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2008年深圳市轮状病毒感染所致腹泻的调查分析
目的:了解深圳市感染性病毒性腹泻中轮状病毒的感染情况,为制定预防轮状病毒感染的策略提供依据.方法:采用实时荧光RT-PCR,对2008年深圳市606例疑似腹泻患者粪便标本进行轮状病毒的检测.结果:轮状病毒感染率为15.18%(92/606),其中男性感染率为16.41%(54/329),女性感染率为13.72%(38/277).0～2岁年龄组轮状病毒感染率为28.21%(22/78),3～4岁年龄组感染率为0%(0/5),5～14岁年龄组感染率为18.75%(3/16),15～19岁年龄组感染率为5.71%(2/35),20岁以上年龄组感染率为13.77%(65/472).结论:轮状病毒感染全年均可发生,冬季尤有较高感染率.基本上各年龄组男女人群都可感染,其中0～2岁婴幼儿感染率高.应加强对轮状病毒引起的感染监测,尤其是对婴幼儿感染的预防控制.
关键词： 感染性病毒性腹泻 轮状病毒 实时荧光RT-PCR -
一起聚集性流感样病例的病原学分析
2008年4月24日下午5时,湖南省永州市宁远县疾病预防控制中心接到本县某小学电话报告,该校有10余名学生出现发热、咳嗽、头痛、咽喉肿痛、全身乏力伴流涕等症状.为了查明病因,及时控制疫情,我中心工作人员立即赶到学校进行调查采样.在流行病学调查的同时,共采集10例流感样病例咽拭子在24 h内送永州市疾病预防控制中心进行检测.我们分别用针对H1N1、H3N2及B型流感病毒的三对引物对10份标本进行了实时荧光RT-PCR检测；并用MDCK细胞培养法进行了病毒的分离培养和鉴定,现将病原学检测结果报告如下.
关键词： 流感样病例 流感病毒 实时荧光RT-PCR -
实时荧光RT-PCR及RT-PCR快速检测肠道病毒71型和柯萨奇A16病毒
肠道病毒71型(Enterovirus 71,简称EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,简称CA16)是引起手足口病的两种主要的病原体,常相伴造成手足口病的暴发流行,每次流行中两种病毒中所占的比例有所不同[1].EV71感染引起HFMD常有严重的神经系统并发症发生,CA16感染引起自限性的手足口病,极少发生严重并发症和死亡[2～6].2008年安徽、广东(包括深圳市)、浙江等28个省市出现手足口病暴发流行,因此,亟须一种特异性强,灵敏度高的方法对这两种病毒进行快速区分检测.
关键词： 实时荧光RT-PCR 肠道病毒71型 柯萨奇A16病毒 -
2011年-2012年广安市手足口病病原学监测结果分析
目的 了解广安市2011年-2012年手足口病的病原学特征,为手足口病的防控提供病原学依据.方法 用实时荧光RT-PCR方法对广安市各区市县采集的243例手足口病临床诊断病例进行肠道病毒核酸检测和型别鉴定.结果 243例手足口病临床诊断病例中,检测到肠道病毒核酸阳性164例,阳性率为67.45％,其中EV71阳性105例,占阳性病例的64.02％,CoxA16阳性33例,占阳性病例的20.12％,未分型26例,占阳性病例的15.85％,5例重症病例(死亡1例)均为EV71阳性;全年流行呈现两个高峰,第一个高峰为4月-7月,第二个高峰为10月-12月,发病主要集中在4岁以下儿童,占93.90％,人群以散居及托幼儿童为主,不同性别儿童阳性率差别无统计学意义(x2 =2.34,P＞0.05).结论 2011年-2012年引起广安市手足口病流行的病原体主要是EV71,其次是CoxA16和其它未分型肠道病毒.EV71是引起重症和死亡病例的主要毒株.4岁以下散居及托幼儿童为本地手足口病的高危人群.
