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CYP17、CYP19、SULT1A1基因多态性与汉族女性乳腺癌易感性的研究
目的探讨雌激素代谢酶CYP17、CYP19、SULT1A1基因多态性与女性乳腺癌易感性的关系.方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性及短臂重复多态性方法,检测213例乳腺癌患者和430名正常对照CYP17、CYP19、SULT1A1基因多态性分布;应用logistic回归等方法分析单个基因、多个基因联合及雌激素暴露因素对乳腺癌的危险度.结果CYP17变异等位基因A2病例组的频率为49.8%,对照组为49.1%,差异无统计学意义(P＞0.05);SULT1A1变异等位基因His病例组的频率为13.6%,高于对照组的频率9.5%,差异有统计学意义(P=0.03);CYP19(TTTA)10等位基因病例组的频率为12.4%,对照组为8.2%(P=0.02);多基因模型分析显示,携带多个高危险基因显著增加患乳腺癌的危险性(趋势P=0.05);多因素分析显示,携带SULT1A1 His及CYP19(TTTA)10等位基因与乳腺癌危险性相关;高雌激素暴露因素如累计行经年数长、初潮年龄早以及体重指数、腰臀比高等均为乳腺癌的危险因素.结论参与雌激素合成与代谢的多个酶基因多态性与乳腺癌的发生有关.
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一氧化氮合酶基因G894T变异与高血压病关系的研究
目的探讨内皮型一氧化氮合酶(eNOS)基因第7外显子G894T变异(Glu298Asp)与高血压病的关系.方法以人群中筛检出的、未经药物治疗的116例高血压病患者及136名血压正常者为研究对象,运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测G894T变异.结果G894T变异与高血压病显著相关,894T等位基因频率高血压病组显著高于血压正常组(16.0%∶8.8%,P=0.019),OR＝1.96,95%CI:1.14～3.37.在病例组、对照组及两组合计中,G894T变异基因型的收缩压及舒张压水平皆显著升高(P＜0.05).用多元协方差分析调整年龄、性别、吸烟、饮酒、体重指数、甘油三酯、总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇后,在病例与对照合计中,G894T 变异基因型对收缩压及舒张压水平仍具有正显著影响(P＜0.01).结论 eNOS基因第7外显子G894T变异可能是该研究人群中高血压病发病的重要危险因素之一.
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中国人胰岛素受体基因EXON2-2257位点多态性与胰岛素抵抗的关系
目的从群体角度探讨胰岛素抵抗与胰岛素受体基因多态性的关系.方法用聚合酶链反应(PCR)对某一特定队列中国人群的胰岛素受体基因第二外显子(EXON2)进行扩增,并用PCR产物直接测序法对EXON2进行了单核苷酸序列分析.结果在EXON2-2257位点测得单核苷酸多态性,在345人中表现为:纯合CC基因型237人,占68.70%,基因频率0.825;纯合TT基因型13人,占3.77%,基因频率0.175;杂合CT基因型95人,占27.54%,符合Hardy-Weinburg平衡(χ2=0.2898,υ=3-2=1,0.5＜P＜0.75).男女TT、CT基因型人群的甘油三酯水平、稳态模式评估法(HOMA)评价的胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)均显著低于CC基因型人群(P＜0.05);与CC基因型相比,CT基因型在胰岛素抵抗组的构成比(18.4%)显著低于对照组(30.6%)(P=0.022,OR=0.493);TT基因型虽然在胰岛素抵抗组的构成比(2.3%)低于对照组(4.3%),但P=0.297,差异无显著性.logistic分析结果表明:在调整了诸如服用降压药、降糖药、血脂浓度、体重指数和高血压等因素的混杂作用后,与CC基因型人群相比,CT基因型人群患胰岛素抵抗的危险性OR=0.448,95%CI:0.214～0.940.结论 CT基因型可能是胰岛素抵抗的一个保护性基因型的候选基因.
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人类免疫缺陷病毒1感染相关的基因多态性在中国汉族人群中的分布
目的 调查中国汉族人群中人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)感染相关的CCR5△32、CCR2-64I和SDF1-3'A等位基因突变频率和多态性的特点.方法 以1 251例汉族人群为研究对象,应用PCR、PCR/RFLP(聚合酶链反应/限制性片段长度多态性分析)和DNA直接测序等方法进行检测,并用统计学方法进行分析.结果 发现中国汉族人群中存在CCR5△32等位基因突变(均为杂合子基因型),突变频率为0.001 19,和西欧及美国白人相比,中国人群中CCR5△32基因突变频率极低,而CCR2-64I和SDF1-3'A基因突变频率相对较高,分别为0.200 23和0.287 23.结论 中国汉族人群的CCR5△32、CCR2-64I和SDF1-3'A等位基因的突变和多态性特点,具有一定的代表性.由于CCR5△32突变率低,中国汉族人群对性接触传播的HIV-1病毒(R5)株可能有较大的遗传易感性.
