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基于核心家系的XRCC1基因多态性与鼻咽癌易感性的关联分析
目的 利用以核心家系为基础的关联研究探讨X射线修复交叉互补基因1(XRCC1)多态性与鼻咽癌易感性之间的关系.方法 收集457个广东鼻咽癌核心家系(包含2134名成员)作为研究对象.每一个家系由父母和至少有1名患鼻咽癌的子女构成.采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法对XRCC1基因中3个单核苷酸多态性(SNP)位点(其参考SNP编号分别为rs1799782、rs25489和rs25487)进行基因分型.运用家系为基础的相关性检验(family-based association test,FBAT)软件分析这3个SNP位点基因型及单体型与鼻咽癌易感性之间的关联性.结果 FBAT 分析结果显示:XRCC1基因的3个SNP位点基因型及单体型与鼻咽癌的易感性之间无显著相关性(rs1799782:x2=1.006,P=0.605;rs25489:x2=0.470,P=0.790;rs25487:x2=2.563,P=0.278;单体型:x2=3.004,P=0.557;全局统计).基于显性或隐性模式下,rs25487位点等位基因G或A从亲代传递给子代具有增加或减少的传递(Z=1.985/-1.985,P=0.047);然而,全局统计以及基于累加模式下并没有观察到传递的增加或减少.结论 以家系为基础的相关性研究没有发现XRCC1基因多态性与鼻咽癌的易感性之间具有显著相关性.
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热休克蛋白B1基因、肿瘤抑制蛋白p53基因多态性与焦炉作业工人染色体损伤的关联及其交互作用分析
目的：探讨热休克蛋白B1基因（HSPB1）启动子区多态性位点rs2868371和肿瘤抑制蛋白P53基因（TP53）基因多态性位点rs1042522与焦炉作业工人染色体损伤的关联及其交互作用。方法于2010年9—10月，选取武汉市某焦化厂1333名男性焦化厂工人作为调查对象，以其中在辅助车间、炉底、炉侧和炉顶等场所工作的工人作为暴露组，共949名；在办公室场所工作的行政、医务人员作为对照组，共384名。收集调查对象的人口学信息并采集外周静脉血5 ml，分别运用ELISA和胞质分裂阻滞试验测定其血浆苯并[a]芘二氢二醇环氧化物-白蛋白（BPDE-白蛋白）加合物的浓度和外周血淋巴细胞微核率，采用TaqMan探针技术和ABI Prism 7900HT型荧光定量PCR仪进行SNP分型检测，并计算频率比（FR）及其95%CI值。结果暴露组中，携带rs2868371 GG基因型者外周血淋巴细胞微核率为（3.52±2.67）‰，均低于携带GC、CC及GC+CC基因型者[分别为（3.88±2.88）‰、（4.00±2.66）‰和（3.91±2.83）‰]（FR值分别为1.10、1.13、1.11，95%CI值分别为1.02~1.19、1.02~1.25、1.03~1.19），且rs2868371 C有明显的等位基因剂量-效应关系（P趋势=0.006）；携带rs1042522 CC基因型者微核率为（3.95±3.06）‰，均高于携带CG以及CG+GG基因型者[分别为（3.63±2.61）‰、（3.66±2.61）‰]（FR值分别为0.87、0.90，95%CI值分别为0.83~0.96、0.84~0.97）。HSPB1 rs2868371和TP53 rs1042522对外周血淋巴细胞微核率水平存在交互作用（P交互=0.001）。年龄>40岁（FR=1.07，95%CI：1.01~1.12）、工龄>20年（FR=1.08，95%CI：1.02~1.14）、BMI≤24 kg/m2（FR=1.07，95%CI：1.01~1.13）、饮酒（FR=1.09，95%CI：1.02~1.16）以及高BPDE-白蛋白水平（FR=1.07，95%CI：1.01~1.13）者HSPB1 rs2868371 C等位基因与微核率的增加均具有等位基因剂量-效应关系（P趋势分别为0.023、0.013、0.029和0.020）；年龄>40岁（FR=0.94，95%CI：0.89~0.99）、BMI≤24 kg/m2（FR=0.94，95%CI：0.88~0.99）以及饮酒（FR=0.94，95%CI：0.88~1.00）者TP53 rs1042522 G等位基因与微核率的降低均具有等位基因剂量-效应关系（P趋势分别为0.031、0.023和0.038）。HSPB1 rs2868371与年龄和工龄在影响外周血淋巴细胞微核率上存在交互作用（P交互值分别为0.030和0.013）。结论 HSPB1 rs2868371 C等位基因与焦炉工染色体损伤水平增加有关联，TP53 rs1042522 G等位基因与焦炉工染色体损伤水平降低有关联，且上述两个SNP位点在影响焦炉工的染色体损伤水平上具有交互作用。
关键词： 多态性 单核苷酸 HSP27热休克蛋白 肿瘤抑制蛋白质p53 焦炉工 -
细胞色素P450 CYP1A1基因多态与鼻咽癌易感性的关联分析
目的 利用以核心家系为基础的关联研究探讨细胞色素P450酶系(cytochrome P450,CYP450)CYP1A1基因m1和m2多态性并分析其与鼻咽癌易感性的关联.方法 收集457个广东鼻咽癌核心家系(每个核心家系由患者和父母或同胞构成)共2134名成员作为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对CYPlAl基因单核苷酸多态性(SNP)位点m1和m2(其参考编号分别为rs4646903和rs1048943)进行基因分型.挑选PCR产物测序验证.运用家系为基础的相关性检验(family-based association test,FBAT)软件分析这两个多态位点的基因型及其单体型与鼻咽癌易感性的关联.结果 FBAT软件分析结果 显示,位点m1和m2的微效等位基因频率(MAF)分别为0.442(C)和0.339(G).其中无论是否根据EB病毒壳抗原抗体(VCA-IgA)分层,m1位点与鼻咽癌的易感性之间关联均无统计学意义[未分层:X2=2.399,P=0.301;分层后:低滴度组(VCA-IgA<1:80),MAF=0.457(C),X2=1.221,P=0.543;高滴度组(VCA-IgA≥1:80),MAF=0.427(C),X2=2.832,P=0.243];对m2位点来说,末根据VCA-IgA分层时,该位点与鼻咽癌的易感性之间关联无统计学意义(X2=2.694,P=0.260).分层后,在低滴度组,累加和显性模式下,位点m2等位基因G显示了从亲代到子代传递减少[MAF=0.347(G);Z<,累加>=-2.120,P<,累加>=0.034;Z显性=-2.303,P显性=0.021],全局统计也提示了传递的改变(X2=5.394,P=0.067);由这两个位点构建的单体型TG(0.057)可能降低鼻咽癌的发病风险(Z=-2.002,P=0.045),全局统计也提示CYP1A1基因单体型可能与鼻咽癌易感性有关系(X2=7.067,P=0.070).结论 以家系为基础的相关性研究发现CYP1A1基因多态位点m1与鼻咽癌的易感性之间关联无统计学意义,位点m2基因多态性可能与鼻咽癌的发病风险降低有关系.