关键词： 手足口病 病原学 实时荧光RT-PCR EV71 CoxA16 -
重庆三峡库区2011年手足口病监测结果分析
目的:对重庆三峡库区2011年手足口病监测病例进行病原学及流行特征分析,为该病的防控提供科学依据.方法:采用real - time RT - PCR技术检测肠道病毒通用型、肠道病毒71型及柯萨奇病毒A组16型.结果:972份标本检出肠道病毒通用型阳性619份,咽拭子、肛拭子、疱疹液检出率分别为60.25％、72.99％、72.53％；同一病例咽拭、肛拭子检出率差别无统计学意义(x2=0.4444,P=0.5050).手足口病患病人群中各年龄组之间,男、女患病率差别无统计学意义；发病季节呈现两个高峰,第1个高峰为4月-6月,第2个高峰为11月-12月.结论:2011年引起重庆三峡库区手足口病流行的主要病原体为EV71和CoxA16病毒.手足口病病原学核酸检测阳性率与不同类型标本无明显相关性,与标本采集质量、数量成正相关.
关键词： 手足口病 EV71 CoxA16 实时荧光RT-PCR -
2008年-2009年鞍山地区手足口病患儿粪便样本中肠道病毒的检测结果分析
目的:通过实时荧光RT-PCR法检测2008年-2009年手足口病患儿粪便样本,了解鞍山地区手足口病病原特征,为手足口病防治工作提供科学依据.方法:分别于2008年6月-9月收集657份手足口病患儿粪便样本及2009年5月-9月收集274份手足口病患儿粪便样本进行检测.结果:2008年EV71阳性31份,CA 16阳性58份,2009年EV71阳性75份,CA16阳性55份.结论:鞍山地区手足口病病原体以EV71和CA16为主,2008年以CA16为主要病原,2009年以EV71为主要病原.重症手足口病患儿病原均为EV71.
关键词： 鞍山地区 手足口病 肠道病毒 实时荧光RT-PCR -
北京市西城区2009年手足口病病原学监测结果分析
目的:了解2009年北京市西城区手足口病的病原学特征,为手足口病的防控提供病原学依据.方法:用实时荧光RT-PCR方法,对哨点医院定期采集的手足口病临床诊断病例标本进行肠道病毒核酸检测和型别鉴定.结果:2009年4月-2009年12月共收集咽拭子标本280份,84.29%的病例年龄在5岁以下.实时荧光RT-PCR检测结果显示,肠道病毒核酸阳性207例,阳性率为73.93%.EV71、CoxA16及其他型别肠道病毒核酸阳性数分别为61例(29.47%)、114例(55.07%)和33例(15.94%).男性病例肠道病毒阳性检出率高于女性(X2=8.728,P=0.0031).4月-12月的病原构成呈动态变化特征.结论:2009年北京市西城区手足口病病原以CoxA16和EV71为主,CoxA16为优势流行型别.
关键词： 手足口病 EV71 CoxA16 实时荧光RT-PCR -
广州白云国际机场首例输入性甲型H1N1流感病例的实验室检测
目的:检测广州白云国际机场口岸输入性甲型H1N1流感病例.方法:采集机场口岸发热患者的咽拭子样本,使用美国CDC公布和实验室自研的荧光RT-PCR以及RT-PCR方法进行检测.结果:InfA、SWInfA、SWH1以及MP、NP、NA和HA的荧光RT-PCR结果均为阳性.咽拭子样本的RT-PCR扩增显示,7对引物均有预期大小的扩增条带产生.结论:该病例经实验室检测,为广州机场口岸首例输入性甲型H1N1流感病例.
关键词： 甲型H1N1 流感病毒 实时荧光RT-PCR RT-PCR -
实时荧光RT-PCR检测新型布尼亚病毒核酸方法的研究与应用
目的 研究实时荧光定量反转录-聚合酶链(Real-timeRT-PCR)检测新型布尼亚病毒的方法,用于新布尼亚病毒的核酸检测,为发热伴血小板减少综合征(SFTS)的早期诊断提供科学依据.方法 以新布尼亚病毒L基因为靶基因设计引物以及TaqMan探针,建立Real-timeRT-PCR方法,并对岱山县72份临床疑似病人血清、血浆、30份正常人群血清进行了检测鉴定,并验证了方法的特异性、敏感性和重复性.结果 建立的Real-time RT-PCR具有良好的特异性和敏感性,CV＜ 1.0％.在102份检测标本中,72份临床疑似病人血清、血浆,阳性48份,30份正常人群血清阴性.结论 本研究建立的Real-time RT-PCR方法具有较高的特异性、敏感性和重复性,可用于新布尼亚病毒核酸的快速检测、在发热伴血小板减少综合征的早期诊断上具有重要意义.
