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  • 颅骨修补术临床路径实施效果探讨

    作者:杨兴奎;陈英歌;王军;王保江;王晓锋;唐宗椿;张荣军;陈勃勃

    目的 探讨颅骨修补术实施临床路径后在控制费用、提高医护质量、患者满意度方面的效果.方法 回顾对比2012年7月-2013年12月期间实施临床路径患者与2010年7月-2011年12月未实行临床路径患者的住院平均总费、药费比例、住院天数、医护质量、患者满意度等指标,进行统计学分析.结果 实施临床路径后,患者住院平均总费用由22 409.42元降至18 927.60元、药费比例从20.6%降至12.3%、平均住院天数从21.67 d降至11.45 d、医护质量、患者满意度从87%提升至99%.结论 颅骨修补术患者实施临床路径后可有效规范诊疗措施、降低住院总费用及住院天数,有效提高医护质量及患者满意度.

  • 应用R软件对英格兰威尔士新人工流产数据的统计分析引发对我国人工流产现状的学习和建议

    作者:钱佳佳

    目的 应用R软件对英格兰威尔士新的人工流产数据进行统计分析,结合近年发表的人工流产统计相关的文献进行学习,从公共卫生的角度提出建议.方法 应用R软件版本3.4.2对英格兰威尔士新的人工流产数据进行统计分析,从时间序列的角度,从年龄因素、婚姻状况因素,对数据进行分析.结果 从时间序列的角度分析,近年人流人数比率保持平稳;方差分析得出在年龄因素中25~34岁,在婚姻状况因素中单身有伴侣是人流人数多的状况.结合我国近年发表的人流危险因素相关的文献,也支持以上的分析结果.结论 年龄在20~34岁和单身有伴侣的女性是人工流产的高发人群以及健康教育的重点关注对象.

  • 卫生统计方法的R软件处理

    作者:王晓刚

    本文介绍了常见卫生统计方法的R软件处理.

  • R软件3个常用决策树包的应用比较

    作者:帅健;张艳;方瑶;李丽萍

    目的 通过应用R软件中决策树包rpart、party、partykit对伤害发生的影响因素进行分析,比较3种方法分析结果的差别,为伤害资料分析方法提供一种新手段.方法 根据农村女性伤害发生专题调查资料,在R软件中分别建立决策树包rpart、party、partykit的模型,比较3种方法分析结果的差异.结果 rpart包与party、partykit包分类规则不一致.rpart包分类结果表明未接受教育的农民女性是伤害的高危人群,party包与partykit包分类结果表明接受教育女性中离婚或丧偶的女性伤害发生率高,其次是未接受教育的女性.结论 R软件决策树包的应用条件有所不同,应该根据实际情况选择合适的软件包进行应用分析.在伤害资料的分类建模分析中,使用partykit包较为适合、简捷且界面友好.

  • 诊断准确性试验Meta分析软件的比较研究与选择

    作者:陶圆;何倩;许杨鹏;喻亚宇;付文杰;吴君怡;牛玉明;张超

    目的:比较各种诊断准确性试验(diagnostic test accuracy,DAT)Meta分析软件的特征及功能,为使用者选择软件提供参考。方法计算机检索PubMed、EMBase、Cochrane Library、CNKI、Stata软件官网、R软件官网及Google搜索等,收集具有DAT Meta分析功能的软件及程序包,检索时限截至2016年7月。下载软件和程序包及其使用说明,用示例对软件的基本特征、功能和计算结果进行比较分析。结果共纳入9款软件,包括编程软件和非编程软件,主要基于贝叶斯学派和频率学派研发。大多数软件已具备操作简单、易掌握、计算准确及图形绘制优良等优点,但无一款同时具备较佳计算能力与绘图功能的软件,必需多款软件联合来实现。结论建议使用者首先依据自身编程基础与习惯等选取,可考虑选用两种软件相互配合来实现DAT Meta分析,如单独使用Meta-Disc软件或联合使用Bayesian Inference Using Gibbs Sampling(BUGS)与R软件。

