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茎环法与加PolyA尾法PCR在检测MicroRNA时引物设计的策略

高润石;王红;高艾

摘要: MicroRNA (miRNA)是一种长约18 ~ 25个核苷酸的非编码RNA,对基因的表达调控发挥着重要的作用.对于miRNA的实时定量PCR与以往的PCR有些不同,这主要是因为miRNA的自身结构比较特殊.其大的特点就是长度过于短小,仅仅二十几个碱基的核酸片段无法直接应用常规的PCR技术扩增.所以,在针对miRNA的PCR技术中,必须要延长待测miRNA的长度,构建出一个足够长的PCR模板,才能进一步应用PCR技术来定量分析.本文介绍的2种方法,茎环法和加尾法,在原理上有所差异.茎环法的原理是,设计一种特殊的茎环结构的反转录引物,在反转录反应中直接完成模板链的延长;而加尾法的思路则是先对miRNA进行加PolyA尾处理,改造成mRNA的结构,再采用mRNA常用的oligo (dT)反转录引物进行反转录,从而得到较长的模板链.

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