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长链非编码RNA与动脉粥样硬化
新研究证明长链非编码RNA(lncRNA)可调节脂质及糖代谢,调控血管壁功能,参与血管内皮细胞和平滑肌细胞的增殖、迁移、老化、凋亡以及血管炎症及免疫应答,从而影响动脉粥样硬化的发生发展.本文就ln-cRNA与动脉粥样硬化关系研究的进展作一综述.
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非编码RNA在心肌纤维化中作用研究的进展
非编码RNA(ncRNA)是在人类基因组转录产物中非编码蛋白质的 RNA分子,在不同的生理过程中扮演重要角色.ncRNA在心血管疾病的发生发展中起到重要作用,包括心肌纤维化.本文对非编码 RNA中两个主要成员,小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)在心肌纤维化中的研究进展进行综述.
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长链非编码RNA MALAT1在肝癌中表达及功能研究
目的:探讨长片段非编码RNA (lncRNA) MALAT1在肝癌中的表达及其的功能.方法:用qRT-PCR方法检测80例肝癌患者手术切除的癌组织及其癌旁组织,以及不同肝癌细胞系(HepG2、Hep3B、HCCLM3、HuH7)与正常肝细胞系(L02)中MALAT1的表达.分别用MTT试验、划痕试验、流式细胞术检测肝癌细胞(HepG2、HuH7)转染MALAT1 siRNA后增殖、迁移、凋亡的变化.结果:80例配对标本中,72例(90％)肝癌组织MALAT1表达较其癌旁组织明显上调,MALAT1在不同肝癌细胞系中的表达水平均不同程度明显高于正常肝癌细胞(均P＜0.05);HepG2、HuH7转染MALAT1 siRNA后,增殖率均呈时间依赖性降低、划痕愈合能力均明显减弱(均P＜0.05),细胞凋亡率分别为17.0％、16.41％,而各自的对照组分别为8.89％、6.56％,差异有统计学意义(P＜0.05).结论:MALAT1在肝癌中的表达上调,且可能与肝癌的恶性生物学行为密切相关,对其作用机制的进一步研究,有望为肝癌的治疗找到新的靶点.
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甲状腺癌非编码RNA与mRNA差异表达谱及竞争性内源RNA调控网络分析
目的:通过生物信息学方法分析甲状腺癌预后相关的非编码RNA与mRNA及信号通路.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载568例甲状腺癌患者的临床信息及其组织样本的非编码RNA(lncRNA、miRNA)与mRNA数据,筛选出差异表达的非编码RNA与mRNA,对差异表达的mRNA进行功能富集分析与通路分析;构建lncRNA-miRNA-mRNA的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络;结合临床信息进行生存分析获取与甲状腺癌预后相关的非编码RNA与mRNA.结果:共筛选出差异表达的lncRNA 497个(上调93个,下调404个),miRNA 72个(上调5个,下调67个),mRNA 1097个(上调233个,下调864个).功能富集分析结果显示差异表达的mRNA主要参与单组织过程、单组织细胞过程、刺激反应等生物学过程,受体结合、分子功能调节、钙离子调节等细胞功能以及细胞、细胞膜、细胞外组件等细胞构成过程.通路分析结果显示差异表达的mRNA主要参与神经反应受体-配体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤转录失调等信号通路的调节.构建的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA互作网络中,有2个差异表达lncRNA(MIR181A2HG、OPCML-IT1),1个差异表达miRNA(miRNA-184)和2个差异表达mRNA(E2F1、SALL3)与甲状腺癌的总体生存期明显有关(均P<0.05).结论:所筛选的非编码RNA与mRNA以及相关信号通路在甲状腺癌的预后密切相关,并为甲状腺癌发生、发展机制的研究提供了新的方向.
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长链非编码RNA影响胶质瘤发病机制的研究进展
胶质瘤是颅内常见的恶性肿瘤,长链非编码RNA (lncRNA)是一类不能翻译成为蛋白质的RNA,lncRNA对人体生物学功能及疾病的发生发展有重要作用.lncRNA的作用包括表观遗传学调节、控制基因转录、与miRNA相互作用、miRNA的前体等,这些作用广泛存在且影响胶质瘤发病机制.lncRNA对于胶质瘤细胞的增殖、侵袭、转移有很多调节作用,对于胶质瘤的诊断及治疗有很多指导作用.
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LncRNA RP11-316M1.12促进乳腺癌细胞侵袭转移
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA) RP11-316M1.12在乳腺癌中的作用及相关机制.方法 生物信息学统计RP11-316M1.12在乳腺癌组织及正常组织中的表达量,qRT-PCR方法检测RP11-316M1.12在乳腺癌组织及乳腺癌细胞中的表达量,统计分析RP11-316M1.12的表达量与乳腺癌临床特征的关系.在MCF-7细胞中过表达RP11-316M1.12,在MDA-MB-231细胞中敲低RP11-316M1.12,Transwell方法检测上述细胞的侵袭能力,Western blot技术检测上述细胞上皮间质转化(EMT)标志物的表达.结果 GEPIA数据库资料显示RP11-316M1.12在乳腺癌组织中表达量显著高于正常组织.qRT-PCR检测在65例乳腺癌组织和23例癌旁组织中得到相似的结果,且发现RP11-316M1.12在乳腺癌细胞中的表达量高于乳腺正常上皮细胞.RP11-316M1.12表达与乳腺癌TNM分期及远处转移有关.Transwell结果显示过表达RP11-316M1.12可促进MCF-7细胞的侵袭能力,而敲低RP11-316M1.12可显著抑制MDA-MB-231细胞的侵袭能力.机制研究发现过表达RP11-316M1.12可下调E-cadhefin,同时上调Vimentin和ZEB1.结论 RP11-316M1.12在乳腺癌中高表达且增强乳腺癌细胞侵袭能力.
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环状RNA与血液系统恶性肿瘤的研究进展
环状RNA(circRNA)为一类广泛存在于生物界的内源性非编码RNA,其主要结构特征为包含封闭环状结构,不具有5'-、3’-末端与多聚腺苷酸尾结构.封闭环状结构使circRNA不易被RNA外切酶降解,以及避免腺苷酸脱支酶的脱帽效应,因此circRNA的结构与功能均稳定.目前研究发现,circRNA主要参与转录及转录后基因表达的调控,尤其可以作为微小RNA(miRNA)海绵,充当竞争性内源RNA(ceRNA)调控靶基因的表达.circRNA直接或者间接参与骨髓造血发育及血液系统恶性肿瘤的发生、发展,因此其有望成为血液系统恶性肿瘤诊断的分子标志物与治疗靶点.为探讨circRNA与血液系统恶性肿瘤的恶性转化、疗效与预后之间关系,笔者拟就circRNA的分类、结构特征、生物学功能及其在骨髓造血发育及血液系统恶性肿瘤中作用的研究进展进行综述.
