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喉癌组织中nm23蛋白与微血管密度测定及临床意义
近些年来研究表明人类实体肿瘤的生长和转移均需要血管生成[1],肿瘤微血管密度是评估患者转移及预后的重要指标.有研究表明肿瘤微血管密度及肿瘤的转移与肿瘤相关基因相关[2].
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肿瘤相关基因转录调控蛋白的识别与研究进展
癌相关基因主要包括两大类,即原癌基因与抑癌基因.在自然或实验条件下原癌基因的活化或者抑癌基因的失活具有诱导细胞恶性转化功能.癌相关基因的表达调控异常是细胞癌变中的重要事件.在癌相关基因转录调控中,转录调控蛋白作为反式作用因子(trans acting factors)与基因自身的顺势作用元件(cis acting elements)相互作用,实现对基因转录水平的调控.故深入研究癌相关基因的反式作用因子,有助于我们解析癌相关基因的表达调控机制,从而为以基因干预为目的的靶向治疗提供有价值的理论依据.
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肝癌相关基因的研究进展
肿瘤相关基因(tumor-related gene)包括癌基因(oncogene)、原癌基因(proto-oncogene)、病毒癌基因(viral oncogene)、肿瘤抑制基因(tumor suppressor gene)、肿瘤转移相关基因(metastasis-related gene)和肿瘤耐药基因(drug-resistance gene)等,在肿瘤的发生、发展、治疗与预后中发挥着重要作用.
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EBV阳性胃癌细胞系与阴性胃癌细胞系全基因组表达谱差异比较
目的:探讨EB病毒阳性胃癌细胞系与EB病毒阴性胃癌细胞系全基因组表达谱的差异.方法:利用Agilent人类全基因组表达谱芯片技术在3种EB病毒阳性胃癌细胞系和3种EB病毒阴性胃癌细胞系中筛选EB病毒相关胃癌肿瘤相关基因.选取6条差异表达基因,应用实时荧光定量PCR验证芯片结果的可靠性.结果:聚类热图及矩阵图分析显示,EB病毒阳性胃癌细胞系与阴性胃癌细胞系之间表达谱存在明显差异.差异表达基因涉及多种生物学过程.选取的6条差异基因进行验证,其表达趋势与芯片结果一致.结论:感染EB病毒可能会改变肿瘤相关基因的表达,进而在EB病毒相关胃癌的发生、发展及预后中发挥作用.筛选出的肿瘤相关基因涉及多种生物学过程,提示多基因及相关基因的变异参与了EB病毒相关胃癌的形成.
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肿瘤相关候选基因在舌鳞癌中的筛选
目的:寻找舌癌特异性相关基因,阐明舌癌发病的分子机制,为舌癌的诊断、治疗和预后提供分子靶标.方法:采用半定量RT-PCR方法检测了所选9个肿瘤相关基因DLC1、ANXA1、BCAT1、KRAS2、KCNJ8、LDHB、DNMIL、ETNK1、PTX1在舌鳞癌中的表达情况.结果:DLC1、ANXA1、LDHB、DNMIL、ETNK1、PTX16个基因在舌鳞癌组织与配对正常组织中无明显表达差异;而BCAT1、KRAS2、KCNJ8在舌鳞癌组织中表达上调,上调频率分别为45%(9/20)、50%(10/20)和33.3%(4/12).结论:BCAT1、KRAS2和KCNJ8参与了舌鳞癌的发生发展,也为进一步在舌鳞癌中分析3个基因的功能提供实验依据.
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array-CGH技术及其在肿瘤学中的应用和意义
人类肿瘤的发生和发展常与非随机性染色体异常(包括基因组缺失、获得、扩增和重排等)有关[1,2].比较基因组杂交(comparatlve genomlc hybridization,CGH)技术可以快速全面地分析肿瘤组织DNA拷贝数的变化,并在中期染色体上定位,对于肿瘤研究具有重要意义.但是,CGH至今未应用于临床,一个主要的障碍是使用中期染色体铺片作为杂交靶,其局限性为:⑴CGH的分辨率低,不能发现小于2Mb的DNA获得和缺失;⑵不能将DNA拷贝数变化与基因或基因标记物直接联系起来;⑶虽然可经计算机软件识别每条染色体,但仍需要经验丰富的人员进一步确定,这限制了CGH的自动化操作和高通量分析[3~5].为了克服CGH的局限性,人们发明了微阵列一比较基因组杂交(array-CGH,matrix-CGH)技术,将DNA克隆或cDNAs做成微阵列,代替中期染色体作为杂交靶,不仅使分辨率提高,甚至可以确定肿瘤相关基因并提供精确的定位[3,4,6~8].