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儿茶酚胺氧位甲基转移酶基因单核苷酸多态性与2型糖尿病的关联研究
目的 探讨儿茶酚胺氧位甲基转移酶(COMT)基因的单核苷酸多态性(SNP)与广东地区汉族人群T2DM的关联性.方法 采用SNPscanTM多重SNP分型试剂盒,在595例T2DM患者(病例组)和725名健康对照(对照组)中对筛选的2个tagSNP(rs4646312、rs4680)进行基因分型,并应用x2检验、logistic回归模型等方法分析SNP位点与T2DM的关联性.结果 病例组rs4646312的TT、CT、CC基因型频数分别为304(51.1％)、234(39.3％)、57(8.6％),对照组分别为323 (44.6％)、319(44.0％)、83(11.4％);病例组rs4680位点的GG、GA、AA基因型频数分别为311(52.4％)、236(39.8％)、46(7.8％),对照组分别为417(57.7％)、265(36.6％)、41(5.7％).校正性别、BMI和TG等因素后,rs4646312在等位基因关联分析和基因型关联分析(隐性模型)中的差异均有统计学意义[P值分别为0.020、0.022,OR值(95％CI)分别为1.26(1.04～1.53)、1.35(1.05～1.74)],而rs4680的差异均无统计学意义(等位基因关联分析P=0.099,显性模型下基因型关联分析P=0.081).rs4680与BMI有关联.结论 在广东地区汉族人群中,COMT基因的rs4646312位点与T2DM的遗传易感性有关,而rs4680与T2DM则无关联.
关键词： 糖尿病 2型 儿茶酚胺氧位甲基转移酶 多态性 单核苷酸 -
IL-1O基因启动子区单核苷酸多态性和吸烟交互作用与膀胱癌的关联研究
目的 探讨IL-10基因启动子区单核苷酸多态性和吸烟的交互作用与膀胱癌的关系.方法 以医院资料为基础,采用病例对照研究方法,应用AS-PCR法对400例膀胱癌病例和400例健康对照者进行IL-10基因启动子区单核苷酸多态性检测和分析,探讨膀胱癌的遗传和环境因素.结果 IL-10基因启动子区单核苷酸多态性与膀胱癌易感性相关,-1082、-819及-592位点的纯合突变型可能增加膀胱癌发病风险(OR值分别为2.058、1.979及1.979)；IL-10基因启动子区单核苷酸多态性在膀胱癌不同临床分期和病理分级间差异无统计学意义(均P＞0.05);IL-10基因启动子区-1082A/A、-819T/T和-592A/A与吸烟均存在正向交互作用(OR=2.264,γ=10.213；OR=2.438,γ=6.750; OR=2.438,γ=6.750).结论 IL-10基因启动子区-1082A/A、-819T/T和-592A/A与吸烟的交互作用可能增加膀胱癌的发病风险.
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易感基因与环境因素的交互作用对女性系统性红斑狼疮发病的影响
目的 探讨中国长江以南汉族女性系统性红斑狼疮(SLE)患者细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(CTLA-4)及程序性细胞凋亡-1(PDCD-1)基因多态与环境因素的交互作用.方法 采用单纯病例研究设计,收集258例符合条件的患者,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)技术检测CTLA-4与PDCD-1基因的单核苷酸多态性(SNPs),分别在显性、隐性、相加及相乘遗传模式下,选择Poisson对数线性模型估计基因-基因、基因-环境交互作用.结果 在PDCD-1基因的PD1.6位点,隐性及相加遗传模式下均存在GG基因型与紫外线暴露史的交互作用,OR值分别为3.714(95%CI:1.235～11.179)和3.199(95% CI:1.023～10.004).在CTLA-4-1722位点,显性遗传模式下,存在TT或TC基因型与紫外线暴露史的交互作用,OR值为4.874(95%CI:1.119～21.242);相乘遗传模式下存在PDCD-1基因的T等位基因与紫外线暴露史的交互作用,OR值为1.470(95%CI:1.047～2.065);而在相加遗传模式下,TT和TC基因型分别与紫外线暴露史存在交互作用,OR值分别为4.744(95% CI:1.037～21.737)和4.973(95% CI:1.110～22.287).结论 在中国长江以南汉族女性SLE患者中,紫外线暴露史分别与CTLA-4及PDCD-1基因多态存在交互作用,提示基因-环境交互作用可能与SLE有关.
