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结核分枝杆菌中假设蛋白抗原表位的多态性研究
目的 探究中国结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)菌株中8个免疫相关的保守性假设蛋白Rv1158c、Rv1461、Rv1977、Rv2182c、Rv3207c、Rv3333c、Rv3378c和Rv3714c人T细胞表位的多态性.方法 选取151株我国临床分离到的结核分枝杆菌菌株,对8种抗原基因进行PCR扩增,并运用Bioedit软件进行序列比对,比较其人T细胞表位的多态性.结果 在151株菌株中,除了Rv1977外其余7个蛋白都表现保守,这与Comas等的研究结果一致.而Rv1977表现了一定的多态性,发生了3个异义突变和一个单碱基的缺失.在Rv1977中的3个T细胞抗原表位中有1个表位发生了变化.结论 结核分枝杆菌中的8个与免疫相关的保守性假设蛋白的T细胞抗原表位中,大部分是保守的,只有Rv1977蛋白具有多态性,这种多态性可能反映了这个抗原参与了逃避宿主免疫的分化选择.
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丙型肝炎病毒T细胞抗原表位的研究进展
丙型肝炎是一种在全球流行甚广的病毒性传染病,目前还没有特效的治疗药物和预防方法,对人类健康危害很大,因此,急需发展预防性和治疗性疫苗来控制丙型肝炎病毒的感染.T细胞介导的细胞免疫因具有清除病毒感染的重要作用,在丙型肝炎疫苗研究中受到越来越大的关注,本文就T细胞免疫的重要性及CD4+和CD8+ T细胞抗原表位的研究进展作一综述.
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禽流感抗原表位在沙门氏菌菌毛的表达
目的:经抗原表位预测和同源性比较,禽流感M1蛋白位于58-66序列的九肽是A型流感病毒中保守并具有很强免疫原性的T细胞表位,鉴于鼠伤寒沙门氏菌LT2的SEF17菌毛基因agfA作为疫苗载体的优势,在其上构建引起机体细胞免疫的沙门氏菌口服活体重组疫苗,以求在人类对抗禽流感过程中发挥作用.方法:利用两步重叠延伸PCR和基因置换,将外源表位插入LT2菌毛,并利用抗生素抗性,温度敏感质粒,及菌毛的刚果红吸附能力筛选菌毛上插有外源抗原表位的重组菌,并通过测序进一步验证外源基因的插入.结果:两步重叠延伸PCR产物AB,CD,AD长度与理论大小530bp,423bp,932bp一致.两次转化PCR鉴定,产物长度与理论大小932bp,634bp一致.刚果红吸附测定,菌毛上插入有外源肽的菌落因吸附刚果红能力减弱呈粉色,对筛选出的KmS型粉色菌落的PCR鉴定,产物长度与理论大小417bp一致,测序结果也显示agfA中外源表位基因的插入.结论:禽流感M1蛋白位于58-66序列的T细胞表位成功插入沙门氏菌SEF17菌毛基因agfA.
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中国乙型肝炎病毒流行株的适应性进化分析
目的:检测中国乙型肝炎病毒(HBV)B型和C型4个基因(区)(S、C、X和RT)的正选择位点,推断近年来中国HBV的变异趋势和原因.方法:从基因库下载中国所有B型和C型全长序列共864条,参照标准序列分别截取S、C、X和RT 4个基因(区),使用HyPhy方法筛选各基因序列集的正选择位点并进行统计和分析.结果:共检测到226个正选择位点(B型101个,C型125个),其中85个位点(B型37个,C型48个)分别位于75个(B型32个,C型43个)抗原表位上,表明正选择的发生与病毒的免疫逃逸相关.值得注意的是,B型RT区的3个耐药位点180、181和223,和C型RT区的4个耐药位点173、180、181和223,也被检测到受到正选择压力,表明正选择发生与耐药发生相关.结论:中国地区HBV B型和C型的RT区受到的选择压力与耐药突变存在潜在联系,其他区域的正选择与病毒的逃逸机制密切相关.
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超抗原葡萄球菌肠毒素A、B和C1的T细胞抗原HLA表位预测
为预测超抗原葡萄球菌肠毒素(SE)家族中的SEA、SEB和SEC1的HLAI和HLAⅡ抗原结合表位,并对其活化T细胞作用的机理进行探讨,根据已发表的SEA、SEB和SEC1基因全序列,用T细胞抗原表位预测软件Guotif 2.0对其进行T细胞抗原表位预测,统计与HLAI和HLAⅡ各抗原位点结合的SEA、SEB和SEC1肽段的出现次数.结果显示,SEA、SEB和SEC1具有共同的特点,即都是主要与HLAⅠ类分子的A3位点和HLAⅡ类分子的DR1位点具有较强的结合.说明SEA、SEB和SEC1与HLAⅠ类分子和HLAⅡ类分子都有很强的结合性.三者在HLAⅠ和HLAⅡ结合位点上具有较强的同源性.本研究为SE活化T细胞作用机制的功能实验提供了依据.
