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2007年重庆市人群沙门菌监测分析
目的 对重庆市人群沙门菌感染进行监测并对监测分离的菌株进行耐药性和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型研究.方法 明确监测病例定义,制定、实施监测方案,实验室分离、鉴定监测的沙门菌,利用K-B法对分离菌株进行药敏检测,并采用PFGE进行分子分型.结果 2007年监测了835例病例,病例分布在9个区(县),其中监测沙门菌暴发疫情10起,病例175例.实验室共分离鉴定了79株12种沙门菌(11种血清型和1组B群),全部菌株对至少一种抗菌素耐药,9种(75%)对3种以上的抗菌素耐药,2种(16.67%)对6种抗菌素耐药,尤其是里定沙门菌、婴儿沙门菌及汤卜逊沙门菌耐药严重.沙门菌PFGE分型被分成9种14种亚型.结论 重庆市2007年人群沙门菌分离株没有明显的优势流行株,同一事件中的沙门菌PFGE分型相同,分离株耐药情况严重,分离菌株的耐药谱和PFGE型也没有明显的联系.
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北京市售速冻调理生制品中金黄色葡萄球菌PFGE分型与耐药性研究
目的 了解北京市售速冻调理生制品中金黄色葡萄球菌的污染情况、耐药性和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型特征.方法 2016年随机采集北京地区超市中12个品牌速冻调理生制品92份,根据GB 4789.10-2010《食品安全国家标准食品微生物学检验金黄色葡萄球菌检验》对金黄色葡萄球进行分离,采用phoenixTM-100微生物全自动鉴定/药敏系统进行生化鉴定和抗生素敏感性试验,用PFGE进行分子分型.结果 92份速冻调理生制品中检出31份阳性样品(33.70％),所得31株菌可分成23种PFGE带型,带型较分散.31株金黄色葡萄球菌中产β-内酰胺酶菌检出率70.97％ (22/31),耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)检出率12.90％ (4/31)且菌株均携带mecA基因,红霉素诱导克林霉素耐药菌(STAMLS)检出率3.23％(1/31),31株菌呈不同程度的耐药和多重耐药现象,且PFGE型别与耐药谱间无明显关联.结论 北京市售速冻调理生制品中金黄色葡萄球菌污染情况、菌株耐药情况均比较严重.
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北京市西城区食源性与临床感染性单核细胞增生李斯特菌PFGE和MLST分型研究
目的 研究北京市西城区食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌(listeria monocytogenes,Lm)的脉冲场凝胶电泳(plused-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分型特征,分析两种分型方法的应用价值.方法 采用PFGE和MLST两种方法对2012-2015年50株食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌进行分型研究.结果50株单核细胞增生李斯特菌PFGE分型得到23种型别,GX6A16.CN0004为优势带型.MLST分析获得12个型别,ST9为优势型别.其中5组数据是ST型别只对应一种PFGE型别,3种PFGE型别同时存在食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌,并且其ST型别进化关系比较远.结论 北京市西城区不同来源单核细胞增生李斯特菌污染长期存在,出现致病型别,并且致病性单核细胞增生李斯特菌的遗传关系呈多元化.两种分子分型方法的结合,从基因水平上解释了单核细胞增生李斯特菌的变化趋势及流行特征.
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肠炎沙门菌食物中毒中PFGE的应用
目的 对2014年武汉市某区一起食物中毒事件的病原体进行分离鉴定及同源性分析. 方法 参照GB4789-2012和WS/T 13-1996的方法进行病原菌的分离培养,对检出菌进行表型鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对检出菌及实验室收集的其他肠炎沙门氏菌进行分子分型和流行病学特征分析;采用WHO推荐的改良K-B法对检出菌进行抗生素敏感试验 结果 流行病学调查及实验室病原学检测证实,本起事件是一起由肠炎沙门氏菌引起的食物中毒,共分离到18株肠炎沙门氏菌.分离白该事件可疑食物及患者肛拭子的肠炎沙门氏菌相似系数为100％,与同一时期散发临床患者分离的肠炎沙门氏菌相似系数约为90％,与2012年健康体检分离株及2013年、2014年临床患者分离株小相似系数＞90％.此次食物中毒株对所检测药物敏感性较好. 结论 此次食物中毒病原菌为本地区流行的肠炎沙门氏菌优势株.PFGE可用于细菌性食物中毒的溯源分析.