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let-7启动子区基因多态性与肝细胞肝癌遗传易感性的关联
目的 探讨let-7启动子区域基因多态与中国人群肝细胞肝癌(HCC)易感性的关联.方法 采用病例-对照研究设计,以经确诊的1300例乙型肝炎病毒(HBV)阳性HCC患者作为病例组,选取1344例HBV持续性感染患者作为对照组.收集研究对象血液标本5ml,提取基因组DNA.以let-7启动子区rs10877887和rs13293512为研究位点,应用TaqMan探针方法进行多态性检测,并用logistic回归计算OR(95％CI)值,比较不同基因型与HCC患病风险的关系.结果 rs10877887位点3种基因型TT、CT及CC在病例组分布频率分别为43.0％ (542/1261)、44.7％ (564/1261)及12.3％( 155/1261)；在对照组中分别为44.0％( 581/1319)、44.4％( 585/1319)及11.6％ (153/1319).rsl3293512位点3种基因型TT、CT及CC在病例组分布频率分别为32.0％( 406/1270)、48.1％(611/1270)及19.9％ (253/1270),在对照组中分别为33.1％ (427/1291)、49.4％( 638/1291)及17.5％ (226/1291).多因素logistic回归分析显示,携带rs10877887位点至少1个突变等位基因C的个体与携带TT基因型的个体相比,HCC患病风险差异无统计学意义(CC+ CT对TT:调整OR=1.05,95％ CI:0.90～ 1.23)；与携带TT基因型个体比较,携带rs13293512位点至少1个突变等位基因C的个体HCC患病风险差异无统计学意义(CC+ CT对TT:调整OR=1.06,95％ CI:0.89～ 1.25).两位点联合分析显示:携带0、1、2及3～4个突变等位基因C的患者在病例组分别占13.3％( 164/1235)、36.2％ (447/1235)、33.0％ (408/1235)及17.5％ (216/1235),在对照组中分别占14.2％ (181/1269)、37.0％ (469/1269)、33.1％ (420/1269)及15.7％ (199/1269).携带1、2及3～4个突变等位基因C个体的HCC患病风险分别是不携带突变等位基因个体的1.05(0.81～1.34)、1.07(0.83～1.38)、1.22(0.91 ～ 1.62)倍,呈一致趋势,但无统计学意义(Wald x2=1.79,P=0.181).结论 let-7启动子区域rs10877887和rs13293512位点多态改变可能不是中国人群HCC易感性标志.
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广州生物库队列人群心脑血管病相关基因多态性研究
目的 应用Taqman单核苷酸多态性(SNP)分型法检测广州生物库队列人群心脑血管疾病相关基因的多态性.方法 从广州生物库队列研究(GBCS)中选取2000名研究对象,应用ABI7900HT型荧光定PCR仪并采用Taqman SNP分型法检测该人群rs4220、rs5368及rs285等15个心脑血管疾病相关基因多态性.对检测的基因分型数据采用遗传平衡定律检测,并与国际染色体单倍型计划(HapMap)的中国人群数据进行比较.结果 (1)所有15个SNP的分型数据均满足遗传平衡定律;(2)有两个SNP的分型数据与HapMap的中国人群数据差异有统计学意义(rs4220 28.2%对17.8%,X~2=4.891,P=0.028;rs5368 22.1%对32.2%,X~2=5.137,P=0.024).对比美国Perlegen公司人类遗传变异研究(AFD-CHN-PANEL)、美国科学基金会等位基因频率数据库(ALFRED)、日本生物信息学协会(JBIC-allele)等多个基因库数据,造成本研究SNP频率不同于HapMup的中国人群数据的原因是华南人群在遗传背景上与北方人群有一定的差异.结论本研究的数据可能更能反映南方人的特性,因此,建立大样本的广州人群心脑血管疾病相关基因多态性数据库以研究基因与环境对心脑血管疾病的影响是必要的.
