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药用植物三尖杉及其同属易混物种的DNA条形码鉴定研究
目的:探索建立适用于鉴定药用植物三尖杉及其同属易混物种的DNA条形码鉴定体系,以保障其用药安全.方法:提取三尖杉属3个物种(三尖杉、粗榧和篦子三尖杉)共22份样本的基因组DNA、扩增ITS2和psbA-trnH序列并测序,通过CodonCode Aligner V4.2对测序峰图进行校对拼接.应用MEGA 5.1计算种内和种间Kimura 2-Paramter(K2P)遗传距离,构建邻接(Neighbor-Joining,NJ)系统聚类树.结果:基于ITS2序列分析,三尖杉的种内大遗传距离小于种间小遗传距离;基于psbA-trnH序列分析,三尖杉的种内和种间遗传距离有重合.结论:应用ITS2序列,可以实现对三尖杉及其易混物种的鉴别,为三尖杉药材的安全使用提供鉴定依据.
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应用DNA条形码技术对市场苦木药材的检测研究
目的:利用DNA条形码技术对市场上中药材苦木进行检测,为其市场监管及用药安全提供保障.方法:对15份苦木药材(每份取样2个)共30个样品进行DNA提取,PCR扩增其ITS2序列并双向测序,应用CodonCode Aligner version 6.0.2软件对测序峰图进行校对拼接,将得到的所有序列与GenBank 以及中药材DNA条形码鉴定系统分别进行比对,选择相似度相近的物种在中国植物志网站上查询.在此基础上扩增其psb A-trnH序列以验证结果的可靠性.结果:市场购买的苦木样品中正品苦木Picrasma quassioides占70％、臭椿Ailanthus altissima占6.67％、板蓝Baphicacanthus cusia占13.33％、楝叶吴茱萸Tetradium glabrifolium占3.33％、柘Maclura tricuspidata占6.67％.结论:市场上苦木药材存在混伪品,DNA条形码技术能有效鉴别药材真伪.
关键词： 苦木 DNA条形码 ITS2序列 psbA-trnH序列 -
道地药材川麦冬和浙麦冬的生态遗传分化
目的:探讨川麦冬和浙麦冬的生态型差异,为道地药材生物学实质的深入研究提供参考.方法:选择传统道地药材麦冬为模型,收集75份实验样本,通过分子鉴定技术和生态因子分析研究川麦冬和浙麦冬的生态型差异.结果:川麦冬和浙麦冬的sbA-trnH序列在49位点处存在变异,川麦冬为碱基腺嘌呤(A),浙麦冬为碱基鸟嘌呤(G),此为两者序列的差异化特征;生态因子分析显示四川、浙江两大产区呈现不同的地理生态型.其中,浙江产区在年均日照强度、年均降水量、年均相对湿度、热季平均温度、生长期平均温度等因子上高于四川,而四川产区的冷季平均温度高于浙江.结论:川麦冬和浙麦冬的基因型和生态因子均存在明显差异.
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北京地区野生北柴胡种质资源遗传多样性分析
目的:研究北京地区野生北柴胡种质资源的遗传多样性,对其遗传分化进行分析.方法:应用叶绿体DNA psbA-trnH序列对北京地区4个居群的野生北柴胡进行遗传多样性分析.结果:北京地区野生北柴胡种质资源包括6种不同的单倍型,单倍型遗传多样性指数(h)为(0.488±0.082),核苷酸多样性指数(π)为0.00236,遗传分化系数(Gst)为0.35476,种群间基因流(Nm)为0.45.结论:北京地区野生北柴胡种质资源遗传多样性较高,但部分地区柴胡遗传多样性较低,急需加强柴胡属野生资源的科学保护与质量评价.
