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061 骨质疏松症的遗传学研究进展
骨质疏松症是由多个微效基因及多种环境因素共同作用所致的一种全身性骨骼疾病,是我国重要的公共卫生问题之一.骨质疏松症的遗传学研究已成为骨生物学研究为活跃的研究领域之一.本文就骨质疏松症的连锁研究、候选基因关联研究及全基因组关联研究的进展进行简要综述,并对研究中存在的问题及今后的发展方向进行了简要的总结.
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慢性苯中毒易感基因遗传多态性的研究进展
苯进入人体后,在毒物代谢酶的作用下代谢形成与苯毒性密切相关的环氧化物、酚类和醌类化合物等,通过对DNA的直接氧化作用或者与之形成加合物,造成DNA的损伤.
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食管癌危险性与易感基因多态性研究
目的淮安是我国食管癌高发区之一.肿瘤易感基因的遗传多态性是影响个体肿瘤易感性的重要因素,对肿瘤的一级预防以降低肿瘤的发生率和死亡率具有重要意义.因此,在食管癌病因学研究中,探讨与其相关的多基因遗传特征十分必要.本研究对淮安地区人群CYP1A1、CYP2E1、NQO1、GSTM1、GSTT1、MTHFR、XPD和XRCC1基因多态性进行了研究,从代谢酶和DNA修复酶两方面探讨该地区食管癌高发人群易感基因特征.
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儿童失神癫痫易感基因的研究进展
癫痫为常见神经系统疾病之一.据世界卫生组织(WHO)数据统计,世界癫痫患病率为4‰～ 10％‰.研究表明,半数以上儿童癫痫的病因与遗传相关.只与遗传相关而无其他潜在病因的癫痫及癫痫综合征称之为遗传性癫痫,遗传性癫痫的主要类型是遗传性全面性癫痫,而儿童失神癫痫(Childhood absence epilepsy,CAE)属于遗传性全面性癫痫,约占儿童期起病癫痫的5％ ～15％.目前国内外虽已报道了一系列与癫痫相关的易感基因,并设计基因芯片作为基因筛查手段,但癫痫的发病原因及致病机制尚不明确.部分CAE患儿成年后出现肌阵挛发作、强直阵挛性发作等其他全面性发作类型,提示遗传性全面性癫痫可能有共同的易感基因.CAE具有典型的临床表型和脑电图特征,易于确保研究对象的一致性,对癫痫易感基因方面的研究有很大优势.总结CAE易感基因相关研究进展,对于阐明其发病机制、进一步了解CAE病因与发病机制,以及对遗传性癫痫的诊断、治疗、遗传咨询都具有重要意义.
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脑源性神经营养因子基因单核苷酸多态性位点G196A、C270T与癫痫的相关性研究
目的 采用Meta分析的方法探讨脑源性神经营养因子(Brain-derived neurotrophic factor,BDNF)基因单核苷酸多态性位点G196A、C270T与癫痫的相关性.方法 检索美国国立医学图书馆PubMed数据库、荷兰医学文摘EMbase数据库、Cochrane临床试验数据库、中国知网CNKI和万方数据库,查找从建库至2017年9月有关BDNF基因单核苷酸多态性位点G196A、C270T与癫痫的病例对照研究.由两名研究人员独立筛选文献、提取资料和评价质量后,采用RevMan 5.2软件进行Meta分析.结果 第一,BDNF基因G196A位点与癫痫相关性Meta分析,纳入9个病例对照研究,共1 841例癫痫患者,6 467名健康对照者.对纳入的所有研究进行Meta分析结果显示:G等位基因可增加癫痫的患病风险[OR=1.13,95％CI(1.06,1.21),P=0.0 001].GG+GA/AA、GG/GA+AA、GG/AA基因型模式在病例组和对照组的分布均具有统计学差异(P均＞0.05).按种族(亚洲、欧美)分亚组进行Meta分析,结果显示G等位基因增加亚洲癫痫的患病风险[OR=1.13,95％CI(1.05,1.20),P=0.0 004],但不增加欧美癫痫的患病风险[OR=1.29,95％CI (0.94,1.78),P=0.12].BDNF基因G196A位点与颞叶癫痫Meta分析,结果显示G等位基因增加颞叶癫痈的患病风险[OR=1.18,95％CI (1.04,1.34),P=0.008].第二,BDNF基因C270T位点与癫痫相关性的Meta分析:纳入4个病例对照研究,594例癫痫患者,738名对照.分析结果显示C270T位点不同等位基因、不同基因型模式(TT+ TC/CC、TT/TC+CC TT/CC)与癫痫没有相关性.结论 BDNF基因G196A位点与亚洲癫痫具有相关性,且G等位基因是风险等位基因.BDNF基因的C270T位点与癫痫无相关性.
