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  • 2008~2016年江西省重症手足口病流行病学及病原学特征分析

    作者:郭悦;熊英;王英;冀天娇;龚甜;李健雄;杨倩;张艳妮;周珺;徐刚;施勇;许文波

    为阐明江西省重症手足口病 (Hand, foot and mouth disease, HFMD) 的流行病学和病原学特征, 本研究利用20082016年江西省重症HFMD的监测数据, 采用描述性流行病学方法对重症病例三间分布和病原构成进行系统分析, 并对本省引起重症HFMD的肠道病毒71型 (Enterovirus A71, EV-A71) 进行基因特征分析.20082016年全省报告重症病例2 255例, 在全国排名第15位, 重症死亡病例120例;重症病例数至2011年达到高峰, 此后整体呈下降趋势;各个地市均有上报, 尤以宜春市、南昌市和上饶市重症数较多;除2008年外, 各年重症病例数呈双峰分布, 大多数年份夏季为主高峰, 秋冬季为次高峰;5岁以下散居儿童为主要发病人群, 男性多于女性.EVA71是重症HFMD绝对优势病原体, 占重症确诊病例的81.89%.对引起重症HFMD的72株江西省EV-A71分离株VP1编码区进行基因测定和分析, 显示均属于C4基因亚型的C4a进化分支.本研究提示5岁以下散居儿童应为重症HFMD重点防护人群, 江西省引起重症的C4a进化分支属于我国EV-A71常见的基因型别.

  • 肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征

    作者:崔爱利;许文波;李秀珠;胡家瑜;凌华;唐伟;杨智宏;张燕;陈立;Hiroyuki Shimizu

    2002~2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株.利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT-PCR方法对病毒进行初步鉴别.根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别.RT-PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71.10株病毒的RT-PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法.对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH-F1、SH-F2、SH-H25、SH-H26和CHN-87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89.3%~94.6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81.3%~84.0%,差异较大.在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH-F1、SH-F2、SH-H25、SH-H26)的同源性较高,在94.5%~100%范围内.在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支.与CHN-87株的同源性在92.1%~93.6%之间.与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源性在89.3%~92.9%,差异≥7%,因此认为可将这9株病毒划分为C4亚型.上海、重庆和深圳的EV71病毒有较高的同源性,提示该病毒EV71-CA亚型在中国大陆1998~2003年间有较广泛的传播.建立中国流行的EV71病毒毒株库和基因库,对诊断、预防和控制EV71在中国的爆发有重要意义,对加强EV71的实验室诊断、病毒学监测和病毒基因型和亚型的标准命名和分子流行病学研究有重要帮助.

  • 2014~2015年重庆市手足口病的流行病学及病原学特征

    作者:顾新蕊;赵华;冀天娇;李勤;凌华;祝双利;张勇;杨倩;宋洋

    通过对2014~2015年重庆市手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)的流行病学、肠道病毒(Enterovirus,EV)病原构成和肠道病毒71型(Enterovirus A71,EV-A71) VP1区编码基因分析,为制定重庆市HFMD防控策略提供科学依据.2014~2015年全市报告HFMD共100176例,其中重症284例,死亡37例;全市39个区县(自治县)均有病例报告,且主城区报告发病率(298.83/10万)显著高于郊区(103.37/10万),5岁及以下的儿童占报告发病数95.64%,3岁及以下占83.21%,每年的4~7月为发病高峰期,每年的10~11月为发病小高峰期.重症和死亡病例在3岁和5岁及以下的年龄组中分别占86.97%、94.59%和96.83%、100%.其中重症病例主要集中在万州区、梁平县、涪陵区3个区县中,占全部重症病例的74.65%;死亡病例分布广泛,散在17个区县内.7503份HFMD临床标本的EV核酸检测结果,EV-A71、CV-A16、非EV-A71/CV-A16其他EV分别占23.54%、33.21%、43.25%;非EV-A71/CV-A16的其他EV成为导致重庆市HFMD的优势病原,但重症和死亡病例仍以EV-A71为绝对优势病原.对55株2014年和2015年重庆EV-A71代表毒株VP1编码序列测定和分析,提示54株均属于C4a,1株属于B5.本研究为重庆市制订HFMD防控策略,降低EV-A71引起的重症和死亡提供了重要的流行病学和病原学基础资料.

