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鼠疫杆菌基因测序已完成
英国桑格中心的科学家近日宣布完成了鼠疫杆菌的基因组测序工作,这将有助于研究该病菌的进化过程,为这种烈性传染病寻找新的抗菌药和疫苗.桑格中心的科学家在新一期英国<自然>杂志上报告说,他们从一位于1992年死于肺炎型鼠疫的人身上收集到一种称为"C092"的鼠疫杆菌菌株,对之进行了测序.这一菌株的染色体约包含465万个碱基对,其中约3.7%的序列是重复的,还有约150个已经不起作用的假基因,以及一些可能导致疾病的染色体片段.鼠疫杆菌基因组特征表明,这种病菌在进化的过程中,曾经频繁地从其它微生物获取新的基因,本身的染色体片段也经常发生重组.这些过程可能是病菌迅速进化的关键.科学家认为,鼠疫杆菌是由一种生活在动物肠道、危害性相对较小的微生物--假结核耶尔森氏菌进化来的,而且产生的历史已有几千年.可能正是通过从其它微生物窃取基因及自身染色体片段重组的过程,鼠疫杆菌在极短的时间里获得了在啮齿类哺乳动物和跳蚤之间转移的能力,并学会了在血液里生存.跳蚤将鼠疫杆菌传播给人类,引起肿胀、出血、咳嗽等症状,然后迅速导致死亡.研究人员希望对鼠疫杆菌的多种菌株及与它亲缘关系较近的其它病菌进行测序,通过对比研究,更好地了解鼠疫杆菌的特性和进化过程.摘自<中国病理学网>
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应用抑制消减杂交技术研究鼠疫菌与假结核菌基因组之间的差异
目的:研究古典型鼠疫菌与假结核菌ATCC29833基因组间的差异,为进一步认识鼠疫菌的起源与进化奠定基础.方法:通过抑制消减杂交技术比较两种细菌基因组间的差异.结果:与已测序的3株鼠疫菌基因组进行同源性比较,发现了259个假结核菌基因组中存在的特异序列,与基因库进行同源性比较发现了10个假结核菌ATCC29833基因组中存在的新序列.结论:抑制消减杂交技术是一个简单而有效的比较近源微生物基因组之间差异的方法,鼠疫菌在进化过程中失去了大量的基因,假结核菌基因组之间也存在着一定的差别.
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小肠结肠炎耶尔森氏菌、假结核耶尔森氏菌、志贺氏菌和空肠弯曲菌多重PCR方法的建立
目的 为实验动物微生物检测提供一种简便、灵敏、快速,并且特异性强的小肠结肠炎耶尔森氏菌、假结核耶尔森氏菌、志贺氏菌和空肠弯曲菌多重PCR检测方法.方法 根据小肠结肠炎耶尔森氏菌fox基因、假结核耶尔森氏菌inv基因、志贺氏菌ipaH基因及空肠弯曲菌gyrA基因设计并筛选出特异性引物;优化退火温度等条件,分析多重PCR的特异性、敏感性,使用该多重PCR方法检测小鼠和豚鼠样品.结果 多重PCR扩增出了预计的PCR产物,即小肠结肠炎耶尔森氏菌(511 bp)、假结核耶尔森氏菌(779 bp)、志贺氏菌(290 bp)和空肠弯曲菌(156 bp).该方法的灵敏度为1×10-3ng/μL(小肠结肠炎耶尔森氏菌、假结核耶尔森氏菌、志贺氏菌)和1×10-2ng/μL(空肠弯曲菌).特异性检测未从其他菌中检测出阳性条带.使用该方法从样品中检测出不等的阳性样品数.结论 该多重PCR方法对实验动物微生物检测具有很好的应用和开发前景.
关键词: 小肠结肠炎耶尔森氏菌 假结核耶尔森氏菌 志贺菌 空肠弯曲菌 多重PCR -
鼠疫耶尔森氏菌外膜蛋白研究进展
耶尔森氏菌属包括11个菌种,其中只有鼠疫耶尔森氏菌、假结核耶尔森氏菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌对人致病,而其余8个菌种只对动物致病.致病性耶尔森氏菌的外膜蛋白(yersinia outer-membrance proteins,Yops)一直是研究的热点.现将其研究进展综述如下.
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两种培养基分离鼠疫耶尔森氏菌的效果比较
上世纪80年代,美国、芬兰、日本相继报道小肠结肠炎耶尔森氏菌病的暴发流行而引起国内外医学界高度关注,各种耶尔森氏菌培养基纷纷问世,使用耶尔森氏菌选择培养基即Yersinia selective agar检验小肠结肠炎和假结核耶尔森氏菌已在国际上得到普遍认可,但分离鼠疫菌效果尚不清楚.
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鼠疫耶尔森氏菌外膜蛋白研究进展
耶尔森氏菌属中致病性细菌有3种,即鼠疫耶尔森氏菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌和假结核耶尔森氏菌.其中鼠疫耶尔森氏菌是致病性强的一种.随着分子生物学的研究进展,人们对鼠疫菌有了深入的了解.鼠疫菌外膜蛋白(Yops)是近些年对鼠疫菌的基础研究内容焦点之一[1].