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石英致癌的细胞及分子机制研究进展
关于石英的致癌性,国际上争论了几十年,国际癌症研究中心(IARC)终于于1996年10月正式宣布石英为人类致癌物,但尚缺乏DNA水平的直接证据.本文对近年来有关石英致癌机制方面的文献进行综述,包括对SiO2诱导的肺泡上皮细胞的转化与增殖、肺泡上皮细胞间隙通讯功能下调、SiO2介导的DNA损伤与修复、活性氧自由基对靶细胞的作用、石英与肿瘤相关基因等细胞及分子毒理学机制进行了初步的阐述.
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葛根素对子宫内膜异位症细胞恶性行为调控机制研究
目的:观察葛根素对子宫内膜异位症(endometriosis,EM)血管形成的影响以及葛根素对EM肿瘤相关基因的调控作用.方法:利用子宫内膜细胞原代培养技术、鸡胚绒毛尿囊膜(chicken ehorioallantoic membrane,CAM)模型、基因芯片等方法,了解EM肿瘤相关基因表达的情况,观察葛根素对EM血管生成、肿瘤相关基因的调控作用.结果:葛根素可明显抑制种植内膜组织囊泡及周边血管形成,其血管阳性面积显著小于模型组(P <0.05).基因芯片结果显示.增殖期EM在位内膜组织较之正常在位内膜组织、EM异位内膜组织较之EM在位内膜组织,在癌基因,抑癌基因,细胞黏附、侵袭、转移、血管生成相关基因及细胞凋亡相关基因表达方面有明显不同.100μmol/L葛根素可明显上调EM在位基质细胞凋亡基因BAD、BAX、CASP8、CASP9和TNFRSF6表达,并增强细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子CDKN1B、CDKN2A及IFNA1、IFNB1基因表达;减少癌基因FOS、CHEK2、SRC和黏附侵袭基因ITGB5、MMP9及生长、转录因子基因PDGFA、NFKBIA表达.结论:葛根素能够抑制异位灶新生血管的形成.减少异位灶的血液供应;通过调整EM癌基因、抑癌基因、细胞周期相关因子基因表达,并通过影响凋亡相关基因的表达.促进细胞凋亡,从而改变EM内膜细胞类似肿瘤细胞的恶性行为.
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肿瘤相关抗原基因OVA66特异的RNA干扰对肿瘤细胞生物学特性的影响
构建OVA66基因的特异小干扰RNA表达载体,转染HeLa细胞,分析对该基因表达和肿瘤生物学特性的影响.以RT-PCR、Western blot方法检测OVA66基因在多种肿瘤细胞系的表达谱.利用计算机辅助设计和合成针对OVA66的特异小干扰RNA的DNA片段,定向克隆于特定的干扰载体(pSUPER).利用脂质体法将重组载体转染于OVA66高表达细胞系HeLa,筛选得到shRNA-OVA66稳定表达细胞.采用Real-time PCR检测目的基因的表达;FACS、Western blot方法分析目的蛋白的表达.MTT、3H-TdR掺入等方法检测干扰OVA66基因表达后对HeLa细胞增殖和凋亡的影响.双酶切鉴定得到针对OVA66基因特异的shRNA表达载体(pSUPER-shRNA-OVA66),并经序列分析证实.经检测pSUPER-shRNA-OVA66稳定表达的HeLa细胞(shRNA-OVA66)中目的基因mRNA水平降低;OVA66蛋白表达受到抑制,表明设计的靶片段对目的基因有显著的抑制效果.并显示shRNA-OVA66细胞DNA合成下降;细胞周期分析表明阻断OVA66基因表达可抑制shRNA-OVA66细胞增殖能力,并引发细胞凋亡.OVA66特异的shRNA表达载体构建成功,阻断OVA66基因表达可抑制细胞增殖,促使细胞凋亡,为OVA66蛋白肿瘤生物学功能与肿瘤发生、发展的研究奠定基础.
