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2014年深圳市流行的1型登革病毒分子溯源分析*

马珍元;黄呈辉;张新枝;钟世良;田建华

摘要: 目的:对2014年深圳市登革热(DF)流行时分离的登革热1型病毒株(DENV-1)进行基因序列测定,了解其分子病毒学特征,探讨其可能来源。方法收集35份2014年深圳市DF患者急性期血清标本,用乳仓鼠肾细胞(BHK-21)分离DF病毒,并用逆转录-半套式聚合酶链反应(RT- PCR)反应对其进行型别鉴定。RT- PCR扩增全长基因,测序并进行同源性与进化树分析。结果35份血清样本中分离到DENV-121株。选取6株深圳DENV-1分离株测序,基因全长1485 bp,编码495个氨基酸。6株深圳市DENV-1分离株同源性为100.0%,其同源性与深圳市2010流行株接近,核苷酸和氨基酸同源性分别为99.5%和99.8%,与新加坡2009和日本2004流行株的核苷酸和氨基酸同源性高达99.7%和100.0%。进化分析发现,深圳6株DENV-1属于基因型1型,与Shenzhen2010、Singpore2009、Japan2004的亲缘关系较近,在同一进化支上。结论2014年深圳市DENV-1属GⅠ亚型,可能来源于东南亚一带,于2010年本地化而引起2014年DF流行。

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