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克山病发病与谷胱甘肽过氧化物酶-1基因多态性的关系研究
目的 研究谷胱甘肽过氧化物酶-1(GPx-1)基因多态性与血硒、GPx-1酶活性的关系,为克山病个体的易感性提供分子遗传学基础.方法 采用分光光度法及酶促法测量71例克山病患者和290名对照(其中内对照78名,外对照212名)的全血硒和GPx-1酶活性,采用测序及聚合酶链反应-限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)方法分析GPx-1基因198位点基因型,采用新生乳鼠心肌细胞转染表达质粒,探讨GPx-1两种基因型的功能.结果 克山病患者的血硒为(0.8±0.2)μmol/L,内对照组为(0.9±0.2)μmol/L,外对照组为(1.2±0.2)μmol/L(F=4.888,P＜0.001).克山病患者的GPx-1酶活性为(73.0±12.6)×10-10U/RBC,内对照组为(80.9±9.2)×10-10U/RBC,外对照组为(115.8±21.1)×10-10U/RBC(F=5.324,P＜0.001).克山病患者较对照组均明显降低.GPx-1基因上筛查出突变198位点多态性Pro198Leu;克山病患者的Pro198Leu多态性频率为21.1%,对照组的多态性频率为10.7%,病例组的多态性频率明显升高(x2=5.588,P=0.018).突变型组(Pro198Leu和Leu198Leu)的血硒为(0.9±0.2)μmol/L,非突变型为(1.1±0.3)μmol/L(t=3.183,P＜0.01);突变型组的酶活性为(86.1±23.0)×10-10U/RBC,非突变型组的酶活性为(101.8±25.9)×10-10U/RBC(t=5.784,P＜0.01).进一步研究证实198位等位基因多态性与低硒之间存在协同倍增交互作用.在大鼠乳鼠心肌细胞上过表达GPx-1(198Leu)会降低30%的GPx-1酶活性,并且对添加硒的反应不敏感.结论 低硒并GPx-1基因198Leu多态性,与GPx-1酶活力降低有关;低硒和GPx-1-198Leu存在协同倍增交互作用,共同增加克山病发病风险.
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miR-146a和miR-196a2前体区遗传多态性与焦炉工人遗传损伤的关系
目的 探讨miR-146a和miR-196a2前体区遗传多态位点rs2910164 G＞C和rs11614913 T＞C与焦炉工遗传损伤的关联性.方法 于2010年9月至10月,选取湖北省武汉市某焦化厂工龄在1年以上,无肿瘤,无吸烟习惯的焦炉作业工人,共575名.收集一般人口学资料并采集外周静脉血和尿液；采用胞质分裂阻滞试验计算外周血淋巴细胞的微核率来评价染色体损伤的程度；采用TaqMan探针对miR-146a前体区rs2910164 G＞C和miR-196a2前体区rs11614913 T＞C多态位点进行分型分析；采用三明治ELISA测定血浆中苯并[a]芘二氢二醇环氧化物-白蛋白(BPDE-白蛋白)加合物的浓度；并进行数据分析,并计算频率比(FR)及其95％ CI值.结果 共纳入575名工人.与携带野生型rs2910164 GG基因型的工人的外周血淋巴细胞微核率(4.02±3.09)相比,携带rs2910164CC基因型工人的微核率(4.38±3.46)增加(FR=1.18,95％CI:1.04～1.34),且有明显的等位基因剂量-效应关系(P趋势=0.025).按研究对象不同特征分层后,发现男性(FR=1.11,95％ CI:1.02～ 1.20)、不饮酒(FR=1.07,95％ CI:1.00 ～1.14)、工龄＜20年(FR=1.12,95％CI:1.03 ～ 1.22)和低BPDE-白蛋白水平组(FR=1.11,95％CI:1.02～1.21)中,rs2910164C等位基因与微核率的增加具有等位基因剂量-效应关系(P趋势分别为0.011、0.044、0.006和0.020).此外,与携带rs11614913TT基因型的工人(3.90±3.32)相比,携带rs11614913 TC基因型工人的外周血淋巴细胞微核率增加(4.27±2.91)(FR=1.12,95％CI:1.02 ～ 1.23).以同时携带rs2910164 GG及rs11614913TT基因型的工人组作为对照,同时携带rs2910164CC与rs11614913 CC基因型个体的外周血淋巴细胞微核率(5.32±4.94)是对照组(3.75±3.01)的1.51(1.21 ～1.89)倍.结论 miR-146a前体区域rs2910164C等位基因及miR-196a2前体区域rs11614913 C等位基因与焦炉工遗传损伤水平增加有关.
