特征分析
目的 了解2014年重庆地区手足口病的流行特点和分子生物学特征.方法 收集2014年重庆医科大学附属儿童医院门诊传染病报卡的手足口病病例和住院的手足口病病例,描述性分析其流行病学特征;对住院并采集了粪便标本的手足口病病例,以RT-PCR方法行肠道病毒DNA扩增和鉴定并测序分型,构建系统进化树行分子流行病学分析.结果 19 207例手足口病患儿进入流行病学特征分析,男∶女为1.5∶1,以散居及幼托为主(97.9％),发病中位年龄2.1岁(1d至17岁),5岁以下患儿占94.2％;呈现4～6月和9～12月2个流行高峰,分别占全年发病的36.9％和52.8％.364例住院且行病原学检测阳性的手足口病病例进入病原学和分子流行病学分析,其中239例为重症病例,EV71感染占64.4％;单纯EV71 195例(53.6％)、单纯CA16 18例(4.9％)、单纯CA6 23例(6.3％)、单纯CA10 6例(1.6％)、混合感染45例(12.4％)、其他肠道病毒77例(21.1％);EV71在1～6月检出率高,CA6在9～12月检出率高,EV71/CA6混合感染占9.3％.病毒序列分析显示2014年重庆地区分离到的EV71属于C4a亚型,CA16为B1b亚型,CA6与日本及西班牙等地的代表菌株同源性较高,CA10与中国其他地区流行株同源性较高.结论 2014年重庆地区手足口病流行呈双峰模式,发病人群以5岁以下散居及幼托儿童为主.手足口病流行的病毒株为EV71 C4a亚型和CA16 B1b亚型.
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九江地区手足口病病原学特点及临床特征
目的 分析手足口病病原学变化及其相应临床特点,指导重症手足口病防治.方法 采用回顾性分析方法,对2011-2013年收治的手足口病病例病原学结果及临床转归等进行分析.结果 病原学结果显示,EV71感染人数及比例呈下降趋势,CoxA16型和其他肠道病毒感染的比例和人数均有升高.但重症病例当中,其病原学检查主要为肠道病毒EV71型,占77.09％,其次为CoxA16型,占15.51％,其他型别肠道病毒感染占7.40％.在临床特征方面,患者年龄在4个月～11岁之间,1～～5岁患儿占发病人数的94.5％.城郊及农村病例多于市区,占61.5％.临床普通病例主要表现为手、足、口皮疹,占87.29％,发热占73.31％,心肌酶升高占78.54％;重症、危重症病例主要表现为神经系统、循环系统并发症,该类病例多在1～3岁,常伴有外周血白细胞、中性粒细胞增高等现象.结论 儿童为手足口病高发人群,城郊及农村仍是该病防治的重点;重症、危重症病例多见于EV71感染.
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诺如病毒性腹泻研究进展
诺如病毒(Norovirus,NV),又称小圆结构病毒(SRSV)、诺瓦克样病毒(NLV),全球广泛分布,人们一度低估其危害.随着20世纪90年代NV感染快速诊断技术的建立,其危害性和严重性越来越被了解,如今NV已被公认为各年龄段感染性腹泻常见病因.现就NV的病原学特征、流行概况与临床表现、检测方法与监测的研究进展综述如下.
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江苏省2009年甲型H1N1流感流行病学及病原学特征分析
目的:探讨2009年度江苏省甲型H1N1流感流行特点及其病原遗传学特征.方法:对2009年6月12日～10月15日在"甲型H1N1流感监测系统"中报告确诊的1 888例病人信息进行描述性分析,并对3例输入性病例分离的病毒进行全基因组序列分析.结果:甲型H1N1流感输入后疫情呈现上升趋势,36周达到高峰,随后疫情有所下降;苏南、苏中、苏北地区的确诊病例数占总病例数的构成比分别为48.18%、29.45%、22.14%,全省甲型H1N1流感病例主要集中于学生和青壮年人群.3例输入性病例分离毒株的8个基因片段核苷酸序列同源性高达99%～100%.与参考株相比,分离株A/Nanjing/1/2009HA蛋白突变的5个氨基酸中有一个位于Ca抗原位点208位氨基酸(R→K).分离株同时具有人、禽和猪流感病毒的分子特点,不具备高致病性禽流感病毒的分子基础.结论:江苏省甲型H1N1流感输入后疫情发展存在地区差异,学生和青壮年人群是主要的发病群体;随着病毒在人群中的进一步适应和持续存在,除了抗原漂移外,病毒的某些分子特征也可能发生变化,应特别关注这些变化对病毒的传播力和致病性的影响.
