首页 > 文献资料
-
“那是谁的信息,谁又有权获得那条信息?”
阿鲁 · 秦奈炎博士(Dr.Arul Chinnaiyan)是密歇根大学转录病理中心的负责人.此时,他正盯着一名癌症患者的基因序列打印结果发呆.这名患者是他的一个研究对象.研究结果显示:这名男性患者的癌症基因上还附带有艾滋病病毒的基因,这真是出人意料的发现.
-
HPV的分子生物学特征及其致病机理
广泛存在于自然界的人类乳头瘤病毒(HPV)近20年已分离出120余种,其中85种以上已完全测序.HPV基因序列的多态性和易变性造成皮肤、粘膜、泌尿生殖系和头颈部肿瘤病变的多样性.
-
HBV多样性与乙型肝炎传播途径的关系
HBV基因序列有较高的多样性,不同HBV基因株的传播与临床肝炎的发病有密切的关系.本文就HBV多样性对乙型肝炎的几种主要传播途径的影响做一简要综述.
-
戊型肝炎病毒基因型地域分布特征的演变
自Reyes1990年首次克隆出缅甸株HEV基因序列以来,国内外不同基因型的HEV毒株陆续被发现.科学家们对已分离的HEV毒株进行了全基因及部分基因的克隆及测序,借助于系统软件的分析对HEV进行了基因分型,发现在世界范围内HEV基因型地域分布特征发生了很多变化.本文回顾了HEV基因型地域分布演变的过程,概括了HEV基因型新的地域分布特征.
-
HBV多样性与乙型肝炎传播途径的关系
HBV基因序列有较高的多样性,不同HBV基因株的传播与临床肝炎的发病有密切的关系.本文就HBV多样性对乙型肝炎的几种主要传播途径的影响做一简要综述.
-
2003年美国宾夕法尼亚甲型肝炎暴发
宾夕法尼亚卫生部和CDC正在对宾夕法尼亚州Monaca一餐厅(餐厅A)顾客中的甲型肝炎暴发进行调查.到11月20日,共识别出大约555名甲肝病人,其中至少包括13名餐厅A的食品服务人员和75名在餐厅A就餐的其他6个州的人员.3人死亡.对从3名甲肝病人获得的RNA病毒340核苷酸区的初步基因序列分析表明3株病毒基因序列完全相同.初步的病例对照分析认为青洋葱是此次暴发的传染源.
-
2010-2012年浙江省余姚市手足口病的病原构成及Cox A16 VP1基因特征分析
目的 了解浙江省余姚市引起手足口病的病原构成,研究Cox A16基因特征及变异情况.方法 收集手足口病患者标本,用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)检测并分型,每年选择几个样品进行CoxA16 VP1基因的扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对分析.结果 2010-2012年从1651份标本检出柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)25.86%,肠道病毒71型(EV71) 39.85%,其他肠道病毒19.38%;Cox A16 VP1蛋白氨基酸序列相似性为99.3%~100%,7株Cox A16基因分型属于B1基因亚型.结论 2010-2012年余姚市手足口病流行的主要病原体为Cox A16和EV71,流行的Cox A16属于B1基因亚型,并具有高度相似性.
关键词: 手足口病 柯萨奇病毒A组16型 基因序列 -
分枝杆菌分子鉴定中常用的靶基因序列的研究进展
分枝杆菌种类繁多,至2000年底已发现有128种分枝杆菌,包括结核分枝杆菌复合群(MTBC,包括结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌、田鼠分枝杆菌),麻风分枝杆菌以及其他非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM).近年来,非结核分枝杆菌感染有逐渐增加的趋势,据1990年、2000年第二次全国结核病流行病学抽样调查资料
-
诺如病毒核酸检测及病毒基因序列分析
[目的]通过对国境口岸输入性感染性腹泻暴发病例的快速检测、排查和病原基因序列分析,为病人的诊断、治疗和口岸突发疫情的处置提供依据,保障国境口岸的卫生安全.[方法]利用分子生物学技术,通过粪便样本的核酸(RNA)提取、聚合酶链反应(RT-PCR)、凝胶电泳分析以及基因序列测定、基因序列分析等过程,对造成群体腹泻的病原种类进行确认.[结果]9份送检的腹泻病人粪便样本中均检测到诺如病毒特异性核酸片段.经基因序列分析,确认检测到的诺如病毒基因型属基因组Ⅰ(G I).确认造成马耳他籍船舶"蓝海探索"号暴发腹泻病例的病原为诺如病毒.[结论]通过核酸检测等技术手段,可快速确认传染病病原种类,为疫情控制、保障国境口岸的卫生安全提供技术支持.