  • 应用R软件metafor程序包实现轮廓增强漏斗图

    作者:魏雪梅;胡定伟;敬媛媛;张超;张永刚;曾宪涛

    目的:介绍轮廓增强漏斗图应用R软件metafor程序包的实现方法及其作用。方法通过实例展示应用“funnel()”函数绘制传统漏斗图和轮廓增强漏斗图的方法,并进行比较分析。结果 R软件metafor程序包能够实现普通的轮廓增强漏斗图和结合剪补法的轮廓增强漏斗图。相对于传统漏斗图,轮廓增强漏斗图对对称性的识别更为敏感,且能识别纳入研究分布在有无统计学意义的区域。结论轮廓增强漏斗图利于判断漏斗图是否真正不对称以及这种不对称是否由发表偏倚所致。

  • 生存资料的二次研究系列之一:应用R软件实现生存曲线中数据提取与生存曲线的合并

    作者:孟详喻;靳英辉;程小柯;张永刚;曹越;曾宪涛

    涉及生存资料的Meta分析常用的方法是对两组比较的风险比(hazard ratio,HR)进行合并,其数据基础是原始研究的HR及其95%可信区间(95%CI).然而,原始研究中HR及其95%CI未报道或不完整报道的情况并不少见,这限制了基于HR的Meta分析的开展.绝大多数涉及生存结局的原始研究均提供了生存曲线,通过对生存曲线进行合并能对人群的生存结局进行全面评估.本文介绍利用R软件实现生存曲线数据提取并对其进行合并以生成汇总生存曲线的方法.

  • 应用R软件Metatron程序包实现诊断准确性试验Meta分析及程序包汇总比较

    作者:何倩;孙艳玲;陶圆;吴君怡;桂裕亮;张超;牛玉明

    诊断准确性试验(diagnostic test accuracy,DTA)的灵敏度与特异度之间存在固有的负相关性,为避免二者间负相关性对诊断试验结果的评价产生影响,很多学者提出了双变量模型,因其保留了原始数据的二维结构特性,双变量模型通过参数拟合可以得到灵敏度和特异度的综合估计量值及二者之间负相关的值,从而对诊断试验的准确性进行综合性分析。当前具代表的是由Reitsma等提出的线性混合双变量模型,Metatron程序包正是基于此模型所研发的用于DTA Meta分析的程序包,同时本文将对R软件中专用于DTA Meta分析的程序包做出比较,便于使用者选择。

  • 应用R软件metamisc程序包及CopulaREMADA程序包实现诊断准确性试验的Meta分析

    作者:王权;杨廉洁;何倩;喻亚宇;许杨鹏;张超

    诊断性准确性试验(diagnostic test accuracy,DTA)Meta分析是一种全面评价诊断试验证据准确性的研究方法,R软件metamisc程序包与CopulaREMADA程序包是基于经典频率学方法用于DTA Meta分析制作及图形绘制的程序包,与传统的双变量模型相比,其所建立的分析模型减少了组间差异,简化了其繁琐的迭代运算过程,使诊断试验评价指标更加准确与高效。

  • 应用R软件bamdit程序包实现诊断准确性试验的Meta分析

    作者:王权;何倩;吴君怡;陶圆;张超;牛玉明

    随着医疗确诊手段多样化,如何选取优质的诊断工具显得尤为重要,诊断准确性试验(diagnostic test accuracy,DTA)Meta分析就为评价与获取优质诊断工具提供了重要的证据支持。当前运用贝叶斯理论框架进行统计学分析的方法已逐渐被方法学家接受,其中R软件bamdit程序包就是在运用贝叶斯理论进行数据运算并结合R软件优质绘图功能专门应用于DTA Meta分析制作程序包之一。该程序包简化贝叶斯复杂而繁琐参数设置过程,同时提供亚组分析与相应图形绘制功能。与meta4diag程序包和HSROC程序包相比,bamdit程序包功能更为全面且操作更加简洁,更适合初学者掌握与使用。