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肠出血性大肠埃希菌及其引起暴发的研究
大肠埃希菌属人肠道正常菌群.少数大肠埃希菌可使人致病,称致泻性大肠埃希菌.肠出血性大肠埃希菌( EHEC)是其中常见的一类,是重要的食源性疾病致病菌,常见血清型包括O157等.自1982年在美国引起首次暴发后,EHEC便在世界各国陆续引起暴发.此文针对EHEC的病原学特征、历年暴发及实验室鉴定等方面进行综述.
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ICU肺部感染的病原学以及药敏分析
目的 探讨我院ICU肺部感染的病原学特征及其药敏.方法 分析我科近年来收治的124例肺部感染患者的临床资料,并对其病原学特征以及相关药敏试验结果进行分析.结果 我科重症患者肺部感染主要致病菌以革兰阴性菌居多,主要包括铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、白色链球菌、克雷伯杆菌、肺炎链球菌等,其中革兰阴性菌较头孢噻肟、头孢哌酮/舒巴坦等敏感,革兰阳性球菌病原菌对万古霉素等较为敏感.结论 ICU肺部感染患者的病原菌种类多样,以革兰阴性菌为主,监测重点为多重耐药菌株,结合药敏试验合理选择抗生素是关键.
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泉州地区2014-2015年手足口病病原检测结果分析
目的 分析泉州地区手足口病病原检测结果,了解其病原学特征,为防控提供依据.方法 通过手足口病监测网络平台,收集2014-2015年泉州各监测哨点医院送检的1 225份疑似患者咽拭子标本,用实时荧光RT-PCR法先进行肠道病毒通用型(EV)核酸检测,对阳性标本再进行肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇肠道病毒A16型(CoxA16)分型,分析检测结果.结果 1225份标本中,手足口病EV核酸阳性标本936份,阳性率76.4％;2015年阳性率(83.7％)高于2014年(68.3％);其中EV71型占32.7％,CoxA16型占17.4％,其他肠道病毒型占49.9％.发病高峰在3～6月.肠道病毒感染以1～3岁儿童为主,男性高于女性.结论 2014-2015年泉州市手足口病存在季节、人群及地区分布差异,主要病原为其他肠道病毒和EV71,应引起重视.
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淮安市灌肠类熟肉制品生产环节致病菌检测及病原学分析
目的 了解淮安市灌肠类肉制品各生产环节致病菌污染状况及病原学特征.方法 根据国家食品安全微生物检测标准检测金黄色葡萄球菌、沙门菌和单核细胞增生李斯特菌,使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对致病菌进行分子分型,同时对其进行药敏分析.结果 105份样品中,致病菌总体污染率为17.14％,主要致病菌为金黄色葡萄球菌和沙门菌.原辅料、中间产品和环境污染率分别为31.82％、29.03％和4.76％.经PFGE分型,沙门菌菌株的基因型比较相近,同源性高,而金黄色葡萄球菌分离株型别分散.经药敏分析,沙门菌对氨苄西林和萘啶酸的耐药菌株多,而对头孢他啶和头孢西丁不耐药;金黄色葡萄球菌对磺胺甲恶唑的耐药菌株多,而对头孢噻圬和庆大霉素不耐药.结论 金黄色葡萄球菌、沙门菌是灌肠类熟肉制品生产环节的主要污染菌群,原辅料是主要污染来源.分离出的致病菌大多具有多重耐药性.
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宁波福氏c亚型志贺菌病原学特征、耐药性和毒力基因分布
目的 了解宁波地区福氏c亚型志贺菌病原学特征、耐药性和毒力基因分布,为细菌性痢疾的有效防控提供依据.方法 收集来自腹泻患者的志贺菌株,对其进行生化鉴定、血清分型、药敏试验和5种毒力基因检测.结果 149株菌株中福氏(B群)志贺菌占63.76％,其中福氏1c、2c和4c亚型占36.91％;宋内(D群)志贺菌占36.24％;未检出A群和C群志贺菌.福氏1c、2c和4c亚型菌株生化结果与ATCC标准菌株一致;血清凝集抗原结构式分别为Ⅰ:7(8)、Ⅱ∶3,4∶7(8)和Ⅳ∶7(8),均为多耐药性菌株;5种毒力基因(ipaH、set1、sen、ial和virA)的阳性率分别为100.00％、85.45％、85.45％、90.91％和87.27％.43株菌株(78.18％)携带全部毒力基因.结论 福氏c亚型志贺菌已成为宁波地区主要流行株之一,除血清变异外,生化等生物学特性未变异,菌株为多重耐药菌,携带多种毒力基因,有较强的致病力,应加强志贺菌检测与菌型分析.