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青年女性膳食钙的吸收与VDR基因FokⅠ酶切多态性间关系的探讨
目的在我国城市居民代表性膳食条件下,探讨青年女性膳食钙吸收与VDR基因Fok Ⅰ酶切多态性间的关系.方法从300名18～23岁女青年学生中筛选出40名受试对象,并通过特定引物对VDR基因扩增产物以限制性内切酶Fok Ⅰ酶切电泳条带分布来分基因型.3 d代表性膳食适应后,开始为期12 d的代谢试验.研究对象所摄取的食品和饮品为我们设计的城市代表性膳食,称重(包括饮水)并采集备份样品分析测定;完整采集研究对象的粪便和尿液.测定并计算出每位研究对象膳食钙的吸收率.结果被研究者膳食钙含量与1992年全国营养调查中青年女性的摄入量接近或与成年女性膳食营养推荐摄入量接近;不同VDR基因Fok Ⅰ酶切型别的青年女性膳食钙吸收率不同,呈现如下趋势:ff
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驱动蛋白家族成员1B基因rs17401966位点多态性与原发性肝细胞癌遗传易感性的关联研究
目的：分析厦门市驱动蛋白家族成员1B（KIF1B）基因rs17401966位点多态性与原发性肝细胞癌（HCC）遗传易感性的关系。方法2011年1月至2014年10月在厦门市两家三甲医院，采用个体匹配病例-对照研究设计。病例组纳入标准：调查期间根据HCC诊断依据被首次确诊为HCC、≥18岁、现住址与调查地属同一区（县）级范围、无任何其他肿瘤史的患者；排除标准：患有其他肝脏疾病，患有HCC以外的肿瘤，患有自身免疫性肝炎或中毒性肝炎，拒绝调查或由于病危状态而无法接受调查者。对照组纳入标准：与病例组患者年龄相差不超过3岁，同性别，同期在同院接受健康普查，来自同一区（县），体检合格者；排除标准：患有肝脏疾病及既往肿瘤病史者。病例组376例，对照组403例，各采集晨起空腹静脉血5 ml，进行血细胞分离及基因分型。采用χ2检验和t检验比较病例组、对照组的基本情况，采用多因素logistic回归模型分析KIF1B基因rs17401966位点多态性与HCC遗传易感性的关系。结果病例组的年龄为（61.7±12.8）岁，对照组为（60.6±12.7）岁（t=1.15，P=0.251）。病例组有肿瘤家族史比例、HBV感染阳性率分别为28.7%（108/376）、26.9%（101/376），均高于对照组[15.9%（64/403）、2.7%（11/403）]（χ2分别为18.65、92.02，P值均<0.001）。rs17401966 GA、GG基因型HCC遗传易感性分别是AA基因型的0.64（0.46~0.89）、0.54（0.32~0.92）倍，G等位基因HCC遗传易感性是A等位基因的0.76（0.60~0.96）倍。HBsAg阳性者中，rs17401966 GG基因型HCC遗传易感性是AA基因型的0.12（0.02~0.75）倍，rs17401966 G等位基因HCC遗传易感性是A等位基因的0.38（0.15~0.98）倍；HBsAg阴性者中，rs17401966位点多态性与HCC遗传易感性相关性无统计学意义，与A等位基因相比，G等位基因HCC遗传易感性的OR（95%CI）值为0.79（0.62~1.01）。结论 KIF1B基因rs17401966 GG和GA基因型、G等位基因的HCC遗传易感性较低。
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过氧化物酶体增殖物激活受体单核苷酸多态性基因-基因交互作用与非高密度脂蛋白胆固醇的关系
目的 探讨过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs) 10个SNPs与非高密度脂蛋白胆固醇(non-HDL-C)水平的关联及基因-基因的交互作用.方法 研究对象来自江苏省多代谢异常和代谢综合征综合防治研究队列人群.入组时间为1999年4月至2004年6月.2006年3月至2007年10月随访4 582名基线调查满5年的对象,共随访到4 083名.于2009年10月,对随访到的4 083名对象,在排除基线时患有心血管疾病、糖尿病、BMI＜ 18.5 kg/m2的基础上,从3 731名对象中,采用单纯随机抽样方法抽取其中的820名研究对象,对其基线血液标本进行PPARs/δ/γ10个SNP的基因多态性检测.运用logistic回归模型分析不同SNP与non-HDL-C的关联,并采用广义多因子降维法(GMDR)模型分析10个SNP的基因-基因交互作用.结果 820名研究对象中有男性270名,女性550名,年龄为(50.05±9.41)岁.单SNP关联分析显示,调整性别、年龄、吸烟、体力活动、高脂饮食和低纤饮食后,rs1800206-V等位基因和rs3856806-T等位基因与较高水平的non-HDL-C有关,rs 1800206-V等位基因携带者(LV+ VV基因型)non-HDL-C为(3.15±0.89) mg/L(F=15.01,P=0.002);rs3856806-T等位基因携带者(CT+TT基因型)non-HDL-C为(3.03±1.01) mg/L(F=9.87,P =0.005).GMDR模型分析显示,在调整同样的影响因素后,二阶、五阶、六阶和七阶交互作用模型均有统计学意义(P＜0.05),其中包括rs 1800206、rs3856806、rs135539、rs4253778、m2016520、rs1805192、rs709158的七阶模型交叉验证一致性为10/10,平均检验准确度为0.656 0,为优模型.结论 rs1800206和rs3856806多态性与non-HDL-C水平升高有关联,并与rs135539、rs4253778、rs2016520、rs1805192、rs709158之间存在基因-基因交互作用.
