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2014年浙江省丽水市人感染H7N9禽流感病毒分离株基因特征分析

王晓光;雷永良;叶碧峰;茅海燕;孙逸

摘要: 目的 测定浙江省丽水市1株H7N9禽流感病毒8个基因序列,从分子水平分析其基因特征和遗传变异特点.方法 对入感染H7N9禽流感确诊病例标本在P3实验室进行犬肾传代细胞培养;反转录-聚合酶链反应扩增病毒8个RNA片段后测定基因序列;通过生物信息学软件将8个序列与GISAID和GenBank数据库下载的序列进行多重比对和匹配,发现基因特征,分析病毒关键位点的分子变异情况,大似然法绘制系统进化树用于基因进化分析.结果 从病例标本中分离到病毒:A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9),测序获得8个基因核苷酸全序列.HA裂解位点只包含2个碱性氨基酸,HA蛋白受体结合关键氨基酸位点发生A134T、G186V和Q226L变异;在PB2蛋白上发现E627K突变;M2蛋白上发现耐药位点S31N.LS01株HA基因与A/chicken/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9)的同源性高(98.90%),NA基因与A/chicken/Changzhou/C08/2013(H9N9)的同源性高(98.60%),LS01株其他6个编码内部蛋白的基因均与禽源H9N2株高度同源(99.10% ~99.89%).LS01株HA和NA基因与沪苏浙一带流行的H7N9禽流感病毒株位于同一亚分支,有着直接的进化关系,在相近地域有进化关系较近的禽类流感病毒存在.结论 A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株8个基因序列均符合禽源H7N9亚型禽流感病毒特征,其病原基因均为禽类来源.HA裂解位点具有低致病性禽流感病毒基因特点,Q226L和E627K位点发生变异可能与其对人具有高致病力相关.

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