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生物信息学方法分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控
目的 研制生物信息学软件,分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控.方法 采用java语言编制能够从NCBI的高通测序数据库中比对特定序列的软件工具,利用该软件进行统计分析DDIT3的表达丰度、染色质活化程度及其受miRNA调控程度.结果 开发软件工具无需安装且操作简单.成骨细胞中DDIT3的转录变体丰度不同,在染色质活化程度较低,且受miRNA调控程度也较低.结论 本文开发的软件工具适用于从NCBI的SAR全基因高通测序数据库中研究个别基因的转录调控.
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甲状腺癌DDIT3 mRNA表达及意义
目的 探讨DNA损伤诱导转移因子3(DDIT3) mRNA在甲状腺癌中的表达及意义.方法 采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测40例甲状腺病变组织中DDIT3 mRNA的表达,并与甲状腺良性病变组相比较.结果 DDIT3 mRNA在甲状腺癌中的表达显著高于良性病变组(P<0.01),滤泡癌组与滤泡性腺瘤组相比差异有显著性(P<0.01),同时观察5例甲状腺癌癌旁组织,DDIT3不表达.结论 DDIT3 mRNA在甲状腺癌中表达明显增强,可能参与甲状腺癌的发生发展.
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表没食子儿茶素没食子酸酯逆转小剂量辐射引起的DNA甲基化
目的探讨表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）对0?5 Gy X射线引起的小鼠Rad23b和Ddit3基因启动子CpG岛甲基化及表达改变的逆转作用。方法 BALB/c雄性小鼠30只按随机数字表法均分为6组：对照组、单纯照射组、EGCG低剂量单纯给药组、EGCG高剂量单纯给药组、EGCG低剂量给药照射组、EGCG 高剂量给药照射组。照射方式为6 MV X 射线分次照射（0?05 Gy/d ×10 d）。小鼠在末次照射后2 h取血后处死，收集肾脏、肝脏、脾脏、脑及肺组织。采用BSP和Real-time PCR法检测各组小鼠外周血单个核细胞（PBMC）及各组织Rad23b和Ddit3启动子CpG岛的甲基化水平和 mRNA 表达变化。结果末次照射后2 h，与对照组比较，单纯照射组Rad23b在PBMC、肝脏、脾脏、脑和肺组织中甲基化水平均升高（ t ＝-20?19、-14?80、-12?05、-28?42、-12?58，P＜0?05），同时mRNA水平在PBMC、肝脏、脑和肺组织中表达降低（t＝25?25、17?43、11?53、22?85，P ＜0?05）；Ddit3甲基化水平在 PBMC、肝脏和肺组织中升高（t ＝-52?89、-20?31和-3?85，P ＜0?05），mRNA 水平在 PBMC 和肝脏中表达降低（t ＝11?89和16?52，P ＜0?05）。与单纯照射组比较，除脾脏中Rad23b外，不同浓度EGCG（10、20 mg/kg）给药照射组均能明显降低X射线引起的Rad23b和Ddit3启动子CpG岛高甲基化（t＝-13?39～7?99，P＜0?05），并诱导mRNA重新表达（t＝-34?02～-2?89，P＜0?05），且转录激活作用在高剂量给药照射组中更加明显。结论 EGCG作为逆转小剂量辐射损伤效应的天然药物，可能通过影响DNA甲基化来发挥作用。
关键词： 表没食子儿茶素没食子酸酯 辐射损伤 甲基化 Rad23b DDIT3 -
DDIT3在甲状腺滤泡型良恶性肿瘤中的表达及意义
目的 探讨DDIT3在甲状腺良恶性滤泡型肿瘤中的表达及意义.方法 采用免疫组化Envision法检测24例滤泡性腺瘤、44例滤泡癌中DDIT3的表达情况.结果 DDIT3在甲状腺滤泡性腺瘤,滤泡癌中的表达率分别为20.8%和93.2%,两者比较差异有统计学意义(P＜0.001).同时观察10例甲状腺滤泡癌癌旁组织,DDIT3不表达或表达甚少.结论 DDIT3可作为鉴别甲状腺滤泡癌和滤泡性腺瘤的一个较有价值的指标.
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Ddit3在小鼠下颌第一磨牙牙胚不同时期的表达研究
目的:检测Ddit3在小鼠下颌第一磨牙牙胚不同时期的表达分布及变化规律,初步揭示Ddit3在小鼠牙胚发育中的作用.方法:取不同胚胎时间点的ICR妊娠小鼠,制备牙胚发育标本,通过免疫荧光和免疫组化的方法显示Ddit3在小鼠下颌第一磨牙牙胚发育不同时间点的表达分布.结果:Ddit3在牙胚发育的早期主要表达于胞浆中,从钟状期开始,Ddit3不仅在胞浆中有阳性表达,同时也微弱地表达于细胞核中.分布如下:在小鼠下颌第一磨牙发育的板状期,Ddit3几乎没有表达.在蕾状期,Ddit3主要表达于釉上皮的细胞质中,在牙外胚间充质细胞中几乎无表达.在帽状期,Ddit3的表达模式基本和蕾状期相同.在钟状期早期,Ddit3在成釉细胞、前成牙本质细胞和牙乳头胞质中呈阳性表达,在部分细胞核中也检测到了Ddit3的表达.钟状期晚期,Ddit3在新形成的硬组织周围的高柱状成釉细胞、成牙本质细胞和牙乳头细胞的胞浆中有阳性表达,在大多数成釉细胞、成牙本质细胞和牙乳头细胞的细胞核中也有表达.结论:Ddit3可能会调节成釉细胞和成牙本质细胞的分化及其硬组织的生物矿化.