关键词： 过氧化物酶体增殖物激活受体 多态性 单核苷酸 非高密度脂蛋白胆固醇 交互作用 -
胆固醇酯转移蛋白基因Taq1B多态性对高脂人群血清高密度脂蛋白胆固醇水平膳食易感性的作用
目的探讨胆固醇酯转移蛋白(CETP)基因Taq1B位点多态性是否会影响高脂人群血清高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)对膳食因素的反应.方法对上海市某社区141例高脂血症患者进行膳食调查,测定其血脂水平,以聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)测定调查对象CETP基因Taq1B位点的多态性,并在控制性别、年龄、体质指数的作用下,分析不同基因型高脂人群中膳食因素与血清HDL-C水平的关系.结果高脂人群血清HDL-C同时受到膳食因素与CETP基因Taq1B位点多态性的影响.在不同基因型人群中HDL-C与膳食因素的相关性不同,B2B2型中两者的相关性明显强于B1B1型.结论CETP Taq1B多态性可能会影响高脂人群血清HDL-C对膳食干预的易感性.
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miRNA前体-320b-2启动子区单核苷酸多态性与冠心病相关性及对血浆microRNA-320b表达水平的影响
目的 探讨中国汉族人群miRNA前体-320b-2 (pre-miR-320b-2)启动子区单核苷酸多态性(rs10916581)对冠心病易感性的关联性及对血浆microRNA-320b(miR-320b)表达水平的影响,并探索可能影响血浆miR-320b表达水平的因素.方法 采用病例-对照研究方法,于2004年5月至2009年10月应用单纯抽样法随机法选择入住武汉同济医院、协和医院和武钢总医院3个医院冠心病患者1 507例和与之年龄、性别频率匹配的1 379名健康对照为研究对象,对研究对象的rs10916581位点进行基因分型.从上述人群中采用单纯随机法选择无急性感染疾病的174例冠心病患者,并选择匹配的无急性感染疾病无糖尿病的181名健康对照,应用RT-PCR法检测其血浆miR-320b表达水平.采用多元非条件logistic回归分析rs10916581与冠心病易感性的关联,采用广义线性回归分析各因素与血浆miR-320b表达水平的关联.结果 在单因素logistic回归模型中,rs10916581与冠心病易感性的关联性无统计学意义(P值均＞0.05).在校正年龄、性别、BMI、吸烟状态、糖尿病、高血压、TC/HDL-C比值、总TG后,rs10916581与冠心病易感性的关联性仍无统计学意义[与CC基因型相比,CT、TT、CT+TT基因型患冠心病的OR (95％ CI)值分别为0.94(0.76 ～ 1.15)、0.99(0.74～1.33)和0.95(0.78～ 1.16)].年龄、性别、吸烟状态、BMI、高血压、糖尿病、冠心病家族史和rs10916581在冠心病的发生中无交互作用(P交互值均＞0.05).在对照、病例和总人群中,rs10916581均不影响血浆miR-320b的表达水平[β(95％ CI)值分别为:-0.028(-0.495 ～ 0.440)、0.250(-0.226 ～0.727)、0.134(-0.218 ～0.486),P值均＞0.05].但在病例组中,血浆miR-320b表达水平与BMI负相关[β(95％ CI)值为-0.140(-0.261 ～-0.020),P=0.022],与TC/HDL-C值正相关[β(95％ CI)值为0.620(0.261～0.979),P=0.001],总人群中血浆miR-β20b表达水平与TC/HDL-C值正相关[β(95％ CI)值为0.108(0.027～0.190),P=0.009],与糖尿病、高血压患病状态则呈负相关[β(95％ CI)值分别为-1.025(-1.696 ～-0.354)、-0.594(-1.138～-0.049),P值均＜0.05].结论 pre-miR-320b-2启动子区rs10916581与冠心病易感性和血浆miR-320b表达水平无关联,冠心病患者的BMI、TC/HDL-C值、糖尿病和高血压患病状态可能影响血浆miR-320b的表达水平.