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用分型方法检测溯源副溶血性弧菌
目的用分型的方法分析副溶血性弧菌的流行优势型，溯源其亲缘关系，为追踪感染源提供依据。方法用诊断血清进行血清学分型，用PFGE和ERIC进行基因分型。结果607株分离于海产品的VP分出10个血清群，有30株不能分型，分型率为94．64％，0：6群和0：5群为流行优势株；480株病人VP分为6个血清群，0：3群为流行优势株。377株分离于海产品的VP分成29个 PFGE型；480株病人VP分成12个 PFGE 型。261株不同来源的VP分出42个ERIC基因型。结论3种方法均能用于VP的分型，但各有特点。由于基因分型方法敏感性高、特异性强、分型率和分辨率佳的优点，将逐渐取代传统的表型分型技术。
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宁波地区甲型副伤寒沙门菌基因分型
目的 了解宁波地区甲型副伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因型和流行优势型,为探讨传播途径和追踪传染源等提供依据.方法 用全自动细菌鉴定仪(Vitek32)确定细菌的生物学特征;用诊断血清确定细菌的血清型;用PFGE方法对细菌的染色体进行基因分型.结果 102株甲型副伤寒沙门菌可分成9个PFGE型,其中X2型73株,占71.57%,X1型21株,占20.58%,X7型2株,占1.96%,其他6个型各1株,分别占0.98%.其中优势型为X2型,菌株的带型变化在1～3条范围内,表明宁波地区的甲型副伤寒沙门菌变异不大,有可能是同一克隆系的甲型副伤寒沙门菌.结论 PFGE分型对探讨伤寒、副伤寒疫情内在联系具有重要意义,该法特异性高、重复性好、结果容易判读,有实际应用价值.
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2011年通州区腹泻源性嗜水气单胞菌的分子分型特征
目的 了解北京市通州区2011年腹泻患者粪便中分离到的27株嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)的生物学和分子分型特征,为该菌引发疾病的防控提供参考依据.方法 对27株腹泻源性嗜水气单胞菌进行Aer毒素检测和PFGE分型,并进行同源性比较.结果 27株腹泻源性嗜水气单胞菌中7株菌的Aer毒素为阳性,占总数的25.93％;PFGE图谱分为27个带型.结论 在通州区腹泻患者粪便中检出的菌株部分携带Aer毒力因子,目前无优势流行菌株.建议相关部门加强对该菌的监测,避免该菌引发的各类疾患的发生.
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2009-2011年通州区食源性金黄色葡萄球菌的生物学及流行病学特征
目的 对北京市通州区2009-2011年食品中分离到的32株金黄色葡萄球菌(Staphlococcus aureus)进行研究,建立相关资料的数据库.方法 对32株食源性金葡菌进行耐热核酸酶检测、肠毒素检测、药敏检测和PFGE分型,并进行同源性比较.结果 32株食源性金葡菌中26株耐热核酸酶试验为阳性,有29株菌可以产生不同型别的肠毒素,以SEE型为主,占产肠毒素金葡菌的83％；有27株菌对检测的抗生素有耐药性,占金葡菌总数的84％；PFGE图谱分为17个带型.结论 在通州区食品中检出的金葡菌既具有致病性也具有耐药性.在不同的年份,既存在着拥有同源关系金葡菌的重复流行,也会有新的金葡菌株出现.本研究建立了通州区食源性金葡菌的生化性状和分子图谱数据,为今后预防和控制由金葡菌引起的是食源性疾患的发生奠定了基础.