  • 肠道病毒71型抗原检测试剂参考品制备及标定

    作者:龙润乡;李华;杨蓉;杨婷;岳磊;宋晓燕;谢忠平

    目的 制备一套EV71抗原检测试剂盒质量控制用参考品.方法 用组织培养法制备的一组肠道病毒原液及EV71病毒液,制备成10份阴性参考品、10份阳性参考品、2份灵敏度参考品及1份精密度参考品;以上样品经多人次标定后确定终结果.结果 阴、阳性参考品各10份标定结果分别为10阴及10阳;2份灵敏度参考品标定结果分别为177.97U/mL和1966.86U/mL;精密度参考品平均CV值9.29%.参考品37℃保存5天及反复冻融6次对检测结果没有影响.结论 制备的参考品经标定,并通过反复冻融、37℃热稳定性试验,检测结果稳定,可用于EV71抗原检测试剂的质量控制,保证抗原检测试剂检测结果的特异性、灵敏度及稳定性.

  • 肠道病毒71型的全长cDNA感染性克隆的构建与鉴定

    作者:王冠洲;叶飞;赵阿妮;韩为;阴彬;彭小忠

    目的 构建一株肠道病毒71型的全长cDNA克隆并验证感染性.方法 用长片段高保真RT-PCR方法扩增肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的cDNA,装入pBR322载体.将该克隆线性化,体外转录后转染RD细胞后,通过观察CPE及RT-PCR验证其感染性.随后利用空斑法测定拯救病毒的一步生长曲线.结果 成功构建了肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的全长cDNA克隆;体外转录及转染RD细胞60 h后可观察到明显的CPE现象;RT-PCR在转染RD细胞中检测到病毒的存在;成功利用空斑法测定了拯救病毒的一步生长曲线,大滴度达到2×107 pfu/mL.结论 成功构建了肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的全长cDNA克隆并验证了其感染性,同时测定了拯救病毒的一步生长曲线,与野生型病毒相近.

  • 一起引发手足口病流行的肠道病毒71型的分子特征

    作者:陈立;李秀珠;张礼璧;朱晖;胡家瑜;丁晓光;祝双利;清水博之

    上海市某幼儿园2000年10~11月发生手足口病(HFMD)流行,从患儿粪便标本中分离到13株肠道病毒71型(EV71),血清学实验证明,所分离的病毒为此次HFMD流行的病因.对其中的4株病毒(SHANGHAI-EV71-H25、SHANGHAI-EV71-H26、SHANGHAI-EV71-F1和SHANGHAI-EV71-F2)进行了VP1区全基因核苷酸序列测定,并做了比较分析.4株EV71 VP1区全基因均为891个核苷酸,编码297个氨基酸,与检索到的广东省深圳市和台湾省HFMD病人EV71分离株同源性较高(>94%),与脑炎EV71分离株(BrCr株)同源性低(<83%).种系发生树分析亦表明,上海市的4株EV71与深圳株(AF302996-EV71-SHZH98)和台湾株(AF286531-FV71-TW98)亲缘关系较近,与BrCr株亲缘关系较远.因此上海市HFMD 4株EV71分离株为本地流行株.

  • 延边朝鲜族自治州2009~2010年肠道病毒71型VP1编码区基因特征

    作者:苟伟民;周剑惠;王爽;徐雪梅;魏雷雷;马玉凤;刘君;曹凤瑞;常新

    目的 分析吉林省延边朝鲜族自治州(延边州)流行的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)分离株的基因特征.方法 对2009~2010年延边州手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)来源的5株EV71分离株进行逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)扩增VP1编码区,测序并使用Bioedit和Maga4生物信息学软件进行基因特征分析.结果 延边州5株EV71分离株均为C4a基因亚型,其VP1编码区核苷酸序列具有较高的同源性(99.3%~100%),在基因树上形成紧密的一簇.延边州的5株分离株与安徽省阜阳市2008年流行株具有近的基因亲缘关系,核苷酸同源性高达99.3%~99.4%.结论 延边州2009~2010年EV71分离株均属于C4a亚型,至少有一个EV71传播链在延边州持续传播,引起延边州HFMD的流行.需要加强EV71分子流行病学监测,掌握本地流行的EV71基因型数据,并及时发现输入基因型.

