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丙型肝炎病毒NS5A区与干扰素敏感性间关系的研究
日本学者首先发现丙型肝炎病毒NS5A区存在干扰素敏感决定区(ISDR),可预测干扰素疗效,但随后西欧学者的多项研究并不支持此观点.本文对ISDR与干扰素疗效、病毒滴度、准种选择性的关系以及ISDR的体外研究等方面的现状进行了综述.
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中国地区丙型肝炎病毒的NS5A基因序列及干扰素敏感决定区特征分析
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)NS5A基因编码的ISDR、PKRBD和V3等区域氨基酸序列的变异与HCV对干扰素-α( interferon-α,IFN-α)治疗的不同反应性有关[1-6],了解NS5A基因的序列特征及干扰素敏感决定区(IFN Sensitivity Determining Region,ISDR)的氨基酸序列有助于进一步研究中国地区HCV的致病性及HCV相关肝炎的药物治疗与预后.笔者选取了美国国立生物技术信息中心数据库(NCBI)中发表的中国地区HCV多聚蛋白的核苷酸和氨基酸序列及NS5A蛋白的部分氨基酸片段,对NS5A基因序列及ISDR氨基酸序列进行多序列比对、聚类分析、相似性分析及氨基酸变异位点分析,分析中国地区HCV的NS5A基因序列及ISDR特征,现将结果报道如下.
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干扰素敏感决定区在干扰素治疗丙型肝炎病毒感染中的意义
据国内外报道,丙型肝炎病毒(HCV)感染率为0.5%~4%,其中约80%发生慢性化,经20年以上形成肝硬化或肝细胞癌(HCC),预后恶劣[1]。α-干扰素(IFN-α)是目前唯一公认对HCV感染有效的药物。但HCV感染病人对IFN-α治疗反应不一,平均应答率不足50%,且停药后复发率较高。目前认为耐药原因在于:①治疗前HCV RNA呈现高滴度;②HCV作为一种RNA病毒,其RNA聚合酶缺乏校正功能,易形成基因突变,甚至在同一宿主体内形成多个准种(quasispecies),在IFN选择性压力下,优势株消长变化,影响了干扰素的治
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1b型丙型肝炎病毒基因组不同区域基因变异对干扰素疗效的影响
本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NS5A区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行了探讨,为1b型慢性丙型肝炎患者应用IFN抗病毒治疗时进行疗效预测提供理论依据.
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丙型肝炎病毒NS5A基因变异与干扰素疗效的关系
目的:探讨HCV1b型慢性丙型肝炎患者HCV NS5A基因变异与干扰素(IFN)疗效的关系,NS5A2209-2248片断是否存在干扰素敏感决定区(ISDR).方法:留取慢性丙型肝炎患者干扰素治疗前血清,应用RT-PCR法扩增NS5A基因片段,用直接测序法进行核苷酸及氨基酸序列测定.结果:11例HCV1b型患者中1例为中间型,其余为野生型.2例表现为完全应答,均为野生型,9例为无应答.两组之间核苷酸及氨基酸序列无显著差异.对1例患者的动态观察发现,干扰素治疗后其核苷酸及氨基酸序列均有所变化,改变了其在基因树中的位置.结论:HCVlb型NS5A基因变异与干扰素疗效无关,NS5A2209-2248区高度保守.未证实存在ISDR.干扰素治疗可引起HCV准种改变.
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HCV干扰素敏感决定区"基因盒"的构建,体外表达及功能探讨
目的:构建对干扰素敏感和不敏感的丙型肝炎患者的干扰素敏感决定区(ISDR)基因;在体外表达含ISDR的丙型肝炎病毒(HCV)NS5A蛋白,探讨表达的NS5A蛋白是否通过ISDR与干扰素诱导的RNA蛋白激酶(PKR)结合来影响干扰素的抗HCV作用.方法:采用合成寡核苷酸,PCR,分子克隆等方法构建ISDR基因"盒",包括3个对干扰素敏感的丙肝患者ISDR及1个对干扰素耐受的丙肝患者ISDR,将含不同ISDR的NS5A基因克隆进原核表达载体PRSET,转染BL21(DE3)细胞后由IPTG诱导表达,获得蛋白过柱纯化及透析去掉高盐后,与经体外转录和翻译系统获得的PKR进行蛋白结合试验.结果:经测序证实获得4个不同ISDR基因,包括1个对干扰素不敏感基因和3个对干扰素敏感基因;体外表达的含ISDR的NS5A蛋白约58 000,体外试验初步证实,无论对干扰素敏感或不敏感的ISDR均可与PKR结合.结论:体外构建的含不同ISDR的NS5A蛋白能在原核细胞系统中获得较好表达;研究显示,ISDR影响干扰素抗病毒作用可能不是由ISDR与PKR直接结合导致的.