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宁波地区副溶血弧菌分型与毒力分析
目的:了解宁波地区不同来源副溶血性弧菌的毒力及血清型、基因型,为追溯病原和防控副溶血性弧菌提供依据.方法:海产品菌株分离采用PCR+ GB筛检方法,病人采用全国临床检验操作规程方法;用诊断血清进行血清学分型,用PFGE进行基因分型;用PCR检测tdh和trh毒力基因.结果:海产品流行优势血清群为O6群和O5群,病人株为O3群;海产品株PFGE分型与病人株相比较为分散;88.04％的病人株带毒力基因,海产品株带毒力基因仅有1.11％.结论:海产品株和病人株在流行优势株上存在明显差别,提示血清型分型和PFGE分型能发现菌株间的亲缘关系,可用于病原的追踪与溯源;病人株带毒率明显高于海产品株(P＜0.01),认为海产品株致病性不强,建议将VP分为致病的和非致病两类,有利于鉴别和防控措施的改进.
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伤寒与甲型副伤寒沙门菌基因分型与耐药性研究
目的:通过追溯菌株的流行优势型,了解菌株的耐药性,分析流行因素,为查明宁波地区伤寒、副伤寒疫情回升原因提供科学依据.方法:水产品检测采用GB、PCR和mini VIDAS联合检测方法;病人、从业人员检测采用全国临床操作规程或GB方法;菌株鉴定采用VITEK、ATP方法;药物敏感试验采用K-B纸片扩散法;基因分型采用PFGE方法.结果:从11类1500份海产品中检出6株沙门菌,检出率为0.40%,其中甲型副伤寒沙门菌2株,检出率为0.13%,肠炎等沙门菌3株,检出率为0.20%,伤寒沙门菌1株,检出率为0.07%;住院病人及暴发疫情标本中分离到沙门菌593株,其中伤寒沙门菌25株,占4.22%,乙型副伤寒沙门菌1株,占0.17%,甲型副伤寒沙门菌567株,占95.62%;食品、公共场所从业人员检出甲型副伤寒沙门菌2株;病人胆汁中分离到甲型副伤寒沙门菌1株.182株甲型副伤寒沙门菌和3株伤寒沙门菌药敏试验显示,大多数菌株对常用多种抗生素均敏感,其中1株分离于水产品伤寒沙门菌出现多重耐药.14株伤寒沙门菌可分为3个PFGE型,364株甲型副伤寒沙门菌可分为12个PFGE型.结论:宁波地区伤寒、副伤寒疫情回升与食源性有关,同源性试验提示菌株来是同一克隆系的可能性较大,优势流行型为PFGE 2型,且发现宁波地区副伤寒疫情的流行强度与此型细菌相关.检出的伤寒、副伤寒沙门菌对氧哌嗪青霉素、妥布霉素及头孢哌酮等第3代头孢菌素药物显示良好的敏感性,可作为当前预防和治疗的首选药物.伤寒出现多重耐药株,应引起我们的关注.PFGE分型有助于病原的追溯,分析菌株的变迁,为流行病学进一步分析病因提供支持,在确定传播途径等方面具有重要意义.
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伤寒和甲型副伤寒沙门菌PFGE分型方法研究与应用
目的:了解宁波地区伤寒和甲型副伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因型和流行优势型,为探讨传播途径和追踪传染源等提供帮助.方法:用全自动细菌鉴定仪(Vitek32)确定细菌的生物学特征;用诊断血清确定细菌的血清型;用PFGE方法对细菌的染色体进行基因分型.结果:14株伤寒沙门菌分成3个PFGE基因型,364株甲型副伤寒沙门菌分成12个PFGE基因型,其中伤寒沙门菌1型10株,占71.43%,甲型副伤寒沙门菌2型295株,占81.04%;其次为1型42株,占11.54%;其他各型相对较少,伤寒沙门菌的流行优势型是1型,甲型副伤寒沙门菌是2型.菌株的带型变化在1～3条范围内,表明宁波地区的伤寒和甲型副伤寒沙门菌变异不大,有可能是同一克隆系的伤寒和甲型副伤寒沙门菌.结论:PFGE分型对探讨伤寒、副伤寒疫情内在联系具有重要意义,宁波地区的伤寒和甲型副伤寒疫情是本地菌株反复在人群带菌,污染环境和食物所致,应引起我们的关注.研究认为PFGE分型法特异性高、重复性好、结果容易判读,是一种分子分型的可信方法,为确定菌株之间的亲缘关系,提供了可靠的检测手段.
