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身材和肥胖的"新看法"
胖子基因--确实与基因有关科学家首次在胖鼠身上发现这种基因时,就将其命名为胖子基因.数年后,当他们在人类基因组中,寻找易罹患2型糖尿病的分子标记时,又再次发现了胖子基因(如今人们礼貌地称之为FTO).科学家发现,有两对FTO基因的人,罹患糖尿病的几率比没有这种基因的人高出40%,罹患肥胖症的可能性则高出60%.那些有一对FTO基因的人,体重也会较重.
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水中嗜肺军团菌分布规律研究
目的探讨水环境中嗜肺军团菌分布规律及分型特征.方法采集自然环境及生活环境中各主要水体样品,浓缩后经常规细菌培养后的疑似菌株,用血清学鉴定与16SrRNA半套式PCR技术双重鉴定进行军团菌和嗜肺军团菌的分型.结果全部126个监测点水样有28个出现军团菌阳性(其中嗜肺军团菌21个);自然环境及生活环境监测点军团菌阳性率分别为32.1%、22.2%(其中嗜肺军团菌阳性率分别为21.4%、16.7%);全年430份水样有36份军团菌阳性(其中23份为嗜肺军团菌),夏、秋季检出率较高,春、冬季也有检出;空调冷却塔水、淋浴喷头水、公园湖水检出率较高.结论嗜肺军团菌在自然环境及生活环境各水体中分布广泛.环境温度是军团菌污染的重要因素,夏、秋季是军团菌污染和军团病传播的高发季节,春、冬季也可发生.公园娱乐水体、空调冷却水、淋浴喷头水等与人群密切接触水体是军团菌污染和军团病传播的高危水体.应尽快采取预防与控制措施以保护广大人群身体健康.
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流行性感冒病毒耐药性监测研究进展
流行性感冒病毒简称流感病毒,分为甲(A)、乙(B)、丙(C)三型.临床上用于抗流感病毒的药物主要有两类,一类是烷胺类药物,即M2离子通道抑制剂,包括金刚烷胺和金刚乙胺,该类药物仅作用于A型流感病毒,对B型流感病毒无效;另一类是神经氨酸酶( neuraminidase,NA)抑制剂,包括奥司他韦(oseltamivir,达菲)、扎那米韦(zanamivir,依乐韦)、帕拉米韦( peramivir)、拉尼那米韦(laninamivir),其中后2种目前仅在日本和(或)韩国上市.评价流感病毒药物敏感性的方法包括表型分析和基因型分析.常用化学发光或荧光底物法进行表型耐药分析,而基因型分析则是通过常规测序或焦磷酸测序等方法测定抗性突变的分子标记[1].
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蛋白质组学(proteomics)
蛋白质组(proteomics)系一个基因组、一种生物或一种细胞组织所表达的全套蛋白质.对蛋白质组织相关问题的研究即为蛋白质组学.由于蛋白质是体现生物功能的分子,蛋白质分子由基因所编码,故蛋白质组学研究是基因组学(特别是功能基因组学)研究的深入和延伸.蛋白质组学研究的内容大致包括以下方面:①蛋白质组作用、成分鉴定、数据库构建、新型蛋白质的发现、同源蛋白质比较、蛋白质加工和修饰分析;②基因产物识别、基因功能鉴定、基因调控机制分析;③重要生命活动的分子机制(如细胞周期、分化与发育、肿瘤发生发展、环境反应与调节等);④医药靶分子的寻找和分析(包括新药靶分子、肿瘤分子标记、人体病理介导分子、病原菌毒性成分等).
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丹参EST序列中SSR信息的分析及分子标记的建立
本文对从NCBI下载的鼠尾草属11747条EST序列(其中,丹参10228条)进行分析,搜索到含SSR的序列1911条,共含有SSR 2156个,出现频率为18.35%.在丹参EST-SSR中,核苷酸重复基元种类共77种.单核苷酸重复多,出现频率为10.45%,二、三核苷酸的出现频率为3.72%、4.40%.三核苷酸重复中ACG/CTG为主要类型,占27.3%.共设计引物143对,合成13对(其中,丹参6对,Salvia fruticosa7对),在对引物、dNTP、MgCl2进行测试后,建立了合适的PCR反应体系.引物筛选发现7对引物(丹参6对,S.fruticosa 1对)对丹参基因组DNA均有良好的扩增,并对11个不同产地丹参样品进行扩增均呈现良好的多态性.本研究结果证明根据丹参EST资源建立丹参EST-SSR标记是可行的.
