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2012-2013年湖北省襄阳地区病毒性腹泻的病原学分析
目的 了解湖北省病毒性腹泻的主要病原及其主要基因型别.方法 采集襄阳市儿科腹泻门诊或住院患儿以及消化内科成人的粪便样本,采用逆转录PCR (reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法 检测轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、札如病毒以及腺病毒,并对轮状病毒、诺如病毒和腺病毒进行基因分型和型别鉴定.结果 湖北省襄阳地区收集的儿童和成人粪便样本217份中,病毒检测阳性率依次为轮状病毒A组24.88％、诺如病毒13.78％、星状病毒0.92％、腺病毒35.94％,未检测到B组和C组轮状病毒以及札如病毒,混合感染率10.60.轮状病毒A组G型与P型组合依次为P[8] G9(57.45％),P[8] G3 (34.04％),P[4] G9(4.26％),P[8] G2(2.13％),P[8] G4 (2.13％).诺如病毒的主要型别为GⅡ.3型,同时检测到GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.12型以及GⅠ.3型诺如病毒的感染.其中GⅡ.4型主要与2012年、2013年澳大利亚株具有较高的同源性,系统发育分析发现其与2012年澳大利亚GⅡ.4及其新变种GⅡ.4 Sydney株有较近的亲缘关系.腺病毒检测除发现肠道腺病毒Ad41型感染外,发现存在较多Ad31型感染,并同时检测到Adl、2、5、7以及Ad55型腺病毒.结论 湖北省襄阳地区病毒性腹泻的病原复杂,病原混合感染比例较大,轮状病毒主要流行株为P[8] G9,诺如病毒主要为GⅡ.3型,腺病毒Ad31型以及其他呼吸道感染的腺病毒导致腹泻值得重视.
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2014年温州市317例食源性疾病病例流行病学调查研究
目的 了解哨点医院食源性疾病特定病原体分布情况及其流行病学特征,为食源性疾病防治提供依据.方法 收集温州市食源性疾病监测哨点医院以腹泻症状为主诉且粪便或肛拭样本检测结果为病原体阳性的门诊和住院病例,进行临床症状、可疑食品暴露史调查,并对病原学检测结果进行分析.结果 共收集317例病原体阳性食源性疾病病例,副溶血弧菌检出率高,占67.91％00 (218/321).检出7个血清群,O3:K6为优势血清型,呈现较明显的夏秋季高峰,成年人群中高发,尤其是26～ 35岁年龄段;其次为诺如病毒和沙门菌,分别有48株和44株,占14.95％ (48/321)和13.71％ (44/321).0～5岁的儿童更易感染,全年均有检出,诺如病毒以GⅡ型为主,沙门菌以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主要血清型.所有患者均有不同程度的大便性状改变,水样便为主(96.85％).可疑食品暴露史主要是水产及其制品、肉类、禽类及其制品以及蔬菜水果类.结论 食源性疾病病例特定病原体分布情况、临床症状及可疑食品暴露史对食源性疾病的诊治、预防提供非常重要的意义,需完善食源性疾病监测网络,加快医疗机构信息化建设,提高临床实验室在监测过程中的支持作用,逐步完善食源性疾病监测、预警和控制体系.
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诺如病毒医院内消毒隔离措施的制定与实施
目的 针对杭州市部分医院在住院患者中发生急性非细菌性胃肠炎,制定消毒隔离措施.方法 2006 年 12 月 23 日至 2007 年 1 月 9 日,某院一内科病区发生急性胃肠炎 19 例,其中 3 例患者采集粪样送检诺如病毒监测.结果 经 RT-PCR 检测,3 份粪样中,2 份诺如病毒(GⅡ)核酸阳性;该院内科病区的急性胃肠炎罹患率为 37.25%(19/51);为此,本文针对诺如病毒的病原学特点及多途径感染的流行病学特征,制定了包括对污物、物表、物品消毒以及患者的隔离和个人防护等 10 项措施,并立即付诸实施.结论 该院内科病区的急性胃肠炎疫情得到有效控制,疫情未在其他病区扩散蔓延.制定的诺如病毒医院内消毒隔离措施是有效的、可行的.
