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GyrB基因在诺卡菌菌种鉴定中的应用研究

李路茜;李振军;楼永良
关键词: 诺卡菌 gyrB基因 鉴定

摘要: 目的 分析研究gyrB基因对于诺卡菌种水平的鉴定能力.方法 采用特异性引物对14种41株诺卡菌的gyrB基因进行扩增,并对其产物进行测序.从GenBank数据库中下载21株诺卡菌gyrB基因序列,对序列用DNAStar软件计算其相似性.利用Mega 6.06软件,采用邻接法和大似然法构建诺卡菌菌种系统发育进化树.结果 以gyrB基因构建的系统发育进化树中,不同诺卡菌种能准确地分离成独立的分支,且亲缘关系较近的近缘种也能得到有效分离.诺卡菌种gyrB基因种内相似性为94.2% ~ 100%,种间相似性约为79.2% ~ 97.6%,平均相似性为86.9%.结论 gyrB基因序列分析是一种快速、准确、特异性较高的鉴定方法,能将诺卡菌属的鉴定至种的水平,对于鉴定诺卡菌属近缘种gyrB基因比16SrDNA更具优越性.

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