  • SPSS软件调用R软件实现诊断准确性试验Meta分析

    作者:陶圆;刘俊华;何倩;桂裕亮;付文杰;吴君怡;张超;牛玉明

    SPSS软件是一种基于编程与非编程一体且具有数据处理与图形绘制等强大功能的统计软件,简单的操作、便捷的数据加载、简洁的数据处理与图形绘制等特点使其广受科研统计者们的青睐。而SPSS软件在作诊断准确性试验(DTA)Meta分析时却不完美,此时往往调用R软件,从而充分地结合了SPSS的专业集成、便捷使用和R软件的灵活易扩展、绘图丰富的各自优势。本文主要以实例展示通过调用R软件来拓展SPSS的计算分析和绘图演示的功能实现DTA Meta分析的方式和过程。

  • 生存资料的二次研究系列之二:R软件重建time-to-event结局的单个患者数据

    作者:孟详喻;田国祥;拜争刚;曹越;刘小平;曾宪涛

    在原始研究中,对time-to-event结局的报道往往仅限于中位time to event和风险比。本文介绍一种使用R软件利用文献报道的Kaplan-Meier曲线、特定时间点无事件患者数(numbers at risk)和总事件数重建单个患者数据(IPD)的方法。

  • 应用R软件meta4diag程序包实现诊断准确性试验的Meta分析

    作者:何倩;王晓娜;喻亚宇;桂裕亮;张超;牛玉明

    meta4diag程序包是R软件中专用于实现诊断准确性试验(diagnostic test accuracy,DTA) Meta分析的程序包,该程序包基于贝叶斯理论采用INLA(integrated nested Laplace approximation)法来对单个研究效应值进行合并,同时,该程序包还提供了SROC(Summary Receiving Operation Characteristic)曲线图的分析与绘制,然而其缺陷在于无法给出异质性检验及风险偏倚评估。本文以实例形式就meta4diag程序包实现诊断准确性试验DTA Meta分析的数据准备与分析、结果汇总及图形绘制等功能作相关简述。

  • 应用R软件的robumeta程序包实现基于鲁棒方差估计的Meta回归分析

    作者:冯雨嘉;郭梓鑫;曾宪涛;刘小平

    robumeta是R软件中用来进行非独立效应量鲁棒方差估计的Meta分析方法.传统的Meta回归分析方法不具备处理非独立效应量之间未知且复杂的相关性的能力.robumeta程序包提供了一种使用不同加权算法进行大样本和小样本鲁棒方差估计(Robust variance estimation,RVE)的Meta回归分析的方法.过去的RVE只适用于大样本,而robumeta程序包对传统的鲁棒方差估计进行了一定的调整,使RVE同样适用于小样本.本文以实例介绍了用robumeta程序包实现鲁棒方差估计的Meta回归分析方法的数据准备、执行运算、汇总结果及绘制图形的全部功能.

  • 生存资料的二次研究系列之八:使用R软件netmeta程序包实现生存资料的网状Meta分析

    作者:刘小平;黄静宇;李胜;翁鸿;孟详喻;曾宪涛

    近年来基于直接与间接证据合并的网状Meta分析越来越流行。R语言netmeta程序包是基于频率学图论模型的网状Meta分析软件,可应用于二分类、连续性以及生存资料等多种数据类型的Meta分析,并提供相应异质性与一致性检测方法及将干预措施进行优劣排序的方法。本文通过实例演示如何使用R软件netmeta程序包实现生存资料的网状Meta分析。

