首页 > 文献资料
-
云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶基因进化及分子结构特征分析
目的:禽流感病毒神经氨酸酶(NA)是病毒粒子重要表面抗原之一,其抗原性差异决定病毒神经氨酸酶亚型(N1-N9)的划分.NA介导病毒对敏感细胞的侵染及协助子代病毒粒子的成熟和释放,与病毒的宿主嗜性及毒力有关.方法:对2003～2009年期间采集自云南境外家禽的H5N1亚型阳性样品中病毒NA基因进行测序,并与国内外已知代表毒株进行序列比对及系统发育分析.认识云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶(NA)基因分子结构特征.结果:21份代表性病毒样品NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于94.3%～99.3%、93.1%～99.3%.系统发育分析表明可划分为6个不同进化(亚)分支(1、7、9、2.4、2.3.2、2.3.4).其中进化亚分支2.3.4毒株已成为当前云南境外流行的优势毒株;所有云南境外毒株NA蛋白的49-68位氨基酸均存在缺失.结论:糖基化位点存在特有变异;云南境外毒株对Oseltamivir(达菲)类抗病毒药物可能无耐药性.
-
云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因进化特征分析
目的:认识2003年～2008年期间云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因的进化特征.方法:2003年～2008年期间在云南边境采集境外禽类样品380份,经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析.结果:多重RT-PCR检出18份阳性样品,阳性率4.74%;14份代表性病毒样品HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于93.1%～99.3%、90.5%～99.1%;HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;系统发育分析表明阳性样品可划分为5个不同进化分枝(1、2.4、2.3.2、2.3.4、7).结论:2003年～2008年期间云南边境境外H5N1亚型病毒问具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株已成为当地流行的优势毒株.
-
广东省肇庆市2014年-2016年活禽市场外环境禽流感病毒污染状况分析
目的 分析广东省肇庆市活禽市场外环境禽流感污染状况,为人禽流感科学防治提供依据.方法 2014年-2016年随机选取肇庆市9个县市区活禽市场进行外环境采样,开展甲型流感和H5、H7、H9亚型实时荧光RT-PCR监测,对结果进行统计分析.结果 2014年-2016年共采集4 269份外环境样本,甲型流感和H5、H7、H9亚型核酸总阳性率分别为28.77％、5.43％、5.39％、15.44％;甲型流感在每年1月出现一个高峰;封开县未检出H7亚型,怀集县、四会市、鼎湖区H7亚型检出数较高;在不同类型的标本中,宰杀或摆放禽肉案板表面的甲型流感、H5及H7核酸阳性率高(37.60％、12.22％、7.40％);外环境H7亚型检出较多的地区与H7 N9病例分布呈正相关(r=0.701,P＜0.05).结论 广东省肇庆市2014年-2016年活禽市场外环境禽流感病毒污染程度呈现季节性分布,不同样本类型分布状况不同,H7亚型的污染严重程度与H7N9病例感染分布呈正相关.
关键词： 禽流感病毒 活禽市场 污染状况分析 实时荧光逆转录PCR反应 -
活禽市场环境新型H5N6亚型禽流感病毒的鉴定及其基因特征分析
目的 对活禽市场环境中的新型H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)进行测序鉴定和基因分析,为防控人感染H5N6亚型AIV提供依据.方法 对活禽市场环境中检出的1份H5亚型AIV核酸阳性标本进行红细胞凝集素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因通用引物RT-PCR扩增和测序,经BLAST比对和Mega 6.0软件构建进化树来分析病毒基因特征.结果 1份H5亚型AIV核酸阳性标本经测序鉴定为新型H5N6亚型AIV,进化分析显示该病毒HA和NA均与分离自越南的禽源H5N6亚型AIV株亲缘关系近;HA连接肽出现6个碱性氨基酸(amino acids,HA);HA受体结合区域aa为QRG,受体特征为禽源;NA蛋白第69～73位点aa出现茎缺失.结论 环境中1份H5亚型AIV核酸阳性病毒鉴定为新型H5N6亚型AIV,该病毒对禽表现为高致病性的分子特征,但具有不容易感染人的受体结合特征.