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2型糖尿病易感基因研究进展
2型糖尿病(T2DM)是一个多基因遗传性疾病,每一个基因的变异在糖尿病的发生发展中都起着部分或累积的作用,而环境因素也在其中起着加速或延缓的作用.随着T2DM,有助于深化对T2DM发病机理的认识,为T2DM的治疗提供新的思路和策略.本文总结了近年来T2DM易感基因的研究进展.
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全基因组扫描定位易感基因的策略和方法
基因在决定个体表型方面起着决定性作用,通过赋予个体对疾病的易感性或抵抗力,以及影响机体与环境因素的相互作用,基因对疾病的发生起着间接或直接作用.因此,人们希望通过识别疾病相关基因,以终实现疾病的基因诊断和基因防治[1].
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2型糖尿病易感基因研究中混杂的生物信息学对策
复杂性疾病(complex disease)是对人类健康威胁大、给家庭和社会造成严重负担、需要重点防治的疾病.复杂性状疾病即多基因病,是指由多个基因位点共同参与,且和环境因素相互作用决定表型的遗传病[1].复杂性状疾病病因的识别是一个迫切需要解决的问题,也一直是国际学术界面对的难题.其复杂性和难度主要表现在疾病遗传模式未知、具有遗传异质性和表型异质性、具有不完全外显或不规则外显的现象以及有环境因素影响等方面[2].
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接尘工人对含矽粉尘的基因易感性研究
目的 探讨人类白细胞抗原A位点、B位点、DRB1位点等位基因与矽肺易感性的关系.方法 应用聚合酶链式反应-序列特异性引物(PCR-SSP)的原理,利用DNA对HLA-Ⅰ类、Ⅱ类抗原的等位基因进行分型检测,分析45名矽肺病人和50名正常人群对照组基因型及分布频率等差异.结果 矽肺组与对照组A、B、DRB1位点相同基因型分布频率的卡方检验,差异均无统计学意义.但矽肺组与对照组A、B、DRB1位点均有独有的某基因型.如矽肺组A位点32型4例(4.4%),36型1例;B位点40型3例(3.3%),55型6例(6.7%),8型、12型、15型、56型各1例(1.1%);DRB1位点3型4例(4.4%).正常对照组A位点69型1例,B位点37型1例,38型5例(5%),71型5例(5%);DRB1位点17型3例(3%).经卡方检验,各工龄组与矽肺期别之间差异无统计学意义.结论 接尘工龄长短与矽肺期别无关(P＞0.05).矽肺组B位点55与对照组相比差异有统计学意义,提示此位点可能参与矽肺的发病.而对照组中,B位点38、B位点71出现频率较高,但无统计学意义.各工龄组与矽肺期别之间差异无统计学意义.
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染色体22q基因突变与精神分裂症关系的研究进展
近几年来在精神分裂症(SZ)的遗传学研究方面有了新的进展.SZ遗传度为60%～80%.有证据表明SZ的主要病因涉及几个易感遗传基因的交互作用;明显的证据显示几个染色体区含有SZ的易感基因.独立而可重复的研究报告的阳性候选区域集中于染色体22q、6p、8p、2、1q、13q和10p等,研究发现的阳性候选基因包括5-羟色胺(5-HT2A)受体、多巴胺受体(DRD)、神经营养蛋白(NT-3)等[1].22q11缺失综合征(22qDS)有精神障碍的高度危险性,本文主要讨论在22q11区域及其附近的一些基因在该综合征患者发生精神异常的潜在作用.
