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沃特世推出新一代LC-M S生物信息学产品Progenesis QI组学分析软件
日前,沃特世公司发布了两款新的数据分析软件,用于代谢组学/脂质组学的Progenesis? QI软件以及用于蛋白质组学研究的Progenesis QI蛋白质组学软件。新发布的软件是由沃特世子公司Nonlinear Dynamics开发,其组学软件在全球处于领先地位。
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基于GC/TOF/MS的关木通肾毒性代谢组学研究/利用蛋白质组学技术研究Z24对大鼠给药血浆蛋白质表达的改变/纳米铜体外的细胞毒性
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诊治急性B淋巴细胞白血病精准医学研究有突破
由医学基因组学国家重点实验室、上海血液学研究所陈赛娟院士等牵头的联合课题组,在急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)的基因组学研究方面获得重大进展,全方位解析了B-ALL的分子发病机制,为精准医学研究提供了新的模式。该研究5月14日发表于《E生物医学》(E Bio Medicine)杂志。
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结核分枝杆菌的蛋白质组学研究进展
结核分枝杆菌是长期以来困扰人类健康大的病原体之一,多耐药菌株的出现更是加大了控制结核病的难度,对公共卫生构成了很大的威胁.
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蛋白质组学研究方法进展及在卫生防疫中的应用前景
蛋白质、多肽是生命科学中一类重要的生物大分子物质,是生物体实现其功能的物质基础.人类基因组计划实施至今已获得大量基因信息,但基因表达并不能完全代表蛋白质功能,大部分细胞生命活动发生在蛋白质水平而不是RNA水平.因此,需要直接研究基因表达产物--蛋白质.蛋白质组学(proteome)是在人类基因组计划研究发展的基础上形成的新兴学科,蛋白质组学的任务就是研究细胞内所有蛋白质的组成及其活动规律,是在细胞整体水平上研究蛋白质的属性(表达水平、翻译后修饰,相互作用).它的研究已涉及生命科学中的一系列热点领域,使人们对生命活动的机制认识由间接的基因层次深入到生命执行体--蛋白质层次.本文主要介绍蛋白质组学的研究方法进展以及在卫生防疫中的应用前景.
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自由流电泳(FFE)技术——降低蛋白样品的复杂性
BDTM FFE自由流电泳系统是美国BD公司研制的,基于无固相机制的自由流电泳系统.它为蛋白质组学研究提供了高通量、高重现性、高灵敏度和操作简便的解决方案.
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组学研究与临床应用
科技部领导以及863生物和医药技术领域专家组,从国家层面非常关注863科研项目成果的推广和应用,有计划将在今后的工作中,通过多种渠道,与医院科研处、临床科室、检验科的负责人,开展疾病科研和临床实际运用的讨论,结合临床工作特点,提出实际的要求,开展从立项到推广以及实际应用的全程跟踪,积极推广和发展转化医学,促成组学研究在临床的应用,利用前沿高新医学科技成果,积极开展疾病的预测、预防和个体化治疗.
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精神分裂症多基因遗传位点的筛检
精神分裂症(精分症)是人类常见的精神性疾患之一.在中国,精分症的终身患病率高达0.7%左右,不仅给家庭和社会带来沉重的经济负担,而且还严重威胁社会的安全与稳定.可见,确定其病因从而达到防治是医学界乃至整个社会需迫切解决的问题.遗传流行病学研究证实,精分症与遗传因素有密切关系,但不符合经典的孟德尔单基因遗传规律,属于多基因遗传病或人类复杂疾病.人类基因组系统扫描发现,除19号、21号和Y染色体以外,其余的染色体上都可能含有精分症易感基因.但是,能获得较好重复性的染色体区域至少有6个,包括1q21-22、5q22-23、6p24-21、8p22-21、13q14-33和22q11-12[1-7].本研究工作以中国汉族精分症患者和健康父母双亲组成的核心家系为研究对象,拟在22号染色体长臂一区一带(22q11)和6号染色体短臂二区一带(6p21)染色体区域构建单核苷酸多态性(SNPs)连锁不平衡图,以筛检精分症易感基因和决定疾病易感性的SNPs.此项研究工作是后基因组时期功能基因组学研究的前沿课题,将有助于阐明精分症的分子遗传学机制,并具有潜在的经济与社会效益.
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质谱技术在代谢组学研究中的应用
代谢组学(metabonomics)概念首先由Nicholson等[1]在1999年提出,将其定义为:对病理(生理)刺激或基因改变时生物体系的动态代谢响应的多参数定量分析.即代谢组学是关于生物内源代谢物整体及其变化规律的科学,它的中心任务就是检测、量化和绘制生物代谢组的动态变化规律,并将该变化规律和所发生的生物化学反应过程联系起来[2].
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血清蛋白质组双向凝胶电泳技术优化
蛋白质组学已成为生命科学研究的重点,是寻求疾病标志物的重要源泉.通过血清蛋白质组学研究,寻找特定疾病的血清特异蛋白质标志物或发现新的疾病相关蛋白质,能为疾病的诊断或治疗提供新的依据,也可能进一步阐明一些复杂疾病的发病机制.自1975年O′Farrell[1]提出高分辨率双向电泳技术以来,该技术有了长足的发展,并与质谱技术、生物信息学技术成为蛋白质组学研究的三大核心技术 .
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肿瘤流行病学和病因学研究对转化医学的重要贡献
进入21世纪以来,世界大多数国家肿瘤研究策略发生了重大调整,实行了战略性转移,更加强调将基础研究成果尽快转化为临床应用,即转化医学.例如,美国国立卫生研究院(NIH)成立了转化医学研究中心,强调从分子影像诊断技术到血清标志物的临床应用,从基因组学研究到寻找肿瘤化学治疗、放射治疗的分子靶点,取得了可喜成效.注重转化医学,加强基础应用性研究,从卫生经济学角度出发,可以将有限的资源大限度地投入到解决实际问题中.
