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中国南方汉族急性淋巴细胞白血病与 HLA基因相关性研究
为了研究中国南方汉族急性淋巴细胞白血病与人类白细胞抗原HLA-A、B、DRB1基因的遗传相关性,找出ALL的易感基因,对以DNA作HLA基因分型的南方汉族人群的201例ALL患者进行甄选,并以4 707例南方汉族的志愿捐献造血干细胞的健康供者作为正常对照组,对两组间HLA等位基因多态性分布,通过HLA等位基因频率(GF)分布的x2检验、显著性差异进行比较,计算疾病的危险率(RR)、病因分数(EF)和预防分数(PF),研究ALL与HLA等位基因相关性.结果表明:南方汉族ALL患者的HLA-A26(GF=4.32%,x2=4.90,RR=1.774,EF=0.036),B56(GF=1.92%,x2=4.65,RR=2.116,EF=0.023),DR9(GF=1.29%,x2=3.99,RR=1.349,EF=0.092)3个基因频率显著高于正常对照组(P＜0.05);HLA-A30(GF=1.25%,x2=3.92,RR=0.415,PF=0.081),A33(GF=1.78%,x2=4.842,RR=0.612,PF=0.110)和B58(GF=1.83%,x2=7.21,RR=0.516,PF=0.149)3个基因频率显著低于正常对照组(P＜0.05).结论:HLA-A26、B56、DR9 3个HLA基因与ALL有较强的相关性,对南方汉族ALL患者可能有遗传易感作用;HLA-A30、A33、B58 3个基因可能是保护性基因.
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中国南方汉族人群20个常染色体STR基因座的多态性分析
目的 评估PowerPlex(R)21系统所含基因座的等位基因频率、法医学常用遗传学参数和系统效能.方法 对PowerPlex(R)21系统包含的20个常染色体STR基因座(D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S317、PentaE、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、PentaD、TH01、vWA、D21S11、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433、FGA)进行基因分型.统计2367个南方汉族无关个体中上述20个基因座的等位基因频率和遗传学参数,并将本研究人群的等位基因频率与文献报道的其他人群数据进行比较.结果 该系统各基因座的个体识别率为0.7839～0.9852,非父排除率为0.2974～0.8099.除D5S818基因座外,其余基因座均符合哈-温平衡.该系统的累积非父排除率和累积个体识别率均超过0.999 999 999 999 999 999 999 999999 999.南方汉族人群与8个少数民族(广西彝族、广西回族、广西苗族、贵州侗族、贵州苗族、青海土家族、青海回族、云南彝族)相比,等位基因频率有显著性差异.中国南方汉族人群和日本、菲律宾、韩国、北意大利和阿根廷等人群相比,在8-20个STR基因座上存在显著性差异.南方汉族人群与上述5组国外人群以及及3组文献报道的国内人群(北京汉族、浙江汉族、福建汉族)在D1S1656基因座上的等位基因频率均有显著性差异.Neighbor-joining系统发生树显示所有亚洲人群聚类为一个分支,意大利北部和阿根廷人群聚集成另一个独立的分支,南方汉族人群和云南彝族人群遗传距离较近.结论 PowerPlex(R)21系统的20个STR基因座在中国南方汉族人群具有较高的遗传多态性,可满足亲子鉴定、个体识别以及人类学研究的需求.