-
深圳口岸首例入境人员HIV-1毒株近似全基因序列的测定与分析
目的 获得深圳口岸首例入境人员HIV-1亚型毒株全长基因组序列并分析其特征.方法 以深圳出入境检验检疫局HIV确证实验室确证的1例HIV感染者为研究对象,提取病毒RNA,利用逆转录巢式RT-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,应用生物信息学软件对全基因序列进行系统进化分析.结果 获得了8 831 bp长度的近全长基因组序列,系统进化树分析结果显示该毒株与HIV-1 CRF01_AE亚型参考株成簇,Bootstrap值为100%,通过与世界上不同国家和地区流行的HIV-1 CRF01_AE亚型毒株比较,该毒株与泰国流行毒株的关系近.结论 该毒株是由境外传入的,应对入境人员HIV感染毒株的来源和变异进行密切监测.
-
Nature:科学家首次发现抑郁症相关基因
2014年2月,当牛津大学遗传学家Jonathan Flint第一次发现某些基因序列和抑郁症的发生有关时,他非常吃惊。因为进行这种尝试的研究都相继失败,其中有研究从9000人重度抑郁症筛选敏感基因,也有对17000人进行随访分析的研究。而他自己项目的研究规模只有5303人。该项目中国合作单位有复旦大学、华东师范大学和中国医学科学院等。
-
狂犬病病毒浙江街毒株糖蛋白基因序列分析
目的 测定狂犬病病毒浙江株(鼬獾源和犬源)糖蛋白(GP)基因组全序列,从分子水平比较狂犬病病毒浙江株与其他地区代表性街毒株和疫苗株GP之间的差异.方法 乳鼠接种分离狂犬病病毒,RT-PCR反应测定狂犬病病毒浙江株GP基因核苷酸序列,并进行序列和编码蛋白的比较分析.结果测序获得浙江5株鼬獾源狂犬病病毒和9株犬源狂犬病病毒GP基因序列,全长1575个核苷酸,编码524个氨基酸.浙江病毒株与其他地区街毒株、疫苗株核苷酸和氨基酸序列相似性在82.3%~99.9%和85.1%~99.8%之间,种系分析显示浙汀株均为基因1型,GP编码蛋白无重组,主要抗原位点未出现较大的变异.结论 对GP基因一级结构综合分析表明,在某些区域存在优势抗原表位的可能性较大,可能出现潜在的蛋白质抗原决定簇,浙江株GP基因变异较小,与国内其他地区流行的代表性街毒株相似,但高于其他疫苗株,在基因结构及种系进化关系上存在一定的距离.
-
聚合酶链反应检测SEN病毒D和H亚型方法的建立及比较
SEN病毒(SENV)是新近发现怀疑与输血相关的non-A-E型肝炎有关的一种病毒.我们实验室首次证实在我国也存在SENV感染[1],为进一步了解其致病性,我们在前期工作的基础上,参考已发表的文献[2]及基因序列,建立了两种特异性检测SENV-D和SENV-H的套式PCR方法.
-
中国地区丙型肝炎病毒的NS5A基因序列及干扰素敏感决定区特征分析
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)NS5A基因编码的ISDR、PKRBD和V3等区域氨基酸序列的变异与HCV对干扰素-α( interferon-α,IFN-α)治疗的不同反应性有关[1-6],了解NS5A基因的序列特征及干扰素敏感决定区(IFN Sensitivity Determining Region,ISDR)的氨基酸序列有助于进一步研究中国地区HCV的致病性及HCV相关肝炎的药物治疗与预后.笔者选取了美国国立生物技术信息中心数据库(NCBI)中发表的中国地区HCV多聚蛋白的核苷酸和氨基酸序列及NS5A蛋白的部分氨基酸片段,对NS5A基因序列及ISDR氨基酸序列进行多序列比对、聚类分析、相似性分析及氨基酸变异位点分析,分析中国地区HCV的NS5A基因序列及ISDR特征,现将结果报道如下.