-
H9亚型禽流感病毒与大肠杆菌并发感染的诊断
目的 对苏北某鸡场送检病鸡,剖检显示严重的心包炎、肝周炎,部分脏器出血,进行实验室诊断.方法 取病鸡肝脏划线接种麦康凯平板,同时取病鸡肝脏、脾脏及胰腺,病料混合研磨后接种3枚10日龄SPF鸡胚,每个鸡胚接种0.2ml研磨液.将平板上长出的细菌纯化后进行细菌生化实验及16S rDNA基因测序鉴定.死亡鸡胚收集尿囊液进行试纸条检测、血凝及血凝抑制实验.结果 生化试验、16S rDNA扩增序列分析结果显示麦康凯上红色菌落为大肠杆菌,分离病毒具有血凝性且能被禽流感H9亚型特异性血清抑制.结论 本病例为H9亚型AIV与大肠杆菌混合感染.
-
2014年-2016年楚雄州外环境标本高致病性禽流感病毒核酸检测分析
目的 掌握楚雄州禽流感病毒在环境中的分布情况和变异规律,为防控H5N1、H5N6和H7N9高致病性禽流感疫情提供技术依据.方法 2014年-2016年每年1月-4月根据《云南省高致病性禽流感环境监测方案》,对楚雄州辖区县(市)的家禽规模养殖场、活禽交易市场和公园禽类养殖场所采集外环境标本进行流感病毒核酸检测.结果 共采集199份标本,阳性率为20.1％,其中A/H5阳性率为2.5％,A/H9阳性率为16.1％,A/未能分型阳性率为1.5％,均未检测到A/H1、A/H3、A/H7亚型流感病毒阳性.结论 楚雄州分布在外环境标本中的流感病毒主要以A/H9和A/H5亚型为主,而且阳性标本主要来源于活禽交易市场,其中A/H5亚型阳性标本集中在楚雄市.因此,楚雄市是云南省H5N1和H5N6高致病性禽流感疫情防控的重点地区,高致病性禽流感环境监测的重点应放在活禽交易市场.
-
丽水市禽流感病毒H7N9及外环境标本检测分析
目的 对丽水市人感染H7N9禽流感监测病例、外环境监测标本H7N9和H5、H7、H9亚型禽流感病毒进行检测,了解禽流感病毒的分布情况.方法 荧光定量PCR方法检测甲型通用流感病毒和禽流感病毒H7N9、H5、H7、H9亚型核酸.结果 4份外环境家禽粪便标本禽流感病毒H9亚型核酸检测阳性,其它标本H7N9、H5、H7、H9亚型核酸检测均为阴性.结论 在本市外环境中有禽流感病毒H9亚型存在和扩散危险,目前在人群和禽类中尚未检出H7N9禽流感病毒.
-
2013年-2016年湖州市禽流感外环境监测结果分析
目的 了解2013年-2016年湖州市禽类环境中禽流感病毒污染情况,评估人感染禽流感风险.方法 采集禽类饮用水等环境标本,采用荧光RT-PCR对标本进行甲型流感病毒核酸检测,阳性标本再检测H5、H7、H9亚型禽流感病毒核酸.结果 2013年-2016年共采集并检测各类环境标本5 867份,甲型流感病毒总阳性率为38.5％,检出的禽流感病毒型别以H7亚型为主(占23.6％).流感病毒检测阳性率高峰呈现于冬春季节;且阳性率较高的分别为城乡活禽市场(77.8％)、家禽屠宰厂(69.5％)、清洗禽类污水(67.9％)和禽肉案板表面拭物(57.1％).结论 湖州市禽类环境中禽流感病毒污染较为严重,且型别多样,存在人感染禽流感病毒的风险,应加强禽类环境中禽流感病毒实时监测.
-
2014年-2015年湘潭市禽流感外环境监测结果分析
目的 分析湘潭市2014年-2015年禽流感外环境监测结果,了解湘潭市外环境中禽流感病毒流行特点和趋势,为禽流感防控提供参考依据.方法 采集湘潭市禽流感外环境监测点标本411份,用实时荧光定量PCR进行甲型流感病毒(FluA)核酸检测,FluA阳性标本进行H5、H7、H9分型.结果 411份禽流感外环境标本中,FluA阳性160份,占38.93％;H5亚型49份,阳性率为11.92％;H7亚型19份,阳性率为4.62％;H9亚型124份,阳性率为30.17％;其他型25份,占6.08％;2014年-2015年禽流感病毒阳性高峰期在冬春季节;不同类别标本以清洗禽类污水阳性率高,不同监测场所以禽类交易市场阳性率高.结论 禽流感外环境中存在致病性禽流感潜在传播风险;加强禽流感外环境监测,加强禽类从业人群的健康教育,对于防控人禽流感具有重要意义.