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河南省耐多药结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变分析
目前认为,编码RNA聚合酶beta亚基rpoB基因突变,使利福平不能与其结合而产生对利福平耐药[1].单耐利福平菌株的rpoB基因突变多分布在利福平耐药决定区(rifampin resistance determining region,RRDR),且通过检测RRDR区内特定突变可发现95%~98%的利福平耐药菌株[1],但仍有2%~5%耐药菌株的耐药机制不明.本研究对较大样本量的耐多药MTB利福平耐药相关基因rpoB编码区进行突变分析,以进一步阐明其耐药机制.
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胃黏膜肠化生中CDX2及SOX2的表达及其甲基化状态
DNA的异常甲基化修饰在多种肿瘤的发生中起重要作用.尾型同源盒转录因子2(caudal type homeobox transcription factor 2,CDX2)是肠上皮特异性转录因子,仅在成人肠道中表达而在胃中不表达.与之相反,性别决定区Y框蛋白2(sex determining region Y-box 2,SOX2)仅在胃及胃以上的消化道上皮中表达.胃黏膜的肠化生(intestinal metaplasia,IM)被认为是肠型胃癌的癌前病变.本研究检测了胃黏膜不同程度IM标本中CDX2和SOX2启动子区甲基化的情况,并探讨其与基因表达的关系.
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SRY阴性XX男性综合征一例报告
2003年9月我们收治1例4岁合并会阴型尿道下裂和双侧隐睾的性别决定区基因(SRY)阴性XX男性综合征患者,现报道如下.
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46,XX真两性畸形基因分析1例
真两性畸形的染色体核型常见为46,XX(58%),其发病机制与XXY受精卵的形成有关 [1].本文对1例46,XX真两性畸形进行SRY(Y染色体上的性别决定区基因,sex-deter mining region of the Y)基因检则,试图从分子遗传水平探讨46,XX真两性畸形的发病机制.
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丙型肝炎病毒1b型NS5A 2209-2248区基因突变与干扰素疗效的关系
目前,干扰素仍然是治疗慢性丙型肝炎有效的药物.Enomoto等[1]研究发现丙型肝炎病毒(HCV)1b型NS5A 2209-2248区存在有干扰素敏感决定区(Interferon Sensiti-vity Determining Region, ISDR),是独立预测干扰素疗效的预测因子.为此,我们对HCV-1b型慢性丙型肝炎患者,采用干扰素-α治疗,结果发现治疗前HCV NS5A 2209-2248区基因突变与干扰素疗效之间存在一定的相关性.现将结果报道如下.
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大肠肿瘤中编码区域决定区结合蛋白的表达及意义
大肠癌是常见的恶性肿瘤之一,目前治疗效果仍不十分理想,编码区域决定区结合蛋白(coding region determinantbinding protein,CRD-BP)是近年来肿瘤学研究热点之一.研究表明CRD-BP在大肠癌等多种肿瘤中表达[1,2],而在成人正常、炎性组织中无表达,提示其可能成为一个高特异性的肿瘤标志物.由于多数大肠癌是由大肠腺瘤演变而来,我们拟应用半定量RT-PCR方法检测其在正常大肠黏膜、不同阶段大肠腺瘤及大肠癌中表达,并比较其差异,以了解其在大肠腺瘤到大肠癌发展各阶段的表达情况,评价CRD-BP成为一个肿瘤标志物的可能性以及在大肠肿瘤的诊断中的价值.
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丙型肝炎病毒基因型、准种及干扰素敏感决定区对干扰素应答的影响机制
干扰素治疗慢性丙型肝炎的临床研究己有十多年,新型聚乙二醇干扰素(PEG-IFN)也己应用于临床,但完全应答率过低问题仍未解决.多位学者分别从干扰素的剂型、种类、用法以及加用提高宿主免疫制剂等方面进行了广泛的尝试,试图提高慢性丙性肝炎干扰素治疗的疗效,遗憾的是收效甚微.
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084.L-链N-末端及补体决定区3上的氨基酸残基改变增加人类N血型抗原重组F(ab)亲和力
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丙型肝炎病毒干扰素敏感性决定区的研究进展
丙型肝炎病毒(hepatitis C,HCV)是一种严重威胁人类健康的病原微生物.据统计,全球有17亿~20亿HCV感染者,仅我国就有3800万感染者.HCV感染易慢性化,导致肝脏的慢性炎症和损害,终发展为肝硬化甚至肝细胞癌.目前缺乏有效的HCV疫苗,单独使用普通干扰素治疗丙肝,仅能使20%的患者获得持续性应答;