关键词： 鼻咽肿瘤 细胞色素P450 CYP1A1 多态性 单核苷酸 统计学 -
烟熏肉类摄入和磺基转移酶基因多态性与乳腺癌患病风险的病例对照研究
目的 分析磺基转移酶1A1( Sulfotransferase 1A1,SULT1A1)基因多态性、烟熏肉类摄入及二者联合作用与乳腺癌的关系.方法 收集四川省某肿瘤医院2007年5月至2009年7月经组织病理学诊断为原发性乳腺癌的汉族女性新发病例400例,作为病例组;以成都市某医院健康体检的400名健康女性作为对照组.通过问卷调查收集研究对象的一般人口学特征、乳腺癌相关危险因素,采用半定量频数调查表调查研究对象各类食物摄入量,采用残差法计算能量校正的烟熏肉类每日摄入量,通过测序法确定SULT1A1基因型,以多因素条件logistic回归分析SULT1A1基因多态性、烟熏肉类摄入水平以及二者联合暴露与乳腺癌的关系.结果 病例组和对照组能量校正烟熏肉类摄入量的中位数(第25百分位数,第75百分位数)分别为8.65(3.63,18.44)、4.44(0.19,8.71 )g/d.病例组SULT1A1突变等位基因携带率为14.63％( 59/400),对照组为12.75％ (51/400).烟熏肉类高摄入(≥4.44 g/d)可增加绝经前(0R=2.31,95％CI:1.46 ～3.66)、绝经后(OR=3.13,95％ CI:1.89～5.17)女性乳腺癌患病风险.烟熏肉类高摄入和携带SULT1A1 His突变等位基因可协同增高绝经前(0R=3.31,95％ CI:1.66 ～6.62)以及绝经后(OR=3.81,95％CI:1.79～8.10)女性乳腺癌患病风险.结论 烟熏肉类高摄入可增加乳腺癌的患病风险,携带SULT1A1突变等位基因可增加烟熏肉类暴露者的乳腺癌患病风险.
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谷胱甘肽过氧化物酶1和硫氧还蛋白还原酶2遗传变异与胃癌易感性的相关性
目的 探讨谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX1)第198位氨基酸Pro→Leu和硫氧还蛋白还原酶2(TXNRD2)第370位氨基酸Lys→Arg遗传变异单独或联合与胃癌易感性的关系.方法 采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法,检测361例胃癌患者和363例无肿瘤正常对照的基因型,用logistic多因素分析计算各基因型以及基因-基因交互作用与胃癌易感性的相关性.结果 GPXl 198Pro→Leu和TXNRD2 370Lys→Arg变异单独与胃癌易感性无关.但GPX1和TXNR2基因型存在基因一基因交互作用,携带GPX1 198Pro/Pro和TXNRD2 370Arg/Arg这种保护基因型者患胃癌的风险比携带其他危险基因型者低62%(OR=0.38,95%C/:0.26～0.55,P＜0.001).结论 GPX1198Pro→Leu和TXNRD2 370Lys→Arg基因型可能与胃癌的易感性相关.