关键词： 实时荧光RT-PCR 新型布尼亚病毒 核酸检测 -
金山区诺如病毒聚集性胃肠炎疫情病原学特征分析
目的:分析金山区四起急性胃肠炎聚集性疫情的诺如病毒基因型别特征.方法:收集四起胃肠炎疫情的流行学资料,收集现症病例采集肛拭子或粪便样本,采用实时荧光定量RT-PCR进行诺如病毒核酸检测,应用常规RT-PCR扩增部分NoV阳性株衣壳蛋白的N/S区,PCR产物纯化回收、测序,利用Clustal X、MEGA4.1软件分析其基因序列.结果:四起诺如病毒胃肠炎聚集性疫情分布在护理院、养老院、幼儿园、农村社区,冬、春季节高发；四起疫情共检测样本52份,诺如病毒阳性25份,均属GⅡ.4型NoV株,其与Hu/GII-4/Beijing/54665/2007/CHN、Hu/NSW696T/2006/AUS的同源性高达99-I.结论:诺如病毒是引起我区急性胃肠炎聚集性疫情的主要病原体,变异株GⅡ.4-2006b型诺如病毒是流行优势株.
关键词： 诺如病毒 急性胃肠炎 实时荧光RT-PCR -
新布尼亚病毒核酸检测实时荧光RT-PCR方法的评价
目的:对发热伴血小板减少综合征新布尼亚病毒核酸检测方法进行评价,为今后检测试剂的选择提供帮助与参考.方法:用实时荧光RT-PCR和RT-PCR方法对58例信阳市发热伴血小板减少综合征病例和河南省疾病预防控制中心发热待查门诊100例病例进行检测,对比试验结果.结果:58例标本中,实时荧光RT-PCR方法检出阳性38例,阴性20例,阳性率65.52％; RT-PCR方法检出阳性37例,阴性21例,阳性率63.79％; 100例非发热伴血小板减少综合征的发热待查病例荧光RT-PCR方法实验结果均为阴性,与临床检测结果一致.相对于RT-PCR方法,实时荧光RT-PCR检测方法的灵敏度为97.36％,特异度为100％.结论:实时荧光RT-PCR方法,具有较好的灵敏度和特异性,在发热伴血小板减少综合征早期检测和临床诊断治疗上具有重要意义.
关键词： 新布尼亚病毒 实时荧光RT-PCR RT-PCR -
实时荧光PCR技术在肠道病毒71型检测中的应用
目的:探讨实时荧光RT-PCR和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测肠道病毒EV71病毒核酸的应用.方法:采集2008年5月深圳市龙岗区幼儿疑似肠道病毒感染者粪便和疱疹液标本,分别用实时荧光RT-PCR方法和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法对肠道病毒EV71病毒进行检测.结果:在对16例已收集到的患者的粪便、疱疹液标本进行检测时,用实时荧光RT-PCR方法检测到8份阳性样本,阳性率为50.0%(8/16),而用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测到5份阳性样本,阳性率为31.3%(5/16).结论:实时荧光RT-PCR技术具有特异性强,灵敏度高的特点,且能在采样后数小时内检测到病毒的RNA,从而达到快速诊断的目的,因此该方法对肠道病毒的流行病学调查及治疗起重要作用.
关键词： 肠道病毒EV71 实时荧光RT-PCR RT-PCR -
诺如病毒快速检测方法的建立及其在国境卫生检疫中的应用
目的:建立快速、特异的诺如病毒实时荧光RT-PCR与常规RT-PCR相结合检测方法,对人感染诺如病毒进行快速检测.方法:根据国外新流行的诺如病毒核酸序列,设计并合成诺如病毒基因扩增引物及荧光标记探针,摸索佳反应条件,制定出快速、灵敏检测诺如病毒核酸的实时荧光RT-PCR检测方法及常规RT-PCR检测方法.结果:实验证明,本方法将实时荧光RT-PCR与常规RT-PCR检测方法相结合,能在5 h内快速确认诺如病毒,检测灵敏度达到102拷贝/反应,具有快速、灵敏的特点,且具有较高的特异性和重复性.结论:本实验室利用本方法,首次在广州某国境口岸从外籍发热船员样本中检出5例输入性GGⅡ群诺如病毒.该方法对防止诺如病毒传人我国,保障我国国境卫生安全具有重要意义.