  • 长春市2009年手足口病来源的肠道病毒71型分子特征分析

    作者:吴静;孙宇;周剑惠;王爽;刘红;魏雷雷;常新;曹凤瑞;田鑫

    目的 阐明长春市2009年手足口病(Hand Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)分离株的VP1编码区基因特征.方法 对从长春市2009年HFMD患者分离到的7株EV71分离株,采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)进行VP1编码区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,用生物信息学软件Bioedit和Mega 4.0进行同源性、亲缘关系分析.结果 7株EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.5%~100%和98.6%~100%;与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.1%~99.7%和98.6%~100%.7株分离株均属于C4a基因亚型,在基因亲缘关系树上处于两个相对独立的进化分支(较大进化分支Clade 1和较小进化分支Clade 2).结论 目前监测到的2009年致长春市HFMD流行的EV71为C4a基因亚型,并且至少有2个C4a基因亚型的传播链同时存在,其中Clade1为优势传播链.

  • 广西壮族自治区四个县0~15岁人群肠道病毒71型中和抗体水平调查

    作者:李燕;祝双利;刘燕敏;李荣成;殷大鹏;夏伟;李艳萍;萁兆军;王东艳

    目的 了解广西壮族自治区(广西)4个县0~15岁人群的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)中和抗体(Neutralizing Antibody,NA)水平,为制定EV71疫苗免疫程序提供参考.方法 选取广西4个县作为研究现场,在每个县选取2个乡,对调查现场的0 ~15岁人群采集静脉血标本.结果 ≤6月龄各月龄组研究对象血清EV71 NA阳性率随年龄的增长而迅速下降;直到9~11月龄仍维持在较低水平(20.0%),≥1岁各年龄组NA阳性率迅速上升,其中5岁组的EV71 NA阳性率高(87.0%).0~ 15岁人群的EV71 NA几何平均滴度(Geometric Mean Titer,GMT)为1:18.24,新生儿EV71 NA GMT较高(1:23.12),随着月龄增长,EV71 NA GMT逐渐下降,至5月龄降至低(1:5.46),≥1岁各年龄组的NA GMT迅速上升,5岁组高(1:95.68).4个县及不同性别的分年龄组EV71 NA阳性率及GMT与EV71总的NA阳性率及GMT相似.结论 5~6月龄婴儿EV71 NA阳性率及GMT均降至低水平,为确定EV71疫苗接种起始月龄提供参考.

  • 北京市2008年肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析

    作者:黄芳;李伟红;檀晓娟;曲梅;吕燕宁;丁立新

    目的 了解北京市2008年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,人肠道病毒71型(Human Enterovirus 71,HEV71)分离株的VP1编码区基因特征.方法 采集发病1~3d的咽拭子标本33份,采用人横纹肌肉瘤(Human Rhabdomyosarcoma,RD)细胞进行EV分离,用特异引物通过逆转录-聚合酶链反应扩增进行毒株鉴定.对分离到的HEV71进行VP1编码区全长扩增,并对扩增产物采用双脱氧链终止法进行序列测定,Bioedit7.0.5和Mega 3.1软件进行序列比对和系统进化树分析.结果 从33份咽拭子标本中共分离到16株病毒,经鉴定:HEV7114株,柯萨奇病毒(Coxsackie Virus,CV)A组16型(CVA16)2株,其中1N为HEV71和CVA16混合感染.对10株HEV71进行了VP1编码区全序列测定,10株病毒的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.5%~100%和98.9%~100%;与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.4%~99.1%;与C4基因型代表株的核苷酸序列同源性>92%.基于HEV71的VP1编码区核苷酸序列构建亲缘性关系树,北京市2008年流行株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型中的C4a分支;且10株病毒处于四个相对独立的进化分支.结论 北京市2008年从HFMD患儿分离的HEV71均为C4亚型,且属于2004年以来我国的优势分支-C4a.亲缘性分析提示,此次流行中至少存在4个HEV71传播链.由于近年来HEV71在中国持续大规模流行,迫切需要对HEV71进行连续的分子流行病学监测,及时阐明现阶段流行毒株的基因特征,为疾病预防控制提供病毒学依据.