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白细胞介素10基因多态性与子宫内膜异位症易感性的关系研究
目的 分析子宫内膜异位症(endometriosis,EMs)患者白细胞介素10(interleukin-10,IL-10)的启动子区域转录起始位点上游第1082位点G→A、819位点C→T及592位点C→A多态性,探讨其与EMs易感性之间的关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测EMs组214例和正常对照组160名健康人的启动子区域转录起始位点上游的第1082位点G→A、819位点C→T及592位点C→A碱基转换,采用SPSS11.0软件包统计分析各位点的基因型分布和等位基因频率.结果 IL-10-1082位点的多态性在EMs组(AA:87.90%;GA:12.10%)与对照组(AA:87.50%;GA:12.50%)的基因频率差异无统计学意义(x2=0.01,P=0.919).EMs组和对照组的IL-10-819 TT、CT、CC型基因频率均依次等同于IL-10-592的AA、CA、CC基因型.IL-10-819和-592基因型在EMs组分布(TT或AA:41.12%;CT或CA:47.66%;CC:11.21%)与对照组(TT或AA:53.75%;CT或CA:37.50%、CC:8.75%)差异无统计学意义(x2=5.87,P=0.053).但患者组IL-10-819的CT及-592的CA基因型频率较对照组增高,差异有统计学意义(校正后OR=1.88,95%CI=1.10～3.21,x2=5.24,P=0.021),-819和-592位点的C等位基因与EMs发病风险具有显著相关性(OR=1.42,95%CI=1.04～1.95,x2=4.81,P=0.028).EMs组IL-10-819(-592)位点的CC(CC)、CT(CA)基因型患者的血清中IL-10水平较TT(AA)基因型高[CA/CT:(50.12±82.40)pg/ml,CC(91.00±118.23)pg/ml,TT/AA(21.45±22.10)pg/ml],差异有统计学意义(F=2.492,P=0.048;F=1.852,P=0.008).结论 IL-10-592C及-819C等位基因与IL-10高表达相关,并与EMs的易感性具相关性,也与EMs的发病风险相关.
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丝氨酸苏氨酸激酶-15和基质金属蛋白酶-2基因多态与蒙古族人食管癌易感性相关
目的 探讨中国汉族人群中食管癌遗传易感性相关的功能性单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)与蒙古族人群中食管癌发病风险的关系,并比较这些遗传变异在汉族人群和蒙古族人群中的等位基因频率分布差异.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-based restriction fragment length polymorphism assay,PCR-RFLP)方法,检测了188例蒙古族食管癌患者和324名蒙古族正常对照者的FAS-670G/A、FAS-1377G/A、FASL-844T/C、COX-2-1290A/G、COX-2-1195G/A、STK15 Phe31lie、MMP-2-1306C/T和MMP-2-735C/T共8个多态位点的基因型频率.采用多因素logistic回归模型计算各基因型携带者食管癌的发病风险.并将以上结果 与已报道的汉族人群中的结果 进行比较.结果 在蒙古族人群中,与携带STK1531Ile/Ile基因型者相比,携带STK15 31Phe/Phe者罹患食管癌的相对危险性增加(校正OR=2.20,95%C/值:1.12～4.31).携带MMP-2-735TT基因型者罹患食管癌的危险性明显高于携带-735CC基因型者(校正OR=4.82,95%C/值:1.59～14.60),未发现其他遗传变异与食管癌的患病风险相关.我国蒙古族和汉族人群间FASL-844 T/C[0.264(171/648)/0.736(477/648),0.323(418/1296)/0.677(878/1296)]、COX-2-1195G/A[0.431(279/648)/0.569(369/648),0.492(1250/2540)/0.508(1290/2540)]、MMP-2-1306C/T[0.869(563/648)/0.131(85/648),0.835(1298/1554)/0.165(256/1554)]和MMP-2-735C/T[0.789(511/648)/0.211(137/648),0.748(1163/1554)/0.252(391/1554)]等位基因频率分布差异有统计学意义(x2值分别为7.03、7.84、3.94、4.05,P值均<0.05).结论 STK15 Phe31Ile多态和MMP-2-735C/T可能是我国蒙古族人群食管癌的遗传易感因素.我国蒙古族和汉族人群的遗传差异导致不同SNP与食管癌发病风险关联情况存在差别.
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育龄妇女叶酸代谢通路关键酶基因多态性对血浆同型半胱氨酸水平的影响
目的 观察育龄妇女叶酸代谢通路关键酶基因多态性对血浆同型半胱氨酸水平的影响.方法 2012年通过整群抽样方法抽取535名江苏省绍兴市年龄为20～ 45岁之间的育龄妇女,平均年龄为28.2(95％ CI:27.8 ～28.6)岁.抽取静脉血5ml,加入抗凝剂EDTA或柠檬酸钠连续采集样本7d,共采集1 465名调查对象血样,分离血细胞后,采用离心柱法进行DNA提取.然后对采集到的样本进行叶酸代谢关键酶基因多态性检测及血浆同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)水平分析,分析不同位点基因型的Hcy差异.结果 共检测了调查对象MTHFR、MS、MSR和CBS基因上的8个单核苷酸多态性(SNP)位点.MTHFR基因上的rs1801131位点基因型AA的Hey平均浓度(8.99 μmol/L)高于CC(7.81μmol/L)及CA(8.38 μmol/L)型,P＜0.01.MTHFR基因上的rs1801133基因型为TT的调查对象Hcy平均浓度(11.10 μmol/L)高于CC(8.15 μmol/L)及CT(8.45 μmol/L)型,P＜0.01.该两个位点的基因型组合AA-TT会导致Hcy浓度的升高(11.02μmol/L),均高于其他基因型组合,特别是CC-CC基因型组合(7.83 μmol/L),风险系数是该基因型的1.41 (95％ CI:1.20～1.66)倍.结论 MTHFR基因上的rs1801131和rs1801133的基因突变可导致Hcy水平升高.
