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TUG1基因沉默对脑胶质瘤生物学功能影响的实验研究
目的 观察TUG1基因沉默对胶质瘤细胞生长和凋亡的影响.方法 构建携带shRNA-TUG1的慢病毒载体pLenti6.3-EGFP,将慢病毒载体感染人胶质瘤U251细胞.采用实时荧光定量PCR检测U251细胞中长链非编码RNA(lncRNA) TUG1基因的表达,观察干扰载体对TUG1基因的抑制效果.应用流式细胞术和CCK-8法观察干扰TUG1基因对U251细胞增殖和凋亡的影响.结果 实时荧光定量PCR检测结果显示,对于TUG1的相对含量,U251空白对照组(0.40±0.05)、阴性对照组(1.01 ±0.12)、siRNA-1组(0.09±0.01)、siRNA-2组(0.32±0.01)、siRNA-3组(0.18±0.04)、siRNA-4组(0.18±0.02)之间的差异有统计学意义(P＜0.05).选择干扰效果好的siRNA-1进行后续干扰实验,TUG1干扰组感染72 h时的细胞凋亡率[(11.58±0.11)％]高于空白对照组[(8.55±0.23)％]和阴性对照组[(9.14±0.17)％](均P ＜0.05);TUG1干扰组感染72 h的细胞增殖能力(0.64±0.23)低于空白对照组(1.07±0.50)和阴性对照组(0.94±0.42)(均P＜0.05).结论 TUG1基因沉默能够抑制胶质瘤U251细胞的增殖,促进细胞凋亡.
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牛磺酸上调基因1在肾癌组织的表达及临床意义
目的：探讨牛磺酸上调基因1（ TUG1）在肾癌组织及其配对癌旁正常组织中的表达，及其与临床病理特征之间的相关性。方法从46例经手术完整切除的肾癌组织及其配对癌旁正常组织中分别提取获得各自的总RNA，经逆转录得到cDNA，使用RT?qPCR检测两者TUG1的表达，分析TUG1表达与患者临床病理特征的相关性。结果 TUG1在肾癌组织中的表达明显低于配对的癌旁正常组织（0．533±0．027、1．000±0．298），差异有统计学意义（t＝－3．350，P＜0．01）。46例肾癌组织中TUG1的△CT值经对数转换后小值为－5．535，大值3．085，平均值－0．908，以平均值－0．908为分界线，46例肾癌组织中有25例（54．34％）呈表达下调。 TUG1的表达水平与肾癌患者的年龄、性别、肾癌组织类型、TNM分期以及UICC／AJCC临床分期无显著相关性（ P均＞0．05）。结论肾癌组织中TUG1表达下调，提示其可能与肾癌的发生发展相关。
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长链非编码RNA TUG1在结肠直肠癌组织中的表达与分析
目的:检测结肠直肠癌组织长链非编码RNA牛磺酸上调基因1 (taurine upregulated gene1, TUG1) 的表达, 并探讨其与结肠直肠癌临床病理因素及预后的相关性及临床意义.方法:采用实时定量聚合酶链反应检测106例结肠直肠癌病人的癌组织与相应的癌旁组织 (距癌组织边缘>5 cm) TUG1表达.分析TUG1表达与临床病理的相关性以及TUG1表达与结肠直肠癌预后的相关性.术后随访3～60个月.结果:TUG1在结肠直肠癌组织中表达明显高于癌旁组织 (P=0.003), 表达水平与肿瘤直径 (P<0.001) 、CEA水平 (P=0.049) 以及TNM分期 (P=0.005) 密切相关.TUG1高表达的结肠直肠癌病人, 生存率低于低表达病人 (P=0.002 5) .多因素分析表明, TUG1可作为结肠直肠癌病人的独立预后因素.结论:TUG1在结肠直肠癌的发生发展中起重要作用, 可作为反映结肠直肠癌生物学行为的有效指标.
关键词： 结肠直肠癌 牛磺酸上调基因1 实时定量聚合酶链反应 预后 -
牛磺酸上调基因1在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者中的表达及其与预后的关系
目的:探讨牛磺酸上调基因1 (taurine upregulated gene 1,TUG1)在弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell Lymphoma,DLBCL)患者组织标本中的表达,分析TUG1表达与DLBCL患者临床特征及其预后的关系.方法:收集108例2011年1月至2016年12月在西南医科大学附属第一医院血液科确诊为DLBCL的初诊患者和同期47例反应性淋巴结增生(reactive lymphoid hyperplasia,RLH)患者的组织标本,通过qPCR方法检测DLBCL和RLH患者组织标本中TUG1的表达,采用Chi-Square检验、Kaplan-Meier法和单因素及多因素分析法分别分析TUG1 mRNA表达水平与DLBCL患者临床病理特征的关系和影响DLBCL患者生存时间及预后的因素.结果:TUG1 mRNA在DLBCL患者组织中的表达显著高于RLH患者(6.108±0.332 vs 1.231±0.095,P＜0.01),TUG1 mRNA表达与DLBCL患者的疾病分期、肿瘤大小、B细胞症状、IPI指数、GCB亚型及化疗敏感性显著相关(均P＜0.01),TUG1表达量、疾病分期及肿瘤大小是影响DLBCL患者总生存时间(overall survival,OS)的因素.TUG1 mRNA表达、疾病分期、IPI指数和化疗敏感性是影响DLBCL患者预后的因素.结论:TUG1 mRNA在DLBCL组织中高表达,是影响患者预后的独立因素,TUG1有可能成为DLBCL患者新的预后评估标志物和基因治疗DLBCL的潜在靶点.