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基于全电性离子色谱的6味中药药性的蛋白质分子标记研究
目的:提出分子标记法检测中药药性物质基础研究的新思路,探讨全电性离子色谱技术用于筛选中药药性蛋白质分子标记的可行性.方法:联合应用阴、阳离子交换色谱技术,将特定pH条件下中药的全部水溶性蛋白的色谱峰呈现出来,形成全电性离子色谱图,平行比较不同药性中药的全电性离子色谱图,筛选出相同药性中药间共有的药性标识峰,对药性标识峰组分作SDS-PAGE,比较分析药性相关的共有蛋白条带,作为中药药性的蛋白质分子标记.结果:干姜、肉桂、仙茅3味热性中药在阴离子交换色谱的收集部分编号为30附近,存在多个共有特征峰;黄连、知母、金银花3味寒性中药在阴离子交换色谱的收集编号为35附近会存在多个共有特征峰;3味热性中药的共有特征峰组分在分子质量为50ku(1u=1.660 54×10<'-27>)附近存在一条共有条带,在分子质量约为31ku处,存在2条共有条带;3味寒性中药共有特征峰组分在分子质量为31ku附近,存在2条共有条带.结论:收集编号为35和30附近的共有色谱峰在3次重复中稳定呈现,可以作为6味测试中药的寒、热药性标识峰.标识峰的共有条带分别是3味寒性中药与3味热性中药所特有的,在3次重复中稳定呈现,可以作为6味测试中药药性的蛋白质分子标记.全电性离子色谱法是一种可行的中药药性分子标记研究的新方法.
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濒危药用植物新疆阿魏cDNA文库构建与微卫星标记
目的:测试和分析新疆阿魏转录组,挖掘基因表达谱多态性标记(EST-SSRs),为新疆阿魏属植物遗传多样性、生物学特性、功能基因鉴定和濒危机制的研究奠定基础.方法:提取新疆阿魏茎叶总RNA,反转录合成cDNA,应用454 GS FLX Titanium进行测序,并对其序列进行拼接,获得一致性序列(UniqueSequences);使用Simple Sequence Repeat Identification Tool (Perl Script)对一致性序列进行分析,检索SSRs模体,采用Primer 5及SSR Hunter软件设计引物并进行PCR扩增.结果:高通量测序获得新疆阿魏ESTs序列550 200条,经拼接得到60 248条Unique Sequences,从中发现1916个EST-SSRs,平均每100kb出现3.18个SSR,其中二核苷酸多,GA重复常见,随机挑选5条序列扩增及测序结果表明,80％的SSR位点与Sanger测序结果一致.结论:通过转录组测序首次获得新疆阿魏EST-SSRs,为新疆阿魏生物学特性及濒危机制研究奠定了基础.
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有效成分生源途径解析与调控技术在中药材生产实践中具有广阔应用前景
中药材资源与质量是整个中医药产业链可持续发展的基础与保障.在决定中药材质量的诸多因素中,有效成分是其具有确切临床疗效的物质基础,药效物质的有无多寡是药材质量的核心要素.药效物质的积累水平与原植物的遗传背景密切相关,因此可通过阐明有效成分生源途径,揭示药材品质物质内涵形成机制,调控有效成分生物合成,实现药材品质保障与提升.基于药效物质的中药材品质调控技术体系包括整合分析高通量检测手段所获得的系统生物学多重组学数据,解析有效成分生源合成的遗传机制,从中挖掘和鉴定具有品质识别功用的分子标记,将生源途径调控技术应用于中药材优异种质创制、种植过程精准管理和采收分拣质量识别的全程控制,实现有效成分高效合成和/或稳定积累,提升药材品质.
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石斛资源分子水平研究进展
石斛作为我国传统中药材,具有养阴生津、润肺明目、抗癌防老等显著功效,有着广泛的分布和悠久的应用历史.随着分子生物学技术的发展,石斛属药用资源的研究进展迅速,分子标记技术具有微量、快速、特异性强、准确可靠等特点,为石斛资源的研究提供了新的方法.通过选用RAPD,ISSR,AFLP,SRAP等不同分子标记的结合使用,对石斛不同种类之间的遗传多样性及亲缘关系进行分析,获得的遗传信息,可以为濒危的石斛资源的保护及开发利用提供理论依据.核基因、线粒体基因、叶绿体基因的结合应用,可以有效便捷地鉴定石斛正品,为进一步发展中药材特异性分子鉴定提供科学依据.同时不同基因片段序列的联合运用,可以作为石斛鉴别DNA条形码的分子标记,将为石斛类药材的鉴定提供新的思路和方法,有效提高石斛属植物的鉴定速度和效率.该文从分子鉴定,DNA序列,石斛功能基因等方面进行论述,为石斛属药用植物的进一步开发应用提供理论基础,同时也为石斛属植物的有效保护和可持续开发提供科学依据.