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中国土拉弗朗西斯菌B型亚种新亚型的发现与溯源分析
目的 对于北京市1例疑似土拉热病例,进行实验室诊断和溯源分析.方法 2012年7月19日北京市报告1例疑似土拉热病例.从病例血液样本中提取基因组DNA后,采用土拉弗朗西斯菌(土拉菌)3种特异基因(fopA,tul4和16S rRNA)和两种基因分型引物(C1C4和RD1),进行PCR检测并对扩增子测序.另外两个实验室分别平行进行了fopA的PCR扩增和测序.同时采用4个靶位点(fopA、ISFtul2、23kDa和tul4)进行荧光定量PCR检测,并采用11个规范的SNP和4个插入/缺失进行系统进化分析.结果 3种特异基因均得到阳性扩增,测序后得到的片段大小分别为409、407和1 053 bp,经序列比对,显示病例感染的是土拉菌.两种基因分型引物扩增后分别得到了151和924 bp的序列,根据片段长度可判定病例感染的土拉菌为B型亚种.另外两个实验室对于opA的PCR扩增和测序,均得到了阳性结果.4个靶位点的荧光定量PCR检测也均得到了阳性结果,fopA、ISFtul2、23kDa和tul4位点的Ct值分别为30、25、28和30.系统进化分析显示,本研究中土拉菌和俄罗斯来源的土拉菌聚在一个分支上,为B3亚型.结论 该病例确定为土拉热病例,本研究在中国发现了土拉菌B型亚种的一个新亚型.
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环氧化酶2遗传变异与吸烟交互作用影响肺癌易感性
目的 探讨环氧化酶2(COX2)启动子区-1195G＞A遗传变异与肺癌遗传易感性的关系以及与吸烟的交互作用.方法 以2000年1月至2008年12月在中国医学科学院肿瘤医院就诊的956例肺癌患者作为病例组；健康对照来自同期北京市健康体检个体,以无肿瘤病史和体征者作为对照组,共994名.研究对象均为汉族,无年龄、性别限制.对照组与病例组相匹配.经知情同意,每名研究对象均采集2 ml外周血,以PCR-限制性片断长度多态性方法对研究对象进行基因分型,并且调查了对象的吸烟情况.以logistic回归法计算COX2-1195G＞A变异各基因型影响肺癌发病风险的OR值及95％ CI.结果 对照组、病例组基因分型为COX2-1195AA者分别占24.9％ (247/994)、28.3％ (271/956).与-1195GG基因型携带者相比,-1195AA基因型携带者肺癌的发病风险增加1.36倍(95％ CI:1.03～ 1.79).以吸烟进行分层分析,在吸烟人群中,携带COX2-1195AA基因型者,肺癌的发病风险明显增高,其OR(95％ CI)为1.56(1.08 ～2.25)；在非吸烟组,未发现肺癌发病风险在不同基因型之间的差异(OR=1.17;95％ CI:0.77 ～ 1.61).在重度吸烟者(＞20包/年)中,-1195AA和-1195AG基因型携带者发生肺癌风险分别是-1195GG携带者的1.85倍(95％ CI:1.16 ～2.95)和1.62倍(95％CI:1.08 ～2.43)；在轻度吸烟者(≤20包/年)中,-1195AG和AA基因型携带者发生肺癌风险的OR(95％ CI)分别为0.78(0.47 ～ 1.30)和1.08(0.60～1.94).结论 COX2启动子区遗传变异对肺癌发病风险的相关性和环境因素密切相关.
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核因子E2相关因子2基因启动子多态性对酒精性肝病小鼠感染创伤弧菌的影响
目的 探讨核因子E2相关因子2(nrf2)基因启动子336位点多态性对酒精性肝病小鼠感染创伤弧菌的影响.方法 取C57B6雄性小鼠,简单随机抽样法分为正常喂养组(A组,10只)、酒精性肝病组(B组,10只)、正常喂养且腹腔注射感染创伤弧菌组(C组,8只)、酒精性肝病感染创伤弧菌组(D组,110只),以基因测序法检测D组小鼠nrf2基因启动子336位点多态性,分为非突变组(336T)(D1组,7只)及突变组(336C)(D2组,10只).应用RT-PCR、Western-blotting、ELISA检测各组小鼠肝组织nrf2、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素-10(IL-10)及高迁移率族蛋白B1(HMGB1)的基因及蛋白水平,观察小鼠肝组织病理变化.结果 A、B、C、D1、D2组小鼠在感染创伤弧菌48 h后肝组织nrf2基因的mRNA表达量中位数分别为0.115、0.173、0.211、0.764、0.352 (χ2=40.64,P<0.05);IL-10基因的mRNA表达量中位数分别为0.338、0.637、1.002、1.825、1.403(χ2=41.05,P<0.05);TNF-α基因的mRNA表达量中位数分别为0.140、0.254、0.372、0.399、0.699(χ2=38.16,P<0.05);HMGB1基因的mRNA表达量中位数分别为0.230、0.410、0.668、0.508、1.021(χ2=31.45,P<0.05).A、B、C、D1、D2组小鼠在感染创伤弧菌48 h后肝组织nrf2基因的蛋白表达量中位数分别为0.908、1.461、2.061、3.982、2.243(χ2=33.72,P<0.05);IL-10基因的蛋白表达量中位数分别为13.97、22.54、30.14、57.98、41.53(χ2=37.31,P<0.05);TNF-α基因的蛋白表达量中位数分别为114.07、142.94、175.44、174.60、266.11(χ2=32.29,P<0.05);HMGB1基因的蛋白表达量中位数分别为2.01、6.05、9.62、6.24、12.89(χ2=36.94,P<0.05).与A组比较,B组可见大量散在脂肪滴,呈空泡样改变,C组可见炎症细胞浸润,肝细胞条索紊乱,D组可见肝细胞充血水肿,肝小叶完整性破坏,汇管区可见扩张的肝管和静脉.结论 nrf2基因启动子336位点T→C突变使酒精性肝病C57B6小鼠体内nrf2表达明显降低,并加剧酒精性肝病C57B6小鼠在感染创伤弧菌时的炎症反应及脏器损害.
