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家蚕核型多角体病毒广东株bro基因家族分析
对BmNPV广东株进行了空斑纯化,并对该基因组的bro基因家族进行克隆,获得4个bro基因序列(bro-a、b、c、d),与GenBank数据库中BmNPV bro基因序列及本实验室测定的重庆株的bro基因序列进行比较分析,结果表明广东株BmNPV bro基因存在插入及缺失,其氨基酸的改变主要发生在对应蛋白的N端部分;同时进行的bro基因的系统发生分析表明,广东株bro基因分别位于3个亚组中,广东株bro-d与日本T3、重庆CQ1株bro-d以及法国SC7株bro-Ⅲ属于亚组A,广东株broa、c与T3、CQ1株broa、c以及SC7株bro-Ⅱ属于亚组B,广东株bro-b与T3、CQ1株bro-b、e以及SC7株bro-Ⅰ属于亚组C,bro基因进化与地理位置的相关性不明显.根据bro基因在四个不同株系基因组中的位置特征,进一步支持了Kang等的观点:bro-d是BmNPV生存所必需的,bro-a和bro-c相互间功能互补.同时推测:SC7株的3个bro基因可能是BmNPV bro家族出现的简约形式.
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狂犬病病毒反向遗传学及其应用
反向遗传学是相对于经典遗传学而言的.经典遗传学是从生物的性状、表型到遗传物质来研究生命的发生与发展规律.反向遗传学则是在获得生物体基因组全部序列的基础上,通过对靶基因进行必要的加工和修饰,如定点突变、基因插入缺失置换等,再按组成顺序构建含有生物体必需元件的修饰基因组,让其装配出具有生命活性的个体,研究生物体基因组的结构和功能,以及这些修饰可能对生物体的表型、性状有何种影响等方面的内容.
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全外显子组测序发现 Merkel细胞癌存在RB基因突变
Merkel细胞癌是一种罕见的高度侵袭性的皮肤神经内分泌肿瘤,约80%的病例与Merkel细胞多瘤病毒( MCV)感染有关,病毒大 T 抗原持续表达可能是其发生机制之一。MCV阳性与阴性的Merkel细胞癌在临床表现和形态学上存在重叠,目前分析大多关注MCV阳性Merkel细胞癌的发生机制,对阴性病例则认识不足。本文应用外显子组测序分析5例MCV阳性和3例MCV阴性的Merkel细胞癌样本的基因变异情况。结果发现两组病例在点突变、DNA拷贝数改变、插入缺失以及染色体重组等变异的总数上差异无显著性。此外,研究发现RB1信号途径相关基因存在频发突变,3例MCV阴性病例均出现RB1基因无义突变导致截短蛋白产生,而阳性病例则未发现此突变类型。免疫组化结果证实病例均存在RB1异常调控。作者认为,大T抗原持续表达和宿主体细胞突变均能导致 RB1信号通路失调,可能是MCV阳性与阴性肿瘤表型相似的原因,提示Merkel细胞癌存在病毒依赖和非依赖两种发生机制。
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美国《EmergingInfectiousDiseases》2014年第10期有关人兽共患病论文摘译
P16202013年5月至2014年2月期间北美洲猪流行性腹泻病毒株的不同特征和复杂的进化／／An‐astasia N ． Vlasova ，Douglas Marthaler ，Qiuhong Wang ，等
2013年美国出现的猪流行性腹泻病毒（PEDV ）疫情，已波及整个北美洲。由于缺乏全球的 PEDV全基因组信息，从而妨碍了我们了解该病毒传入美国的途径。为确定北美株和全球新发及既往的PEDV株之间联系，我们对北美洲的74株病毒株的全基因组进行测序和分析；这些毒株聚集成两种不同的进化分枝。与初报道的美国PEDV 株相比，来自4个州的7株S基因存在插入和缺失（称为S插入缺失）。这些S插入缺失株序列间存在99．8％～100％的同源性，与初报道的美国 PEDV 株序列间存在96．2％～96．7％同源性。此外，S插入缺失株在北美洲进化分枝II中形成了独特的聚集簇，该聚集簇全基因组序列间存在98．6％～100％的同源性。在美国，S插入缺失株和原始PEDV 株共同流行，这两种病毒株有可能是同时传入美国。
