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利用TCGA及GEO数据集分析claudin11在胃癌中的表达及临床意义

王硕;李智;郑春雷;曲秀娟;刘静;曲晶磊;车晓芳;刘云鹏

摘要: [目的]研究claudin11在胃癌中的表达及临床价值,预测claudin11参与肿瘤发生发展的机制.[方法]从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(gene expression omnibu,GEO)数据库收集胃癌数据集,下载claudin11基因表达谱及临床信息.分析claudin11表达和临床病理学参数的相关性及对预后的影响.采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测claudin11的调控基因.[结果]在TCGA数据集中claudin11表达水平与年龄(P=0.031)、T分期(P=0.007)、有无淋巴结转移(P=0.039)、TNM分期(P=0.03)及分化程度(P<0.001)相关.Claudin11高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.001).Claudin11高表达样本富集了细胞黏附、紧密连接、细胞外基质、骨架蛋白调控等相关等基因集.[结论]Claudin11在胃癌中是一种不良预后因素,可以作为判断预后的标志物.

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