关键词： 多态性 单核苷酸 横断面研究 microRNA-320b 冠心病 -
鼠双微体-2基因多态及P53基因多态与乳腺癌易感性的关联研究
目的 探讨鼠双微体-2(M DM2)基因rs2279744位点T→G多态与P53基因rs1042522位点G→C多态之间的交互作用与乳腺癌遗传易感性的关联.方法 于2001年3月至2011年5月,选取杭州市余杭区女性乳腺癌患者600例作为病例组；选取同时期余杭区某医院参加健康体检的,年龄及地域分布与病例组匹配的健康女性600名作为对照组.采集研究对象静脉全血,并通过问卷收集其人口学资料.应用PCR-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)法进行分型,应用logistic回归分析MDM2基因rs2279744位点T→G与P53基因rs1042522位点G→C多态性之间的交互作用与乳腺癌患病的影响.结果 MDM2基因rs2279744位点GG、TG及Tr基因型在病例组分布频率分别为31.5％(189/600)、45.5％(273/600)及23.0％ (138/600),在对照组中分别为19.0％(114/600)、49.2％ (295/600)及31.8％ (191/600).P53基因rs1042522位点GG、GC及CC基因型在病例组分布频率分别为23.1％ (139/600)、50.2％ (301/600)及26.7％ (160/600),在对照组中分别为30.5％(183/600)、51.3％(308/600)及18.2％(109/600).回归分析显示,携带rs2279744位点TG、GG基因型能明显提高乳腺癌的患病风险[OR(95％ CI)值分别为:1.31(0.97 ～1.73)、2.24(1.61 ～3.09)],携带rs1042522位点GC、CC基因型能明显提高乳腺癌的患病风险[OR(95％ CI)值分别为:1.34(0.94～1.68)、1.89(1.35 ～ 2.68)].两基因多态位点联合分析显示,与携带rs2279744位点TT基因型和rs1042522位点GG基因型的个体相比[病例组和对照组中分布频率分别为4.8％(29/600)、11.5％(69/600)],携带rs2279744位点TG或GG基因型和rs1042522位点GC或CC基因型[病例组和对照组中分布频率分别为95.2％(571/600)、88.5％(531/600)]能明显增加乳腺癌的患病风险(TG/GG+GG:OR=2.30,95％ CI:1.39～3.82; TT+ GC/CC:OR=2.14,95％ CI:1.29 ～ 3.55; TG/GG+ GC/CC:OR=2.86,95％CI:1.80 ～4.53),即MDM2和P53基因的这两个多态位点联合交互作用能明显增加乳腺患病风险(P =0.046),当两位点均存在危险基因型时,乳腺癌的患病风险更大.结论 MDM2基因rs2279744位点T→G多态和P53基因rs1042522位点G→C多态是乳腺癌患病的遗传易感因素,且两个位点的多态性之间的交互作用与乳腺癌遗传易感性相关.
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艾滋病和丙型肝炎病毒感染吸毒者的树突状细胞表面分子基因多态性分析
目的 研究吸毒人群中艾滋病病毒(HIV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染者与未感染者中,等位基因树突状细胞表面特异性分子同源物(DC-SIGNR)的分布情况,筛选出HIV或HCV抗性基因.方法 选择深圳市戒毒所吸毒人群血液样本500份,其中313份来自静脉注射吸毒者,对他们进行HIV及HCV抗体筛查,并提取外周血基因组DNA,对DC-SIGNR颈区基因进行聚合酶链反应(PCR)扩增,对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测和基因序列测定分析.结果 检出97例HIV阳性吸毒者,均为静脉注射吸毒者,且全部为HCV阳性;HIV阴性吸毒人群中,HCV抗体阳性率57.57%(232/403);HIV阴性静脉注射吸毒者中,HCV阳性率63.89%(138/216);而采用鼻吸等其他方式吸毒者的阳性率为50.26%(94/187),静脉注射吸毒与其他方式吸毒者阳性率的差异具有统计学意义(x2=7.61,P=0.0058).x2检验结合确切概率法分析显示,HIV阳性的吸毒者中,DC-SIGNR颈区5/6和5/8等位基因型的出现频率[4.55%(4/88)和2.27%(2/88)]高于HIV未感染组[1.04%(4/384)和0(0/384),确切概率法P=0.043和P=0.034],具有统计学意义;HCV阳性吸毒人群中,各类杂合子及纯合子的出现频率与HCV阴性吸毒人群间差异无统计学意义,静脉注射吸毒者与其他方式吸毒者之间差异无统计学意义.结论 在吸毒人群中,DC-SIGNR颈区等位基因分布与HCV感染无明显相关性,而等位基因型5/6可能与HIV感染相关,但由于频率较低,仍需进一步验证.
