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炎症影响下血管平滑肌细胞神经传递中相关基因的研究

田众一;邓颖;汤敬东

摘要: 血管平滑肌细胞的排列紊乱和肥大在血管病中十分常见,炎症在疾病的发展过程中扮演了关键角色.为了研究炎症对血管平滑肌细胞神经传递的作用,笔者在二代测序后进行了生物信息分析.对经LPS处理的A7r5细胞和经PBS处理的A7r5细胞的基因经二代测序测序,重复三次.差异基因表达集通过R框架下的NOISeq软件包取得.随后,通过DAVID数据库获得功能和通路富集分析来推断其潜在功能.蛋白富集通路的相互作用关系与神经系统疾病有关,这些蛋白与ADRA1D或CACNA1S有关,这一结果通过使用Cytoscape软件构建的STRING和PPI网络得到.相较于对照组LPS组中共计2038个基因有差异表达,包括1094个基因上调、944个基因下调.富集分析提示NADH中NDUFV2与多种神经系统疾病相关,包括氧化磷酸化、阿尔兹海默症、帕金森症和亨廷顿舞蹈症.而且,NDUFV2在差异基因PPI网络的通路富集分析中也与神经系统疾病有关.在通过PPI网络分析ADRA1D、CACNA1S和差异基因与之的相互关系中,PHB、OXTR、CRMP1和DPYSL2都和ADRA1D、CACNA1S交互作用.目前研究提示NDUFV2、PHB、OXTR、CRMP1和DPYSL2可能是炎症对血管平滑肌细胞的神经传导的作用中的关键基因.

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