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南方汉族KIR-HLA系统基因多态性与慢性髓系白血病的相关性
目的 探讨中国南方汉族人群KIR-HLA系统基因多态性与慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)的相关性.方法 对172份成年CML患者及480份随机正常对照的样本,采用PCR-SSP方法检测KIR基因,用测序分型法进行HLA-A、-B、-C基因分型.从KIR基因及其基因组合型、HLA Ⅰ类配体、已知的单个KIR+ HLA受-配体组合及KIR-HLA基因型组合等4个层次比较病例组与对照组分子遗传多态性的差异.结果 与KIR2DL1配位的HLA-C2、KIR2DL1+ HLA-C2、与KIR3DL1配位的HLA-B Bw4-80I的检出频率均显著低于正常对照组,为CML保护因素(HLA-C2:OR=0.386,95％CI:0.240～0.620,P＜0.01;KIR2DL1-+ HLA-C2:OR=0.316,95％CI:0.191～0.525,P＜0.01;HLA-B Bw4-80I:OR=0.576,95％CI:0.384～0.862,P＜0.01).HLA-C2及HLA-B Bw4-80I分子表达机率降低,可能导致与相应的抑制性KIR亲和力的减弱,有利于NK细胞活化.值得注意的是:KIR-HLA基因型组合ID2(KIR AA1-HLA-C1/C1-Bw6/Bw6-A3/11)在CML组的检出频率显著高于正常对照组,为CML易感因素(OR=2.163,95％CI:1.198～3.906,P＜0.01).结论 本研究识别了KIR-HLA与CML白血病相关的易感或保护性因素,可为CML白血病的发病机制和个体化免疫治疗提供新的线索及理论依据.
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应用SBT直接测序分型法研究中国南方汉族人群HLA五个基因座单倍型
目的 研究中国南方汉族人群HLA-A、B、Cw、DRBl、DQBl等位基因多态性及单倍型的分布特征.方法 应用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)法对186名中国南方汉族健康人群HLA-A、B、Cw、DRBl、DQBl进行基因分型.结果 检出的HLA-A、B、Cw、DRBl、DQBl等位基因分别有28、49、24、29、20种.经统计分析A*0207-B*4601(10.81%),A*3303-B*5801(6.14%),B*4601-DRBl*0901(6.22%),B*4001*DRBl*0901(3.78%),DRBl*0901-DQBl*0303(12.16%)和DRBl*1202-DQBl*0301(8.38%)单倍型呈强连锁不平衡单倍型(RLF≥0.5,X<'2>>3.84,P<0.05);A*0207-B*4601-Cw*0102(10.75%),A*3303-B*5801-Cw*0302(5.14%),A*0207-B*4601-DR*0901(5.07%),A*3303-B*5801-DRBl*0301(2.96%),A*0207-B*4601-Cw*0102-DRBl*0901-DQBl*0303(4.87%)和A*1101-B*1301-Cw*0304-DRBl*1501-DQBl*0601(2.43%)单倍型分别是中国南方汉族人群常见单倍型.结论 中国南方汉族人群HLA 5个基因座单倍型分布具有高度的遗传多态性且有其自身分布特点.本研究获得的较完整的HLA 5个基因座单倍型分布数据,将为人类学、HLA疾病相关性和器官移植等研究提供遗传学参考数据.
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KIR3DL3等位基因多态性与南方汉族人群白血病的关联研究
目的 了解中国南方汉族人群KIR3DL3等位基因多态性与白血病的相关性.方法 收集急性髓系白血病患者(AML组,n=137)、急性淋巴细胞白血病患者(ALL组,n=141)以及健康无关志愿献血者(对照组,n=306)的血样(3组均为南方汉族),提取基因组DNA,应用本实验室设计的引物对KIR3DL3全部外显子进行测序分型,用As-sign 4.7.1软件判定基因型.使用SPSS 22.0统计软件对2个病例组与对照组中检出的每个KIR3DL3等位基因做差异性分析.结果 AML组、ALL组和对照组分别检出了12、14、16种等位基因.ALL病例组和对照组中KIR3DL3*004和*028等位基因的检出比例分别为12.77％(18/141)vs1.63％(5/306)与11.35％(16/141)vs 3.27％(10/306),(Pc＜0.05).AML病例组中检出的各等位基因的检出比例与对照组比较无明显差异(P＞0.05).结论 本组人群携带的KIR3DL3* 004、*028等位基因为中国南方汉族人群发生ALL的易感因子.