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2种致病性耶尔森氏菌与鼠疫菌EV株的相互拮抗作用
目的 研究3种对人致病性耶氏菌在试管内的拮抗作用,以探讨目前雷州半岛的鼠疫疫源性.方法 分别将小肠结肠炎菌、假结核菌与鼠疫菌EV株等量同时混合接种于赫金格尔溶解血肉汤,在不同时间点取样并进行菌落计数.结果 小肠结肠炎菌0:3、0:9、猪盲株、假结核519株抑制了EV株,而EV株抑制了假结核277株.结论 所选3种致病性耶尔森氏菌株存在相互拮抗作用.
关键词: 小肠结肠炎耶尔森氏菌 假结核耶尔森氏菌 鼠疫耶尔森氏菌 拮抗作用 -
假结核耶尔森氏菌致感染性全眼内炎1例
假结核耶尔森氏菌感染导致眼内炎的病例尚未见报道,延边大学附属医院曾收治1例.本病例对广谱抗生素治疗无明显效果,眼部病情恶化极为迅速,眼球壁液化、自行破溃.1 临床资料患者,男性,42岁,以左眼被小石粒崩伤后眼痛2d、视物不见1d为主诉于2010年5月20日入院.患者于入院前2d做工时不慎被弹起的小石粒崩到左眼,当时有左眼刺痛感、视物略模糊,未引起足够重视而行氯霉素滴眼液点眼,次日早晨起床后发现患眼视物模糊不清、轻度胀痛,口服头孢氨苄片,当日半夜患眼疼痛加重、视物不见而来院就医.眼部检查:Vod=1.0,右眼前后节正常.Vos=无光感,左眼睑轻度红肿,球结膜混合充血呈强阳性((卅)),全角膜呈灰黄色混浊并已有部分溶解改变,3点位瞳孔缘处见1.0mm长线状穿透伤痕,上1/3前房隐约可见、略浅,其余前房沉积黄白色脓性渗出物,窥不见瞳孔及其后部结构,眼压为4.84 kPa.
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耶尔森氏菌毒力岛的研究进展
耶尔森氏菌属为肠杆菌科,共11种,其中3种即鼠疫耶尔森氏菌、假结核耶尔森氏菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌对人是致病的[1,17,18].尽管鼠疫耶尔森氏菌和假结核耶尔森氏菌在遗传方面几乎相同,在DNA水平90%以上的一致性,[1,16]但它们的传播方式和所引起的疾病表现形式却有很大差异.作为鼠疫病原体的鼠疫耶尔森氏菌对人类危害是大的,曾造成3次鼠疫世界大流行,夺去了2亿人的生命.另2种致病菌一般引起自限性疾病,但也可发展为系统性疾病,危害相对较小[11].
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对1株疑似鼠疫耶尔森氏菌的系统鉴定
目的 对1株可疑菌株进行系列验证实验,以确定其是否为鼠疫耶尔森氏菌(以下简称鼠疫菌).方法 用鼠疫细菌学常规方法和分子生物学手段确定其生物学表型特征、特异性基因及基因组特征.结果 该菌株具备鼠疫菌的典型形态特征;能被鼠疫噬菌体完全裂解;主要生化特性为阿胶糖(+)、鼠李糖(-)、麦芽糖(+)、蜜二糖(-)、甘油(+)、脱氮(+),与典型鼠疫菌一致.毒力因子检查结果为均为阴性;对实验动物小白鼠完全无致死能力.全基因组芯片杂交实验和PCR扩增表明55023菌株没有鼠疫菌的三个质粒;也不具鼠疫标识基因;pgm位点代表性基因YPO1954扩增阳性,YPO1908扩增阴性,表明其pgm位点不完整;差异片段(DFR)分型结果表明该菌株缺失了14个DFR,不符合鼠疫菌的特征;多位点序列分型(MLST)分析结果表明该菌株与鼠疫存在16个碱基的差异,而与血清III型假结核耶尔森氏菌仅相差两个碱基.结论 尽管55023菌株具备鼠疫菌的一些表型特征,但基因组特征表明其不是鼠疫菌,而可能是血清III型的假结核耶尔森氏菌;噬菌体裂解结果等表型不能作为鼠疫菌鉴定的终标准.
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鼠疫菌研究进展
鼠疫杆菌是由一种生活在动物肠道、危害性相对较小的微生物一假结核耶尔森氏菌(Y.pseudotuberculosis)进化来的,产生的历史只有几千年.假结核菌是于鼠疫菌近源关系为接近的肠道致病微生物,研究表明,鼠疫菌40%的岛状结构在假结核耶尔森氏菌并不存在.病菌迅速进化的关键是自然界中啮齿动物数量的剧增.
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假结核耶尔森氏菌在改良磷酸盐缓冲液中的低温生长
目的应用改良PBS对Y.pseudotubercolosis 进行低温增菌和碱处理试验.方法用生理盐水分别稀释假结核耶尔森氏菌521,522,F2 3株菌,然后分别转种在改良PBS液体内,置4°C增菌于不同时间取出,接着经碱处理后进行分离培养.结果 Y.pseudotubercolosis 521,522株在21天出现一个峰值,F2 株在14天达到高峰后维持至28天不变;碱处理不影响分离率. 结论改良PBS低温增菌培养方法简便,经碱处理对其结果没有影响,可应用于Y.pseudotubercolosis增菌培养.