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山东省汉族人群慢性肾小球肾炎与人白细胞抗原相关性研究
目的 探讨慢性肾小球肾炎(CGN)与人白细胞抗原(HLA)的相关性.方法 以山东省3所省级医院近十年汉族CGN尿毒症患者1073例为病例组,选择中国造血干细胞捐献者资料库山东省分库汉族人7418名无关汉族健康志愿捐献者为对照组,对两组的HLA-Ⅰ、Ⅱ类A、B、DRB1三个位点的基因多态性进行分析比较,探寻上述基因多态性与CGN的关系;并随访了部分携带易感基因的患者,评价其预后.结果 病例组中HLA-A23、A25、B15、B40、B53、DRB1 * 18基因频率显著高于对照组,这些基因可能是CGN尿毒症的易感基因,且随访发现携带该类基因的患者预后较差.病例组中A23-B44-DRB1 * 18、A25-B15-DRB1 * 07、A3-B70-DRB1 * 11、A68-B13-DRB1 * 04、A11-B10-DRB1 * 12五个单倍型基因频率显著高于对照组,同时检出HLA-A20、A22、A35、A36、A38、B21、B73、B78等8种低频率基因在对照组中未见表达;病例组中HLA-A32、A33、B50、B58、B60、B71、DRB1 * 16基因频率显著低于正常对照,这些基因可能是慢性肾小球肾炎尿毒症的保护基因.结论 山东省汉族人群CGN与HLA具有较强关联性,且携带可能易感基因的患者肾移植预后较差.
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六号染色体短臂MHC区DRB3、DRB1基因多态性与精神分裂症症状的关系探讨
目的探讨六号染色体短臂MHC区DRB3、DRB1基因多态性与精神分裂症症状的相关性.方法采用聚合酶链反应(PCR)和限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)方法检测两个基因位点上的单核苷酸多态性(SNPs),并对116例精神分裂症患者家系进行连锁不平衡分析.结果DRB1的SNP(rs707954: G/T碱基互换)等位基因与关系妄想症状呈显著相关(χ2=5.484,df=1,P=0.019),GG、GT、TT三种基因型频率在关系妄想症状中呈显著相关(χ2=6.771,df=2,P=0.034).rs707954的三种基因型频率与情感淡漠症状呈显著相关(χ2=12.110,df=4,P=0.017). 结论 DRB1位点等位基因与关系妄想和情感淡漠症状高度相关,DRB1基因型与关系妄想症状高度相关.
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人类染色体22q11精神分裂症易感基因的筛查研究
目的在人类22q11区域内筛查与精神分裂症相关的易感基因.方法由中国汉族精神分裂症患者和他们的健康父母组成的100个核心家系作为研究对象.采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法对22q11区域内分别位于腭心面综合征中缺失的犰狳重复基因(ARVCF)上的rs165655(A/G碱基改变)、rs165815(C/T碱基改变)和LOC128979(EST序列)位点上的rs756656(A/C碱基改变)3个单核苷酸多态性(SNP)进行检测.用连锁不平衡方法分析基因型数据,连锁不平衡方法包括单体型相对风险分析(HRR),传递不平衡检验(TDT)和单倍型传递分析.结果 3个SNP基因型频率分布都符合Hardy-Weinberg平衡;HRR和TDT分析结果都显示rs165815与精神分裂症有关联(P＜0.05),而rs165655和rs756656与精神分裂症无关联;单倍型传递分析结果显示,父母传递给患病子女的rs165655-rs165815单倍体和rs756656-rs165655-rs165815单倍体的频率偏离50%,差异具有统计学意义(P＜0.01).结论对于中国汉族精神分裂症患者而言,ARVCF基因本身或其附近的基因可能与精神分裂症的易感性有关联.