关键词： 诺如病毒 实时荧光RT-PCR -
应用实时荧光RT-PCR对象山地区婴幼儿副流感病毒感染的监测分析
目的 应用实时荧光RT-PCR方法检测副流感病毒1型～3型,初步探讨象山地区儿童感染副流感病毒的状况.方法 以副流感病毒的HN基因序列为参考,综合分析GenBank上的HN基因序列,使用引物和探针设计软件Primer Express设计特异性引物和TaqMan荧光探针,建立实时荧光RT-PCR方法,用于分别检测副流感病毒1型～3型,并进行灵敏度和特异度检测.结果 实时荧光RT-PCR方法具有较好的特异度和灵敏度,与其他常见呼吸道病毒无交叉反应.1 172例标本中实时荧光RT-PCR方法检测阳性为85例(7.25％),HPIV 3型阳性73例(6.23％);检测结果显示2010年第四季度,HPIV感染以HPIV3型为主,HPIV 1型和HPIV 2型散发存在.应用实时荧光RT-PCR方法还检测到1株HPIV 1型和HPIV3型的混合感染.结论 本研究建立的实时荧光RT-PCR方法具有简便快捷、特异、敏感的特点,适用于临床诊断.HPIV在儿童感染中除了单一型感染外,还存在混合型感染.
关键词： 副流感病毒 实时荧光RT-PCR 呼吸道感染 儿童 -
2012年沈阳地区手足口病病原检测结果分析
目的 掌握2012年沈阳地区手足口病病原体特征,为手足口病的预防和控制提供科学的依据.方法 采用实时荧光RT-PCR法对2012年采集的566份临床诊断手足口病患者的粪便标本,同时检测肠道病毒通用型、EV71型和CoxA16型特异性核酸.结果 566份粪便标本中,肠道病毒通用核酸阳性509份,阳性率89.93％,其中CoxA16阳性292份,占57.37％,EV71阳性129份,占25.34％,CoxA16和EV71双重感染12份,占2.36％,其他未分型肠道病毒76份,占14.93％.33份重症患者标本,32份为阳性,其中EV71阳性25份,占78.12％,CoxA16阳性5份,占15.63％,其他未分型肠道病毒2份,占6.25％.手足口病发病5月-7月占87.23％,1岁～4岁儿童占79.76％,男女比例为1.74∶1.结论 2012年沈阳地区手足口病病原以CoxA16为主,重症病例以EV71为主,5月-7月为发病高峰,1岁～4岁儿童是感染的主要人群.
关键词： 手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组16型 实时荧光RT-PCR -
2012年-2016年衢州市流感病原学监测分析及评价
目的 了解2012年-2016年衢州市流感流行特征,并对监测结果进行评价,为本市流感防控工作提供科学依据.方法 对本市流感监测哨点医院采集的流感样病例标本,采用实时荧光RT-PCR进行流感核酸检测,用MDCK细胞进行病毒分离.结果 2012年-2016 年共检测流感样病例标本4 436 份,检出流感病毒阳性567 份,总阳性率为12.78％,各监测年度中流感流行优势株均为A(H3N2)型,其他型别交替出现,以冬春季节为主要流行期;不同年龄组中,0岁～阳性率低(6.00％ ),60岁～阳性率高(17.44％ );不同监测方法中,核酸检测的灵敏度和特异度均高于病毒分离.结论 衢州市流感病毒A(H3N2)型流行一直保持较高活跃状态,应积极防控其引发局部暴发流行的风险;多方法监测能够提供更为准确的监测数据.