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2013-2015年宁波市轮状病毒和诺如病毒腹泻监测结果分析
目的 了解2013-2015年宁波市腹泻患者中轮状病毒(rotavirus,RV)和诺如病毒(norovirus,NV)的感染情况和流行趋势.方法 2013-2015年(以5～10月为主)采集宁波市10家医院(儿童医院3家,综合性医院7家)门诊就诊的食源性腹泻患者样本2 129份(与病原菌监测共用).采用实时荧光定量PCR法,对2 129例腹泻患者按不同年龄分组检测RV和NV型别.结果 检出RV和NV核酸阳性165份,总阳性率为7.75％,其中RV阳性率为2.44％,NV阳性率为5.31％;2013-2015年连续检测显示RV阳性率呈逐年下降趋势,NV阳性率呈波动趋势,差异有统计学意义(x2=23.46,P=0.000);＜5岁组患者感染率高于＞18岁组人群,两者差异有统计学意义(x2=120.60,P＜0.05);RV和NV感染高发季节分别在11～12月和11月至次年的3月,具有季节性.结论 RV和NV在流行特征上有许多相似点,首先是全年各月份均可检出,以秋冬季为感染高峰,NV感染高峰更长;其次均感染＜5岁年龄组人群(P＜0.05),重症时危及生命.3年检测提示NV已成为病毒性腹泻的主要病原.宁波市处于随时有引起暴发疫情的可能性,应引起关注,加强检测,以减少疾病的流行.
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佛山市南海区诺如病毒引起急性胃肠炎暴发的流行病学研究
目的 了解佛山市南海区暴发的急性胃肠炎中诺如病毒感染的流行特征.方法 对南海区 2006-2007 年暴发的2起急性病毒性胃肠炎疫情进行流行病学调查和分子流行病学研究,将收集到的患者的粪便、肛拭子标本,采用针对诺如病毒的特异性引物和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术进行检测,再经过分析核酸序列分析病毒的基因型.结果 两起暴发流行的急性胃肠炎均由GⅡ.4亚型的诺如病毒引起.结论 诺如病毒是引起南海区秋冬季急性胃肠炎暴发流行的主要病原体,且引起暴发的流行病毒株属于GⅡ.4型.
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佛山市南海区5岁以下儿童病毒性腹泻病原监测分析
病毒感染性腹泻是引起儿童急性腹泻的重要原因,这类病毒有轮状病毒(rotavirus,RV)、诺如病毒(norovirus,NV)、星状病毒(astrovirus,AstV),肠腺病毒和肠道病毒等.而前两种病毒常见,2006-2007年初南海区曾出现过这两种病原引起的腹泻暴发,为了解南海区5岁以下儿童中这两种病原引起的病毒性腹泻的存在流行情况,本研究于2008年12月到2010年2月间开展了病毒性腹泻两种病原的连续监测,并对收集的资料进行分析.现将研究结果报告如下.
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一起大学校园内诺如病毒GⅡ型胃肠炎暴发的流行病学调查
为了解杭州市某大学急性胃肠炎暴发疫情波及范围,并确定疾病暴发的病原学病因以及流行病学病因.根据病例定义开展病例搜索,进行个案流行病学调查.采用描述性流行病学和病例对照研究方法分析病例发病的危险因素.样本采用RT-PCR检测诺如病毒(norwalk viruses,NV)核酸.结果显示,2014年11月26日～12月5日西湖区某校共发生诺如病毒胃肠炎病例82例,罹患率为1.11％;病例主要集中在12月1～3日,占总病例数的80.72％;病例以学三楼和学二楼为主,占59.04％;病例临床表现以呕吐(61例,74.39％)和腹泻(44例,53.66％)为主.生活用水使用井水的罹患率(1.64％)是使用市政自来水的罹患率(0.23％)的7.13倍.病例对照研究结果显示同宿舍或同伴中有同学出现呕吐症状是独立危险因素(OR=5.01,95％ CI=1.44～17.45,P=0.011).实验室检测结果发现9份患者肛拭子诺如病毒核酸阳性.根据病例临床表现、流行病学调查以及实验室检测结果判断该起疫情为诺如病毒GⅡ型引起的急性胃肠炎暴发,暴发的主要原因可能为食用受污染的井水,同时,接触传播也是主要的传播途径.