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结核病易感基因研究进展
结核病研究虽然长达几个世纪之久,但到目前为止,仍然是由单一病原菌导致死亡人数多的疾病,并且近年来呈现死灰复燃之势,为此WHO于1993年宣布结核病为新发的全球公共卫生事件.近年来,发达国家通过研制有效的抗菌药和改善社会经济条件以降低结核病发病率和死亡率,但是结核病仍为发展中国家的主要健康威胁之一.根据2009年WHO估计,2007年全球结核病新发病例为927万,其中我国约为130万[1].流行病学调查显示,不到10%的结核分枝杆菌感染者会发展成为活动性结核病,而大多数的感染者却能控制或者清除结核分枝杆菌[2].感染结核分枝杆菌能否发展成为临床症状的结核病与机体免疫状态相关,而机体的免疫状态很大程度上是由宿主基因决定的,一系列的研究已经证明宿主的遗传因素在结核病发展过程中发挥着重要的作用[3-6].
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精神分裂症多基因遗传位点的筛检
精神分裂症(精分症)是人类常见的精神性疾患之一.在中国,精分症的终身患病率高达0.7%左右,不仅给家庭和社会带来沉重的经济负担,而且还严重威胁社会的安全与稳定.可见,确定其病因从而达到防治是医学界乃至整个社会需迫切解决的问题.遗传流行病学研究证实,精分症与遗传因素有密切关系,但不符合经典的孟德尔单基因遗传规律,属于多基因遗传病或人类复杂疾病.人类基因组系统扫描发现,除19号、21号和Y染色体以外,其余的染色体上都可能含有精分症易感基因.但是,能获得较好重复性的染色体区域至少有6个,包括1q21-22、5q22-23、6p24-21、8p22-21、13q14-33和22q11-12[1-7].本研究工作以中国汉族精分症患者和健康父母双亲组成的核心家系为研究对象,拟在22号染色体长臂一区一带(22q11)和6号染色体短臂二区一带(6p21)染色体区域构建单核苷酸多态性(SNPs)连锁不平衡图,以筛检精分症易感基因和决定疾病易感性的SNPs.此项研究工作是后基因组时期功能基因组学研究的前沿课题,将有助于阐明精分症的分子遗传学机制,并具有潜在的经济与社会效益.
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中国食管癌分子流行病学研究
食管癌是我国常见的癌症之一,目前其临床治疗效果还相当有限,5年生存率不到15%.我国研究者对食管癌进行了长期的研究并取得显著成绩,提出环境因素是食管癌病因的假说.然而,同样暴露于相似环境因素的人群,却只有少数人发生食管癌,提示个人的遗传因素对食管癌发生可能有重要作用.目前普遍认为食管癌是多因素作用,多基因参与,多阶段发展的疾病,然而其发生和发展的确切机制仍未阐明.已有许多研究探讨了食管癌中癌基因和抑癌基因的改变[1],有人用cDNA芯片分析食管癌变不同阶段的基因表达谱[2],这些研究有助于认识食管癌的生物学性质以及发生和发展过程中的分子生物学的改变.近有人对我国北方食管癌家族聚集性进行研究,认为存在高度外显的易感基因[3],另一研究也提示林县食管癌符合孟德尔常染色体隐性遗传[4].然而,至今尚无直接证据证明确实存在高度外显的食管癌易感基因.我们设想,即使存在这种高度特异的易感基因,也可能只局限于一些家族性食管癌,正如BRCA1/2与乳腺癌一样;而大多数散发性食管癌更可能是一系列多态性相关基因之间以及这些基因与环境之间相互作用引起的.