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调控microRNA成熟的通路基因标签单核苷酸多态性与原发性肝癌易感性的关系
目的 研究调控microRNA成熟的通路基因(DICERI、RAN及GEMIN4基因)标签单核苷酸多态性(tSNP)与原发性肝癌遗传易感性的相关性.方法 采用1∶1配对病例-对照研究,将2008年9月至2010年12月在郑州某两个教学医院就诊的532例原发性肝癌患者纳入病例组,将532名健康个体纳入对照组,对其进行面对面调查并采集外周静脉血5ml.从DICER1、RAN及GEMIN4基因中筛选tSNP,采用PCR-RFLP或等位基因特异PCR技术对研究对象进行基因分型,应用多因素条件logistic回归及多因素降维法(MDR)分析tSNP与原发性肝癌易感性的关系及其与环境因素的交互作用.结果 在所筛选的DICER1、RAN及GEMIN4基因tSNP中,rs14035位点CC、CT、TT基因型在病例组中的频率分别为67.29％ (358/532)、28.20％ (150/532) 、4.51％ (24/532),在对照组的频率分别为70.30％(374/532)、28.20％ (150/532)、1.50％( 8/532)(x2=8.35,P ＜0.05)；rs1045491位点GG、GA、AA基因型在病例组中的频率分别为71.05％ (378/532)、26.69％( 142/532)、2.26％(12/532),在对照组的频率分别为80.45％(428/532)、18.42％(98/532)、1.13％(6/532)(x2 =13.17,P＜0.01)；rs2291778位点GG、GT、TT基因型在病例组中的频率分别为53.38％( 284/532)、40.23％(214/532)、6.39％( 34/532),在对照组的频率分别为25.94％ (138/532)、63.91％(340/532)、10.15％( 54/532)(x2=83.71,P＜0.01).rs14035位点TT基因型(OR=2.54,95％CI:1.19 ～6.32)、rs1045491位点GA基因型(OR=1.74,95％CI:1.08 ～2.66)是原发性肝癌的易感基因型,rs2291778位点的GT基因型(OR =0.52,95％ CI:0.43～0.75)和TT基因型(OR=0.62,95％CI:0.46 ～0.86)是原发性肝癌的非易感基因型.单体型分析显示,单体型3 (AACTGGGT)(OR=1.42,95％CI:1.10～1.82)和单体型5(AGCCAGCC)( OR=1.36,95％ CI:1.02～1.80)可增加肝癌发病风险,而单体型2( AACTATCC)(OR=0.69,95％CI:0.52 ～0.91)和单体型6(AACTGTGT)(OR =0.61,95％ CI:0.45～0.81)可降低原发性肝癌发病风险.具有rs1045491(等位基因A)、rs14035(等位基因T)和HBV感染的交互组合的人群是原发性肝癌的高发人群(OR=3.72,95％ CI:2.38～ 5.56).结论 rs14035位点TT基因型、rs1045491位点GA基因型是原发性肝癌的易感基因型,rs2291778位点T等位基因是原发性肝癌的非易感等位基因.多位点多基因联合作用对于原发性肝癌的发生可能具有协同作用.
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焦炉作业工人核苷酸剪切修复酶基因多态性与染色体损伤的关系
目的 研究核苷酸剪切修复酶基因多态性与焦炉作业工人外周血淋巴细胞染色体损伤易感性的关系.方法 以140名焦炉作业工人(暴露组)和66名医务人员(对照组)作为研究对象,测定尿中1-羟基芘浓度反映多环芳烃暴露内剂量,用双核淋巴细胞微核评价个体外周血淋巴细胞染色体损伤,采用聚合酶链-限制性片段长度多态性方法 分析ERCC1、ERCC2、ERCC4、ERCC5、ERCC6基因多态性,多元统计方法 分析不同基因型与染色体损伤水平的关系.结果 在校正年龄、性别、mEH基因型、自然对数转换后的尿1-羟基芘水平后,暴露组中ERCC1基因19007位点CC基因型个体微核率[(1.05±0.68)%]显著高于CT基因型[(0.81±0.66)%](P=0.01),或TT[(0.66±0.37)%](P=0.05),或CT+TT基因型个体[(0.75±0.63)%](P=0.004).ERCC6基因3368位点AA基因型个体微核率[(1.00±0.69)%]显著高于AG[(0.67±0.42)%](P=0.05),或AG+GG基因型个体[(0.66±0.41)%](P=0.02).进一步按焦炉工年龄均数(39.1岁)分层,发现在高年龄组ERCC1 C19007T和ERCC6 A3368G位点多态性与染色体损伤水平相关联;另外,高年龄组中ERCC2 G23591A位点GA基因型个体微核率[(1.40±0.63)%]高于GG基因型个体[(0.98±0.59)%](P=0.01).结论 ERCC1 C19007T、ERCC6 A3368G以及ERCC2 G23591A位点的多态性能够影响职业性多环芳烃暴露导致的外周血淋巴细胞染色体损伤水平.