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浙江省新昌县2010-2012年婴幼儿病毒性腹泻病原学特征分析
为了解浙江省新昌县婴幼儿病毒性腹泻的病原学特征,制定有效防治对策,新昌县疾病预防控制中心采集新昌县某医院2010-2012年5～12月份婴幼儿腹泻患者的粪便样本546份,采用实时荧光定量-聚合酶链式反应同时进行轮状病毒、诺如病毒和肠道腺病毒的核酸检测.结果显示:在546份粪便样本中,263份样本检出至少1种病毒核酸,核酸阳性检出率为48.17％ (263/546),轮状病毒、诺如病毒和肠道腺病毒的检出率分别为22.71％ (124/546)、13.74％ (75/546)和20.51％ (112/546),混合感染占8.24％(45 /546),病毒检出主要集中于2岁以下儿童腹泻患者.监测结果表明病毒为本地区婴幼儿腹泻的重要病因,其中轮状病毒和肠道腺病毒均为主要的病原体,其次为诺如病毒.对混合感染现象需要引起重视.
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诺如病毒分子生物学研究进展
诺如病毒(NoVs)是引起人感染性胃肠炎和腹泻的主要病原体之一,通常会造成群体性的暴发疫情,给患者造成心理恐慌,同时给社会带来严重的经济负担.然而,NoVs尚不能在体外培养、基因型众多且容易变异,导致NoVs疫苗和抗病毒药物研究进展缓慢.随着病毒分子生物学技术的不断深入,NoVs基因组结构、复制特征、致病机制以及机体的免疫应答等方面已取得新的突破.本研究在介绍NoVs基因结构特征的基础上,着重从分子生物学角度将近些年有关NoVs发病机制、体内外模型、感染的诊断以及抗病毒药物及疫苗的研究现状做一综述和展望.
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诺如病毒胃肠炎暴发后环境中病毒检测情况分析
目的 了解诺如病毒胃肠炎暴发后,病例临床症状消失、末例病例发病日期经过长潜伏期(72 h)且无续发病例的情况下,病例家庭环境及外环境水标本中病毒存在情况.方法 在末例病例发病日期经过长潜伏期(72h)后,采集病例肛拭标本、家庭环境标本、外环境水标本,采用RT-PCR方法 检测病毒,阳性标本测序分析.结果 9份病例肛拭标本中3份呈阳性;46份家庭环境拭子中2份呈阳性,分别是来自两户已无现症病例的家庭厕所马桶表面;5份外环境水标本中1份呈阳性,即村民粪便直接排入的河涌.病例肛拭、家庭环境拭子及河涌水三者检出的病毒株核苷酸序列一致,提示病毒同源.结论 诺如病毒胃肠炎暴发后期,病例肛拭、病例家庭环境及外环境水标本中仍能检出病毒,因此有必要加强病例的粪便管理及疫情后期的环境消毒,以防粪便污染引起二代病例.