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宁波市首例人感染猪链球菌病的病原学分析
猪链球菌病是由猪链球菌引起的人-猪重症感染,病死率高.2005年7～8月份,四川省爆发了猪链球菌病,造成多人死亡,引起人类严重感染的疫情,对人类的生命健康造成了严重威胁.2007年5月,宁波市发现了首例猪链球菌引起化脓性肭膜炎的病例,我们对这一病例的病原菌进行了研究分析,现将检测结果报告如下.
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天津市滨海新区2014年-2017年流感病原学特征分析
目的 了解天津市滨海新区2014年-2017年流感流行趋势及病原学特征, 为本地区流感防控工作提供依据.方法 对天津市滨海新区2014年4月-2017年3月监测哨点医院采集的流感样病例 (ILI) 咽拭子样本流感病毒realtime PCR检测结果进行统计分析.结果 2014年4月-2017年3月, 天津市滨海新区监测点ILI总数23 266例, ILI比例为1.02％;共采集流感样病例咽拭子样本2 227份, 其中核酸检测阳性样本381份, 阳性率为17.11％.阳性样本中季节性H3型、新甲型H1、B型Victoria、B型Yamagata所占比例分别为48.03％、12.60％、24.41％及14.96％.季节性H3型隔年强势流行, B型Victoria与B型Yamagata在时间轴上交替流行, 新甲型H1近年流行态势较弱.核酸检测阳性率3月份高 (39.62％).5个年龄组中, 5岁～组阳性率高 (25.31％);各年龄组间阳性率与总阳性率差异有统计学意义 (χ2=65.63, P＜0.01).结论 2014年-2017年天津市滨海新区流感流行情况复杂多变;下一监测周期需关注B型流感病毒流行;北方片区夏秋季节流感防控工作应有所加强.
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珠海地区副溶血性弧菌病原学特征及分子分型分析
目的 研究珠海地区副溶血性弧菌血清型、毒力基因以及分子分型的病原学特征,分析流行株的分布情况.方法 对珠海市2009年-2014年共81株副溶血性弧菌进行血清型鉴定及基因型耐热溶血素(tdh)、耐热直接相关溶血素(trh)和不耐热溶血素(tlh)检测,并从中选取60株进行多位点序列分析(MLST).结果 共分出35种血清型,其中优势型别为O3∶K6,占整个血清型的20.99％.所有菌株均含有tlh基因,含有tdh基因的有31株菌株,含有trh基因只有2株菌株为阳性.根据PubMLST网络数据库提供的方法进行比对分析,60株副溶血性弧菌共分为33种ST型别.结论 珠海市引起食物中毒的副溶血性弧菌主要为O3:K6.tlh基因可以作为鉴别副溶血性弧菌的鉴定基因,多数食物中毒事件菌株中携带tdh基因.MLST的优势型别为ST3,为副溶血性弧菌其他型别共同祖先.而食品株血清型和MLST分型均呈多样化、分散趋势.
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化脓性角膜炎的病原学特征及感染危险因素分析
目的 分析区域内化脓性角膜炎的病原学特征、耐药性变化和主要危险因素,为化脓性角膜炎的临床诊治提供依据.方法 采用描述性研究方法,收集2009年1月至2014年1月住院治疗、临床资料完整的化脓性角膜炎患者277例(277眼),详细记录每例患者的基本信息资料、就诊信息、病原学检查结果,将所有资料进行整理分析.结果 277例患者中病原学检测检出率37.55％,其中细菌检出率35.47％,真菌检出率42.13％,各年份真菌检出率均高于细菌检出率,但差异均无统计学意义(均为P＞O.05).检出细菌株包括革兰阳性球菌56株(59.57％),革兰阴性杆菌28株(29.79％),革兰阳性杆菌10株(10.64％);真菌以曲霉菌(26株,34.67％)、白假丝酵母菌(13株,17.33％)为主.药物敏感试验结果显示,葡萄球菌属对哌拉西林、氨苄西林、红霉素等耐药比较高,而对庆大霉素和万古霉素敏感;革兰阴性杆菌属对红霉素、氨苄西林、环氧氟沙星的耐药比较高.不同菌属病原体对哌拉西林、红霉素和左氧氟沙星的耐药比差异均有统计学意义(均为P＜0.05).化脓性角膜炎的主要危险因素是角膜外伤,以植物外伤为主,其次是沙石异物和金属异物;其他危险因素还包括原有眼部疾病、全身疾病、眼部手术史和配戴角膜接触镜.结论 化脓性角膜炎病原检出率偏低,真菌检出率超过细菌检出率,同时存在明显的抗生素耐药现象,角膜外伤仍是导致化脓性角膜炎的主要危险因素.应根据区域病原学特征及药敏试验结果,规范临床合理用药,改善治理效果,同时相关部门应开展针对性的宣传教育,使居民远离危险因素,降低角膜炎的发生率.