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白细胞分化抗原-40基因SNP及其血清水平与缺血性脑卒中的相关性
目的：研究白细胞分化抗原-40(CD40)基因SNP及其血清水平与缺血性脑卒中(IS)易感性之间的关系。方法选择2013年5月至2014年11月就诊于百色市某医院的缺血性脑卒中患者作为病例组,共202例。以同一时期在该医院门诊部进行体检的109名健康人群作为对照组。所有调查对象均来自广西壮族自治区，且相互间无血缘关系。经知情同意，每名调查对象均采集空腹静脉血3 ml，用单碱基延伸的PCR技术对CD40基因rs1883832 C/T、rs13040307 C/T、rs752118 C/T和rs3765459 G/A多态性进行基因分型，同时采用ELISA检测血清CD40水平。采用t检验比较CD40血清水平在病例组与对照组间的差异及病例组中各位点不同基因型间的差异；采用χ2检验比较CD40基因不同位点基因型及等位基因在病例组和对照组中的分布差异，并以OR(95%CI)值表示相对风险。结果病例组CD40基因rs1883832 C/T位点CC、CT、TT基因型频率分别为21.78%（44/202）、49.51%（100/202）、28.71%（58/202），对照组分别为33.17%（66/199）、48.74%（97/199）和18.09%（36/199），两组差异有统计学意义（χ2=9.57，P=0.008）。病例组CD40血清水平为(62.7±24.5) pg/ml，高于对照组[(45.3±17.2) pg/ml]（t=8.97，P<0.001）；病例组中rs1883832 C/T位点TT、CT基因型CD40血清水平分别为（65.9±26.3）、（64.3±25.9）pg/ml，均高于CC基因型CD40血清水平[（55.1±23.7）pg/ml]（t值分别为5.34和5.03，P值均<0.001）。与rs1883832 C/T位点C等位基因携带者相比，T等位基因携带者患缺血性脑卒中的风险增加(OR=1.56,95%CI：1.18~2.06)。联合基因型分析后发现，与对照组比较，病例组TCCA单倍型的携带者增加了缺血性脑卒中的发病风险(OR=2.49，95%CI：1.13~5.48)。结论 CD40基因rs1883832 C/T位点和TCCA单倍型与缺血性脑卒中的发病可能存在相关性，其中缺血性脑卒中的遗传易感基因可能是T等位基因。
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细胞色素P450 2E1基因PstⅠ多态、腌制品与大肠癌关系的病例对照研究
目的研究代谢酶细胞色素P450 2E1基因(CYP2E1)PstⅠ多态性和腌制品与大肠癌易感性的关系.方法采用人群基础的病例对照分子流行病学研究和PCR-RFLP技术,对126例大肠癌和343名健康对照PstⅠ识别的CYP2E1基因型进行检测.结果健康对照组CYP2E1基因野生型(C1/C1)为61.8%,杂合子(C1/C2)为35.8%,突变纯合子(C2/C2)为2.4%.调整年龄性别后,结肠癌病例中突变基因型频率54.9%(52.9%C1/C2和2.0%C2/C2)高于对照(OR 1.979,95%CI 1.090～3.595),但直肠癌病例与对照比较,无统计学意义.分层分析发现,突变基因型、每周1或2次和隔天或每天吃腌制品单因素作用的大肠癌OR值分别1.935、2.122和2.315,而每周1或2次+突变型、隔天或每天吃+突变型联合作用后大肠癌OR值分别为2.272和3.127.分别分析结、直肠癌,腌制品对直肠癌的危险性在食用频率为每周1或2次时,差异有统计学意义,野生型和突变型的OR值分别为2.646和2.297,两者差异无统计学意义;而结肠癌危险性只有在PstⅠ突变者隔天或每天吃腌制品时才剧增,OR值4.262(1.395～13.017),为野生型的2.69倍,差异有统计学意义.结论CYP2E1PstⅠG→C点突变是大肠癌的遗传易感性因素,与腌制品有协同作用,该作用在结肠癌尤为明显.
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X线修复交叉互补基因194和399两位点多态性与乳腺癌易感性
目的 探讨中国女性人群DNA修复基因X线修复交叉互补基因1(XRCC1)Arg194Trp、Arg399Gln多态与乳腺癌易感性的关系.方法 采用病例对照研究设计,包括经组织病理学确诊的女性乳腺癌患者698例和按地区、年龄频数匹配的对照人群813名,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法进行多态性检测,应用logistic回归计算OR值及95%CI值,运用Meta分析估计Arg399Gln与中国女性人群乳腺癌危险性的关联.结果 XRCC1基因194位点3种基因型Arg/Arg、Arg/Trp、Trp/Trp及Arg/Trp+Trp/Trp在病例组分布频率分别为48.81%(327/670)、39.85%(267/670)、11.34%(76/670)和51.19%(343/670),在对照组中分别为48.80%(387/793)、41.99%(333/793)、9.21%(73/793)和51.20%(406/793).与Arg/Arg比较各基因型的校正OR值(95%CI值)分别为0.98(0.75～1.28)、1.17(0.76～1.80)、1.09(0.86～1.40).399位点Arg/Arg、Arg/Gln、Gin/Gin和Arg/Gln+Gin/Gin基因型频率在病例组分别为52.40%(349/666)、38.29%(255/666)、9.31%(62/666)和47.60%(317/666),对照组分别为52.22%(412/789)、38.53%(304/789)、9.25%(73/789)和47.78%(377/789).与Arg/Arg比较各基因型的校正OR值(95%CI值)分别为0.93(0.63～1.08)、0.96(0.42～1.09)、0.91(0.62～1.05).未见两位点多态与乳腺癌危险性之间存在关联.分别以绝经状况、哺乳、生育、口服避孕药史进行分层,未发现两多态位点与乳腺癌危险性的显著关联.Meta分析结果提示Arg399Gln位点与中国女性乳腺癌无相关性(OR=0.97,95%CI:0.85～1.10).结论 XRCC1基因Arg194Trp和Arg399Gln多态性可能不是中国女性人群乳腺癌的易感性标志物.