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重庆市2007年临床分离79株沙门菌耐药性及PFGE分型研究
目的:对重庆市2007年分离的人群沙门菌菌株进行耐药性和PFGE分子分型研究.方法:全自动细菌生化鉴定仪(VITEK 32)和血清学鉴定分离的人群沙门菌,利用K-B法对分离菌株进行药敏检测,并采用PFGE进行分子分型.结果:2007年共分离鉴定79株12种沙门菌(11种血清型和1组B群),全部菌株对至少一种抗菌素耐药,75%(9种)对3种以上的抗菌素耐药,16.67%(2种)对6种抗菌素耐药,尤其是里定沙门菌、婴儿沙门菌及汤卜逊沙门菌耐药严重.沙门菌被分成9种PFGE型14种亚型.结论:重庆市2007年人群沙门菌分离株没有明显的优势流行株,同一事件中的沙门菌PFGE分型相同,分离株耐药情况严重,分离菌株的耐药谱和PFGE型也没有明显的联系.
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PFGE法分析多血清型副溶血性弧菌引起的食物中毒
目的:对从食物中毒样品中分离到的7株副溶血性弧菌作常规鉴定及脉冲场凝胶电泳(PFGE)同源性分析,以明确致病因子.方法:按GB/T4789.7-2008进行副溶血性弧菌分离、生化鉴定、神奈川试验、血清分型;Pulse-Net PFGE分子分型标准实验室操作方法作同源性分析.结果:7株副溶血性弧菌分成三个血清型,即03:K6型5株,04:K8型和01:K56型各1株,分别属于三种不同的PFGE条带型,其中6株菌神奈川试验阳性.结论:这次食物中毒可能为以03:K6型为主的不同克隆群副溶血性弧菌混合感染所致.
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3种副溶血性弧菌分型方法的应用与比较
目的:用分型的方法分析副溶血性弧菌的流行优势型,溯源其亲缘关系,为追踪感染源提供依据.方法:用诊断血清进行血清学分群,用PFGE和ERIC进行基因分型.结果:607株分离于海产品的VP分出10个O血清群,有30株至今尚不能分群,分群率为94.64％,O6群和O5群为流行优势群；480株病人VP分为6个血清群,O3群为流行优势群.377株分离于海产品的VP分成29个PFGE型；480株病人VP分成12个PFGE型.261株不同来源的VP分出42个ERIC基因型.结论:3种方法均能用于VP的分型,但各有特点.由于基因分型方法敏感性高、特异性强、分型率和分辨率佳的优点,将逐渐取代传统的表型分型技术.
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人源与动物源大肠埃希菌的同源性分析
目的 研究某大规模养殖场与某院临床患者分离的大肠埃希菌的同源性.方法 泰安地区某大规模养殖场分离出4株耐多粘菌素大肠埃希菌,泰安中心医院临床患者分离出12株耐碳青霉烯类大肠埃希菌;对目的菌株进行耐药基因测序,通过多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行同源性检测,探讨分析人源与鸭源大肠埃希菌的同源性.结果 共有16株大肠埃希菌,4株鸭源菌株中2株ST为5912型;12株人源菌株中5株ST为167型,3株ST为405型;1株鸭源与1株人源ST相同,为ST10,但PFGE分型发现这2株菌相似度为64.7％.结论 泰安地区人源与鸭源大肠埃希菌菌株同源性不高.
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MRSA分子流行病学研究
目的 采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型及多重聚合酶链反应(PCR)SCCmec分型技术对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行基因分型,以了解医院感染MRSA的流行情况.方法 收集天津市南开医院2007年1月-2008年12月住院患者送检标本分离的MRSA 40株,进行耐药谱分析、PFGE分型和SCCmec分型.结果 40株菌耐药谱高度相似,可被分为A-E 5个PFGE型,其中A型21株,B型8株,C型4株,D型6株,E型1株;SCCmec分型:Ⅰ型1株,Ⅲ型33株,Ⅳ型1株,Ⅴ型5株.通过对医院内菌株发生的时间和空间分析,明确了感染的发生和传播情况,即在2007年1月-2008年12月存在MRSA散发感染.结论 PFGE可有效鉴定菌株间的亲缘关系.SCCmec分型对是否为医院感染菌株有提示作用,两种分型方法 相结合可更好地鉴定流行菌株的特征,为医院感染的监控提供依据.