-
2012年-2015年新疆兵团禽流感外环境监测
目的 监测新疆兵团外环境中禽流感的分布和流行情况,分析感染高危因素,为预防控制禽流感提供依据.方法 采集城乡活禽市场、家禽规模养殖场和散养户等监测点的水、粪便及笼具表面擦拭物等外环境标本,用Real-timePCR方法检测禽流感病毒及亚型.结果 共检测1 033份外环境样本,禽流感阳性率为12.97％;H5、H7和H9亚型阳性率分别为0.97％、0.00％和9.58％.2013年和2015年监测到H5亚型;在各年份中均检出H9亚型且阳性率均高,未检出H7亚型.在城乡活禽市场、家禽规模养殖场和散养户禽流感阳性率分别为15.78％、6.30％和4.55％,差异有统计学意义(x2=17.928,P=0.000);在134份阳性标本中,各监测场所检出率有所不同,城乡活禽市场共检出116份,占86.57％.不同类型标本中,清洗禽类的污水阳性率高19.25％,禽类饮水阳性率低9.14％,差异有统计学意义(x2=15.299,P＜0.05).结论 城乡活禽市场禽流感病毒的污染普遍存在,主要为H5亚型和H9亚型.
-
黄河三角洲地区禽流感病毒外环境标本监测分析
目的 对黄河三角洲地区禽流感外环境监测标本进行禽流感病毒H5、H7、H9亚型检测分析,分析该地区禽流感病毒的分型情况.方法 2013年10月-2014年10月,根据《职业暴露人群血清学和环境高致病性禽流感监测方案(2011年版)》的要求设置监测点,采集禽类粪便标本、活禽市场污水标本、案板表面擦拭标本、禽类饮水标本、笼具表面擦拭标本.采用荧光定量PCR方法检测甲型通用流感病毒和禽流感病毒H5、H7、H9亚型核酸.结果 检测外环境标本600份,禽流感病毒核酸检测阳性标本44份,阳性率为7.33％,检出禽流感病毒H5亚型核酸阳性26份、H7亚型核酸阳性2份、H9亚型核酸阳性16份.结论 在黄河三角洲地区野禽及家禽中有禽流感病毒H5、H7、H9亚型存在.活禽市场污水及案板的禽流感病毒核酸检测阳性率较高.存在感染人类及禽类间传播扩散的风险.
-
2013年-2015年宁夏环境禽流感病毒和职业暴露人群血清学监测分析
目的 了解2013年-2015年宁夏环境高致病性禽流感病毒的分布变化情况及职业暴露人群禽流感病毒的感染状况.方法 采用实时PCR对环境样本进行F1A、H5、H7、H9禽流感病毒核酸检测;采用马红细胞血凝抑制实验检测职业暴露人群H5N1和H7N9亚型血凝素抗体.结果 1 479份环境样本禽流感病毒核酸检测,A型总阳性率为4.46％,其中H5亚型阳性率为0.34％,H9阳性率为3.38％,H5亚型和H9亚型交叉双阳性率为0.74％,H7亚型均为阴性.城乡活禽市场样本阳性率显著高于其他场所,高峰期在冬春季.5个监测县区中,沙湖旅游区A型阳性率高,为11.66％.职业暴露人群血清837人份,H5N1和H7N9抗体均为阴性.结论 2013年-2015年宁夏监测点环境中禽流感病毒以H9亚型为主,未检出H7亚型病毒.禽流感病毒呈地区性分布和变化的特点,城乡活禽市场仍然是禽流感病毒主要的集散地.宁夏尚未发现人感染H5N1和H7N9禽流感.
-
2014年-2015年镇江市外环境禽流感病毒监测与分析
目的 了解镇江市活禽市场等外环境样本中禽流感病毒的动态分布情况,为防治人感染禽流感提供科学依据.方法 采用实时荧光定量PCR法对2014年-2015年镇江市外环境标本(清洗禽类的污水、笼具表面及禽类粪便等)进行禽流感病毒核酸检测,阳性者进一步检测H5、H7N9、H9亚型核酸,监测数据用SPSS 19.0软件进行统计分析.结果 共采集外环境标本1 058份,甲型通用病毒核酸阳性标本共284份,总阳性率为26.84％;H5、H7N9、H9亚型和混合感染的检出率分别为5.10％、17.67％、3.02％和1.04％.外环境标本中禽流感核酸阳性率有明显的季节性,冬季、春季高于夏季.禽流感病毒检出率高的标本为清洗禽类的污水(41.57％),低为鸡食(3.23％).结论 镇江市城乡活禽市场与宰杀加工场所等外环境中有H5、H7N9、H9等多种亚型禽流感病毒存在,建议继续加强外环境禽流感实时监测,对发现禽流感病毒变异、预防控制禽流感具有重要的意义.