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基因组时代生物标志物研究的机遇与挑战
20世纪50年代,DNA双螺旋结构模型的建立标志着人类发现了生命的基本信息.20世纪70年代,遗传工程技术的发展使之趋于成熟,20世纪90年代开始,人类基因组计划把生命科学带入了新的世纪.人类基因组计划的任务是测定人类基因组的30亿个核苷酸序列结构,为阐明人类基因的结构与功能,解读人类遗传信息奠定基础.在此基础上的后基因组学研究要解决的课题是全面系统地分析基因功能,在整体水平上阐述基因活动规律 [1].
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蛋白质组学(proteomics)
蛋白质组(proteomics)系一个基因组、一种生物或一种细胞组织所表达的全套蛋白质.对蛋白质组织相关问题的研究即为蛋白质组学.由于蛋白质是体现生物功能的分子,蛋白质分子由基因所编码,故蛋白质组学研究是基因组学(特别是功能基因组学)研究的深入和延伸.蛋白质组学研究的内容大致包括以下方面:①蛋白质组作用、成分鉴定、数据库构建、新型蛋白质的发现、同源蛋白质比较、蛋白质加工和修饰分析;②基因产物识别、基因功能鉴定、基因调控机制分析;③重要生命活动的分子机制(如细胞周期、分化与发育、肿瘤发生发展、环境反应与调节等);④医药靶分子的寻找和分析(包括新药靶分子、肿瘤分子标记、人体病理介导分子、病原菌毒性成分等).
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蛋白质组学研究与中医药学的原创性发展
基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多变性存在着巨大反差,使得人们对于生命活动的直接执行者--蛋白质的重要性有了更深刻的理解.因此,对蛋白质的数量、结构、性质、相互关系和生物学功能进行全面和深入的研究,成为生命科学研究的迫切需要和重要任务."蛋白质组"的概念提出后几年,已成为现今世界范围内生物学领域研究的热点[1~6].
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中医证型与中药作用靶点的蛋白质组学研究进展
21世纪生物和信息在科学、社会发展中的作用表现得尤为突出.随着人类基因组计划的顺利完成,蛋白质组学研究的重要性日益凸现.它作为后基因时代功能蛋白质组学研究的核心技术之一,在生物学、医学等各个领域日益成为强大的技术支撑.而蛋白质组学从整体水平研究蛋白质的表达和功能的方法与中医基础理论的整体观相符,能够为中医药的研究和发展提供良好的实验平台.
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后基因组时代中医证候组学研究的思考
人类基因组工作草图完成后,研究便进入更为艰巨和复杂的后基因组时代,其主要工作是阐明一些已知基因的功能,并进行基因组序列变异研究,这必将为自然科学各学科的发展提供新的机遇,同时也将促进各学科的进一步渗透和整合,出现新的科学发展格局。中医药学又一次面临一个大好机遇的选择,若能很好地吸取当代科技精华,在其所能提供的技术平台上融合中医药的独特研究思路,将促进中医药学的发展,特别是对中医药重大问题,如对证候组学研究的突破产生影响,在WHO生物医学家们认同“个体化的具体治疗”是临床试验的高层次的时候,运用基因组学研究证候与复方,探索辨证治疗疾病与改善亚健康状态的科学原理则可能是中医学科发展的方向之一。
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双向凝胶电泳在临床血浆蛋白质组学研究中的技术难点和解决方法
随着双向电泳技术中固相化pH梯度的发明、电喷雾质谱、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术的应用,蛋白质组学技术已经越来越多的应用于疾病的研究中.临床蛋白质组学已经成为目前医学研究中的热点[1].血液标本因取材简便、应用价值高,因此血浆蛋白质组学具有应用前景,并成为临床蛋白质组学研究中关注的重要问题.
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有关"组"(-ome)和"组学"(-omits)的几个名词
自人类基因组计划(Human Genome Project)实施并进入功能基因组学研究以来,有关"组"和"组学"的研究迅猛发展,各种相关的"组"和"组学"名词大量涌现,迄今已有数十个之多.一般来说,"组"的基本涵义是集合、总合或总和之意,其名词的后缀为-ome.
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光学靶向分子探针介导内窥镜诊疗技术的研究进展
恶性肿瘤的发病率正逐年上升,很多肿瘤的发病早期无明显临床症状,目前的常规检测手段在发现时已经进入中晚期,失去根治机会。然而超早期诊断和治疗能有效提高肿瘤的治愈率。随着人类蛋白质组学研究的不断进展,从分子水平超早期诊断和治疗肿瘤的研究成为医学研究的热点。现研究表明,光学靶向分子探针介导内窥镜检查有望成为肿瘤超早期诊断和治疗的新技术。本文将结合国内外文献对光学分子探针、靶向分子受体和光学分子内窥镜成像技术进行综述,探讨光学靶向分子探针介导内窥镜诊疗技术的科学性和实用性。
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2001年"973规划"项目
有关人口与健康领域的5项新项目是:--干细胞的基础研究与临床应用;--抗原特异性免疫应答与免疫耐受的分子机制及其应用基础研究;--人胚胎生殖嵴干细胞的分化与组织干细胞的可塑性研究;--人类重大疾病的蛋白质组学研究;--中国人口出生缺陷的遗传与环境可控性研究.这些项目已经取得了阶段性突破和可喜成果.