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ANOVA模型实现贝叶斯方法的诊断试验准确性网状Meta分析
目前诊断试验准确性的网状Meta分析尚在探索阶段,我们先前探索并介绍了可以实现诊断试验准确性网状Meta分析的不同方法.本文结合具体实例,介绍ANOVA模型实现贝叶斯方法的诊断试验准确性网状Meta分析的步骤,以期为拟进行相关研究的学者提供参考.
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如何实现Meta分析中不同亚组合并效应量的比较
本文介绍了Meta分析中不同亚组的合并效应量比较的2种统计方法,并通过实例演示采用R软件对不同类型的数据(二分类和连续型变量)进行Z检验和Meta回归分析,以解释不同亚组的合并效应量比较方法的异同.
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应用R软件meta程序包实现遗传关联性研究的Meta分析
单核苷酸多态性与疾病的相关性是遗传关联性研究的典型代表.相对于传统的二分类数据,单核苷酸多态性的数据具有其自身的特点,在开展Meta分析时常使用5种遗传模型.本文通过实例展示如何使用R软件Meta程序包实现单核苷酸多态性数据的Meta分析.
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Stata和R软件在生存资料Meta分析中的正确使用
在系统评价或Meta分析中,风险比(Hazard ratio,HR)常作为效应量用于时间-事件结局分析,但在实践中,常因忽视数据的对数转换从而导致错误结果.本文以实例说明如何正确使用Stata和R软件对获得HR及其95％可信区间的生存资料进行Meta分析.
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RevMan、Stata和R软件在生存资料Meta分析的应用
生存资料的Meta分析越来越多.从原始文献计算出风险比(HR)及其95％可信区间,实际频数和理论频数的差值(O-E)及其标准差后,可以使用Review Manager (RevMan)、Stata和R等软件计算合并HR.RevMan软件简单易学,但存在一定的局限;Stata和R软件功能强大,灵活多样,能够绘制多种图形,但需要进行适当的编程.
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剂量-反应Meta分析之软件的应用
在循证实践和决策中,剂量-反应Meta分析已受到不少学者的关注.它不仅可以反映暴露因素与疾病之间独特的量效关系,且产生的结果证据等级在观察性研究中处于较高等级.了解此种类型Meta分析在软件中如何操作实现,显得尤为重要.目前,有多种软件用于剂量-反应Meta分析,不同软件存在不同的特点.本文将介绍如何使用Stata软件、R软件、SAS软件实现剂量-反应关系Meta分析的计算和绘制剂量趋势图,对其进行介绍、归纳及深入探讨,并对部分过程进行实例演示.
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应用R软件metacor程序包实现相关系数的Meta分析
metacor程序包是一款基于经典频率学理论研发的专用于在R框架下执行相关系数Meta分析的程序包.该程序包于2011年正式推出,可直接将相关系数作为效应量进行合并,采用的方法为DerSimonian-Laird法和Olkdn-Pratt法.metacor程序包可以绘制森林图,操作简单易行,但仍有需要完善的地方.本文通过实例演示,介绍R软件metacor程序包实现相关系数Meta分析的方法.
关键词： R软件 metacor程序包 相关系数 Meta分析 -
使用R、GeMTC和STATA软件实现连续变量的网状Meta分析
当前已发表的介绍网状Meta分析的方法学文章主要集中于二分类变量,尚无针对连续性变量的相关报道.本文介绍如何使用R、GeMTC和Stata软件联合实现连续性变量网状Meta分析的计算及绘制收敛诊断图、轨道密度图、森林图、等级概率图、内部关系总结图、网状关系图、贡献图和发表偏倚检测图.
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应用R软件meta程序包与metafor程序包实现相关系数数据的Meta分析
相关系数是管理学、社会学、心理学及护理学领域常用的统计学指标,基于相关系数数据的Meta分析也日渐增多.R软件meta程序包与metafor程序包能够实现多种类型的Meta分析,包括相关系数数据的Meta分析.本文通过实例展示了应用R软件meta程序包和metafor程序包实现相关系数数据的Meta分析过程,并简要比较了两款程序包的结果与绘图等功能.
关键词： 相关系数 Meta分析 Meta程序包 metafor程序包 R软件 -
应用R软件rmeta程序包实现Meta分析
R软件是一款具备强大的数据处理和图形绘制功能的免费软件,其在Meta分析中的应用日趋广泛.本文介绍了可以实现二分类变量的Meta分析、累积Meta分析、绘制森林图和漏斗图的rmeta程序包的使用.该程序包具有结构单纯、命令函数参数较少、易于理解和掌握、功能较全面等优点,但现行版本有些功能存在局限性,有待发掘和完善.
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模型回归系数的合并分析在R软件metafor包中的实现
目的 通过R软件metafor包实现模型回归系数合并的Meta分析.方法 以公开发表的一个Meta分析为研究实例,介绍利用R软件metafor包实现回归系数合并的Meta分析的具体操作方法.结果 利用R软件metafor包进行回归系数合并的Meta分析结果与发表文献一致.结论 R软件作为一款自由、免费、开源的统计分析软件,可灵活准确地实现模型回归系数合并的Meta分析,在Meta分析的实际应用中值得推广.
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应用R软件pcnetmeta程序包实现网状Meta分析
R软件pcnetmeta程序包是一款基于贝叶斯理论实现网状Meta分析的程序包,其融合了JAGS软件的优势计算功能与R软件特有的数据整合和强大的图形绘制等功能.pcnetmeta程序包通过调用JAGS软件来实现运算,提供了3种不同模型供操作者选取,每种模型均给出3种不同的效应量(RR、OR及RD)结果;同时可以绘制多种图形,极大程度上满足了使用者处理复杂网状Meta分析的客观需求.本文以实例方式展现该程序包的完整操作流程.
