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高通测序文献资料
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生物信息学方法分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控
目的 研制生物信息学软件,分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控.方法 采用java语言编制能够从NCBI的高通测序数据库中比对特定序列的软件工具,利用该软件进行统计分析DDIT3的表达丰度、染色质活化程度及其受miRNA调控程度.结果 开发软件工具无需安装且操作简单.成骨细胞中DDIT3的转录变体丰度不同,在染色质活化程度较低,且受miRNA调控程度也较低.结论 本文开发的软件工具适用于从NCBI的SAR全基因高通测序数据库中研究个别基因的转录调控.