-
浙江鼬獾狂犬病毒F01株P和M基因序列测定分析
狂犬病毒(mbies virus,RABV)广泛存在于多种哺乳动物体内,并在宿主动物之间相互传播.鼬獾又名白面鼬,野生小型貂科动物,杂食性,浙江全境均有分布.
-
塞拉利昂埃博拉病毒的遗传多样性和进化动态研究
截至2014年3月,新型埃博拉病毒(EBOV)在西非已被确诊感染超过2.5万例,造成超过1万例死亡。针对2014年3月至6月在几内亚和塞拉利昂分离的81株EBOV的基因序列初步分析显示,2014年EBOV来源于天然宿主的一个独立传播事件,通过人传人的模式进行持续感染。Tong等详细描述从2014年9月28日至11月11日在塞拉利昂5个严重受灾地区提取的175株EBOV全长基因组序列,并发现从2014年7月到11月EBOV出现多个新的谱系,有更强的亲缘关系,遗传多样性急剧增加。EBOV基因组变异可能会影响以序列为基础的病毒检测和候选治疗方案,而该研究提供的数据将有助于国际社会开发疫苗和治疗方案。
-
与自然合其序--中医与时间天体医药学
截然不同的你我他就生命个体而言,我们每个人都是不同的,而且又是"命中注定"的.绝没有宣传宿命论的意思,现代基因学证明这完全是真实的存在,我们不仅各自显示不同的基因序列,而且这个独特的基因还预示着我们将来的健康状况与寿命的长短.
-
核酮糖1,5-二磷酸羧化酶加氧酶基因序列、化学成分和块茎解剖对沿阶草属和山麦冬属麦冬的鉴别
-
中医个体化医疗的现代研究基础
中医辨证论治具有显著的个体化倾向.然而在以急性感染或传染性疾病为主诊疗对象的生物医学模式阶段,人们曾因缺乏双盲对照和可重复性,而对中医的个案治疗的有效性产生质疑.两年前完成的人类基因组计划,不但从基因水平证明了个体差异的存在基础,同时也揭示了个体差异与疾病易感性和对药物敏感性之间存在着潜在的联系.SNPs分析为基础的个体化医疗将彻底改变人们目前已经习惯了的疾病诊断和治疗模式.
-
从急性腹泻儿童中检出的人博卡病毒2型的研究
为了调查北京地区急性腹泻患儿中人博卡病毒2型(HBoV2)的流行情况并了解这一病毒的基因组特征,本研究收集2010年11月至2011年10月到首都儿科研究所附属儿童医院门诊就诊的急性腹泻患儿的粪便标本553例,采用荧光实时PCR进行HBoV2 DNA的检测.选择2例病毒载量较高的阳性标本进行HBoV2各基因片段的扩增并测序.将所测到的序列进行拼接后得到完整的基因组序列并与GenBank中的相关序列进行比较分析.结果显示,553例粪便标本中共检出HBoV2阳性标本15例,阳性率为Z.7%;各年龄组中,3~6月龄患儿中的HBoV2 DNA阳性检出率高(4.1%);所检年度中,7月份阳性检出率高(7.0%);15例HBoV2检测阳性的患儿年龄均在2岁以下,其中4例患儿同时检出了诺如病毒,3例患儿同时检出了轮状病毒,1例检出了腺病毒.经测序得到两株接近完整的HBoV2基因组序列BJQ19和BJQ390;序列分析表明,这两株序列的同源性为99.2%,与GenBank中的FJ375129同源性高,分别为99.1%和99.2%,为典型的HBoV2.上述结果表明,北京地区部分儿童的急性腹泻可能与HBoV2感染相关,且HBoV2感染在低年龄组儿童中更为常见.