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过氧化物酶体增殖物激活受体的基因-基因交互作用对高甘油三酯血症的影响
目的 探讨过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)与高甘油三酯血症的关联及基因-基因的交互作用.方法 研究对象来自“江苏省多代谢异常和代谢综合征综合防治研究”队列人群.于2009年对随访得到的4083名对象采用单纯随机抽样的方法抽取了820名研究对象,于基线和随访时采集空腹8h静脉血11 ml.对研究对象的基线血标本进行PPARα、PPARδ、PPARγ的基因多态性检测,并对随访得到的血标本进行血脂检测.使用logistic回归模型分析不同SNP与高甘油三酯血症的关联,并采用广义多因子降维法(GMDR)模型分析基因-基因的交互作用.结果 调查对象中非高甘油三酯血症者474名,高甘油三酯血症者患者346例.rs 1800206位点的LL、LV、VV的基因型频数在高甘油三酯血症组分别为211(61.0％)、132(38.2％)、3(0.9％),在非高甘油三酯血症组分别为411(86.7％)、59(12.4％)、4(0.8％) (x2 =74.18,P ＜0.01),Ⅴ等位基因频数在高甘油三酯血症组和非高甘油三酯血症组分别为138( 19.9％)和67(7.1％) (x2 =60.62,P＜0.01)；rs2016520位点的TT、TC、CC的基因型频数在高甘油三酯血症组分别为177(51.2％)、154(44.5％)、15(4.3％),在非高甘油三酯血症组分别为211(44.5％)、212(44.7％)、51(10.8％)(x2=12.12,P ＜0.01),C等位基因频数在高甘油三酯血症组和非高甘油三酯血症组分别为184(26.6％)和314( 33.1％)(x2 =8.07,P ＜0.01)；rs3856806位点的CC、CT、TT的基因型频数在高甘油三酯血症组分别为149(43.1％)、156(45.1％)、41(11.8％),在非高甘油三酯血症组分别为269(56.8％)、170( 35.9％)、35(7.4％)(x2=15.93,P＜0.01),T等位基因频数在高甘油三酯血症组和非高甘油三酯血症组分别为238(34.4％)和240(25.3％) (x2=15.96,P＜0.01)；rs1805192位点的PP、PA、AA的基因型频数在高甘油三酯血症组分别为145(41.9％)、158(45.7％)、43( 12.4％),在非高甘油三酯血症组分别为314(66.2％)、137(28.9％)、23 (4.9％)(x2=50.92,P＜0.01),A等位基因频数在高甘油三酯血症组和非高甘油三酯血症组分别为244(35.2％)和183( 19.3％)(x2=52.89,P＜0.01).调整年龄、性别、吸烟、饮酒、高脂、低纤饮食和职业体力因素后,rs 1800206、rs2016520、rs3856806和rs1805192位点与高甘油三酯血症有关联,OR(95％ CI)值分别为3.88(2.69 ～5.60)、0.71(0.52 ～ 0.96)、1.40( 1.03 ～ 1.90)、2.56(1.88～3.49).GMDR模型分析显示,以质量性状的TG为结局,二阶模型(rs1800206和rs1805192)为佳模型(P＜0.01).以数量性状的TG为结局,三阶模型(rs 1800206、rs1805192和rs2016520)为佳模型(P＜0.01).结论 rs1800206、rs2016520、rs3856806和rs1805192位点与高甘油三酯血症有关联,多个SNP之间存在基因-基因的交互作用.
关键词： 过氧化物酶体增殖物激活受体 多态性 高甘油三酯血症 交互作用 -
白细胞介素-28B基因多态性与原发性肝细胞肝癌的关系
目的 探讨白细胞介素-28B(IL-28B)基因不同位点SNP与原发性肝细胞肝癌的关系.方法 以2001年11月至2010年4月就诊于桂林某医院和北京某医院的肝癌患者作为病例组,共300例,其中有139例患者具有完整的临床追踪资料；选取2009-2010年于上述两所医院中进行健康体检,且无肿瘤及慢性乙型肝炎疾病史者作为对照组,共310名；研究对象均为汉族,无年龄、性别限制.经知情同意,每名研究对象采集外周血2ml,采用质谱分析法对研究对象IL-28B基因rs12972991、rs8099917、rs12979860和rs4803223等位点SNP进行分析.结果 病例组rs12972991位点C等位基因、rs8099917位点G等位基因和rs4803223位点G等位基因频率分别是6.7％ (40/598)、7.9％ (47/598)、10.0％(59/588)；对照组分别为2.9％( 18/618)、4.1％(25/616)、3.6％(21/608),病例组均高于对照组,差异有统计学意义(x2值分别为9.542、7.858、20.736,P值均＜0.05)；携带上述等位基因可增加原发性肝细胞肝癌的患病风险[OR(95％CI)值分别为1.67(1.13 ～2.46)、1.49(1.08 ～2.06)、2.91(1.79～4.72)].病例组rs12972991位点AC+ CC基因型、rs8099917位点GT+GG基因型和rs4803223位点GA +GG基因型频率分别为13.0％ (39/299)、14.7％ (44/299)、19.0％(56/296)；对照组分别为5.8％ (18/309)、8.1％( 25/308)、6.6％ (20/304),病例组均高于对照组,差异有统计学意义(x2值分别为9.319、6.557、20.948,P值均＜0.05)；携带上述基因型可增加原发性肝细胞肝癌的患病风险[ OR(95％ CI)值分别为2.24(1.31～3.83)、1.81(1.14～2.88)、2.90(1.78～4.70)].对患者临床资料分析发现,出现门静脉癌栓的患者rs4803223位点GA +GG基因型频率为50.0％(13/26),高于AA基因型频率[21.1％ (23/109)],差异有统计学意义(x2=8.965,P=0.003).结论 IL-28B基因多态性与原发性肝细胞肝癌患病存在关联,其中携带rs4803223位点GA+ GG基因型可增加原发性肝细胞肝癌患者门静脉癌栓的发生风险.