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浙江省2006-2007年暴发性胃肠炎中诺如病毒的分子流行病学分析
目的 分析浙江省2006-2007年暴发性病毒性胃肠炎中诺如病毒感染的分子流行病学特征.方法 收集监测期间暴发性病毒性胃肠炎疫情患者的粪便标本及相关流行病学资料.采用RT-PCR及荧光定量RT-PCR检测诺如病毒.随机选掸部分阳性标本扩增部分多聚酶区和衣壳蛋白片段,进行序列测定,结合诺如病毒I(GI)、Ⅱ(GⅡ)基因型参考株进行进化分析.结果 诺如病毒感染暴发性胃肠炎共5起,发生时间均集中于9-12月,送检标本63份,诺如病毒检测阳性45份.序列分析结果显示,浙江省诺如病毒序列与诺如病毒GⅡ/4型参考株同源性高,其中与北京2006年、荷兰2006年诺如病毒GⅡ/4型变异株为接近,核苷酸同源性分别为99.7%和98.5%～99.0%.诺如病毒与北京、荷兰流行的GⅡ/4型变异株处于同一分支.结论 诺如病毒是浙江省病毒性腹泻暴发疫情的重要病原体,流行时间集中于秋季,其流行株为GⅡ/4型变异病毒株.
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诺如病毒GGⅠ、GGⅡ型混合感染致胃肠炎饮水型暴发调查
诺如病毒是引起人类急性胃肠炎的重要病原体,基因型包括GG Ⅰ、GG Ⅱ、GGⅣ~([1]).混合基因型引起感染较少.2009年2月浙江省安吉县某学校发生一起诺如病毒GG Ⅰ、GGⅡ型混合感染暴发疫情.使用统一调查表对该校疫情流行期间的腹泻学生进行流行病学调查核实,出现腹泻(≥3次/d)或呕吐伴腹泻、恶心、腹胀、头晕等症状之一者作为胃肠炎病例;采集部分病例粪便标本,用Real Time RT-RCR方法检测病毒基因型.通过描述性研究进行流行特征分析;通过病例对照研究进行病因探索,按1:3频数匹配随机选择病例24例、对照72人;通过计算OR值、χ~2值判断可能的暴露因素.
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天津市轮状病毒和诺如病毒性腹泻流行病学特征研究
调查天津市感染性腹泻病患者中轮状病毒(RV)和诺如病毒(NV)发病状况,并分析其流行病学特征.1.资料与方法:随机选取天津市南开区、近郊的津南区、滨海的塘沽区及地处远郊的宝坻区作为调查地区.各区选一所综合医院参加,包括天津市儿童医院.将2007年12月1日至2009年12月31日在5所医院就诊的成年人和儿童感染性腹泻临床诊断病例纳入研究.
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一起诺如病毒感染性腹泻暴发的调查
2007年7月初,江西省某高校出现多例感染性腹泻患者,后被证实由诺如病毒(NV)感染引起,是江西省首起经实验室确认的NV感染性腹泻暴发疫情,现将调查结果报道如下.
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GGⅠ诺如病毒致胃肠炎饮水型暴发的调查
诺如病毒是引起人类急性胃肠炎的重要病原体,其感染基因型包括GG Ⅰ、GG Ⅱ和GGⅣ[1].调查显示我国人群诺如病毒感染十分普遍[2],尽管如此,国内报道的诺如病毒基因型多为GGⅡ[3-5],而GGⅠ特别是多区域人群暴发的研究较少涉及.2008年3月杭州市某区发生一起GG Ⅰ诺如病毒的暴发疫情,调查结果如下.
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广州市大学城诺如病毒GⅡ.4 Sydney 2012变异株感染疫情再次暴发的调查
2013年1月广州市大学城ZD 大学暴发国内首起诺如病毒GⅡ.4 Sydney 2012变异株感染引起的急性胃肠炎疫情［1］。2个月后该地区其他4所高校（HS、HG、GD、GG）和1所中学（GDFZ）相继又出现暴发。为此本文分析两次疫情间的连续关系。
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深圳地区2006年诺如病毒分子流行病学研究
诺如病毒是世界范围内引起急性胃肠炎的主要病原体,1990年首次证实我国也存在该病毒引起的感染[1],此后北京、长春、河北、兰州、广州、福州等地均发现存在诺如病毒感染,表明我国急性胃肠炎病例诺如病毒感染亦相当普遍.本研究对2006年深圳地区急性胃肠炎中诺如病毒进行分子生物学研究.