关键词： 流感病毒 病毒分离 实时荧光RT-PCR -
实时荧光PCR检测EV71病毒核酸的临床应用价值
目的:讨论实时荧光PCR技术检测EV71病毒核酸的临床价值.方法:对128例临床诊断为手足口病患者采用实时荧光RT-PCR技术检测患者粪便中EV71病毒核酸,分析结果与临床诊断相符性.结果:128例临床诊断为手足口病的患儿经实时荧光RT-PCR检测EV71病毒核酸阳性者65例(50.78％).结论:实时荧光RT-PCR技术是诊断手足口病的主要实验方法,但该方法存在一定的漏检,临床诊断手足口病时应密切结合临床以防漏诊.
关键词： 实时荧光RT-PCR 手足口病 病毒核酸 -
黄芩苷对人外周血T细胞TCR Vβ mRNA表达的影响
目的 研究黄芩苷对人外周血T细胞表面TCR Vβ mRNA表达的影响及其可能受体.方法 采用尼龙毛柱法分离T淋巴细胞,将其分为空白对照组(T1)、黄芩苷组(T2)、抗体封闭用药组(T3)、抗体封闭对照组(T4),37℃培养48h,Trizol法提取总RNA,实时荧光RT-PCR法检测各组TCR Vβ mRNA表达.结果 T2组较T1组TCR Vβ mRNA的表达明显增强(P<0.01);T3组较T2组TCR Vβ mRNA的表达明显减低(P<0.01);T3组较T4组TCR Vβ mRNA的表达增高(P>0.05).结论 黄芩苷能显著增加T细胞表面TCR Vβ mRNA的表达;T细胞受体(TCR αβ)是黄芩苷作用于T细胞的主要受体之一.
关键词： 黄芩苷 T细胞受体 TCR Vβ mRNA 实时荧光RT-PCR -
2012年江苏部分地区动物中发热伴血小板减少综合征病毒携带状况调查
目的 了解江苏部分地区动物中发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)携带状况,探讨其可能的传播媒介和自然宿主.方法 2012年3月～12月在江苏省发现发热伴血小板减少综合征病例的7个市/县,采集鼠、牛、羊、刺猬、鸟类和蜱等动物标本,提取总核酸后,应用实时荧光RT-PCR法对标本进行布尼亚病毒S基因核酸的检测,阳性标本采用Vero细胞进行病毒分离.结果 采集761只(管)动物,43只(管)检出SFTSV核酸阳性,阳性率为5.65％.采集3 728份标本,阳性49份,阳性率为1.31％.鼠的病毒携带率高(6.84％),蜱标本阳性率高(4.94％).除蜱标本外的3 647份标本中检出阳性45份,阳性率为1.23％,不同器官阳性率分别为淋巴结(50.00％)、血清(2.34％)、脾(1.64％)、心(1.64％)、肝(1.28％)、肺(1.09％)、脑(0.94％)、肾(0.73％)、血块(0.41％).5月标本阳性率高(4.01％).从1份羊血清及其体表1份蜱标本中各分离出1株SFTSV病毒.结论 鼠、牛、羊和蜱均可携带SFTSV,可能是其自然宿主或传播媒介.
关键词： 发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV) 实时荧光RT-PCR 宿主 媒介 监测 -
运用实时荧光RT-PCR方法检测疟原虫的研究
目的 对比金标准的厚薄血膜显微镜检查法(以下简称"镜检法"),对国产疟原虫核酸实时荧光PCR检测试剂(以下简称"RT-PCR检测试剂")进行研究. 方法 首先提取全血样本的DNA,加入RT-PCR检测试剂进行荧光定量PCR检测,比较其相关指标. 结果 2种方法经配对比较,RT-PCR检测试剂检测45份全血临床标本的总符合率达93.33％,经测序对3例不符样本进行复检,3例镜检法检测为阴性,经RT-PCR检测试剂检测为阳性的样本经测序结果显示均含有疟原虫核酸序列. 结论 RT-PCR检测试剂与镜检方法在各项指标差异无统计学意义,甚至在样本处理的时效性和阳性率等方面更具有明显的优势,该实时荧光PCR试剂有良好的检测质量,特别适用于口岸、进出境等单位疟原虫DNA的检测.
关键词： 疟疾诊断 疟原虫DNA 实时荧光RT-PCR