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抗结核治疗队列人群药物性肝损害的感基因多态性研究
目的 探索药物代谢、转运和免疫反应基因多态性与中国人群抗结核药致肝损害的关联.方法 利用“中国结核病防治规划抗结核病药品不良反应研究”的人群资料和样本,构建1∶4巢式病例对照研究,选择与抗结核药物所致肝损害相关的三相代谢基因以及相关免疫基因,采用TaqMan分型技术检测基因单核苷酸多态性(SNP),结合Lasso回归和多因素条件logistic回归筛选易感基因.结果 共检测33个基因的75个SNP位点,Lasso回归和logistic回归的合并分析显示,SLCO1B1 rs4149014、HSPAIL rs2227956、STAT3 rs1053023和IL-6 rs2066992基因多态性与抗结核药致肝损害的关联有统计学意义(P＜0.05).结论 SLCOIB1、HSPAlL、STAT3和IL-6基因可能是抗结核治疗人群发生药物性肝损害的易感基因.
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脑梗死患者载脂蛋白E基因单核苷酸多态性分析
以动脉粥样硬化为病理基础的脑梗死是常见的脑血管疾病,其发病机制与多种因素有关,其中遗传因素的作用不可忽视.位于19号染色体长臂的载脂蛋白E(apoE)基因参与体内的脂质代谢,是动脉粥样硬化的易感基因之一,其编码产物apoE在神经细胞突触形成及修复过程中起关键作用.apoE基因多态性与阿尔茨海默病的关系已被证实,但与脑梗死的关系尚有争议.
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胃癌相关易感基因的生物信息学分析
目的:归纳分析胃癌易感基因的相关文献,并进行生物信息学分析,为进一步的研究提供参考依据.方法:检索PubMed、Embase、中国知网数据库、万方数据库2006年1月1日至2015年12月31日发表的文献,摘录胃癌易感基因并进行GO分类、KEGG通路分析、在线STRING 9.05软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图、Cytoscape2.8.2软件可视化分析.结果:共检索有效文献405篇,摘录胃癌相关易感基因188个,不同分级的GO分类201种, KEGG通路13种,这些基因主要与细胞损伤修复、免疫反应、细胞周期调节、炎性反应、DNA损伤修复、凋亡和抗原递呈等有关.KEGG通路主要是参与细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞凋亡、Toll样受体信号通路、谷胱甘肽代谢、MAPK信号转导通路、脂肪酸代谢等.其中178个可翻译成蛋白的蛋白与蛋白相互作用网络图,提示这些基因的表达产物大部分存在密切的相互关系.进一步可视化及量化,筛选出TP53、VEGF-α、SOD2、TNF、 STAT3、BRCA1、PTGS2、PTEN、TGF-β1 9个基因蛋白网络节点度数超过30.结论:TP53、VEGF-α、SOD2、 TNF、STAT3、BRCA1、PTGS2、PTEN、TGF-β1 9个基因可能为胃癌易感关键基因.
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膀胱癌相关易感基因的生物信息分析
目的:归纳分析膀胱癌易感基因的相关文献,并进行生物信息学分析,为进一步的研究提供参考依据.方法:检索Pubmed、中国知网、万方三大数据库2006年1月1日-2015年12月31日发表的文献,摘录膀胱癌易感基因并进行生物信息学分析.结果:共检索有效文献405篇,摘录膀胱癌相关易感基因188个,不同分级的基因本体论(GO)分类201种,京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路7种.GO分类这些基因主要与细胞损伤修复、免疫反应、细胞周期调节、炎性反应、DNA损伤修复、凋亡和抗原递呈等有关.KEGG通路主要是参与细胞受体相互作用、细胞凋亡、信号转导通路、氨基酸和脂肪酸代谢等.在线STRING软件构建其中166个可翻译成蛋白的蛋白与蛋白相互作用网络图,提示这些基因的表达产物大部分存在密切的相互关系.进一步运用Cytoscape软件将STRING软件所构建的蛋白网络图可视化及量化,筛选出TP53、MTHFR、IL6、CDKN2A、GSTP1共5个基因.结论:通过对膀胱癌易感基因的生物分析研究,TP53、MTHFR、IL6、CDKN2A、GSTP1共5个基因可能为膀胱癌易感关键基因.