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中国7个地区诺如病毒GⅡ.4/Sydney2012变异株分析
目的 分析2012-2013年冬季中国地区诺如病毒新流行株GⅡ.4/Sydney 2012的衣壳蛋白区核苷酸与氨基酸变异特点.方法 对已获得的22份2012-2013年冬季北京地区GⅡ.4/Sydney 2012株进行全衣壳蛋白区基因扩增.从GenBank检索中国其他地区的GⅡ.4/Sydney 2012株衣壳蛋白区核苷酸序列.对获得的GⅡ.4/Sydney 2012株的衣壳蛋白区核苷酸及氨基酸序列与往年GⅡ.4流行株进行系谱分析.结果 获得中国7个地区(北京、上海、江苏、湖州、荆州、香港和台湾)的GⅡ.4/Sydney 2012株资料共38份(至少包含完整VP1核苷酸序列).GⅡ.4/Sydney 2012株之间VP1核苷酸差异为0.1％～3.3％,氨基酸差异为0～3.1％.系谱分析发现GⅡ.4/Sydney2012株与Apeldoom 2008和New Orleans 2009起自共同的分支.中国和悉尼GⅡ.4/Sydney 2012代表株的A、D、E抗原表位氨基酸序列组合有两种:TSRN-GTT-SNT和TSRN-STT-SNT.结论 GⅡ.4/Sydney 2012株已在中国多个地区出现,各地区病毒株同源性较高.GⅡ.4/Sydney 2012株的抗原表位氨基酸组合发生明显改变.
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上海市2010-2014年确认和疑似诺如病毒感染聚集性疫情流行病学分析
目的 分析2010-2014年上海市确认或疑似诺如病毒感染聚集性疫情及其流行病学特征.方法 统计分析2010年1月至2014年11月上海市报告的确认或疑似诺如病毒聚集性疫情的调查报告.结果 共报告80起聚集性疫情,报告病例总数为2 399例,总罹患率为4.17％.聚集性疫情持续时间M=4.5 d,疫情达到峰值时间M=2d.秋冬季疫情高发,10月至翌年2月共发生53起,占总例数的66.25％.发生在学校、幼儿园和养老院的疫情共75起(93.75％).医院住院病例和养老院老年人罹患率高于托幼儿童及学生,差异有统计学意义(x2=683.12,P＜0.01);集体机构员工罹患率均低于其服务对象的罹患率.临床症状以呕吐为主,共1 900例(79.20％),腹泻和发热仅分别为694例(28.93％)和364例(15.17％),差异有统计学意义(x2=2 251.48,P＜0.01).短期共同来源为主要暴露形式,接触传播是主要感染途径.结论 2010-2014年上海市诺如病毒聚集性疫情主要发生在秋冬季和集体机构,应加强重点地区和人员监测及防护.
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中国2006-2007年诺如病毒胃肠炎暴发及其病原学特征分析
目的 了解中国2006-2007年诺如病毒胃肠炎暴发及其病毒基因型别.方法 收集2006-2007年19起胃肠炎暴发的流行病学资料以及腹泻粪便样本,用RT-PCR方法对201份粪便标本进行诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺病毒和札如病毒检测,对扩增产物进行序列测定.用Clustal X 1.83和MEGA4.0生物软件对诺如病毒序列进行序列比对和系统进化分析.结果 诺如病毒是引起病毒性胃肠炎暴发的主要病原之一(12/19,63.2%).在12起诺如病毒胃肠炎暴发中,变异株GⅡ-4/2006b是引起暴发的流行优势株(11/12,91.7%),其他型别包括GⅡ-17、GⅡ-6和GⅡ-3.诺如病毒引起的疫情暴发主要集中在冬春季节(12月至4月),发生场所多样,且各年龄组人群均有发病.同时,12起诺如病毒暴发中有2起与其他腹泻病毒混合感染,且在同一起暴发中病原具有病毒多样性和基因型别多样性.结论 诺如病毒是2006-2007年引起胃肠炎暴发疫情的主要病原之一,变异株GⅡ-4/2006b为流行优势株.