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本草基因组学在中药材新品种选育中的应用
针对中药材传统育种周期长、效率低等问题,本研究团队提出基于本草基因组学辅助中药材优质新品种选育的策略.通过分析中药材的基因组、转录组、简化基因组等,获得大量单核苷酸多态性(SNP),简单重复序列(SSR)等标记,结合中药材高产、优质、抗逆等目标性状,辅助中药材新品种的选育,如紫苏高产新品种“中研肥苏1号”、三七抗病新品种“苗乡抗七1号”等.然而中药材种类繁多,研究基础薄弱,应通过加强中药材组学研究为其新品种优质基因筛选提供标记,同时建立分子育种和传统选育的综合技术,实现分子标记与优良性状的连锁,加快优质中药材的选育进程,以保障中药材的安全有效.
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丹参新的EST-SSR分布规律及分子标记的建立
目的:建立新近较高覆盖度丹参KST-SSR分子标记,为不同产地来源丹参居群的遗传变异分析奠定基础.方法:对截止2010年11月Genbank下载的丹参EST序列结合HMPL实验室获取的共计1 408条EST序列,进行处理,获取高质量EST序列;经SSRIT软件搜索、分析EST序列中SSR位点的分布规律及类型;在此基础上,运用Websat软件设计EST-SSR引物,经对不同产地丹参样本DNA模板的PCR筛选和条件优化,建立新EST-SSR分子标记.结果:丹参的EST-SSR种类丰富、覆盖度较大,平均每5.8 kb就检出1条SSR.各种类型出现的频率相差很大,主要重复类型为二核苷酸、三核苷酸重复,分别占SSR总数的63.0%,35.5%,其次为四核苷酸和五核苷酸重复.在重复基元类型中,二核苷酸重复以CT/AG为主,三核苷酸重复以GAA/TCC为主.所优选的36对引物中有29对引物有扩增产物,有效率达80.5%,所选引物对不同产地丹参居群的分子标记出现了多态性.结论:建立的丹参新EST-SSR分子标记具有较高的覆盖度和多态性,可用于不同产地丹参居群的遗传变异分析.
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林麝分子遗传学研究进展
林麝是目前养殖规模较大、数量多的麝科动物之一,雄麝能分泌名贵中药材麝香,具有很高的药用价值和经济价值,由于栖息地的丧失及乱捕乱猎,该物种野生种群数量及分布范围已急剧减少.因此,深入了解林麝分子遗传学相关研究,能为林麝遗传资源保护和遗传选育工作奠定坚实的基础.该文综述了近年来有关林麝分子标记、遗传分类、人工繁育、泌香性能、疾病等方面的分子遗传学研究进展,以期为后续的分子遗传工作提供一定的理论依据.
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短葶山麦冬遗传多样性TRAP标记研究
目的:利用TRAP分子标记技术研究短葶山麦冬遗传多样性.方法:以果糖、光合或甾体皂苷代谢途径7个关键酶基因和1个凝集素基因作为靶标序列设计固定引物13条,筛选随机引物19条,利用其中11对多态性较高引物组合对50份短葶山麦冬种质进行分析.结果:共扩增了335条带,其中多态性带323条,占96.42%.引物平均多态信息量0.930.遗传分化系数0.610.UPGMA聚类表明相似系数0.52～0.98,,结论:短葶山麦冬遗传多样性水平较高,出现了一定程度的遗传分化.
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中药材二维分子标记法及其构建
该文针对目前中药鉴定学重“真伪”、轻“优劣”的不足,充分发挥一般分子标记和测序技术的“真伪”鉴别优势,结合功能基因在表征药材“优劣”方面的独特作用,提出了中药材“真伪、优劣”二维分子标记的构建策略.该文系统介绍了二维分子标记法的概念、原理及方法,总结了该方法所具备的技术优势,展望了其在同时解决中药“真伪”和“优劣”鉴定评价中的重要作用.二维分子标记法的提出,将从技术方法层面,进一步拓展中药鉴定学的科学内涵和外延,为真正实现中药的“真伪优劣”鉴定奠定方法学基础.