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2015年郴州市布鲁氏菌病的实验室诊断及病原学特征分析
目的 对2015年郴州市人感染布鲁氏菌疑似患者和病羊进行血清学和分子生物学检测,以明确诊断.方法 对患者进行流行病学调查,采用血培养法对试管凝集试验检测为布鲁氏菌抗体阳性的患者和病羊血液进行荧光PCR及细菌分离培养,应用分子生物学方法和基因测序对可疑菌落进行种类鉴定.结果 68份高危及疑似布病患者血清抗体筛查13份阳性;1 679份羊血血清抗体检测57份阳性,6株分离株经荧光PCR鉴定为羊种布鲁氏菌.结论 2015年引起郴州市布病的主要病原类型为羊种布鲁氏菌,应采取综合措施防止布病在郴州流行.
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湖南省2012年霍乱弧菌病原学特征分析
目的 了解2012年湖南省不同地区不同时间各疫情菌株的病原学特征,分析比较各疫情分离株之间以及与常规监测分离株之间的遗传相关性,为追溯传染源提供依据. 方法 利用生化鉴定系统进行菌株鉴定,血清学方法生物分型,PCR方法检测毒力基因和脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)进行分子分型. 结果 2012年从湖南省疫情和监测样品中分离的17株O139群霍乱弧菌均带毒力基因,均为产毒株.在进行PFGE分子分型的17株菌中,有2起疫情酶切图谱完全相同,而该2起疫情与其他的3起疫情以及这3起疫情之间的酶切图谱不完全相同. 结论 湖南省2012年从甲鱼中分离的O139群霍乱弧菌毒力基因携带率高,是疫情频发的一个重要原因.从病人和食品中分离的菌株具有高度同源,进一步证实该疫情为食源性传播.分子分型图谱相似率100％的2起疫情传染来源一致,而其他各起疫情之间关联性很小或者没有,传染来源均不同.
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2009-2010年湖南省哨点医院婴幼儿病毒性腹泻病原学研究
目的 了解湖南省哨点医院2009-2010年常见腹泻病毒的病原学特征,为病毒性腹泻的综合防治提供科学依据. 方法 收集湖南省哨点医院2009-2010年5岁以下住院腹泻患儿的粪便标本,采用Dako公司酶免疫试剂盒检测轮状病毒,采用逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)进行分型鉴定；采用聚合酶链反应(PCR)检测腺病毒；逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测星状病毒和杯状病毒,对部分PCR阳性标本进行测序加以验证. 结果 检测2009-2010年湖南省哨点医院婴幼儿腹泻标本759份,其中轮状病毒占22.79％ (173/759)、杯状病毒占9.22％ (70/759)、腺病毒占4.61％ (35/759)、星状病毒占0.79％ (6/759)、混合感染占2.50％ (19/759).173份轮状病毒G血清型与P基因型以G1、G3、P[4]型为优势株.四种病毒主要是感染2岁以下婴幼儿,且有明显的季节特征.测序结果证实12份阳性标本的PCR产物均为其所对应的病毒. 结论 轮状病毒是2009-2010年湖南省婴幼儿病毒性腹泻的主要病原,杯状病毒、腺病毒和星状病毒也是本省婴幼儿病毒性腹泻的重要病原.