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Eppin 基因多态性与原发性男性不育的相关性研究
目的：探讨中国汉族人群中Eppin基因的4个标签单核苷酸多态性（ tagSNPs）位点与原发性男性不育发病风险之间的关系。方法以2005年3月至2007年3月就诊于南京某两家医院男性不育门诊的患者作为病例组，共473例，另选取2005年3月至2009年2月于上述两所医院其他门诊就诊的有正常生育史的男性作为对照组，共198名。研究对象均为来自南京和南京周边地区的中国汉族人群。经知情同意，每名研究对象采集5 ml 外周血，采用PCR－限制性片段长度多态性（ PCR－RFLP）方法对研究对象Eppin基因rs6124715、rs2231829、rs2227290和rs11594等4个tagSNPs位点进行分析，采用放射免疫（ RIA）方法对研究对象血清中睾酮（ T）浓度进行测定。结果病例组rs11594位点AA、AC和CC基因型频率分别为76．3％（361／473）、20．1％（95／473）、3．6％（17／473），对照组分别为75．3％（149／198）、24．2％（48／198）、0．5％（1／198），各基因型在两组间的分布差异有统计学意义（χ2＝7．73，P＝0．021），CC基因型携带者发病风险为7．02（95％CI：0．93～53．19），其余位点（ rs6124715、rs2231829和rs2227290）各基因型频率在病例组和对照组间的分布差异无统计学意义，并与男性不育易感性不相关。位点联合分析发现，CTGA单倍型的个体原发性男性不育的发病风险降低（ OR＝0．18，95％CI：0．06～0．53）。结论 Eppin基因多态性与原发性男性不育存在关联，其中携带rs11594位点CC基因型可增加原发性男性不育的发病风险。
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5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性和叶酸摄人与先天性心脏病的关系研究
目的 探讨5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T多态性及其与孕期叶酸摄入水平交互作用与先天性心脏病(简称先心病)的关系.方法 限制相应条件收集104例先心病患者与208例对照,对其母亲孕期膳食摄入频率及相关因素进行调查;通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restricted fragment length polymorphism,PCR-RFLP)并酶切检测儿童MTHFR C677T基因型,采用单因素和多因素非条件logistic回归模型,进行影响因素关联强度及交互作用分析.结果 病例组104例中叶酸摄入不足的38例(占36.54%),对照组208例中叶酸摄入不足的21例(占10.10%),叶酸摄入减少与先心病发病增多有正相关关系(X2=31.614,v=1,P<0.0001),其OR值为1.417(95%CI:1.216～1.651),叶酸摄入水平低是子代先心病的危险因素;病例组104例中MTHFR基因的TT、CT、CC三种基因型分别为46例、42例和16例,对照组208例中相应的基因型分别为39例、114例和55例,病例组和对照组该基因型分布的差异有统计学意义(X2=23.13,v=2,P<0.0001),MTHFR 677TT基因型是先心病的易感因素,OR值为3.437倍(95%CI:2.042～5.784).孕期叶酸摄入水平低与MTHFR 677TT基因型之间对先心病发生具有正相加交互作用,调整父母年龄、胎龄、性别等因素前后,交互作用的效应量分别为13.343、15.911,归因交互效应百分比分别为0.619和0.612,纯因子间归因交互效应百分比分别为0.649和0.637,根据估计的人群暴露率计算的一般人群预防分值为25.26%和27.82%.结论 孕期叶酸摄入水平低是子代先心病发生的危险因素;MTHFR 677TT基因型是先心病的易感基因型;MTHFR 677TT基因型与叶酸摄入水平低具有协同作用,在MTHFR 677 TT高危个体中,有效提高孕期叶酸摄入水平,可使人群先心病的发生下降,可对先心病的临床早期诊断和群体预防提供依据.