  • 全州县2010年手足口病流行病学和病原学特征分析

    作者:姜孟楠;莫兆军;檀晓娟;陈立;麦浩;张欣欣;祝双利;许文波

    目的 分析全州县2010年手足口病(Hand,Foot andMouthDisease,HFMD)的流行病学和病原学特征.方法 采用描述流行病学方法,对国家疾病监测信息报告管理系统中报告的HFMD资料进行统计分析;对1例HFMD死亡病例和4例HFMD重症病例的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71),采用逆转录-聚合酶链反应(ReverseTranscription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)扩增结构蛋白1(VP1)基因片段全长,并对扩增产物进行测序.根据VP1基因核苷酸序列与其他EV71毒株序列构建亲缘性关系树.结果 截至2010年12月31日,全州县共报告HFMD4580例,其中死亡10例;报告发病率651.15/10万,病死率为0.22%.0~5岁儿童病例占90.94%,其中2~3岁发病率15250.16/10万.实验室确诊HFMD106例,其中EV71阳性77例;实验室确诊重症病例86例,EV71阳性62例.全州县5例HFMD的EV71 VP1基因序列测定和分析证实为C4a亚型.结论 全州县2010年发生HFMD流行,重症病例发病高峰在4~6月,病例以<5岁儿童为主,2~3岁儿童发病率高.EV71 C4a亚型为引起全州县HFMD重症和死亡的主要病原.

  • 陕西省2009~2012年肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析

    作者:檀晓娟;关路媛;徐艺;冀天娇;张宝敏;王敬军;余鹏博;许文波

    目的 对陕西省2009~2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究.方法 采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR),对陕西省2009 ~2012年分离自手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)病例的38株EV71进行衣壳蛋白(Capsid Protein) VP1编码区基因序列扩增.通过双脱氧末端终止法(Sanger法)测序,获得VP1编码区核苷酸序列.采用软件Sequencher5.0和MEGA 5.0对序列进行生物信息学分析.结果 陕西省2009 ~ 2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有高的核苷酸序列同源性,为93.4% ~99.4%;与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有近的进化关系.陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为93.3% ~ 100%(平均97.3%)和98.3% ~ 100%(平均99.4%).但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大.结论 陕西省2009 ~ 2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支,为中国近年来流行的优势基因亚型.陕西省EV71具有较高的基因同源性,但基因多态性随着时间逐渐增大.进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律,需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测.

  • 六个县母婴肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型中和抗体水平调查

    作者:夏伟;李燕;殷大鹏;毛乃颖;王华庆;梁晓峰;刘燕敏

    目的 了解新生儿和新生儿母亲的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A Type 16,CVA16)中和抗体(Neutralizing Antibody,NA)水平.方法 选取广西壮族自治区和江苏省的3个手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease; HFMD)高发县和3个低发县作为研究现场,在每个县选取一个HFMD高发乡和一个低发乡,每个乡选择10对新生儿及新生儿母亲,对所有调查对象采集静脉血,并对新生儿母亲进行问卷调查.结果 母亲Ev71和CVA16的NA阳性率和几何平均滴度(Geometric Mean Titer,GMT)分别为83.5%、33.1%和1∶26.61、1∶6.11,新生儿EVn和CVA16的NA阳性率和GMT分别为75.2%、35.5%和1∶22.05、1∶6.97,母婴EV71、CVA16的NA阳性率及GMT差异均无统计学意义(x2EV71=2.52,P=0.1124;x2CvA16=0.1650,P=0.6846;tEV71=1.05,P=0.2953;tCVA16=1.30,P=0.1946).EV71、CVA16的NA阳性率和GMT在HFMD高、低发县差异亦无统计学意义(x2Ew1=1.45,P=0.2288;x2CVA16=1.28,P=0.2583;tEV71=1.86,P=0.0643;tCVA16=0.2,P=0.8399).母婴EV71和CVA16的NA GMT均存在相关性(rEV71=0.69,P<0.0001;rCVA16=0.4769,P<0.0001).结论 母亲EV71和CVA16的NA阳性率和GMT高,新生儿EV71和CVA16的NA相应也高,可为新生儿提供有效保护.