  • Markov模型的R实现及在卫生经济学评价中的应用

    作者:屈水令;潘晓平;王爱玲;张彤

    目的 应用R软件heemod包开展Markov模型在卫生经济学评价中的应用研究.方法 Markov模型的数学基础是随机过程理论,可用于模拟疾病发生发展状态.应用R软件heemod包,通过函数实现Markov模型在卫生经济学评价.结果 Markov模型的数学基础是随机过程理论,可用于模拟疾病发生发展状态,以HIV感染者进行抗病毒治疗作为示例,运用heemod包中define_transition()、define_state()、define_strategy()、run_model()等函数定义模拟疾病的转移状态、对各个状态的成本及健康效用赋值、运行模型,开展卫生经济学评价并用实例演示了实现过程,对敏感性、确定性等评价进行了介绍.结论 应用R软件heemod包可实现Markov模型卫生经济学评价,R软件heemod包易于学习掌握、展示功能强,在此推荐给卫生经济学评价学习者及研究者.

  • R软件OptimalCutpoints包在影像诊断中的应用

    作者:刘小华;何鹏;徐凯;李绍东;马红;赵华硕

    目的 探讨通过使用R软件OptimalCutpoints程序包来解决影像学数据中常见截断值求取结果的智能化、可视化的实现.方法 通过对搜集的50例脑胶质瘤MRI数据,采用OptimalCutpoints包,根据不同目的选取常见的选择截断值的方法分别进行佳截断值的求取,并将结果加以比较.结果 OptimalCutpoints包不但实现了在不同情况下佳截断点的智能选取,还给出了相应的可视化结果和ROC分析结果.结论 OptimalCutpoints包不需要太深的统计基础,使用方便,可供选择的方法丰富,能自动实现对诊断指标的佳截断值的选取,结果直观、形象.

  • 应用R软件进行logistic回归模型的交互作用分析

    作者:许敏锐;强德仁;周义红;石素逸;秦晶;陶源

    目的 应用R软件进行logistic回归模型的交互作用分析,为探讨交互作用提供依据.方法 使用R软件,编写程序实现logistic或Cox回归模型三个评价相加交互作用的指标及其可信区间的计算.结果 生物学交互作用的评价应该基于是否有相加交互作用,而流行病学研究中常运用logistic回归模型,并纳入乘积项分析因素间交互作用,其是否有意义仅反映相乘交互作用,并不能反映两因素间相加或生物学交互作用的有无.本文通过实例分析,调用基于R软件编写的interact程序,可以直接计算出logistic或Cox回归模型的三个交互作用评价指标(RERI、AP、SI)及其可信区间;并将结果与运用Andersson编制的Excel计算结果相比较,验证了本程序的科学性和准确性.结论 应用R软件编制程序,可实现logistic回归模型因素间交互作用和可信区间的计算,为流行病学研究人员分析生物学交互作用提供依据.

  • 时间序列分析在空气污染与健康领域的应用及其R软件实现

    作者:路凤;李亚伟;李成橙;陈晨;宋士勋;郭玉明;施小明

    目的 探讨时间序列分析在空气污染健康影响研究领域的应用与软件实现,为我国相关工作提供实用的操作方法参考.方法 利用美国芝加哥市1987年至2000年大气污染与死亡数据,分别采用广义线性模型、广义相加模型,并结合分布滞后模型,介绍时间序列分析的基本理论与R软件实现步骤.结果 时间序列分析可在R软件中方便实现.结论 R软件为时间序列分析在空气污染流行病学研究中的应用提供了相对成熟的软件包,在实际研究中值得推广.

  • 广义相加模型在R软件中的实现

    作者:张云权;朱耀辉;李存禄;冯仁杰;马露

    目的 通过R软件实现广义相加模型.方法 通过空间污染流行病学的一个实例研究介绍利用R软件mgcv包实现广义相关模型的具体步骤和评价方法.结果 广义相加模型可在R软件中方便实现.结论 R软件作为一款自由、免费、开源的统计分析软件,可灵活方便地构建广义相加模型,在实际研究中值得推广.

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