-
2011年-2014年厦门市环境和职业暴露人群禽流感监测分析
目的 了解厦门环境禽流感病毒分布情况及职业暴露人群高致病性禽流感病毒感染情况.方法 采用实时RT-PCR对环境标本进行禽流感病毒核酸检测;采用血凝抑制试验对职业暴露人群血清标本进行H5N1抗体检测,2014年增加H7N9抗体检测.结果 环境标本A型流感病毒阳性率为40.08％,各病原阳性率由高到低依次为H9(33.97％)、H7(5.22％)、H5(3.82％).25家城乡活禽市场,H9阳性24家,H7阳性15家,H5阳性11家;6处家禽散养户集中的地区,H9和H5阳性各1处;4家家禽规模养殖场(户)均无阳性.H9阳性率以12月-次年1月高.5种类型标本阳性率由高到低依次为宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭标本(50.00％)、禽类饮水(44.88％)、清洗禽类的污水(44.44％)、笼具表面擦拭标本(44.38％)、粪便(34.27％).574份职业暴露人群血清H5N1、H7N9抗体均阴性.结论 厦门市城乡活禽市场存在H9、H7、H5;家禽散养户集中的地区仅个别地区个别时间存在H9和H5;家禽规模养殖场(户)未发现禽流感病毒.职业暴露人群未发现H5N1和H7N9感染.
-
厦门翔安区2014年-2015年环境H7N9禽流感病原监测结果分析
目的 分析2014年-2015年冬春季厦门翔安区环境H7N9禽流感病原监测情况,了解病毒在环境中的分布情况,为防控和预警提供参考.方法 2014年11月-2015年4月,选择该地区不同场所,按月采集不同种类环境标本,采用real-time RT-PCR方法对标本进行禽流感病毒特异性核酸检测.结果 共采集环境标本189份,A型禽流感检出52份(27.51％),H7N9亚型检出17份(8.99％);3月病毒分离检出率高,A型为50.00％,H7N9为20.00％;活禽市场检出率A型为30.32％,H7N9亚型为10.97％;粪便、笼具表面物和水标本检出率,A型分别为31.88％、17.39％和14.29％,H7 N9亚型分别为11.59％、4.35％和0.00％,差异有统计学意义.结论 翔安区2014年-2015年冬季、春季外环境存在H7N9亚型等禽流感病毒流行,但H7N9亚型不是优势株(32.69％).大病毒分离高峰出现在3月.活禽市场是人感染H7N9亚型的高风险场所.粪便和笼具表面物拭子标本的分离检出率较高,应加强监测.
-
义乌市职业暴露人群血清学和环境高致病性禽流感监测分析
目的 了解高致病性H5N1禽流感病毒在浙江省义乌市职业暴露人群中的感染变化状况及其在环境中的分布情况.方法 马血球血凝抑制试验(HI)检测高致病性H5N1禽流感病毒抗体,实时荧光定量PCR检测A型流感病毒.结果 在105份职业暴露人群血清标本中检出H5N1抗体阳性标本12份,总检出率为11.43％.男、女性别间H5N1抗体阳性率差异无统计学意义(x2=0.064,P＞0.05);家禽规模养殖场(户)和家禽散养户两类职业暴露人群间H5N1抗体阳性率差异无统计学意义(x2=1.304,P＞0.05);226份环境标本中检出H9亚型禽流感病毒1份,未检出H5亚型.结论 义乌市职业暴露人群中存在高致病性H5N1禽流感病毒隐性感染的情况或有个别轻症病例的可能,环境中存在禽流感病毒的污染,未发现高致病性H5N1禽流感病毒污染的证据,应加大监测力度.