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猎枪瞄准目标锁定“十三五”助力“病毒猎人”——“十三五”国家重点研发计划“重要新发突发病原体发生与播散机制研究”项目正式启动
动物源性呼吸道病毒及媒介传播病毒所导致的新发突发传染病对公共卫生及社会经济危害重大.为了阐明这两类重要新发突发病原体起源、演化与传播扩散的生物学基础,及其鉴别的分子标记,由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所牵头、舒跃龙研究员作为项目首席科学家,凝集了10家我国新发突发传染病应对一线单位和微观组学、计算生物学和群体遗传学优势平台单位的“重要新发突发病原体发生与播散机制研究”项目获得了“十三五”国家重点研发计划专项资助.该项目将围绕“分子标记的筛选——分子标记的验证——分子标记指标体系的形成”三个环节,从病原体与宿主、个体与群体、基因型与生物表型三个方面,分子、细胞、动物和群体4个层面,筛选及验证同病原发生、传播、致病、耐药相关的病原及宿主关键分子标记,建立一套基于分子调频理论的新发突发传染病分子标记指标体系.
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结肠癌组织中SATB1的表达及其临床意义
目的 探讨SATBI异常表达与结肠癌发生、发展及预后的关系.方法 分别用RT-PCR和Western blot 法检测SATB1在25例结肠癌活检组织及相应癌旁正常组织中mRNA和蛋白表达水平；采用免疫组化检测58例结肠癌石蜡组织切片中SATB1的表达,分析其与结肠癌临床病理因素的关系及预后意义.结果 SATB1 mRNA和蛋白在92％( 23/25)结肠癌活检组织中的表达水平高于其癌旁正常组织；58例结肠癌石蜡组织中,SATB1蛋白强阳性率为46.6％(27/58).统计学分析结果显示,SATB1强阳性与结肠癌Dukes分期和远处转移密切相关,而与性别、年龄、病理分级、肿瘤大小、淋巴结转移无显著相关性.结论 SATB1在结肠癌中高表达,其表达水平与肿瘤进展相关,可作为预测结肠癌进展和转移的分子标记物.
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HPV检测及分子标记在宫颈上皮内瘤变和宫颈癌中的应用
宫颈癌是女性好发的第二位恶性肿瘤.据统计,美国每年新发宫颈癌病例9 000余例,3 000余例死于该疾病;另外,每年诊断的高级别上皮内瘤变(CIN2/3)病例约为33万,低级别上皮内瘤变(CIN1)病例为140万.
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4种常见储藏物螨类ITS2基因片段序列以及系统发育分析
目的 以核糖体第二核糖体内部转录间隔区 (ITS2) 作为分子标记, 对粉尘螨、屋尘螨、腐食酪螨和热带无爪螨进行系统发育树分析.方法 PCR扩增种常见储藏物螨种的ITS2基因并测序, 进行序列比对分析;从GenBank下载8条螨虫的ITS2序列, 用MEGA 2.1软件构建分子系统树, 进行系统进化分析.结果 分析4种螨的ITS2序列长度为316～487bp, 种内基因遗传距离为0.003 823～0.052 599, 种间遗传距离为0.187 440～0.534 699.以长食酪螨 (Tyrophagus longior) 为外类群构建系统发育树, 进行系统发育分析, 屋尘螨与粉尘螨亲缘关系较近, 腐食酪螨及热带无爪螨分别位于发育树的基部和中部, 系统发育树结果与根据形态分类对应.结论 依据ITS2基因片段序列及系统发育树可对常见螨种鉴定, ITS2基因片段可作为螨种鉴定的分子标记.
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恶性疟原虫与耐药性相关分子遗传标记的研究进展
长期以来抗疟药在全球的广泛使用导致恶性疟原虫已普遍对氯喹等传统药物产生耐受性,并对青蒿素类药物造成潜在威胁.随着在基因水平上对疟疾抗药性的深入研究,分子遗传标记已广泛应用于恶性疟耐药性和控制疾病的监测.本文就常见抗疟药的主要作用机制、相关分子标记及其多态性特征的研究进展作一综述.
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恶性疟原虫对双氢青蒿素-哌喹敏感性研究进展
疟疾严重威胁人类的生命健康,双氢青蒿素-哌喹(科泰复)是世界卫生组织推荐的治疗无并发症恶性疟疾的首选药物,在减少其相关的发病率和死亡率方面发挥了不可或缺的作用.但随着其广泛使用后,已有研究表明在大湄公河次区域(GMS)恶性疟原虫对科泰复产生了抗药性.这严重威胁着全球疟疾防治和消除计划的实施.本文将针对恶性疟原虫对科泰复的抗药性研究以及抗药性的检测方法、抗性相关的分子标记做一综述.
