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全基因组关联分析散发性阿尔茨海默病的研究进展
阿尔茨海默病（AD）的发生和发展涉及到复杂的环境因素-遗传因素的相互作用，目前尚无有效的治疗药物。利用全基因组关联分析对AD的风险基因进行遗传学研究可以为揭示这一复杂疾病的致病机制和为指导药物开发提供重要的信息。本文从AD的遗传学研究现状、风险基因及其AD的生物学关联性、遗传学研究对治疗阿尔茨海默病的提示等方面进行综述。
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基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因
目的 挖掘潜在的心血管疾病风险基因,为疾病的预防、诊断和治疗提供一定的参考.方法 根据人类信号转导网络、心血管疾病相关的Toll样受体信号通路以及相关的表达谱信息,以网络motif及其包含的基因为研究对象,采用基因芯片显著性分析、网络motif筛选以及基因功能富集分析等方法对候选基因进行分析.结果 经分析得到21个潜在的心血管疾病风险基因,有12个为已知心血管疾病风险基因.结论 对所发现的潜在心血管疾病风险基因进行研究,以阐明心血管疾病发病机制有重要的生物学意义.
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重症肌无力风险基因挖掘
目的:挖掘重症肌无力(Myasthenia gravis,MG)可能的风险基因.方法:通过人工挖掘在PubMed数据库收集重症肌无力风险基因,通过Gene数据库获取重症肌无力风险基因编号,用以表示基因或者其相应的蛋白.应用基因功能分析软件DAVID(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)对重症肌无力风险基因进行KEGG通路富集分析,挖掘重症肌无力风险通路,进而对任意两个通路进行关联分析.应用基因功能分析软件DAVID的Gene Ontology,对MG风险基因进行功能注释,以P＜0.01来判定注释是否有显著意义.结果:(1)本研究挖掘出97个重症肌无力的风险基因,KEGG基因富集分析共筛选出44条与重症肌无力显著相关的通路,主要包括多种自身免疫性疾病相关通路、信号转导相关通路、肿瘤相关通路、抗原的加工提呈通路等等.(2)以上44条风险通路两两通路间均具有相关性(P＜.0.01).结论:本研究共挖掘出44条重症肌无力风险通路,8个重症肌无力风险基因,分别为:NF-kB、TNFR、MEK、AP-1、Raf、MEK1/2、MSK1、TAPBP.其中,MEK同时出现在多个风险通路中,考虑其风险性更高.
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阿尔茨海默病相关风险基因及功能的研究进展
近年来,大规模的基因组学研究已经发现了阿尔茨海默病(AD)相关的风险基因.对于这些基因的分析显示,其作用主要集中于AD病理的免疫过程,尤其是对小胶质细胞活化的影响.本文着重对AD病理过程中具有显著影响的髓样细胞2触发受体(TREM2)、补体受体(CR)1、CD33和APOE进行综述,阐述4个基因的生物学功能以及在AD中的作用.
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瘦素基因启动子 C2549A 多态性位点基因与早发冠心病的相关性分析
目的：研究瘦素（leptin）基因启动子区 C2549A 的基因多态性与早发冠心病是否具有相关性，了解leptin 基因多态性与血浆 leptin 水平之间的关系，阐明该类患者 leptin 基因特点。方法：选取198例经冠脉造影证实为冠心病者为观察对象，以同期住院排除冠心病者95例为对照。所有患者测定 leptin 启动子 C2549A的基因型及 leptin 水平。结果：（1）早发冠心病组的血清 leptin 水平明显高于对照组。（2）早发冠心病组 AA 基因型分布频率明显高于对照组。（3）与其他基因型相比，2组中 AA 基因型人群的血清 leptin 水平均明显增高。结论：（1）leptin 基因启动子 C2549A 基因多态性位点 AA 基因型与早发冠心病的易感性有关，可能是早发冠心病发病的风险基因。（2）早发冠心病组中，AA 基因血清 leptin 水平明显高于 AC、CC，可能是高瘦素血症的分子遗传学机制之一。
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非酒精性脂肪性肝病风险基因SIRT3的关联验证和体内过表达效应研究
目的 研究肝脏脂肪酸氧化关键分子SIRT3编码基因变异与非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)发生的关系,并在小鼠体内研究人源SIRT3保护性等位型基因过表达对脂肪肝相关表型的影响.方法 建立非酒精性脂肪肝的人群研究队列,提取基因组DNA对编码区基因变异rs11246020进行基因分型,并与疾病发病与否做关联分析;建立小鼠NAFLD模型,在小鼠肝脏过表达人源SIRT3基因,8周后检测小鼠肝脏相关生化指标及肝脏HE染色、油红O染色情况,并提取RNA和蛋白采用Real-time PCR和Western blot检测Pparα、Acox1、cpt1a、cpt1b和SIRT3的转录或表达水平.结果 与对照组相比,SIRT3基因编码区错意突变rs11246020的GA+AA基因型在NAFLD组分布较低,而GG基因型分布较高,差异具有统计学意义(P＜0.05);在小鼠肝脏过表达人源SIRT3的A等位型基因后,肝脏脂肪蓄积降低,肝细胞空泡化程度降低,肝脏和血清游离脂肪酸以及肝脏甘油三酯、总胆固醇水平显著降低(P＜0.05),肝脏脂肪酸代谢相关基因Pparα和Acox1基因转录水平降低(P＜0.05).同时,小鼠体质量上升被有效控制(P＜0.05).结论 SIRT3基因变异rs11246020与NAFLD风险相关,小鼠体内过表达SIRT3可显著改善脂肪酸代谢和肝脏脂肪蓄积.
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多系统萎缩的遗传学研究进展
多系统萎缩(multiple system atrophy,MSA)是一种进行性神经系统退行性疾病.少突胶质细胞内包涵体是此病的特征性病理学标志物.长期以来,MSA被认为是散发性疾病,但近年来国内外报道了少数MSA家系,且研究发现其候选基因的某些变异可增加MSA的发病风险,这些表明遗传因素在MSA的发病机制中起着非常重要的作用.