关键词： 北柴胡 种质资源 遗传多样性 psbA-trnH序列 -
基于psbA-trnH序列对穿龙薯蓣及同属物种的鉴别研究
利用sbA-trnH序列建立一种能快速精准,将穿龙薯蓣区别于其他同属物种的方法.该实验收集全国17个不同产区,共144份穿龙薯蓣样本,从GenBank上下载的23份薯蓣属其他植物的sbA-trnH序列,使用DNAMAN 8.0软件对测序后所得到的峰图进行拼接和校对,使用MEGA 6.0软件对序列进行分析比对.结果表明:穿龙薯蓣与毛胶薯蓣亲缘关系近,与盾叶薯蓣亲缘关系远,使用sbA-trnH序列作为DNA条形码能有效区分穿龙薯蓣与薯蓣属中的其他植物.
关键词： psbA-trnH序列 穿龙薯蓣 薯蓣属 -
不同产地忽地笑的叶绿体基因psbA-trnH序列分析
目的 通过叶绿体基因sbA-trnH序列分析,探讨我国忽地笑种质资源的系统进化关系及分子鉴定方法.方法 分别提取15省(市)52个忽地笑居群的DNA,经PCR扩增叶绿体基因sbA-trnH序列及测序,并用Mega 5.0等软件对测序结果进行分析.结果 52条sbA-trnH序列长度为544～656 bp,GC含量为35.8％～37.0％,遗传距离为0.000 00～0.009 47;核苷酸变异(多态性)位点数共33个,其中简约信息位点9个,单一突变位点18个,插入/缺失片段6个;单倍型数量(H)10个,单倍型多态性水平(Hd) 0.749,核苷酸多态性(π)0.002 63,收集的忽地笑资源具有较高的遗传多样性.大简约法(maximum parsimony,MP)系统树中52个居群聚为4类,并且该聚类结果与其地理分布基本一致.结论 不同产地忽地笑居群的遗传变异较大,psbA-trnH序列可作为忽地笑种源分子鉴定的依据;我国忽地笑种质资源在进化上具有明显的地域性特征.
关键词： 忽地笑 居群 psbA-trnH序列 核苷酸多态性 系统聚类 -
基于psbA-trnH 序列鉴别溪黄草及其习用品的研究
目的:利用叶绿体基因psbA-trnH序列探讨溪黄草及其习用品的分子鉴定方法.方法:分别提取线纹香茶菜、狭基线纹香茶菜、纤花香茶菜及溪黄草的植物基因组DNA,经PCR扩增后测序,利用相关软件对序列进行分析.结果:线纹香茶菜、狭基线纹香茶菜、纤花香茶菜的psbA-trnH序列长度为231bp,植物溪黄草的碱基为309bp,共存在碱基差异13bp,缺失78bp,种间变异平均距离为0.029.从构建的系统分支树可知,各物种虽能明显分开,但其支持率不高.结论:psbA-trnH序列不适用于鉴定溪黄草及其习用品.
关键词： 溪黄草 习用品 psbA-trnH序列 分子鉴定 -
基于psbA-trnH序列鉴定酸模属几种药用植物
目的:分析酸模、皱叶酸模、巴天酸模、长刺酸模、毛脉酸模、羊蹄酸模的psbA-trnH条形码序列,探讨酸模属植物的鉴定新方法.方法:对24份植物样品提取基因组DNA,PCR聚合酶链式反应扩增psbA-trnH序列进行双向测序,序列经过Con-donCode Migner拼接后,采用MEGA 6.0软件进行序列比对,计算种内种间K2P遗传距离,构建系统邻接树(NJ Tree).结果:表明酸模属psbA-trnH序列种内平均K2P距离均小于种间平均K2P距离;应用相似性搜索法分析结果表明psbA-trnH序列可准确鉴定酸模属植物;NJ树显示除巴天酸模和皱叶酸模聚为一支,其余酸模属植物表现出良好的单系性.结论:psbA-tmH序列可用于鉴定酸模属植物,为酸模属植物的临床安全用药提供依据.