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网状Meta分析中敏感性分析和一致性分析在R软件中的实现
目的 介绍网状Meta分析的敏感性和一致性检验及其在R软件中的应用.方法 以实例演示的方式,采用随机效应模型与固定效应模型比较的方法实现敏感性分析,并采用R软件metafor包和combinat包实现一致性分析.结果 随机效应模型与固定效应模型所得结果相近,数据较稳健.一致性检验结果表明,各环的可信区间均与空白值相交,说明网状Meta分析计算结果与直接比较计算结果无明显差异,一致性较好.结论 网状Meta分析作为一种间接比较的分析方式,敏感性尤为重要,而一致性的引入使网状Meta分析更准确.通过R软件实现网状Meta分析的敏感性和一致性分析是一种可行的方法.
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应用R语言netmeta程序包实现网状Meta分析
netmeta程序包是基于经典频率学派研发、在R语言框架下运行的专用于网状Meta分析的程序包.该程序包克服了基于贝叶斯统计学派研发的软件及程序包实现网状Meta分析时对先验设定的难点,同时具备操作流程简单、操作难度小等优点.此外,该程序包还能同时以随机效应与固定效应模型展现单个配对研究及Meta分析合并的结果,并能绘制森林图.本文通过实例展示了应用netmeta程序包实现网状Meta分析的过程.
关键词： 网状Meta分析 贝叶斯学派 频率学派 netmeta程序包 R软件 -
R软件调用OpenBUGS软件实现网状Meta分析
R软件当前可通过R2OpenBUGS程序包、BRugs程序包和rbugs程序包来调用OpenBUGS程序包实现网状Meta分析.本文分别对这3种程序包实现网状Meta分析的过程进行演示.从结果来看,3种程序包的计算结果相近,但rbugs程序包无绘图功能,仅R2OpenBUGS程序包能绘制森林图.
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R软件调用JAGS软件实现网状Meta分析
JAGS (Just Another Gibbs Sampler)是为弥补BUGS软件无法在Unix或Linux等非Windows系统上运行的缺陷而研发的编程软件,其自身独立拥有一套贝叶斯理论运算函数及公式,具有操作界面简单、与系统兼容好、运行流畅、且与其他编程软件具有良好交互性等特点.然而,由于JAGS软件在结果数据读取、解读以及图形绘制方面存在功能性缺失,限制了其推广应用;通过R2jags、rjags及runjags程序包从R中调用JAGS软件则克服了这些缺陷.R2jags、rjags及runjags这3款程序包的工作原理均是在R语言的框架下通过调用JAGS软件来完成相关迭代运算,它们的功能结构基本相似,都具有操作简单、命令简洁、数据读取和结果汇总以及图形绘制功能较完善的特点,但在实践运用中仍存在差异.本文介绍了如何使用R软件通过R2jags、rjags及run jags程序包调用JAGS软件来实现网状Meta分析.
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应用R软件mada程序包实现诊断准确性试验的Meta分析
mada程序包是R软件中专用于实现诊断准确性数据Meta分析的程序包.该程序包是基于经典统计学研发的,能够完成所有诊断准确性试验Meta分析效应指标的计算,但不提供总敏感度与特异度汇总值.本文以实例介绍了mada程序包实现诊断准确性试验Meta分析的数据准备、执行运算、汇总结果及绘制图形的全部功能.
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基于使用的网状Meta分析软件的比较研究与选择
目的 比较各种网状Meta分析(NMA)软件的特征及功能,为使用者选择软件提供参考.方法 计算机检索PubMed、CNKI、Stata公司官方网站、R软件官方网站和Google,收集具有NMA功能的软件及程序包,检索时限截至2014年7月.下载软件和程序包及其使用指南,用示例进行计算.对软件的基本特征、功能和计算结果进行比较分析.结果 共纳入11款软件,包括编程软件和非编程软件,主要基于贝叶斯学派和频率学派研发.大多数软件已具操作简单、易掌握、计算准确及图形绘制优良等优点,但无一款同时具备较佳计算能力与绘图功能的软件,必需多款软件联合来实现.结论 建议使用者首先依据自身编程基础与习惯等选取,可考虑选用两种或三种软件相互配合来实现NMA.建议研发一款功能完备、操作简单的免费软件.
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R软件R2WinBUGS程序包在网状Meta分析中的应用
R软件是一个自由、免费及开放的统计软件,并具有强大的绘图功能,但其处理网状Meta分析数据的代码命令较为复杂,因此易错且不易掌握.WinBUGS软件是基于贝叶斯理论而开发的一款统计软件,具有强大的数据处理功能,在处理网状Meta分析数据时,代码编写易懂且操作方便,但对结果的绘图功能欠佳.为充分发挥R软件与WinBUGS软件各自的优势,开发者在R软件的基础上研发了R2WinBUGS程序包,构建了R软件与WinBUGS软件之间的“桥梁”,使网状Meta分析的过程和结果处理方便快捷又美观.本文以实例操作的方式展示使用R软件R2WinBUGS程序包进行网状Meta分析的过程.
关键词： R软件 R2WinBUGS程序包 WinBUGS软件 网状Meta分析 -
网状Meta分析中网状关系图的绘制
网状关系图能够清晰地展示网状Meta分析时各干预措施间存在的直接比较关系.目前有较多绘制网状关系图的方法,但不同方法绘制的网状关系图所提供的信息量有所区别,且软件不同,其操作的友好程度亦不一样.本文简要介绍了如何应用R软件network程序包和gemtc程序包、Stata软件、ADDIS软件绘制网状关系图,并对其异同点进行了比较.