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肠炎沙门菌引起的一起食物中毒事件的分子流行病学研究
目的 对2012年深圳市龙岗区某酒楼发生的一起食物中毒事件的病原体进行分离鉴定和同源性分析.方法 对2012年深圳市龙岗区某酒楼发生的食物中毒事件进行现场调查并采集患者肛拭子15份、厨工肛拭子3份和手拭子1份、可疑食品1份以及物表涂抹拭子2份.通过分离鉴定、生化试验和血清学分型确定菌型,再使用脉冲场电泳(PFGE)分型方法对同期患者中相同菌型的菌株进行同源性分析.食物中毒菌株使用K-B进行药敏分析.结果 流行病学调查及实验室病原学检测证实本次事件是一起由肠炎沙门菌引起的食物中毒.共分离到16株肠炎沙门菌,其中患者、厨工及可疑食品分离出的肠炎沙门菌同源性达到95％以上,与同一时期散发临床患者分离的肠炎沙门菌同源性为89.4％,可判断为来自同一克隆株.结论 此次事件是一起由肠炎沙门菌引起的食物中毒,分子流行病学的证据显示其可能的传播途径为厨工带菌者污染食品烧鸡,被患者进食后引起感染.
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伤寒沙门菌PFGE分子分型及耐药性研究
目的 对深圳市2004-2011年伤寒沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型及耐药性分析,为临床用药和追踪传染源提供依据.方法 采用K-B法对42株伤寒沙门菌进行20种抗菌药物敏感性测试,并用PFGE对其进行分子分型.结果 42株伤寒沙门菌株对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林/舒巴坦、头孢噻吩、头孢他啶、头孢曲松、头孢吡肟、头孢西丁、阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素、环丙沙星、左旋氧氟沙星、复方新诺明、甲氧苄啶、氯霉素和四环素17种药物的敏感率均超过90％,对萘啶酸耐药率高达61.5％.42株伤寒沙门菌株可分为SZ0001 -SZ0028共28个PFGE型别,其中流行优势型为SZ0023型别.结论 结合药物敏感试验结果和PFGE分子分型结果可以判断伤寒疫情的优势株型.
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玉溪红塔区212株甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果分析
[目的]了解玉溪红塔区甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因型和流行优势型,为探讨传播途径、追踪传染源和确定流行范围等提供依据.[方法]利用Xba I酶切染色体DNA进行PFGE分析.[结果]212株甲型副伤寒沙门菌共分为13种PFGE型,其中0002型123株,占58.02%,0003型46株,占21.7%,0001型32株,占15.1%,0007型2株,占0.94%,其余9个型各1株,分别占0.47%.其中优势型为0002型、0003型和0001型,这3种带型的菌株占到分离菌株的94.8%,并在不同月份和绝大部分乡镇中出现.菌株的带型变化在1～3条范围内,表明红塔区甲型副伤寒沙门菌变异不大,有可能是同一克隆系的甲型副伤寒沙门菌.[结论]红塔区甲型副伤寒沙门菌分离株PFGE型别集中,存在同型菌株的广泛流行.另外10种菌型少见,可能与红塔区甲型副伤寒高度散发有关.
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上海市静安区儿童腹泻中分离的宋内志贺菌脉冲场凝胶电泳分析
[目的]研究上海市静安区2006～2008年儿童腹泻标本中分离的20株宋内志贺菌的耐药性和脉冲场凝胶电泳图谱特征.[方法]采用K-B法检测对16种抗生素的敏感性,并用WHONET 5.3软件对菌株的酎药性进行分析.通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对菌株进行分子分型,通过同源性分析以确定菌株间的亲缘关系.[结果]20株宋内志贺菌对利福平和奈啶酸100％耐药,对四环素、氨苄青霉素、复方新诺明的耐药率≥85％.主要分为6种复合耐药型.19株宋内志贺菌被分成16个带型,聚类分析显示属于来源高度相似的克隆系.[结论]建立了本区的宋内志贺菌脉冲常凝胶电泳分析方法和初步带型数据库.宋内志贺菌存在多重酎药现象,抗生素型与基因型间无明确关系.
