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从胚胎早期细胞基因表达谱分析心与小肠相表里内涵

刘声;杨国旺;王笑民

摘要: 目的:比较胚胎发育早期“心”与“肾”实质细胞基因表达水平的相似性,再结合之后的相关生理病理实验研究,为“心与小肠相表里”实质内涵提供依据.方法:分离胚胎发育早期心与肾组织实质细胞,提取总RNA,扩增染色后,与大鼠全基因组芯片杂交,对其基因表达情况进行检测和比较,利用生物信息技术挑选同源表达基因,进一步对同源表达基因进行基因本体论(GO)分析和信号通路(pathway)分析;以qRT-PCR验证芯片结果.结果:在胚胎早期两者实质细胞基因表达相似;GO分析表明与细胞生物过程相关的表达基因符合率为15%,其中比例较高的有生物调节、细胞分化、细胞周期等;细胞分子功能表达基因符合率为33%,其中比例较高的包括转移酶活性、激酶活性和酶调节活性;细胞组分表达基因符合率为66%,比例较高的为非膜结合细胞器、胞外区等;pathway分析显示雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、wnt通路有明显相似性.qRT-PCR结果与芯片结果比较,差异无统计学意义.结论:胚胎发育早期,“心”与“肾”实质细胞在基因表达水平存在明显相似性,且主要体现在形态发育上,心与小肠相表里”更有可能为心肾相关,丰富了心与小肠相表里的内涵.

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