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胃癌相关基因启动子甲基化的研究进展
随着人类基因组"序列图"的绘制成功.以测序为主的"结构基因组学"研究已趋于尾声,基因组学进入了后基因组学(也称"功能基因组学")时代.
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人胃癌组织DNA甲基化酶、去甲基化酶与肿瘤相关基因的表达
目的探讨胃癌组织中甲基化酶、去甲基化酶基因与肿瘤相关癌基因和抑癌基因的关系.方法取28例胃癌手术标本的癌区、癌旁、正常组织,分别以RT-PCR法和定量RT-PCR法检测DNA甲基化酶1(DNMTl)、去甲基化酶mbd2、甲基化结合蛋白MeCP2和p16INK4A、c-myc等基因的转录水平,以相关分析等统计学处理研究各基因表达之间及分别与病理组织学之间的关系.结果癌组织平均DNMTl和mbd2 mRNA分别明显高于和低于正常组织.胃癌组织中c-myc的表达增强,而MeCP2和p16INK4A无明显变化.在正常组织中,MeCP2与mbd2,p16INK4A与MeCP2、mbd2,c-myc与MeCP2的转录水平表现出一定的相关性,而当肿瘤发生后仅发现c-myc与mbd2的表达呈负相关.以上各基因与肿瘤生物学行为均无相关性.结论肿瘤相关基因mRNA的表达与甲基化酶DNMTl无关,而与甲基结合蛋白有关.
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重组DNA甲基化酶1表达质粒对结肠癌细胞相关基因表达的影响
目的分析DNA甲基化酶1(DNMT1)基因的真核表达质粒对人结肠癌细胞肿瘤相关基因的表达影响.方法分别构建并转染含有人正义和反义DNMT1的真核表达质粒入结肠癌SW1116细胞,PCR和限制性内切酶证实转染结果,以Western印迹法分析各组细胞DNMT1蛋白的表达情况.定量PCR检测hMLH1、hMSH2及c-myc、p16INK4A基因的表达.结果经G418筛选得到稳定转染DNMT1基因的结肠癌细胞系,且分别在该转染有正义和反义质粒的细胞系中,DNMT1蛋白表达上调和下调.同时发现转染正义DNMT1的细胞中hMLH1、hMSH2及c-myc的表达降低,而转染反义DNMT1的细胞中hMSH2的表达明显增强.各组细胞p16INK4A基因的表达差异不明显.结论DNMT1基因调控人结肠癌细胞中肿瘤相关基因的表达.
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SLP-2和CDC42蛋白在结直肠癌组织中的表达及临床意义
SLP-2基因是新近发现的肿瘤相关基因,属stomatin基因超家族的一个新成员,在人食管癌、肺癌、喉癌、子宫内膜癌组织中高表达,并发现其与肿瘤的发生、发展关系密切.
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胰腺癌组织中p16基因启动子区5'CpG岛甲基化及其表达研究
在胰腺癌多步骤、多阶段发生过程中有多种肿瘤相关基因参与.p16基因是其中一个重要的抑癌基因,参与细胞周期的调控,控制细胞的生长和分化.大量研究表明,多种肿瘤细胞中p16基因通过突变、缺失、高甲基化等方式失活,造成p16蛋白功能丧失,从而导致肿瘤细胞恶性生长.
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端粒酶逆转录酶和生存素在结直肠癌患者粪中表达及意义
近年研究表明,粪便中肿瘤相关基因的检测有助于结直肠癌的早期诊断.端粒酶逆转录酶(human telomerase reverse transcriptase,hTERT)和生存素与结直肠癌关系密切,我们利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)及PCR技术检测了hTERT、生存素mRNA在结直肠癌组织表达及其基因在粪中扩增情况.