关键词： 弥漫性大B细胞淋巴瘤 牛磺酸上调基因1 总生存时间 预后 -
长链非编码RNA Tug1在结直肠癌患者血清中的表达及临床意义
目的:探讨长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(Tug1)在结直肠癌患者血清中的表达及其在诊断和预后方面的临床价值.方法:运用实时荧光定量PCR检测90例结直肠癌患者术前、术后和90例健康对照者(对照组)血清中Tug1的表达,分析血清中Tug1的表达与诊断和预后的关系.结果:结直肠癌患者血清中Tug1的表达显著高于对照组(P<0.001),且患者术后血清中Tug1的表达明显降低(P<0.001).结直肠癌患者血清中Tug1的表达与肿瘤浸润深度(P=0.003)、淋巴结转移(P=0.019)、远处转移(P=0.017)和TNM分期(P=0.013)相关.血清中Tug1高表达的患者比低表达的患者有着更低的5年总体生存率(P<0.001).结直肠癌患者术前血清中Tug1的表达水平(P<0.001)、淋巴结转移(P=0.041)、远处转移(P=0.031)和TNM分期(P=0.045)是影响患者总体生存的独立预后因素.结论:结直肠癌患者血清中Tug1的表达显著高于健康人,可以作为结直肠癌术前有效的诊断标志物和术后预后标志物.
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长非编码RNA TUG1与消化系统肿瘤
牛磺酸上调基因1 (taurine-upregulated gene 1,TUG1)是新近发现的致癌性长非编码RNA(lncRNA),其在各种消化系统恶性肿瘤组织和细胞株中过度表达,包括食管癌、胃癌、肝癌、胆道肿瘤、胰腺癌和结直肠癌.研究表明高表达的TUG1参与肿瘤细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭过程,且与恶性肿瘤患者的临床病理特征及预后相关,表明lncRNA TUG1可能是消化系统肿瘤中可行的肿瘤标志物或治疗靶点.
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牛磺酸上调基因1对人绒毛膜癌JEG-3细胞增殖及迁移和凋亡的影响
目的 探讨牛磺酸上调基因1 (taurine-upregulated gene 1,TUG1)在人绒毛膜癌JEC-3细胞增殖、迁移和凋亡中的作用.方法 采用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)技术构建TUG1慢病毒载体.将对数生长期人绒毛膜癌JEG-3细胞随机分为空白对照组(不作任何处理)、阴性对照组(转染阴性对照靶序列慢病毒载体)和转染组(转染siRNA-TUG1慢病毒载体).采用实时荧光定量PCR法检测3组TUG1 mRNA、caspase-3 mRNA、caspase 9 mRNA相对表达量,采用Western blot法检测3组TUG1、caspase-3、caspase-9蛋白相对表达量,采用Transwell小室试验检测3组培养24 h细胞侵袭能力,采用CCK-8法检测3组细胞培养72 h吸光度值,采用流式细胞术检测3组培养72 h细胞凋亡率.结果 构建siRNA-TUG1载体的慢病毒滴度为3×108TU/mL;转染72 h,转染组TUG1 mRNA、caspase-3 mRNA、caspase-9 mRNA相对表达量(0.42±0.02、0.31±0.01、0.21±0.01)低于阴性对照组(1.09±0.03、1.29±0.03、1.02±0.01)和空白对照组(1.01±0.01、1.02±0.02、1.00±0.01) (P＜0.05),TUG1、caspase 3、caspase-9蛋白相对表达量(0.24±0.07、0.49±0.23、0.11±0.02)低于阴性对照组(7.32±0.05、10.12±1.47、9.98±2.78)和空白对照组(6.08±0.19、9.88±0.93、9.91±1.44) (P＜0.05);培养24 h,转染组迁移细胞数[(52.11±4.09)个]较阴性对照组[(142.11±14.02)个]和空白对照组[(131.32±18.39)个]少(P＜0.05);培养72 h,转染组细胞吸光度值(24.27±3.11)较阴性对照组(51.12±2.47)和空白对照组(60.34±1.24)低(P＜0.05),细胞凋亡率[(35.21±13.31)％]较阴性对照组[(3.09±1.13)％]和空白对照组[(4.21±1.24)％]高(P＜0.05);阴性对照组各观察指标与空白对照组比较差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 TUG1沉默表达慢病毒载体可明显抑制人绒毛膜癌JEG-3细胞增殖和侵袭,促进细胞凋亡.