  • 山东省2007年肠道病毒71型基因特征分析

    作者:檀晓娟;李崇山;纪峰;张勇;祝双利;王海岩;张玉军;严冬梅;朱晖;陈立;王东艳;姬奕昕;徐爱强;王显军;李岩;唐浏英;毛乃颖;朱贞;安洪秋;许文波

    目的 阐明引起山东省2007年手足口病(Hand-Foot-Mouth Disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(Entero-virus 71,EV71)基因特征.方法 对从山东省2007年HFMD患者分离到的EV71,采用逆转录-聚合酶链反应(Re-verse Transcription Polymerase Chain Reaction,RT-PCR),进行VP1编码区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定和分析.结果 从山东省2007年HFMD患者标本中共分离到50株E71.根据VP1部分基因核苷酸序列与EV71其它基因型和亚型参考株建立亲缘性关系树,50株病毒与C4亚型代表株聚为一簇.对其中的17个代表株进行VP1编码基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建亲缘性关系树,17个代表株与C4亚型仍然聚为一簇,与C4亚型代表株的核苷酸序列同源性为92.3%~93.8%.结论 引起山东省2007年HFMD的EV71均为C4亚型,但与中国大陆以往分离的C4亚型毒株有较大差异,提示C4亚型毒株在中国大陆传播了较长时间,有多个不同分支的C4亚型毒株曾在中国大陆流行.应加强对引起HFMD的EV71作分子流行病学监测,阐明现阶段流行的EV71基因型别和基因特征.

  • 吉林省2009年致手足口病流行的肠道病毒71型分离株基因特征分析

    作者:侯祥;周剑惠;常新;王爽;陈超;刘桂艳;齐中;吴丹;安小娜;浦苗;张勇

    目的 分析引起吉林省2009年手足口病(Hand Food and Mouth Disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)分离株的基因特征.方法 选择15株2009年分离于吉林省六个设区的市(州)的HFMD病例的EV71分离株,进行 VP1编码区基因全长逆转录-聚合酶链反应扩增、序列测定,使用Bioedit软件和MEGA 4.0软件进行同源性、基因亲缘关系分析.结果 吉林省2009年的15株EV71分离株均属于C4基因亚型,而且分属于四个相对独立的传播链,其中11株病毒(分离于六个市)属于一个较大的传播链,其余4株形成三个小的传播链.29.5%的吉林省分离株间比对同源性高达99.1%~99.8%,吉林省2009年分离株与安徽省阜阳市2008年以及北京市2008年的流行株间,核苷酸高同源性分别达到了99.8%和99.7%.结论 吉林省2009年至少有四个C4基因型的EV71传播链引起了HFMD的流行,并且有一个EV71优势传播链在几个省以及省内六个市持续传播,引起HFMD的流行;三个小的传播链可能为输入病毒所致.尚未发现在引起HFMD死亡、重症以及轻症的EV71分离株VP1编码区的氨基酸序列呈现规律性的区别.

  • 2015年甘肃省健康人群肠道病毒71型血清流行病学调查

    作者:陈建华;武海卓;李红育;于德山

    目的 了解2015年甘肃省健康人群肠道病毒71型(EV71)抗体水平,为EV71疫苗的预防接种提供依据.方法 于2015年在5个县区按照分层随机抽样方法采集5个年龄组健康人群血清标本,使用微量细胞中和试验检测血清EV71中和抗体.结果 调查对象EV71中和抗体阳性率为62.63%(533/851),抗体几何平均滴度(GMT)为1∶12.93.0-1岁、2-4岁、5-9岁、10-14岁、≥15岁人群EV71中和抗体阳性率分别为51.15%、50.90%、58.88%、75.61%、79.87%(x2 =51.52,P<0.001),GMT分别为1∶7.54、1∶12.10、1∶12.90、1∶20.35、1∶16.08(F=4.19,P=0.002).5个县区人群EV71抗体阳性率在46.00%-83.15%之间(x2 =56.70,P<0.01),GMT在1∶6.81-1∶20.05之间(F=8.08,P=0.00).结论 2015年甘肃省健康人群EV71抗体水平较低;建议开展重点地区<5岁儿童EV71疫苗的接种工作.

