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系统生物学模式下的中风病研究对策
从系统生物学角度,在整体和系统的水平上阐释中风病病因病机多重复杂的特点,在其思维与研究模式下对中风病病证进行分析,并利用现代组学技术探讨中风病病因的物质基础,揭示中风病证候的机理,丰富中风病病机多元化的内涵,以期寻找中风病防治的病理环节及关键靶点,给中风病的现代化研究提供新思路与新策略.
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表皮生长因子受体对肝细胞增殖的调控作用
表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)属于受体酪氨酸激酶超家族成员,广泛表达于哺乳动物的各种组织细胞,是一多功能的膜蛋白.它能与多种配体结合而发生二聚化,从而调节细胞的生长、增殖和分化.在包括肺癌、膀胱癌和乳腺癌等多种组织中,存在EGFR信号通路的高度激活.近年来的研究表明,EGFR信号转导网络在肿瘤的发生和发展过程中发挥了重要的作用.新的研究表明,EGFR与肝细胞的增殖密切相关.
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肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中与细胞黏附相关的信号转导网络研究
目的 利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α(TNF-α)刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络.方法 利用肝癌细胞HepG2应对TNF-α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白-蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中的信号转导网络,并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究.结果 发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键转录因子,信号转导网络中的基因与细胞黏附密切相关,EGFR很可能是肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中调控细胞黏附的关键基因.结论 EGFR很可能在TNF-α引起的肝癌细胞迁移过程中发挥了关键作用.
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基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因
目的 挖掘潜在的心血管疾病风险基因,为疾病的预防、诊断和治疗提供一定的参考.方法 根据人类信号转导网络、心血管疾病相关的Toll样受体信号通路以及相关的表达谱信息,以网络motif及其包含的基因为研究对象,采用基因芯片显著性分析、网络motif筛选以及基因功能富集分析等方法对候选基因进行分析.结果 经分析得到21个潜在的心血管疾病风险基因,有12个为已知心血管疾病风险基因.结论 对所发现的潜在心血管疾病风险基因进行研究,以阐明心血管疾病发病机制有重要的生物学意义.
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子宫腺肌病在位内膜差异基因表达及信号转导网络构建
目的:探讨信使RNA(mRNA)在子宫腺肌病在位内膜组织中的差异表达情况,并构建差异基因间的信号转导网络.方法:收集4例子宫腺肌病患者的在位内膜组织及4例正常内膜组织.采用基因芯片检测mRNA表达,对差异表达的mRNA进行信号通路分析,得到差异基因参与的具有显著性、低误判率、靶向性的信号通路.基于KEGG数据库构建基因间的信号转导网络并得到网络中的关键基因.结果:子宫腺肌病在位内膜与对照内膜相比,有612个差异表达的mRNA,其中下调的有414个,上调的有198个.上调差异基因参与的显著性信号转导通路共40项,包括MAPK信号通路、局部黏附、黏附连接、PI3K-Akt信号通路等;下调差异基因参与的显著性信号转导通路共39项,包括DNA复制、细胞周期、细胞因子、细胞因子受体相互作用等.成功构建信号转导网络,得到网络中关键基因包括HDAC2和ACTN4等.结论:与正常内膜相比,子宫腺肌病在位内膜的mRNA存在明显的差异表达,可能与子宫腺肌病的发生发展密切相关.
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TGF-β的信号转导的调控
TGF-β家族通过调节靶基因的表达发挥作用,其细胞内信号转导通路是TGF-β的膜受体与靶基因之间的桥梁.TGF-β信号转导的调控是多层次、多水平的.凡能够调控以上信号转导过程中蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA相互作用的因子就能在各个环节上影响TGF-β家族的信号转导,从而产生多种多样的生物学效应.
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细胞外信号调节激酶5信号转导通道研究的新进展
作为一个开放系统,细胞具有极其复杂的生命活动,而这些生命活动又受细胞本身严密的调控机制所调节.为了与细胞外的环境和其他细胞之间进行信息交流,生物体在长期的自然选择和进化发展当中逐渐形成了一个复杂的信号转导网络.促分裂素原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)链是自然界生物体内普遍存在的信号转导系统之一,它在细胞的生存、增殖、分化和凋亡等生命活动周期的调控中发挥着极其重要的作用.
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血小板活化及其产物对类风湿关节炎的影响
类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病,主要是以血管翳的形成和滑膜炎为病理改变.研究发现血小板活化及其活化产物作为类风湿关节炎一个重要的病理变化和发病因素,贯穿在病程始终,对类风湿关节炎的发生发展极其重要.本文通过对血小板活化机制的分析以及对血小板活化产物与类风湿关节炎之间关系的分析,探讨血小板活化及其活化产物对类风湿关节炎的影响.
关键词: 类风湿关节炎 血小板活化 FAK/Calpain 信号转导网络 -
受体水平的细胞信号转导调节
众多的受体与G蛋白及效应器组成一个极为复杂的信号转导网络.在此网络中,任一部分的变化都可能影响到整个系统,从而引起相应生物学效应的变化.调控可发生在信号转导过程中从受体到发生生物效应的各个阶段,主要是在受体及效应器阶段.本文仅就受体水平上信号转导的调控因素做一简要综述.