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基因芯片在胰腺癌研究中的前景
胰腺癌是一种恶性程度高、易转移、预后差的恶性肿瘤.由于胰腺癌位置较深,无特异性临床症状,诊断时大部分已属中、晚期,故5年生存率仅5%.近年来,胰腺癌发病率逐年上升,在美国居恶性肿瘤死亡率的第4~5位.上海地区近30年发病率增加7.5倍.由于胰腺癌治疗效果尚不理想,因此,对其分子病理学及肿瘤相关基因的研究逐渐受到重视.目前,国内外对胰腺癌相关基因的研究,主要针对一些基因异常表达、基因突变、癌基因异常扩增及抑癌基因失活等进行研究.涉及的主要基因有Ki-ras、p53、p16、p21、DPC4及胰蛋白酶原基因等.但各个研究中涉及基因较少,对基因研究也主要是将一个癌基因或可能的抑癌基因转到培养细胞或转基因动物中,或把某一基因进行敲除(knock out)以观察生理或病理变化,但无论是生理或病理过程中,每一个基因都不是独立发挥作用.
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肿瘤相关基因mRNA在胃癌中的表达
1998年,Julia等报道一条新肿瘤相关基因(malignancy-associated gene, MAG),其在许多癌肿和癌前病变中均为阳性表达,而在正常组织中不表达[1]。迄今为止,尚未见在胃癌中表达的报道,故对此进行研究,并分析其含量与临床病理的关系。材料与方法 1.取材 随机取1999年4月~1999年12月在新华医院外科手术切除的胃癌标本20例,每例分别取非肿瘤对照粘膜组织(距肿瘤边缘6cm以上)和肿瘤组织,大小约1cm×1cm×0.2cm,置于冷冻管,迅速置液氮中保存,另各取一份常规送病理检查。
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cDNA阵列分析法研究虫草素对胰腺癌BxPc-3和BxPc-3-LN细胞株部分肿瘤相关基因表达的影响
目的 从分子水平探讨虫草素对胰腺癌细胞株部分肿瘤相关基因表达的影响.方法 利用多点eDNA阵列分析法对9个胰腺癌相关基因进行表达研究.结果 与空白对照组相比用药(虫草素)组甲基化CpG结合蛋白1(MBD1)、视网膜母细胞瘤1 (RB1)基因、E2F转录因子5(E2F5)、胰岛素样生长因子1(IGF1)、转化生长因子BI (TGFBI)、转录因子2B (GTF2B)、上皮细胞钙黏蛋白(CDH)、视黄醇受体-β(RARB)和RAS癌基因家族成员之一(RAB1)表达均明显下降(P<0.05).结论 虫草素对胰腺癌细胞具有一定的生长抑制作用.
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胃癌及癌旁组织多个肿瘤相关基因超甲基化
目的 检测胃癌及癌旁组织肿瘤相关基因超甲基化状态,探讨多个肿瘤相关基因启动子超甲基化与胃癌发生的关系.方法 应用甲基化特异性聚合酶链反应,检测23例手术切除的胃癌组织、癌旁组织和10例胃镜活检正常的胃黏膜组织的hMLH1、E-cadherin、GSTP1、p16和p15基因启动子区域的超甲基化状态.结果 正常胃黏膜组织未检测到所选基因的超甲基化,22例(95.7%)胃癌组织和7例(30.4%)癌旁组织中检测到超甲基化.在17例(73.9%)胃癌组织和5例(21.7%)癌旁组织可以检测到2个以上基因的超甲基化;E-cadherin、p15和 p16 三个基因的甲基化率分别为78.3%、82.6%、60.8%,明显高于hMLH1和GSTP1的34.8%和17.4%.结论 胃癌组织和邻近的癌旁组织中可以同时检测到多个肿瘤相关基因的甲基化,启动子区域超甲基化导致的基因功能失活可能发生在胃癌肿瘤形成的早期.
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人yrdC基因表达促进人结肠癌SW-480细胞增殖的实验
Chen等[1-2]在前期研究中心发现了一种新的人类基因,即人yrdC基因,其在人体组织中普遍存在,且在结肠癌等多种人类肿瘤组织中高表达,提示该基因是一种人类肿瘤相关基因,与这些肿瘤的发生、发展有密切相关.