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福建省汉族人群肺癌相关microRNA基因SNP与吸烟交互作用研究
目的：探讨福建省汉族人群肺癌相关microRNA（miRNA）基因SNP位点rs11614913、rs2910164、rs12894467、rs7372209及rs895819与吸烟的交互作用关系。方法采用病例-对照研究设计，收集2006年1月至2012年1月经病理确诊的汉族新发原发性肺癌患者1053例；按照性别、年龄进行频数成组匹配，同期选取探视病例组患者的汉族亲友及在福建省福州市苍霞社区卫生服务中心进行健康体检的汉族人群作为对照组，共1058名。调查研究对象性别、身高、体重、文化程度、婚姻状况、肿瘤家族史、肺部疾病史、吸烟、饮茶、饮酒等情况。经知情同意后，均采集空腹静脉血5 ml，应用基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术（MALDI-TOF-MS）进行 rs11614913、rs2910164、rs12894467、rs7372209及rs895819位点多态基因分型。以是否发生原发性肺癌为因变量，以SNP位点为自变量构建多因素非条件logistic回归模型。利用叉生分析探讨SNP位点与吸烟之间可能存在的联合作用；利用超额相对危险度（RERI）分析吸烟与SNP位点显、隐性模型的相加交互作用。结果病例组吸烟量P50(P25~P75)为30.00（0.00~56.00）包年，高于对照组[0.00（0.00~20.48）包年]（Z=14.57，P<0.001）；病例组不吸烟者的被动吸烟指数P50(P25~P75)为11.40（0.00~25.00），高于对照组[0.00（0.00~13.11）]（Z=10.71，P<0.001）。rs11614913、rs2910164、rs12894467、rs7372209及rs895819位点检出率在病例组中分别为95.82%（1009/1053）、97.72%（1029/1053）、97.82%（1030/1053）、97.15%（1023/1053）和96.01%（1011/1053）；对照组中分别为98.11%（1038/1058）、98.96%（1047/1058）、98.30%（1040/1058）、98.68%（1044/1058）和98.02%（1037/1058）。rs11614913位点的显性遗传模型中，TT基因型与吸烟联合可增加原发性肺癌的发病风险（OR=4.04,95%CI：2.67~6.12）；隐性遗传模型中，CC基因型与吸烟联合可增加原发性肺癌的发病风险（OR=4.76,95%CI：3.16~7.17）。rs12894467位点的显性遗传模型中，TT基因型与吸烟联合可增加原发性肺癌的发病风险（OR=2.98,95%CI：2.28~3.90）；隐性遗传模型中，CC基因型与吸烟联合可增加原发性肺癌的发病风险（OR=1.94,95%CI：1.10~3.43）。rs2910164位点的显性遗传模型中，CC基因型与吸烟联合可增加原发性肺癌的发病风险（OR=2.18，95%CI：1.60~2.98）；隐性遗传模型中，GG基因型与吸烟联合可增加原发性肺癌的发病风险（OR=3.29，95%CI：2.16~5.03）。吸烟与rs12894467位点显、隐性基因模型相乘交互项的联合作用均存在统计学意义（χ2=8.58，P=0.003；χ2=4.76，P=0.040）。结论 rs11614913、rs12894467及rs2910164位点多态性与福建省汉族原发性肺癌发生存在潜在关联。
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中国居民血管紧张素转换酶基因多态性与冠心病易感性关系的荟萃分析
目的 综合评价血管紧张素转换酶(ACE)基因插入和(或)缺失(insertion/deletion,I/D)多态性与冠心病易感性的关系.方法 用关键词途径搜索了Medline光盘数据库(1994年1月至2005年2月)和中国医院知识仓库(CHKD)中文期刊全文库(1994年1月至2005年5月),搜集所有研究ACE基因多态性与冠心病易感关系的病例对照研究,应用RevMan 4.2软件对各研究结果进行异质性检验和数据合并.结果 共有16篇符合条件的文献纳入分析,累积病例1345例,累积对照1286例.同杂合子(DI)和(或)纯合子插入型(Ⅱ)基因型相比,DD(纯合子缺失型)基因型冠心病的发病风险高出156%(OR=2.56,95%CI为2.09～3.13);ACE D等位基因与冠心病关系的趋势性检验结果表明,随着D等位基因的增多发生冠心病的危险性也随之增大(χ2Trend=97.12,P＜0.01).结论 ACE基因多态性可能与我国人群冠心病的易感性相关,DD基因型个体冠心病的发病风险明显增高,冠心病发病风险与D等位基因密切相关.