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长链非编码RNA牛磺酸上调基因1对人神经母细胞瘤侵袭和转移能力的影响
目的 观察长链非编码RNA (lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)对人神经母细胞瘤侵袭和转移能力的影响.方法 神经母细胞瘤SK-N-SH细胞分为3组:TUG1小干扰RNA(si-TUG1)组、乱序对照小于扰RNA(si-NC)组和空白对照组.将TUGI-siRNA在阳离子脂质体Lipofectamine 2000的介导下,瞬时转染入神经母细胞瘤细胞株SK-N-SH,实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测3组细胞中TUG1表达水平;划痕实验和Transwell小室实验检测瘤细胞迁移和侵袭能力.结果 TUG1-siRNA转染神经母细胞瘤后,TUG1 mRNA表达下调.与对照组比较,si-TUG1组细胞迁移能力下降,细胞侵袭能力下降50.4.％(P=0.001).结论 TUG1在神经母细胞瘤细胞中高表达,且能促进瘤细胞的侵袭和转移能力.
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长链非编码RNA牛磺酸上调基因1在人胃癌组织的表达及临床意义
目的 探讨长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(TUG1)在人胃癌组织表达及临床意义.方法 收集人胃癌和配对正常胃黏膜组织,采用荧光实时定量聚合酶链反应(FQ-PCR)方法检测组织中TUG1表达水平,分析其表达与患者性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤直径、Lauren分型、组织分化程度、肿瘤浸润深度、淋巴结转移、远处转移、TNM分期、是否印戒细胞以及脉管内有无癌栓等临床病理因素的关系,并作统计学分析.结果 结果显示TUG1表达与患者性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤直径、Lanren分型、组织分化程度、是否印戒细胞均无明显相关,但与肿瘤浸润深度(P＜0.01)、淋巴结转移(P＜0.05)、远处转移(P＜0.05)、TNM分期(P＜0.05)以及脉管内有无癌栓(P＜0.01)均显著相关.进一步研究结果显示,TUG1表达水平为影响胃癌患者预后的重要独立危险因素之一.结论 TUG1可能是胃癌基因诊断和治疗中重要靶点之一.
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牛磺酸上调基因1对肿瘤发生发展的调控作用
基因的失调控(异常表达)是肿瘤发生发展的重要原因(诱因)业已被学术界所公认,而在这一过程中非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)起到了极为重要的调控作用[1-2].小RNA(small RNA;包括微小RNA,microRNA,miRNA,miR)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)均属于ncRNA[3-4].大量研究已证实miRNA对基因表达的调控与诸多生理病理过程有着密切的联系,并且miRNA的异常表达参与了肿瘤的发生发展[5-7].而对于另一重要分支lncRNA的研究目前尚处于萌芽阶段.
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长链非编码RNA TUG1在肝细胞癌中的生物信息学分析
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)在肝细胞癌(HCC)中的意义,并对TUG1进行靶基因预测,为TUG1在HCC中的进一步研究提供借鉴.方法 利用UALCAN数据库分析TUG1在HCC中的差异表达,并对 TUG1进行生存分析.利用 RegRNA 2.0生物学软件、HMDD、tar-getscan、microT-CDS进行TUG1的靶基因预测,构建lncRNA TUG1-microRNAs-mRNAs调控网络.并运用FunRich平台对预测的靶基因进行Gene Ontology(GO)分析和KEGG信号转导通路富集分析.结果 TUG1在HCC中表达明显增高,随着肿瘤分级增高TUG1的表达呈上升趋势.lncRNA TUG1低表达患者的总生存期较高表达患者明显延长.TUG1上存在has-mir-122-5p、has-mir-200a-3p、has-mir-34c-3p、has-mir-629-3p这4个与 HCC相关microRNAs的可能结合位点,从而调节下游245个靶基因,形成了lncRNA TUG1-microR-Nas-mRNAs调控网络.在生物学过程中,microRNAs靶基因高度富集到碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢调节等过程.KEGG pathway分析中,microRNAs靶基因高度富集到Syndecan、TRAIL等介导的信号通路.结论 TUG1在HCC中表达水平增高,并与不良预后有关.利用生物信息学方法,可以从分子水平探究肿瘤发生机制,可为后续实验及临床诊疗提供有价值的信息.