关键词： 酸模属 DNA条形码 psbA-trnH序列 鉴定 -
中药材DNA条形码技术研究进展
药用植物滥用现象带来的众多有害反应已经引起了国内外广泛的关注。药物安全使用问题亟待解决。 DNA条形码是一种强有力的分子鉴定技术,它能弥补传统形态学和化学方法鉴定中药材的不足之处。近年,DNA条形码技术给中药材的鉴定带来了新的视野也获得了众多突出性成绩。一些热门的DNA条形码候选序列如ITS, ITS2, psbA-trnH, rbcL, matK已经用于中药材的鉴定。
关键词： DNA条形码 中药材 ITS序列 ITS2序列 psbA-trnH序列 -
酸枣仁的DNA条形码鉴定研究
目的:采用psb A-trnH序列对药食同源药材酸枣仁进行鉴定.方法:提取酸枣仁药材及其混伪品的DNA,对psb A-trnH序列进行扩增和双向测序分析.将拼接后序列进行多序列比对分析,计算物种的种内、种间kimura 2-parameter (K2P)遗传距离,并构建系统聚类树.结果:酸枣仁药材的psb A-trnH序列比对后长度为336 bp;酸枣仁的种内大K2P遗传距离为0.017,小于酸枣仁与混伪品的小种间K2P遗传距离;基于psb A-trnH序列构建的NJ树表现出良好单系性,酸枣仁与混伪品明显区分开.结论:采用psb A-trnH序列可有效地鉴定药食同源药材酸枣仁.
关键词： 酸枣仁 DNA条形码 psbA-trnH序列 -
基于psbA-trnH序列对广藿香与藿香、广防风的分子鉴定
目的：采用叶绿体基因psbA-trnH间隔区序列探讨广藿香及其常见伪品的分子鉴定方法。方法分别提取广藿香及藿香、广防风植物的总DNA,经PCR扩增psbA-trnH间隔区序列,产物纯化后测序,采用Clustal_X 1.8和MEGA 5.05软件对序列进行分析。结果广藿香与藿香、广防风的小种间K2P 距离(0.1592)大于大种内K2P距离(0.0043),邻接树中广藿香9个不同产地来源样品聚为一支。广藿香与藿香、广防风之间存在多个特异性信息位点。结论 psbA-trnH序列可作为广藿香及藿香、广防风分子鉴定的依据。
关键词： 广藿香 藿香 广防风 psbA-trnH序列 鉴定 -
巴戟天及其伪品的psbA-trnH序列鉴定
目的 利用叶绿体基因psbA-trnH间区序列探讨巴戟天及其常见伪品大果巴戟、樟叶巴戟、羊角藤、虎刺的分子鉴定方法.方法 分别提取巴戟天及其伪品植物的总DNA,经PCR扩增纯化后,测序,利用Clustal X和MEGA 3.1软件对序列进行分析.结果 各样品psbA-trnH序列长度为306 bp,巴戟天及其伪品之间存在多个特异性信息位点.结论 psbA-trnH序列可作为巴戟天分子鉴定的依据.
关键词： 巴戟天 伪品 psbA-trnH序列 鉴定 -
安国地区荆芥资源的调查报告与分析
目的:调查安国地区荆芥的资源状况,为荆芥资源的保护及可持续利用提供科学基础和参考依据.方法:采用查阅文献资料、实地调查及鉴定等方法对安国地区荆芥的资源分布状况进行全面了解,提取样品基因组DNA,对ITS2和psbA-trnH序列进行PCR扩增及双向测序,所有序列用软件DNAStar拼接,采用MEG6.0软件进行序列比对,计算其种内和种间K2P遗传距离,并构建邻接树.结果:安国地区荆芥集中分布在海拔23 ～ 36m,经度115°27′～115°16′,纬度38.32′ ～38°20 ′区域内的山坡路旁或山谷、林缘,目前主要以人工栽培为主.裂叶荆芥ITS2序列长度为497bp,与其混伪品种间K2P小距离为0.060,psbA-trnH序列长度为452bp,与其混伪品种间K2P小距离为0.064,种间距离均大于其种内距离,邻接树显示可以将裂叶荆芥与其混伪品完全分开.结论:归纳概述了安国地区荆芥的地理分布、资源量、药用价值,ITS2序列和psbA-trnH序列可鉴别荆芥及其混伪品,为荆芥的种质资源鉴定和可持续利用开发提出了切实可行的建议和措施.
关键词： 荆芥 ITS2序列 psbA-trnH序列 地理分布 DNA条形码