-
2009年-2013年赣州市禽类养殖人群血清学和环境高致病性禽流感监测分析
目的 监测赣州市禽类养殖人群和环境高致病性禽流感病毒的感染情况,为其预防控制策略的制定提供科学依据.方法 根据《全国职业暴露人群血清学和环境高致病性禽流感监测方案》的要求,采用单放射免疫扩散溶血试验(SRH)或马红细胞血凝抑制试验(HI)检测禽类养殖人群H5N1血凝素抗体;采用Real-time PCR对环境标本进行A型/和H5、H7、H9亚型禽流感病毒核酸检测.结果 2009年-2013年5个监测年度共657份禽类养殖人群血清H5N1血凝素抗体均为阴性;621份环境标本禽流感病毒核酸监测A型阳性率为15.78％(其中H5阳性率5.96％,H7阳性率0.97％,H9阳性率0.97％,A未分型8.86％,且H7和H9是混合感染).结论 赣州市禽类养殖监测点环境中存在H5、H7、H9禽流感病毒,存在人感染高致病性禽流感的风险,应加强禽类养殖人群的禽流感病毒感染监测.赣州市尚无人感染H5N1禽流感.
-
宁夏2011年-2013年度职业暴露人群血清学和环境禽流感监测分析
目的 了解宁夏职业暴露人群H5N1禽流感病毒抗体水平和环境中禽流感病毒的分布情况,为禽流感的防控提供科学依据.方法 采用血凝抑制试验检测职业暴露人群A(H5N1)血凝素抗体;采用Real-time RT-PCR方法对环境标本进行H5、H7、H9禽流感病毒核酸检测,从2013年4月份起,对采集的环境标本增加H7N9核酸检测.结果 职业暴露人群812人份血清H5N1抗体均为阴性;环境标本760份禽流感病毒核酸检测A型阳性率为5.13％.A型禽流感病毒核酸阳性样本除原州区未检出外,其它地区均检出阳性标本.不同监测场所城乡活禽市场样本阳性率高,不同环境样本宰杀或摆放禽肉案板表面擦拭标本阳性率高.结论 职业暴露人群血清标本中未检测出A(H5N1)禽流感病毒抗体阳性标本,宁夏监测点环境中存在H5、H9禽流感病毒,未检出H7N9禽流感病毒.城乡活禽市场是禽流感病毒重要的集散地.
-
2017年潍坊市对首例H7N9禽流感疫情应急监测结果分析
目的 2017年4月潍坊市确诊首例人感染高致病性禽流感H7N9病例后, 通过对密切接触者带毒情况调查及大范围活禽市场禽流感病毒开展监测工作, 为疫情防控提供可靠实验依据.方法 实时荧光定量PCR (RT-PCR) 法对密切接触者咽拭子标本及活禽市场环境标本进行禽流感病毒的核酸检测.结果 103例密切接触者中, 3例为H3亚型季节性流感病毒携带者, 未发现H7N9病毒携带者.508份环境标本中, A型核酸阳性率为24.4％, 其中H7亚型阳性率为10.2％, 明显高于H5亚型 (0.2％) 、H9亚型 (5.5％) 及H7和H9亚型双阳性 (3.0％);各类型标本中, 宰杀或摆放禽类案板表面擦拭标本 (14.0％) 和清洗禽类污水等标本中, H7亚型检出率高于与其他类型标本中的阳性率, 差异有统计学意义 (χ2=8.67, P＜0.05).结论 潍坊市活禽市场H7亚型禽流感病毒污染情况较普遍, 提示人感染H7N9风险较高, 因此需采取强有力措施以控制疫情进一步扩散.
-
人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列分析
目的 测定本市首例人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列,分析H7N9禽流感病毒HA基因特点.方法 采用real-time PCR检测患者H7N9禽流感病毒核酸,RT-PCR扩增病毒HA基因后测定核苷酸序列.结果 实验室确诊丽水首例人感染H7N9禽流感患者.测序得到H7N9禽流感病毒长度为1 683 bp的HA基因核苷酸全序.A/Zhejiang/LS01/2014 (H7N9)与我国江浙沪分离株HA基因核苷酸和氨基酸序列相似性都比较高,分别为98.8％ ～ 99.5％、98.9％ ～ 99.5％;与浙江鸡分离株A/chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)序列相似性高.A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)与我国江浙沪H7N9病毒株HA基因序列均处于同一进化分支;与浙江外环境分离株A/environment/Hangzhou/34/2013(H7N9)进化关系近;与浙江鸡分离株A/chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)进化关系次之;与韩国野鸟分离株A/wildbird/Korea/A3/2011(H7N9)处于同一进化分支.结论 A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9) HA基因来源于浙江鸡携带的H7亚型流感病毒.HA基因具有低致病性禽流感病毒基因特征,但与人类呼吸道上皮细胞的亲和力增加,更容易感染到人.