  • 肠道病毒71型及其候选疫苗株研究进展

    作者:陈鹏;王海岩;陶泽新;王显军;徐爱强

    肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)于1969年首先在美国加利福尼亚被分离到.此后,EV71在世界范围内不断发生流行,特别是近几年在中国许多省、自治区、直辖市发生的EV71感染所致手足口病的流行,引起国内外学者的高度关注,EV71疫苗研发成为当前的热点之一.该文综合国内外有关研究文献,就EV71的病毒学、流行病学、致病机制、候选疫苗株研究进展进行综述.

  • 肠道病毒71型的分子流行病学现况

    作者:檀晓娟;许文波

    目的 肠道病毒71(Enterovirus 71,EV71)是导致婴幼儿感染的重要病原之一,可引起多种疾病,具有较广的疾病谱.EV71可引起大规模的手足口病(Hand,Foot,and Mouth Disease,HFMD)爆发,也可引起脑干脑炎等神经系统感染,导致死亡.现对EV71分子流行病学研究方法和研究进展进行综述,总结和分析了EV71各种基因型/亚型毒株的进化史及进化地位,对国际上EV71各种基因型/亚型的流行现况进行了概括总结.

  • 肠道病毒71型疫苗研究进展

    作者:李燕;刘燕敏;梁晓峰

    近几年来,手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)受到越来越多的关注.肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)是引起HFMD的病原体之一.由于HFMD重症或死亡病例以EV71为主要病原,且该病尚无特效的治疗药物,因此EV71疫苗成为预防HFMD有效的措施.国内外已有灭活疫苗、减毒活疫苗、亚单位疫苗、病毒样颗粒和脱氧核糖核酸疫苗等多种尝试,但这些疫苗仅在动物模型中进行了评价,尚未实施临床试验.现将EV71疫苗研究进展进行综述.

  • 肠道病毒71型武汉分离株(EV71-WH029)全基因组cDNA克隆及序列分析

    作者:李江;刘希佳;刘海舟;刘万红

    目的 对肠道病毒71型武汉分离株(EV71-WH029)进行全基因组克隆、序列测定及分析,了解其基因组结构和遗传进化特征,并初步探索EV71毒力相关位点.方法 采用RT-PCR扩增覆盖基因组全长的cDNA片段,利用Over-lap extension PCR得到WH029全基因组cDNA克隆;cDNA片段测序后利用BioEdit 4.8.8和MEGA 5.2.2等软件进行序列分析和遗传进化分析;采用Fisher's exact test进行编码区氨基酸变异位点的统计分析;采用RNAfold服务器进行非编码区二级结构分析.结果 WH029分离株基因组全长7 406 nt(未包含多聚腺苷酸尾),5'-和3'-UTR分别为743 nt和81 nt,中间为一个全长6 582 nt开放阅读框(ORF),编码一个长度为2 194 aa的多聚蛋白,编码区无核苷酸的缺失或插入;该毒株与安徽阜阳株EU703813及上海株JQ736684的核苷酸及氨基酸序列同源性均高(分别为97.53%~100%和97.41%~99.73%),系统进化分析也表明该毒株与以上两株的亲缘关系近;编码区氨基酸序列分析发现有7个位点变异.非编码区的二级结构预测提示,该区域的核苷酸位点变异与毒力无直接相关性,而与地域有相关性.结论 WH029分离株全基因组结构符合EV71病毒特征,经序列比对及进化分析证实WH029分离株属于EV71 C4a基因亚型,并推断该株可能来源于2008年安徽HFMD疫情.对不同临床症状的EV71毒株序列的比较分析提示,EV71毒力与编码区单一位点的突变及非编码区二级结构的变异无直接相关性,可能与多位点突变共同作用及患者的个体差异相关.

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