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广东省1株百日咳鲍特菌分离株的全基因组测序分析
目的 了解2017年广东省1株百日咳鲍特菌(简称百日咳杆菌)分离株的基因特征.方法 对2017年广东省百日咳杆菌分离株(BP_GD2017)进行全基因组测序,分析这株菌的ptxS1、prn、fim2 、fim3等主要抗原基因,并与我国的百日咳杆菌疫苗生产株CS株的抗原基因序列以及GenBank中收录的百日咳基因序列进行比较分析,同时应用wg-SNPs方法与NCBI上获取的31株国内外百日咳杆菌的基因组进行遗传进化分析.结果 广东分离株BP_GD2017的基因组大小为3.64 MB,G+C含量67.74％,rRNA操纵子3个,分别是5S、16S和23S,46个tRNA,基因组结构和特征与我国疫苗生产株CS株以及其他地区和时间分离的百日咳杆菌基因组相似.分离株的ptxS1基因为A型、prn基因为2型,均与我国疫苗生产株CS株不同,fim2和fim3基因的氨基酸序列与我国疫苗生产株CS株同源性为100％.wg-SNPs基因进化显示与我国疫苗生产株CS株在不同的进化分支,而与近年来流行的其他地区(美国、英国、荷兰和挪威等地)分离株处于同一进化分支.结论 广东省这株百日咳分离株与我国疫苗生产株CS株的主要抗原基因序列存在一定变异,遗传进化分支选择也出现了改变,通过比较分析不同国家或地区的分离株,可以从基因组水平上更加准确地分析基因重组、突变和进化,可以为制定百日咳疫苗免疫策略以及新型无细胞百日咳疫苗的研发提供支撑.
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人体5种小型吸虫病原形态观察
目的通过对东方次睾吸虫(Metorchis orientalis)、华支睾吸虫(Clonorchis sinensis)、钩棘单睾吸虫(Haplorchis pumilio)、扇棘单睾吸虫(Haplorchis taichui)和台湾棘带吸虫(Centrocestus formosanus)的形态观察,为鉴别这些人体寄生虫病病原提供科学依据.方法收集5种吸虫的成虫、虫卵、囊蚴,并进行形态、大小测量和寄生部位观察.结果东方次睾吸虫和华支睾吸虫成虫寄生部位完全相同,都是在胆管和胆囊内.其他3种则在小肠内.囊蚴寄生部位:除台湾棘带吸虫在鱼鳃外,其余4种均在鱼肉内.虫卵特征:5种吸虫除卵盖和外壳光洁度有些差别外,其余差别甚微.囊蚴特征:东方次睾吸虫囊壁很厚,而其他4种则很薄.其它特征:台湾棘带吸虫的排泄囊呈"工"字形,扇棘单睾吸虫生殖吸盘上的小棘呈杆状排列成葵扇状;而钩棘单睾吸虫则呈点状并围成一圈.成虫特征:华支睾吸虫大,呈葵花仔状;东方次睾吸虫其次,呈叶片状;钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫居中,两者均呈鞋状;台湾棘带吸虫小,呈酒瓶状.结论发现上述5种吸虫的成虫、虫卵及囊蚴时,必须根据各自形态、大小等特征,认真鉴别.
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院内感染病原菌变化趋势及耐药性分析
目的 分析珠海香洲区院内感染病原菌变化趋势及耐药性,为制定预防措施提供依据.方法 搜集2014年1月-2015年12月广东省珠海市香洲区医院以及社区医院院内感染患者的临床资料,记录所有患者的医院感染率、感染部位、病原菌分布以及耐药性,分析出现医院感染的危险因素.结果 2014年1月-2015年12月临床共分离1 250株病原菌,其中革兰阴性菌感染985例,占78.8％,革兰阳性菌感染220例,占17.6％,真菌感染45例,占3.6％;感染部位以呼吸道感染为主,共856例,占68.5％,其中上呼吸道感染184例,下呼吸道感染672例,分别占21.5％和78.5％;其次包括泌尿道、胃肠道、皮肤软组织和口腔感染,分别占13.8％、8.5％、5.2％和4.0％.医院感染的主要危险因素包括年龄、基础疾病、住院时间、意识障碍、滥用抗菌药物、留置导尿管、留置胃管和机械通气,其中年龄、住院时间、意识障碍、滥用抗菌药物和机械通气患者的医院感染率显著升高,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 医院感染的主要病原菌为革兰阴性菌,且以下呼吸道感染为主.此外,感染的发生可能与年龄、住院时间、意识障碍、滥用抗菌药物和机械通气等危险因素有关.
